Leucoraja erinacea (little skate): 129703273
Help
Entry
129703273 CDS
T09122
Name
(RefSeq) multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
leri
Leucoraja erinacea (little skate)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
leri00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
leri04990
]
129703273
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
leri04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
129703273
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
Laminin_EGF
cEGF
EGF_CA
EGF_2
hEGF
EGF_3
EGF
DSL
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129703273
NCBI-ProteinID:
XP_055501585
LinkDB
All DBs
Position
14:11146669..11435631
Genome browser
AA seq
1603 aa
AA seq
DB search
MDLQVVLVCLHCLAIRLGLAVELQPDMPHVCAEQALAMVGHRQPCVQAFTRMVKVWKQGC
TAHRWCVGYERRTGYYTAYRQVYSIELQTTYKCCLGWNQQNEEPGCLHPMCTIGACFNGG
KCTEGISQVCHCSEGFQGPRCQYDVNECAKDNGGCQDQCCNTIGSYYCKCPTGQKLAANG
KYCEDVDECSMVNGGCQLRCINTKGSFYCECEPGYKIHADGRTCITINSCSMNNGGCEHE
CVQISENHYQCKCRWNYQLTGDGKHCELKDPCQERNGGCGHICHNDAGMAQCECNPGYRL
SVNGKSCDDINECTTGIAMCAHQCINILGSFSCICKPGFELGADGKQCYRIEMEIVNSCE
RNNGGCSHHCEHKTAGPSCFCNQGYILDSDGHTCLDSNECETNTACCVQDCSNNPGGYEC
SCHVGYRLNMDGCSCDDVDECSADNGGCEHLCINILGSFQCACQEQYRLDTDRKSCTSLD
DDDEFEGDLDGEEGDIELVRFRNMLLRVPPQLLHYKPSLTPLYQEDVRSELRLVHKIVCL
DNTFGHDCSLSCADCGNGGLCNAEGDGCICPAGWAGLICNETCPQGTFGKECNEICKCQN
GGSCDGVTGTCRCPPGIGGEFCEDGCPKGFYGKSCTRRCSCAGNGYCHRLYGACLCDPGL
YGRFCHLPCPKWAFGPGCSIECQCAQEHATGCDPQNGTCICRPGFHGLGCEEDCRPGFYG
TGCKFQCDCAAGGLCDQEGGECRYQCPPGFHGEGCLLSCDSGKFGINCGQSCNCGGASCN
SRTGQCICPAGKTGPRCEIDCPAGHWGINCQFSCEVCENGGTCNKELGTCDCPAGFTGAL
CQLACSPGYYGLACQHPCRCENGVLCHSVTGDCICGPGWMGPDCKIVCAVGRWGEGCRDL
CDCNNTDGSCDPVTGCCLCEAGYAGDRCEYKCPAGSYGPGCGSICRCQNGAACDHVSGAC
ICAAGWMGTFCERPCPDGFHGVDCQQVCKCRNGAGCDPAMGTCHCLPGWLGPQCNQPCAD
LRYGEGCSQRCDCYNNATCDRVTGQCLCIPGWTGARCQQRCPLGFYGLNCLQPCICRDSA
ECDPVSGSCGCPKGWTGIACELECEDGRFGEGCQHHCSCSNGGTCDRLIGRCTCRPGWVG
EKCQTPCPAGYHGEHCEERCQCKNAYSCHHETGVCQCTRGWRGKRCDKPCLPGYYGEDCG
QRCECLPGIACNHVTGECGCSAGFTGNGCEKSCPPGTYGQNCNQVCQCSGVNEECHPVTG
HCTCLPGYHGTKCDLQCPEGTYGPYCRERCKCQNEGRCDTVTGTCHCPPGFIGADCMVAC
PEGYYGKDCMKLCDCGKDGQCDPVSGKCLCRSGTVDPTCHTGCLKGRFGQSCLQVCACQN
NGICNAEDGACSCGLGWTGAHCEKECLVGKFGANCQQECSCLNSGTCDRFTGTCQCLEGF
YGPLCEYSCPLGFYGLLCAHSCDCRNGAACDPSTGHCICPLGYQGDGCEEACHAGYFGER
CQKTCDCEGISSCNPVTGRCFCSPGRTGDRCETECRMNRYGPNCSLICHCANKAYCNPVN
GSCACPFQWMGPTCDEGGPAQPATSYRSVQSQRHHLQRGVPRS
NT seq
4812 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatttacaagtcgtgctggtctgccttcactgtctggccatcagactgggacttgca
