Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly): 124419886
Help
Entry
124419886 CDS
T06013
Name
(RefSeq) serine-rich adhesin for platelets
KO
K14316
nuclear pore complex protein Nup121
Organism
lcq
Lucilia cuprina (Australian sheep blowfly)
Pathway
lcq03013
Nucleocytoplasmic transport
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lcq00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03013 Nucleocytoplasmic transport
124419886
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
lcq03019
]
124419886
Messenger RNA biogenesis [BR:
lcq03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Nuclear pore complex
124419886
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-GeneID:
124419886
NCBI-ProteinID:
XP_046806762
EnsemblRapid:
LOC124419886
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(100487461..100491682)
Genome browser
AA seq
1250 aa
AA seq
DB search
MDGNSSLERRYSFNMAQANPVAESTHLNGSSFSWGSSMSPKHRSNSSICLNNTHTPSAFN
NKSIVSPKSKNITKIDARIAADVQSKGLASRIVKYHESGTRLNRSMSAHNLYSKPGQFPA
VTLKKTDLPYRATKQELSMIRIAPPEKSSFLGNTISSLLRSSSVVGLQQSKRNEDLSREN
RPIIHPPPTENDMAPTRSVLDVLKEISRKRINSDDLEVDETSKKYCNRAGNDSVDTGNNM
TSTNPQYFSTSSVSCQRYKRQRDCITSHHSVQIQETRTSPEQAKKRVCNYNNDITSSLSS
SIKCKAYGNTKRVSASTNFNQTMPSNLESYEMQKAKVQRYHDYNKTNNTQVDVRFDNLEN
TLRKVDNTINPITPIPATPCGQDQNNTGGVPPMRTVSEPAYNPDRTNKMNLIQPANKPRL
TLFNKKYDDDESKVTNESGTSVDENTDDLNEFGECAGIPFVKPKKLSSISGLRNPVIERT
QKSKLALMLSGLRGELYQNSDDDELDSAKEKLNIPENNKVDSNSGAVTSALKSTSTVTTL
TTVTSTSNEGVINTSSSFNFSTNTKSSSPLVGLKLSQSKVSSATVNNTLSIDSTKKLETN
PKQNIPVLGGFSFSTTNTSSTPVVDAVASNSTLKEPKASEATISSISANNSNAFNFGQST
QLPTKLSSSPVSNNTDKLSANLQTSTKDNLTQFPTVSAAFTLATTKTSTSSTVPSSMSAT
SAFSFNTNVTAPTSTISTSTPAVTTTSFTSTVKPNNGFSFSVPSTTSQPVTSASVAPIMF
GTSTSSAASVNSTTNTSVITTTTTSVPTFGAVATSTNLGGLTSTTSFAFNTPKQSSTIQP
TNVSSSSGAVPAPTFNFGSSVNSASLPTFGTNANAVIKPQPSSSGFSFGSEPKNQNSSSG
AQNNPADTSKQPDNNAFNSSSSTIFGSTGFNAPSGGTTPIFGNATNSSEKNVFNSSNATS
IFGSSSVKGATQTFGSNVDNKSAALVTPSVFGGSTTNNSTSTPFSFGSKPAIAQNTNSNN
TNGAAGGFSFSSTVSNSSEGGSFGFGSKTDGSTNTSSNTFGGAPTSAQNKNFTFSGAASS
KPSNPPSVFGGAVNKPTENTASPGGFSFGSALAPKTPTFSFGASSNSFSGSNANSTDNTS
SGFSFGAAASIKTNEISTNKPFSFGSPQPPQQQQIMSAQNNSNANPPNIFGSSVASKTTP
VPAFSFNSGSSTNLQPNAPASNNLFAPPPSTITTGPGDRLIRRATRRLQK
NT seq
3753 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgggaatagttcgttagagagacgatacagctttaacatggctcaagcgaatcct
gttgctgaatctacacatcttaatggaagcagtttttcttggggttcttctatgagtcca
aagcatcgaagtaattcaagcatttgtttaaataatacacacacaccttcggcctttaat
aacaaatctattgtcagtccaaaatctaaaaatattacgaaaattgatgcaagaatagca
gccgatgttcaaagcaaaggtttggcgtcacgcattgttaaataccatgagagtggaact
agattaaatcgcagtatgtcagcacataatctatacagtaaaccaggacagtttccagcc
gttacccttaagaaaactgatctaccatatagagctactaaacaagaattgtcaatgata
cgaatagctccaccagagaaatcatcgtttttgggaaacacgatttctagtcttttaaga
tctagttctgtcgtgggtttacaacaatctaaacgaaatgaagatttatcccgagagaat
cggcctataattcacccacctcctacagagaatgatatggctccaacacgtagtgtttta
gatgttctgaaagagatatctcgtaaacgtattaacagtgatgatttagaagtggatgaa
acctcaaaaaaatattgcaatcgtgcaggaaatgactctgttgatactggaaacaatatg
acatcaacaaatccacaatatttttcaacgtcatcggtatcttgccaacgatacaaaaga
