Limnospira fusiformis: HFV01_14535
Help
Entry
HFV01_14535 CDS
T06534
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
lfs
Limnospira fusiformis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_3
PAS_4
HisKA_2
PAS
PAS_9
CBS
PAS_8
GAF_3
GAF
HATPase_c
GAF_2
HWE_HK
PAS_11
HATPase_c_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QJB26806
LinkDB
All DBs
Position
complement(3003803..3006955)
Genome browser
AA seq
1050 aa
AA seq
DB search
MSTPTINPWLMSSPTLNDIIHRDPLTVVPNTSLMEVMALMSQEPSDQWGTENFPPNSCVL
VVEDGKLVGMWTERDVVQLIGAGENPGDLVVSEVMRQPPVVWREADELDIYAIIQKLKTH
KIHYIPVLDEKDYLTGIIPEYRVIEKLVDSHPNHDILSRISPTKLQQQLAQFKAKLQNTN
AQLQGEISQRGIIRMIEQKLRTGEPNLLTFFDALTDIILIINTRTNSIQTPRKSRQNNHE
YLGTKYEGNTSPIINQTRQLFSPDYPDNIFREKVNQCLQTGRIINFEYHLNVEGDCLWFS
ANISPISSESVAWVARDITENKRAESALKSLTAELEQRVQERTLELQKTNQMLTRYLEEQ
QQSKKELLKAHNKMRSHVENSPLAVIEWDPEFKVQYWGKQAEKIFGWKAEEIIGIHWGEW
PIVFEEDLQLVETVIGDLLGDKTNKNICKNRNYTKDGRVIYCEWYNLVLRDESHQVISIL
SLVQDVTERELLEIERCQVEEALRESEARYATLTDISPVGIFRTDAEGKFVYINERGCDL
VGCSVMEMFGHGWTKRLHPDDRERVINEWNKCVNNHQMFQLEYRFCHGEGQVVWVFSQAV
PELNDDDEIVGFVGTLTDISELKSAEKSLQELNQDLEMLVEQRTSQLQETNEKLRVEIAE
RQKIEAEIATKAYQQAMVAEVGQKALLGIDSEILIQDIVGMVGRCLQVDYCKLLEIRVSE
PDRLTVAIANHQHTHNHRLKTDKYHQVYSFILPESSSTTPSPSHHLNLGIEPSSNIYQFP
HINGISIPIESQNSYYGILGVYTTETREFVQEDVHFLQSVANVLATAIERQHAEEQLMNS
LKEKEILLKEIHHRVKNNLLVVSNLLEFQSDYTDNPEVIKLLSDSQQRIQSMALIHEKLY
KSTGLDRINFGDYLNDLVEQLFDSYGTEAHTVDLELDIESVELNLETANPCSLIVNELIS
NAFKHAFVDERPGKLGLELHQDDLGIITLIIRDNGVGIPEGLDIRNVESLGMELIWTLTE
QIEGNLELLDVTEGTAFKLIFSELSYRQRY
NT seq
3153 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctacacccacgattaacccttggcttatgtccagtccaactttaaacgacatcatc
catagagaccccctaacggttgttcctaatacctccctcatggaggtcatggctttaatg
agtcaggagccctcagaccagtggggaacagaaaacttcccccctaacagttgtgtactg
gtggtggaagatgggaaattggtgggtatgtggacggaaagggacgtggtgcagctaatt
ggtgcgggggaaaatccgggggacttggttgtgtctgaagtgatgagacaaccccctgtg
gtctggcgagaagcagatgagctggacatttatgcaattattcaaaaattaaaaacccat
aaaattcactatatcccagttctagatgagaaagattatttaactggaataattcctgag
tatcgggtgatagaaaaacttgttgattcccatcctaaccatgatattctcagtagaatt
agccccactaagctgcaacagcaactggcacaatttaaggctaaattacaaaataccaat
gcccaactacagggggaaatcagtcaacggggtatcatccgcatgattgaacaaaaattg
cgaactggtgaaccgaatcttctgacattttttgatgctttgactgatattatcctgatt
attaatactcgcaccaattcgattcagactccccgcaagtcccggcaaaataatcatgaa
tacctaggtacaaaatacgagggtaatacatctccaataattaaccaaactcggcagcta
ttttctcctgattacccggacaatatttttagagaaaaagttaatcaatgtttgcaaacg