gtggaacttcaacccgatatgccccatgtgtgtgcagagcaggcactggccatggtggga
cacagacagccctgtgtgcaggcctttacacgaatggttaaagtgtggaaacagggatgc
actgcacatcggtggtgtgttggatacgagagaaggactggttactacactgcctataga
caggtgtacagtatagagctgcagaccacctataagtgctgcctcggatggaaccagcaa
aatgaagagccaggctgcttgcacccgatgtgcacgatcggcgcttgtttcaatggaggc
aaatgtactgaaggtatctcccaagtgtgtcattgttccgaaggattccagggtccgcgg
tgtcagtacgatgtgaacgaatgtgccaaggataatggaggttgtcaggaccagtgctgt
aacaccattggtagttattactgcaaatgtccaacgggacagaaacttgcagcaaatggg
aagtattgtgaagatgttgatgaatgttctatggttaatggaggatgccaactgcgttgt
atcaacaccaaaggatccttttattgtgaatgcgagcctggctataagatccatgcggac
ggtcgcacgtgtatcactatcaactcgtgttccatgaacaatggcggttgtgaacatgag
tgtgtgcagatcagcgagaaccactaccagtgcaagtgtcgttggaactatcagctgaca
ggagacgggaaacactgtgaactgaaggacccatgtcaggagagaaacggaggctgtggc
cacatatgtcacaacgatgctggaatggcgcagtgtgaatgcaatcctggatatcggcta
tcggtgaatgggaagagctgcgatgacattaatgagtgcaccactggaattgcaatgtgt
gctcatcagtgcatcaatatcctgggatcatttagctgtatctgtaagcctggatttgaa
ctgggtgccgatgggaagcagtgttaccgtattgaaatggagattgtgaatagctgtgag
aggaacaatggtggttgctcacaccattgtgaacacaaaaccgctgggccttcttgcttt
tgtaatcaaggatacatcctggactctgatggacacacatgtcttgattccaatgagtgt
gagaccaacactgcttgctgcgtgcaagattgcagtaacaatcctggaggctacgagtgc
agctgccatgtggggtaccggctgaacatggatggatgcagctgtgatgatgtcgatgaa
tgctctgcagacaatggcggctgtgagcatctatgtataaacatccttggatcctttcag
tgtgcgtgccaggagcaatacaggctggatacagacaggaaaagctgtacttctctcgat
gacgatgatgaatttgaaggggatttggatggagaggagggtgacatagaactggtcagg
ttccgcaacatgctgttgagggttcctccacaacttctgcactacaagccctcactgaca
cccttgtatcaggaggatgtgaggagtgaactcaggcttgtgcataaaatcgtttgcttg
gataacacctttggccatgactgtagcctcagctgtgcggactgtgggaacggaggcctc
tgcaatgcagaaggagacggctgcatctgccctgcaggatgggctggtctcatctgcaat
gaaacctgtccccaaggcacctttgggaaggagtgcaacgaaatctgcaagtgtcagaat
ggaggatcgtgtgatggagtcacagggacatgccgttgcccccctggaattggtggagag
ttttgtgaagatggttgtccaaaaggattctatggaaaaagctgcaccagacgatgtagt
tgtgctggcaatggctactgtcaccgtctctatggggcctgtttgtgtgaccctggtctg
tacggtcgcttctgccatttgccatgtcccaagtgggcctttggacctggttgctccata
gaatgtcagtgtgcacaggagcatgctaccggctgtgacccccaaaatggcacttgtatt
tgcagaccaggcttccatggccttggatgtgaagaagattgcaggcctggtttctatggt
actggctgtaaattccaatgtgactgtgcagctggcgggctatgtgaccaagaggggggc
gagtgcagataccaatgcccaccagggttccacggagaggggtgtcttttgagttgcgat
tctggaaaatttgggattaactgcgggcagagttgtaactgtggaggggcctcttgcaac
tcaagaactgggcagtgcatctgccctgctggtaaaacgggaccaaggtgtgaaatagat
tgcccagccggtcactggggcatcaactgccagttctcttgtgaagtctgtgaaaatgga
