Lycium barbarum (goji berry): 132610022
Help
Entry
132610022 CDS
T09483
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
lbb
Lycium barbarum (goji berry)
Pathway
lbb03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lbb00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
132610022
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lbb03019
]
132610022
Messenger RNA biogenesis [BR:
lbb03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
132610022
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
132610022
NCBI-ProteinID:
XP_060180259
LinkDB
All DBs
Position
9:complement(9809130..9813513)
Genome browser
AA seq
472 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLKEYFQGYGDVLQTVVMRDKISGKPRGFGFVVFADPNVL
DRVLQDEHVIDGRTVDAKRALSREEQQGSKPGNTNSARNFGGGGNTRTKKIFVGGLPPTL
TEEGFRQYFESFGNVTDVVIMYDQQTNRPRGFGFISFDLEDAVDRVLQKTFHDLNGKQVE
VKKALPKDANPGAGGRSMSSGGGGGMGGGSYQGYGASGNNPSSYDSRMDSNRYMQSQNAG
GMGYGGGYGNPGYGYGPSNNGMGYGGYGSYGGANPGYGGANPGYSAAAVAAYGNPNAASA
GYGGGPAGGPRSTWGSQGPSAYGNMGYGNAPWGAANAAAGGGGPASGGSGQSPTGTTGYG
NQGYGYGGYAGNEGAYGNQSGYGAVGRASGAPSGNSPVGGGAAGDMQSGAGGYMNSGYGD
ASGNSSYGNSAWRSDNSQGSGNYGAPPNGAHGGQVGYGGGYGVAPSRQAQQQ
NT seq
1419 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcaaggaaagctgtttattggtgggatatcatgggaaacaactgaagag
aaactgaaagagtatttccagggttatggtgatgtcttgcagactgttgttatgagagac
aagatttcggggaaacctagaggttttggttttgttgtctttgcagatcctaatgttctt
gatagagttcttcaagatgaacatgtcattgatggccgtactgttgatgctaagagggcc
ttgtcaagagaggagcagcaaggctcaaagcctggaaatacaaatagtgccagaaatttt
ggaggtggtggaaataccaggaccaagaaaatttttgttgggggattgcctcccactttg
accgaggaaggatttagacagtattttgaaagttttggtaatgtcactgatgtagtaatc
atgtatgaccagcagaccaaccgacctcgtgggtttggcttcatctcatttgatcttgaa
gatgctgtagatagagttttacagaagacctttcatgatctgaatggtaaacaggtagaa
gttaagaaagctcttccgaaagatgctaatcctggtgctggtggccgttccatgagcagc
ggaggtggtggtggtatgggtggtggaagttaccaggggtatggtgcatcaggtaacaat
cccagctcttatgacagcagaatggattccaacaggtacatgcaatcgcaaaatgctgga
ggtatgggctatggtggtgggtatggtaatccaggttatggctatggcccatccaacaac
ggtatgggctatggtggttatggaagttatggcggagcaaatccgggctatggcggtgcc
aatcctggctatagtgctgctgcagttgctgcctatggaaatccaaatgcggccagtgct
ggctatggaggtggtccagcgggtggaccaagaagcacatggggctctcagggtccttct
gcatatggtaatatgggctatggtaatgctccttggggtgctgcaaatgctgctgctggt
ggcggcggtcctgctagtggaggatctggtcaatctccaactggaacgacaggatatggg
aatcaaggttatggttatggtggttatgctggaaatgagggcgcttatggaaatcaatct
ggttatggcgctgttggacgtgccagtggagctcctagtggtaattcacctgttggaggt
ggtgctgcaggagacatgcaatctggtgctggtggttacatgaacagtggctatggtgat
gcaagtggaaactctagctatgggaattcagcatggagatctgataactcgcaaggttct
ggtaattatggtgctccaccaaatggagctcatggtggccaagttggatatggtggtggg
tatggagttgcccccagtcggcaagctcaacagcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
