Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_218488
Help
Entry
LOTGIDRAFT_218488 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K06271
talin
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Pathway
lgi04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
LOTGIDRAFT_218488
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
lgi04147
]
LOTGIDRAFT_218488
Exosome [BR:
lgi04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of haemopoietic cells (B-cell, T-cell, DC-cell, reticulocyte, and mast cell)
LOTGIDRAFT_218488
Exosomal proteins of other cancer cells
LOTGIDRAFT_218488
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
I_LWEQ
Talin_middle
Talin_R4
VBS
FERM_f0
FERM_M
FERM_N
IRS
LOH1CR12
Trehalase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20246788
NCBI-ProteinID:
XP_009059493
JGI:
218488
UniProt:
V4BLR4
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2543 aa
AA seq
DB search
MATLSLKISVVQSNAVKTMQFEPSTIVYDACRMIRERIAEAQQGNPSEFGLFLADEDPKK
GVWLEQGRSLEYYLLRNGDLLEYRKKHRILKVRTLDGALKTLQVDDSHTVGGLMVTICTR
MGITNHEEYSLVRELAEDEKEKTLTLKRDKSIAKDQKKLEEMKKKLHTDDDMNWLDHSKT
LREQGIDQNEVLLLRRKFFFSDQNVDARDPIQLNLLYVQSRDAILNGTHPVSLEEAIMFG
GIQCQVQFGDHVDSKHKSGFLDLKEFLPKEYLKVKGAEKKIFQEHKKHVGLTEIEAKVKY
THQCRSLKTYGITFFLVKEKLKGKNKLVPRLLGITKESVVRVDEKTKEIMKTWPLTTVRR
WAASPNSFTLDFGDYSDTYYSVQTTEGEQISQLIAGYIDIILGKKKAKDHLGIDGDDNSM
MLEDNVAPAKATIIQHNTSKVSHASSGNVAIPAVIRDGGQGESQYGVGSMQSTQYTQVSN
QAISGHSAAHRLSKAQKALLITIEEGLSSVNAAQSQLEHQADLPTLGSDPASKKWREDAL
DVSRQKVGSQLSAMNAATAQLVTLTSGNQDEIDYTAVGSAVNQISSNLNEFSGDVRMLAA
LQEDNGNKLMNAARRLAGAFSDLLQAAQPGSKEPRLNLLAAAGKIGEASQDVMDNVGETT
EDMDKAYQDTLLALAKAVANATAALVLKAKTVANKTEDPGLQNKVISSATQCALATSQLV
ACTKVVAPTIGHPACQEQLIEAAKLVAKSVEGIVEAAQGACRDDYVLQDLGGAATQVTKA
LNDLLQHIKKAAGPTKATEVHEEAVDQIITTTDKLFSSVGDAHEMVKNARLLAQATSQLV
TAIRGQAESHPDSDVQKRLLAAAKQLADATANLVEAAKGCASSPNDSNQQMMLRSAAEEL
RSATNTAASNALKKKLVKRLENAARQAVSASTQLINSSKQANKTNRNAASQQQLAAQCQV
VDEEIPNLVQSIKGAQRHYDSASAQLGLINSSQEFIQPCSRLMAQANSAAPTVTDQSSVL
TLNNNIKAMATALAELRTSAAKAAEACHSLEVDSALDQLHALDKELDDVQRSAESGNLLP
LPGETAESAALQLGATSKTVASSMSQLLTAAAQGNEDYVGIASRDTANALKVLTSAVRGV
AATTNDQQIQRNIIGSAHDVMDKSIRLLEEAKSALENPNSPENSQRLTQVAKSVATALSN
CINCLPGQRDVDNAIQQITASSQMLANPSFPGTNKTYPEVQTDMNNSAVNLNQAASDIVT
ASRGATSQLATSSNRYSECYQQFVHNGLTMAGLTKDYETQNQIVGGLKSVSMVSSKLLLA
AKSVSADPNAPNAKNLLAQAARAVTESINHLINICTVSAPGQKECDNALRQIQMMRNVLD
NPNEPVSDQTYFDCLESVMERSKALGDAMTGISNHAKRNDIDDFCDSVRNFANSVCGLTE
ASAQAAYLVGIADPASEPGRPGIVDQSQFSRANQAIQMACQNLTNPASSQQQVLSAATVV
AKHTSALCNACRVASSKTSNPVAKRHFVQSAKDVANSTANLVKAIKALDQDFTDQNRQKC
AEAARPLVEAVEELTTFASSPEFASKPAKISPKARQAQEPITHAGKGMIDGASSMLQAAK
