Lelliottia sp. WB101: DAI21_19715
Help
Entry
DAI21_19715 CDS
T05398
Name
(GenBank) autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein
Organism
lew
Lelliottia sp. WB101
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
AC_1
Pertactin
Trypan_PARP
DUF3575
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVY99724
LinkDB
All DBs
Position
4061827..4065069
Genome browser
AA seq
1080 aa
AA seq
DB search
MEICKKNDYSLKGKWLFTPFYWLLLSPLSVYASITYSDGKEHFFNFLPSTETTADNDPAF
IITGAGTAVKVQGSNNAGDTLIPEKSVISTSGKESYAFNLSNLANLTLTNAAIDTKNASR
TINISSGASATLNNADISANQSRSYVVYVSGAGSSFHGDDIRITDTNSTGTGISLHYGAS
ANDLSNVTITLSDAMYGIQLDSSTAVIDNLTINQSSTGYQNAIYAIGSNSNQKAVATITN
GHVNLTGINSTMINANAYSDVRLDGGIYQSYGDNITAFFLSGKESSLTANNLTLITNGVR
SNAIDARNNMHIDNDIVKTTGDKSYALYVDSGDMTYNQLPPVTLTASNMTLVTEGNSSAA
AVAACSANIACTGILDISNSSITTSGTGSYLLAAMNDAIITAESVTGHSSGENADLIRSY
ANSNITLKGSQLSATGANANAIYGTGFDADNPAIVTLINSDLSSAAAEGIIISGANEQIN
VNDHSTITSGSGILLRANSTINTSTGVITASKVNLSASDSLLEGDIIAAQGNLVDVYLNS
DSQWKGATETTNSVNIDATSKWVIPDNSTVNTLNSAGNVFFSHTGSAYSTLNITGNMNGD
GIYHINTFLDDSNSPTDTIHVTGDVTGSNILYVNNTGGQGDYTPANGIQVIQVDGTNTEG
SNAFTLGNTVSAGAFNYTLHKGDISSGEGENWYLSDCADYTCSEAIPDPVPDPDPTPEPD
PTPDPTPDPDPTPDPDPVPDPDPAPEPEPTPDPEPAPEPDPIPDPTPAPIPSDGNLPWRE
EVPSYLAAPTLLMNYGFDAIGTYHQRNGSNVMHTDETWARTAYQHTNYDAGRYSYDTDMS
LIQFGQDLLWDKTTDGGEIRAGIMATLGRQTTDSEDSLRRHNPSLSTKTGSIDSRIYSLG
GYYTLKTHEGAYIDVVGQGSWYKTDYDSTHDASQNGYGAALSVEVGKPFVLYQNLKVEPQ
AQIIYQYLNLEDFNDEISSVSGVSMSNGQGRTGLRFFMDNPDWTPYLAINAVSVMGDEAN
VQIADKHTRADFGKDWWQSAAGVTVSLGENTLLNADVSYQKGFGSDIEGYSANANVKVSF
NT seq
3243 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatatgtaaaaaaaatgattattcattaaagggtaaatggctatttacgccgttc
tattggcttctgctttctcctttgagtgtttacgcatccataacctatagcgacggtaaa
gaacatttttttaactttttaccttcaacagaaaccacagcggataatgatcctgcgttt
atcattaccggtgcgggaaccgcagttaaggttcaggggagtaataatgctggcgatacg
cttattcctgaaaaatcagttatatctacttcaggaaaagagtcctatgcgtttaacctt
tctaaccttgccaatttaacccttaccaatgccgctattgacaccaaaaacgcgagcaga
accatcaacataagctccggtgcatcagcaacattgaataatgctgatattagtgcgaat
caatcaagaagttatgtggtttatgtcagtggggccggttcctcatttcatggtgatgat
attcgtattaccgatactaactctacaggtactggcatctctttgcattatggcgcttcc
gctaacgatctgagtaatgtcactattacactcagtgatgccatgtatgggattcagctc
gattcatctacagcagtgattgataatctcactatcaatcagtcctccacgggctatcaa
aatgctatttatgccattggttcgaattcgaaccaaaaagcggtggcaacaatcaccaat
gggcacgtcaatttgacgggcattaacagcacaatgattaatgccaacgcctacagtgac
gttcggctggatggcggtatttatcagagctatggcgataatatcacggcctttttctta