caacgggattgtataacgtcacatcatagtgtacaaatacaagaaaccagaacttcaccg
gaacaagccaagaaacgcgtatgtaattacaataatgacattacaagttcacttagttca
agcataaaatgcaaagcatatggaaataccaaaagagtttcagcatcgactaattttaat
caaacaatgccatcaaatttagaatcatatgaaatgcagaaagcaaaagtgcaacgatat
cacgattataataagacgaataacacacaagttgacgtgagatttgataatctcgaaaat
actttaagaaaggtggataacactataaaccccatcactcctattccagcaactccttgt
ggtcaggatcagaataatactggaggggttcctcctatgcggaccgtatctgagccagct
tataatccagatcggacgaataaaatgaatttaatacagccagctaacaaacctcgctta
acattgtttaacaagaagtatgacgacgatgaaagcaaagtaacaaacgaatcaggcaca
tctgtagacgaaaacactgacgatttaaatgaatttggcgaatgcgcggggattccattt
gttaagcctaagaagttatcatcaattagtggcttaagaaatcctgtaatagaacgaaca
caaaaatcaaaattggctttgatgttgagtggattaagaggagaactttatcagaactcc
gacgatgatgaattggattcggcaaaggaaaaattgaatataccagagaacaacaaagta
gactctaattccggtgcagtaacatcagcattaaaatctactagcacagtaaccacttta
actacagtcacttcaacctctaacgagggagtgataaacacatctagttcattcaacttt
tctacgaatacaaaatcatcgtctcctttagttggactgaaattatcccagtcaaaggtg
tcatcggcaactgttaataatacattgagtattgactctactaaaaagttggaaaccaac
ccaaaacaaaatatacccgttttaggtggtttctctttcagcactacaaatacaagttct
acaccagttgttgacgctgttgcatcaaatagtactctaaaagagcctaaagcttcagaa
gcaacaatatcatctatttcagcaaataatagtaatgcttttaactttggccaatcaact
cagttgccgacaaagctttcgtcttctccggttagtaataacacagataaattatcagca
aatttacaaacttcgacaaaagataacttgacacaatttcctactgtcagtgctgcattc
acattagccactacaaaaacaagtacatcatcaacagtgccaagctctatgtcagctaca
agtgctttcagtttcaatacaaatgtaacagcaccaacatctacgattagtacatcaact
ccagctgtgactacaacctcttttacaagcactgttaagccaaataatggttttagtttt
tctgtcccttctactacatctcagcccgtcactagtgcttcagttgctccaataatgttt
ggtacatcaacgtcttcagcggcctcagtcaacagtactaccaatactagtgtcataaca
accacaacaactagtgtaccaacttttggcgcagttgctacatctacaaatctaggtggt
ttaacgagcacaacatctttcgcatttaatacaccgaagcaatcatcaacaatacaacct
acaaatgtttcttcaagtagtggtgcggtccccgccccgacttttaattttggttcaagt
gttaattctgcgtctcttcctacgtttggaacaaatgcgaatgcagtaattaaacctcaa
ccaagtagctctggattttcgtttggttctgaacccaaaaatcagaattcgtcatcaggt
gcacaaaataaccctgcagacacttccaagcagccagacaataatgcctttaattcgagc
tcatcaacgatatttggatcaacaggatttaatgcaccatcaggtggtactactcctata
tttggtaatgccactaatagttcagagaaaaatgtcttcaattcttctaatgctacatca
atatttggttcgagttcagttaaaggagctacccagacatttggctcaaatgtggataat
aaatcagcggcattagtaactccatcggtatttggtggtagtactaccaacaacagtaca
tcaactccatttagttttggctcaaagccggcaatagcacaaaatactaattctaataac
accaatggcgctgctggaggattctctttcagttcaacagtttcgaatagttcggaaggt
ggatcttttggatttggtagtaaaacagatgggtcaacaaatacttctagcaacactttt
ggtggcgcacccacatcggcacaaaacaaaaactttacattcagtggcgctgcaagcagc
aaaccaagcaatcccccgagtgtatttggtggagctgtgaataaaccaactgaaaacacg
gcatctcctggtgggttttcatttggttcagcattggcccctaaaactcccacatttagc
tttggagcaagcagtaattcattttctgggagcaatgctaatagcacagacaacacttca
tcaggtttttcatttggcgcggctgcatctataaaaacgaacgaaatctcaactaataaa
ccattttcctttggatctccacaacctccacagcaacaacaaataatgtcagcgcaaaat
aattcaaatgccaatcctccaaacatttttggttctagtgtagcttctaaaacaacacca
gtgcctgcttttagtttcaattctggaagttcaacaaatttacagcctaatgctccagcg
tctaacaatttatttgcaccacctccatcaactattacaacaggtcctggtgatcgtcta
atacgtcgagccacaagacgtttgcaaaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