QLAVNPKDPPTYQMYSHHSKSVSDSIKQLVSSIKESAPGQRECDDGIEKINQVIRQLDQA
SLAAISQNLAPQNEKSLKAFQEQLINSAREILEKIDFVRNAAKREPENLGHLSTTIASYF
EPLAYSAIGTASRNLNSKQQMNILDLTKTVAESALQFLYASKEGGGNQKATHAHQPIDNA
ADDMKDVLIDLLQTMEEAASQTGVVSSMIDSISKSIAKIDERVAVGEKASFVDYQTEMVR
LAKQIARSAQDMTGKSTTDVSELGHLANQMTRDYSQLVSNSRGAVSSTTNVDVSHRIQST
VQDLGKSLIEIVQDAGNLQMNPSDTYAQKDLSDHARSISEKVSFILAALQAGSRGTQACI
NASSTVSGIIGDLDTTIMFATAGTLNPEGDESFADHRESILKTAKALVEDTKTLVAGAAS
NQEQLASAAQQAVKTITRLADVVKFGAGSLGSEQPEAQVLLINAVKDVASALSDLISATK
NASGKDAHDPAMHHLKDSAKVMVTNVTSLLKTVKTVEDEAVRGTRALESTVEAINQEIKA
YDTTDTFGKKASAEDLIRYTKPITAATAKAVAAANSMKQEDIIAASNMGRKAIMDLLHNC
KAAAATAETAEIRQRAINAGRMCGTAYKELLEYVHVALAKPSQESRQNLSMVSRKVANAV
TELIQSAEAIKGQEWVDPDDPTVIAENELLGAANSIEAAAKKLASLKPRQAARQADENLN
FEEQILDAAKCIAAATAALVKSASAAQRELVAQGKVGSTFHRHTLDEDGQWSQGLISAAK
MVAAATHSLCESANAMVQGHATEEKLIASAKQVAGSTAQLLMACKVKADPGSVAMQRLQA
AGNAVKRATEALVRSAQQAQDYVDDTSVTVDKRLVGGIARDIMAQEEVLRKEKELADARK
KLALVRRERYKDRPDEYDSSSSF
NT seq
7632 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacgctatcgctgaagatcagcgttgttcaaagcaatgcagtaaaaactatgcaa
ttcgaaccctcaactattgtttatgatgcttgtcgtatgattagagagaggattgctgaa
gcacaacaaggaaatccctcagaatttggtttgtttttggctgatgaagatcctaagaaa
ggagtatggctggaacaaggaagaagcttagagtattatctcctcagaaatggagatttg
ttggaatacagaaagaaacatcgtatattaaaagtaagaacattggatggagctttaaaa
acattacaagtagatgacagccatactgttggtggtttaatggttactatttgtaccaga
atgggtataacaaaccatgaggagtattcattagtaagagaattagctgaagatgaaaaa
gagaaaactttaacattgaaacgtgacaaatctattgctaaagatcagaagaaacttgaa
gaaatgaaaaagaaactacacactgatgacgatatgaactggttggatcattctaaaact
ttacgagaacaaggaatagaccagaatgaagttttattgttgagacgaaagtttttcttc
tctgatcaaaatgtagatgctcgagatcctattcagttgaatttactctatgtacaatct
cgagatgctattttgaatggcactcatcctgtaagtcttgaagaagctataatgtttggt
ggtattcagtgtcaagtacagtttggtgaccatgttgattcgaaacataaatcaggattt
ttagatttgaaagaatttcttcctaaagaatatttaaaagtgaaaggagctgaaaagaag
atatttcaggaacacaagaaacatgttggattaacagaaattgaagctaaagtaaaatat
acacaccaatgtcgttcattaaaaacatatggtataacattctttttggtcaaggaaaaa
ctaaaaggaaagaataaattagtacctagattattaggtattactaaagaaagtgttgtt
cgtgttgatgaaaaaaccaaagagatcatgaaaacctggccattaactacagtcagaaga
tgggctgcttcaccaaacagttttacattagattttggcgattattctgatacatattat
tctgtacaaacaacagagggtgaacaaatttctcaacttattgctggttatattgatatt
atattgggcaagaaaaaggccaaagatcatcttggtattgatggtgatgataattctatg
atgttagaagataatgtagcaccagctaaggctaccattatccaacataatacatctaaa
gtgagccacgctagtagtggtaatgtggctataccagctgttataagagatggtggacaa
ggggaatcacagtatggtgttggttccatgcaatcaacacaatatacacaggtgtcaaat
caagctattagtggacattctgctgctcacagattgagtaaagcccagaaagcattattg
attactattgaagaaggtttatcatcagttaatgctgcccagtcacaacttgaacatcag