tcggggaaagagagcagtctcacggccaacaatcttacacttatcacgaacggcgtcaga
tccaacgctattgatgctcgcaataatatgcatatcgataacgatattgttaagacgaca
ggggataaatcgtatgccttgtatgtcgactctggtgatatgacctataaccagctcccg
cctgtcaccctgacggcctccaacatgacgctggttacagagggaaatagttctgctgcg
gcagtcgccgcgtgttccgccaacatcgcctgcacaggtatccttgatatcagcaactcc
tcaattacgacctccggtacgggtagttacctgctggcggcgatgaatgatgccatcatt
actgcggagtctgttactggacactcttcgggcgagaatgccgatttaatacgctcatat
gcaaacagtaatatcacgcttaaagggagccaactgagtgcaacgggagccaatgcgaac
gcgatttatggaacggggtttgacgcggacaacccggcgatagtcacgcttattaacagt
gacctgagcagcgccgctgccgaaggaatcatcatttcgggtgcgaatgagcaaatcaat
gtgaacgatcattcaacgattaccagcggcagcggtattttgttgcgtgcgaacagcact
atcaatacgagtaccggggtgattactgcgagcaaggtgaacctatcggccagtgattca
ctccttgagggtgacattatcgcggctcagggaaaccttgttgatgtttatctgaattcg
gactcgcaatggaagggtgcaaccgagaccactaatagcgtaaacatagatgctaccagt
aaatgggttattcctgataattctacggttaatacattgaattccgcagggaatgtcttc
ttctctcatacaggaagtgcttattcgacgttgaatatcactggcaacatgaacggtgat
ggtatttaccacatcaatacattcctcgatgatagtaactcccccaccgataccatccat
gtgacgggtgacgttaccggcagtaatattctgtatgttaacaatacgggtggtcagggt
gattacaccccggctaacggcattcaggttatacaggtcgacggtaccaataccgagggc
agtaacgcctttacgcttggaaacaccgtttctgctggcgcgtttaactacacgttgcac
aaaggcgacatttcaagcggcgaaggggaaaactggtacctgagtgattgtgctgattat
acgtgctccgaagctattcctgacccggttcccgatccggacccgacgccagaacccgac
ccaactcctgatcctactcctgatccagacccgacgcccgatccagatcctgttcccgat
ccggacccggctccagaaccagaaccgacccctgatcccgagccggcgccggaacccgat
cctattccggacccgacacctgccccaattccgtctgatggaaacctgccgtggcgtgaa
gaggtaccttcttatctcgcagccccaactttgctcatgaattatggatttgatgctatc
ggcacttatcatcaacgtaatggcagtaacgttatgcacacagacgaaacatgggcacgg
acagcgtatcaacatacaaactatgatgccggtcgttatagctatgatacggatatgagc
ttaatccagtttggtcaggatttattgtgggataaaaccactgatggcggggaaattcgt
gcaggtattatggcgacgttgggccgccaaaccacagattccgaagacagtttacgccgt
cataatccctctctctcgacaaaaactggcagcattgacagtcgtatttacagcttaggc
gggtattacactctgaaaacccacgagggcgcgtacattgacgttgtcggtcagggaagc
tggtacaaaaccgattatgacagcacccatgacgccagtcagaatggctatggtgccgca
ctgtcagtagaagtgggtaagccatttgttctttatcaaaatctcaaagtagaacctcag
gcgcagattatttatcagtaccttaatctcgaggattttaacgacgagatcagttcagta
tcaggcgtttccatgagtaacggacagggtcggacagggcttcgtttcttcatggataat
ccagactggaccccttacttagcaattaatgccgtaagcgttatgggtgatgaagcaaac
gtgcaaattgccgataaacatacgcgagcagatttcggtaaagactggtggcagagtgca
gcgggcgtcaccgtaagtcttggagagaataccctcttgaatgctgatgtgagttaccag
aaaggttttggttctgacatcgagggatatagcgcgaatgcaaatgtgaaagtctctttc
taa
DBGET
integrated database retrieval system