ggtacttgtaacaaggagttggggacatgtgactgtcctgcaggattcactggagcattg
tgccagcttgcttgttctccgggttactatgggctggcttgtcagcacccctgccgctgt
gaaaatggcgtcctgtgtcacagtgtgactggagactgcatctgtggccctgggtggatg
gggcctgactgcaaaatagtgtgtgccgttggccgatggggcgaaggctgcagggatttg
tgtgactgtaacaacactgacgggagctgcgatcctgtgacgggctgctgtctgtgtgag
gctgggtatgcgggggaccgctgtgaatacaagtgccctgctggaagctacggtccggga
tgtggctccatctgccggtgccaaaatggagcagcttgcgatcacgtcagtggggcgtgc
atctgtgcggctggatggatgggaacattctgtgaaaggccctgccctgatggctttcat
ggcgttgactgtcagcaggtgtgcaagtgcaggaatggcgccggatgtgatcctgcgatg
ggaacgtgccactgtcttcctggatggctgggacctcagtgcaaccaaccctgtgctgac
ctgcgatatggcgagggttgcagccaacgttgcgactgctacaataatgcgacgtgtgat
cgtgtgaccggccagtgcctctgcattcctggatggacaggagccaggtgccaacaacga
tgcccattggggttctatggattgaactgcctgcagccctgtatctgcagggattcagct
gagtgtgaccccgtgagtggatcgtgcggctgccccaaggggtggactggtatcgcctgt
gagctggagtgtgaagacggacggtttggggaaggctgtcagcaccactgcagctgcagt
aacgggggaacctgcgaccgactcattggacggtgcacttgcagacccggctgggtcggg
gaaaagtgtcaaactccttgcccagcaggatatcatggggagcactgcgaggaaagatgc
cagtgcaaaaatgcttactcctgtcaccacgagacaggggtttgccagtgtacccgaggc
tggcggggcaagagatgcgacaaaccatgcttgcccggttactatggagaggactgtggc
cagagatgtgagtgcctgcctggcattgcctgcaaccatgtcaccggagagtgtggctgt
tctgccgggttcactggcaatggttgtgaaaagagttgtcctccaggcacctatggacag
aattgcaaccaggtgtgccagtgctcaggagtgaatgaagagtgccaccctgttactgga
cactgcacctgccttcctggctaccatgggaccaagtgtgatctccaatgcccagagggg
acctatggcccatactgccgagagagatgtaagtgtcaaaacgagggtcggtgtgacact
gtgactggaacctgccactgtcctcctggatttattggagccgattgcatggttgcttgt
ccagaaggttattacgggaaagattgtatgaagctgtgcgactgtggtaaagatggtcag
tgtgaccctgtgtcaggaaaatgtctgtgtcggtcgggaacagtggaccccacgtgccac
acaggttgtctaaagggaagatttggacaaagctgtctgcaggtttgcgcttgtcagaac
aatggcatctgtaacgcagaagatggggcatgctcctgtggactcgggtggactggtgct
cattgtgagaaagaatgtcttgtcggaaagtttggagcgaattgccagcaggagtgttcg
tgcttgaacagtggaacctgtgatcggtttacggggacctgtcagtgcttggagggtttc
tacggtcctctgtgtgaatacagttgtcctctgggtttttacggcttactctgtgcacac
tcctgtgattgcaggaatggtgctgcttgtgatcccagcacaggccattgcatctgccca
cttggttaccaaggtgatggctgtgaagaagcttgtcatgctggttactttggggaaaga
tgtcagaaaacttgcgactgtgaaggcatcagttcatgcaatcctgtaacagggaggtgc
ttctgctcaccgggtagaacaggagatcgatgtgaaacagaatgtcgaatgaacagatat
ggacctaactgctccttgatctgccactgtgcaaacaaagcttactgtaaccctgttaat
ggaagttgtgcatgtccattccaatggatggggccaacatgtgatgaaggtggtccagcg
cagccagcgacctcctatcggagtgtgcagtcacaacggcatcatctgcagcgaggggtt
cctcgctcatag
DBGET
integrated database retrieval system