gcagatttacctacccttggttctgatcctgcatccaagaaatggagagaagatgcatta
gatgtatcaagacagaaggttggaagtcagttgtctgctatgaatgctgctacagcacag
ttagttacattgacgtctggtaatcaagatgaaatagattatactgctgttggttcagct
gtcaatcaaatttcatccaatctaaatgagtttagtggtgatgtgcgtatgttagccgct
ctacaagaagataatggtaataaattgatgaatgcagcaagacgtttggccggtgctttc
agtgatttactacaagcagcacaacctggctctaaagagccaagattgaacctattagct
gctgctggtaagattggtgaagccagtcaagatgtcatggataatgttggtgaaacaaca
gaagatatggacaaagcttaccaggatactttgttagctcttgctaaagctgttgctaat
gctactgcggcattagtccttaaagctaaaactgtagctaataaaacagaagatccaggt
ttacagaataaagttattagttctgctacacaatgtgctctagctacttcacagcttgta
gcttgtacaaaggttgtagcaccaactataggtcatccagcctgccaggaacagcttatt
gaagctgccaaactagtagctaaatctgtagaaggtattgtagaagctgctcaaggagct
tgcagagatgattatgttttacaagatctcggcggtgctgctacacaagttaccaaagct
ctcaatgacttgttgcaacacatcaagaaagctgctggacctacaaaggctacagaagta
cacgaagaagctgttgatcagattattacaaccactgataaattatttagtagtgttggt
gatgctcatgagatggtcaaaaacgctagacttttggctcaggctacttcacaattagta
actgctattagaggtcaagctgaatctcatcctgattctgatgtacagaagagactatta
gctgctgctaaacaattagctgatgccactgctaacctcgtggaagctgctaagggatgt
gcttccagtcctaatgactccaaccaacagatgatgttaagatctgcagctgaagaatta
agatctgctaccaatacagctgctagtaatgctttgaagaagaaactagtgaaacgttta
gagaatgctgcacgtcaagctgtatcagcctccacccagctgattaattcatcaaaacaa
gctaataaaactaatcgtaatgctgcctcacaacaacaactagcagctcaatgtcaagtg
gtagatgaagaaatacctaatctggtacagagtattaaaggtgcacagagacattatgat
agtgcttcagcacaacttggtctgattaactctagtcaggaattcatacagccctgtagt
agattgatggcccaagctaattcagcagctcctacagttacagatcagtcctctgtttta
acattgaataataatattaaagctatggctacagcactagctgaactgagaacttctgca
gccaaggcagctgaagcttgtcattcattagaagttgacagtgctttagatcaactccat
gctttagataaagagttagatgatgtccaaagatcagcagaaagtggtaatttattacct
ctaccaggagagacagctgaaagtgctgctttacaacttggtgctacatctaaaacagta
gcttcatccatgtcacaacttcttactgctgcagctcagggtaatgaagattatgttggt
attgccagtagagatacagctaatgctcttaaagttttaacatctgctgtacgaggtgta
gcagctactactaatgatcaacaaatacaacgtaatattattggtagtgctcatgatgtc
atggataaatctatcagattgttggaagaagctaagtctgcgttagagaaccctaatagt
cctgaaaatagtcaacgtttaacacaggttgccaagtcagtagctacagctctctctaac
tgtattaattgtttaccaggacagagagatgttgataatgctatacaacaaataacagct
agcagtcaaatgttagctaatccatcgttccctggtaccaacaagacctatcctgaagta
cagactgatatgaataattctgcagtcaatctgaatcaagctgccagtgatatagtgaca
gcatctagaggagccacaagccaactggctacatcttctaatagatatagtgaatgttac
caacaatttgtacataatggtctgaccatggcaggattaaccaaagattatgaaacacag
aatcaaatagttggtggattaaagagtgtgtctatggtatctagtaaattattattagca
gctaaatcagtttcagctgatcctaatgcacctaatgctaaaaatcttctagcacaagct
gccagagctgtaacagagagtataaaccacctaattaatatctgtacagtatcagcacca