gggagaattataaattttgaatatcatctgaatgtggaaggtgattgcttgtggttttcg
gcaaatatctcccccatttcctcggaatctgtagcttgggttgctcgtgatattactgaa
aataagcgagctgaatcagctttaaaaagtctgacggcggaattggaacaacgggtacaa
gaacgtacccttgaactgcaaaaaactaatcaaatgcttaccaggtacttggaggaacaa
caacagtcaaaaaaagagttattaaaagctcataataaaatgcgatcgcacgtggaaaat
tctcctctagctgtgattgaatgggacccagaatttaaggtacaatattggggaaagcaa
gcggaaaaaatctttgggtggaaggctgaagaaatcataggtattcattggggagaatgg
ccaattgtttttgaagaagacctacaattagtagaaacagttatcggtgatttactcgga
gacaaaaccaataaaaatatttgtaagaatcgtaactataccaaagacgggagagtaatc
tactgtgaatggtataacttagtattacgggatgagtcccatcaggttatatcgattttg
tcattagttcaagatgtgacggaacgggagttattagaaattgaacgttgtcaggttgag
gaggctttgcgggaaagtgaggctcgctatgcgactcttacagatatttctccggtgggg
atatttcggactgatgctgaaggtaaatttgtctatatcaatgagcgtggatgtgatttg
gttggctgttcagtcatggaaatgtttgggcatggttggactaaaaggcttcatcctgat
gaccgagagcgggtaattaatgaatggaataaatgcgttaataatcatcaaatgtttcag
ttagaatatcgtttttgtcatggtgaaggccaggtagtttgggttttttcccaagctgtt
cctgagctaaatgatgatgatgaaatagttggttttgtgggaactctcactgatattagt
gaactaaaatccgctgaaaaatctctgcaagaattgaaccaagacttagaaatgctggtg
gaacagcgaacatctcaactacaagaaactaacgaaaagttgcgagttgaaattgcggag
cgacaaaaaattgaggcggaaattgcgactaaggcttatcagcaggctatggtagctgaa
gttggacaaaaagctctcttgggtattgactcggaaatattaattcaggatattgtcggg
atggtgggtcgatgtttacaggtggattattgtaagttattagaaatacgggtgtctgaa
cccgatcgcctgacggtggcgatcgctaaccatcaacacacccataatcatcgcttaaaa
actgacaaatatcaccaggtttactcatttattttacctgaatcatcatcaactacaccc
tctcctagccaccaccttaacctaggaatagaaccgtcgtcaaatatttatcagtttccc
catattaatgggatcagtattcccattgaaagccaaaattcctattatggcattttgggg
gtttatacgaccgaaactagagaatttgtgcaggaggatgtacactttctgcaaagtgta
gctaatgttttagcaacggcgatcgaacgccaacacgctgaagaacaattaatgaactcc
cttaaagaaaaagaaattttgctgaaagaaattcaccaccgagtgaaaaataacttgctg
gtagtttccaatttattagagtttcaatcggattacacggacaacccagaagtaatcaaa
cttttgtcagatagccaacaacgcattcaatctatggctctgattcacgaaaaactatat
aagtcaacaggtctggataggattaactttggcgactatctcaatgatttagttgagcaa
ctatttgactcttacgggacagaagctcacacagttgacttagaattagatatagaatcc
gttgaacttaacctggaaacagctaacccttgtagtttaattgtcaatgagctgatatct
aatgcttttaaacacgcctttgtcgatgaacgtcctggtaaacttgggttagaacttcat
caagatgatcttggtattattactttgattatccgggataatggggtcggtattccagaa
ggactagatattcgcaatgtggaatccctaggaatggagttgatctggaccctgactgag
cagatagaaggaaacttagaactattggacgtaaccgagggaacagcatttaaactgatt
ttctcggaattgtcctatagacaaagatattga
DBGET
integrated database retrieval system