ggacagaaagaatgtgataatgctttacgtcaaatacagatgatgagaaatgtattagat
aatcctaatgaaccagtcagtgatcagacatatttcgattgtttagaaagtgttatggaa
cgttcaaaggcacttggtgatgctatgactggtatatctaaccatgctaaaagaaatgat
attgatgatttctgcgactctgttagaaatttcgctaattctgtttgtggcttaactgaa
gcttctgctcaggctgcatatctagtaggaatagctgaccctgcctctgaaccaggtaga
cctggtattgttgatcagtcccagttttcacgagctaatcaggctatacagatggcttgt
caaaaccttaccaatccagccagttctcaacaacaggttttatctgctgccacagttgtc
gctaaacacacgtctgccttatgtaatgcatgtagagttgcctcctccaaaacctccaat
ccagtcgcgaaacgtcattttgtacagagtgcaaaggatgttgctaacagcactgctaat
ctagtcaaagccatcaaagcattggaccaagattttacagaccaaaaccgtcagaaatgt
gcagaagctgctcgacctttagttgaagcagtagaagaattaaccactttcgcttcttca
ccagaatttgccagtaaaccagcaaaaattagccccaaagcacgacaagcacaagaacct
atcacccatgctggtaaaggaatgattgatggtgctagtagtatgttacaagctgctaaa
caactagctgttaaccctaaagatccaccaacatatcaaatgtattcacatcattcaaaa
tctgtatcagactctatcaaacaattagttagttctatcaaggaatctgcaccaggtcag
agagaatgtgatgatggtattgagaagattaatcaggttatacgacaattagatcaagct
tcattagctgctatcagtcagaatttagctccacagaatgaaaaatcactgaaggccttc
caagaacaattgataaacagtgcaagagagatattggagaagatagactttgttagaaat
gctgcaaagagagaacctgaaaaccttggccatcttagtaccacaatagcctcatatttt
gaaccactagcctacagtgcaataggaaccgcctccaggaatttgaattctaaacaacaa
atgaatatattagatttaactaagactgtagcagaatcagctctacaatttttatatgct
tctaaagaaggcggtggtaatcaaaaggcaacacatgcacatcaacctattgacaatgct
gctgatgatatgaaagatgtgttaattgatttattacaaactatggaagaagctgcctca
caaactggggttgtttccagcatgattgatagtatatcaaaatctattgccaagattgat
gagagagttgcagtaggagagaaagcatcctttgttgattatcaaaccgaaatggtgaga
ctagctaaacaaatagctagatctgcacaagatatgactggtaaatcaactaccgatgtc
agtgaattaggacatctagctaatcaaatgacaagagattacagtcagttagttagtaat
tctagaggtgctgtatcttctaccactaatgttgatgtatctcatagaattcaatcaaca
gtacaagacttaggtaaaagtttaatagagattgtacaagatgctggtaatttacagatg
aacccatcagatacctacgcacagaaagatctatcagatcatgctagatcgatctcagaa
aaggtgtcatttattctggctgccttacaagctggttctcgtggtacccaggcctgtatc
aatgctagtagtactgttagtggtattattggtgacttggatacaactattatgtttgct
acagccggtacactcaatcctgaaggagatgaatcttttgctgatcatagagagagtata
ttaaagacagccaaggcattagtagaagatactaaaacattagtagctggtgctgcttct
aaccaagaacaactagcatctgctgcccaacaagctgttaaaactatcactagactagct
gatgttgttaaatttggagctggttctcttggttcagaacaacctgaagctcaggtgtta
ttgataaatgcagtcaaggatgtggcgtctgccttatctgatttgattagtgcaaccaaa
aatgcatcaggaaaagatgcacatgatccagccatgcaccatctcaaagattcagctaag
gttatggtaaccaatgtaacatcattattaaaaactgttaaaacggtagaagatgaagct
gttcgaggaaccagagctttggaatcaactgtagaggctatcaatcaagaaatcaaggcg
tatgatactactgatacctttggtaagaaagcatctgctgaagatctgatcagatatact
aaacctatcacagcagcaactgctaaagctgtagcagctgctaatagtatgaaacaagaa
gatattattgctgcttctaatatgggaagaaaagctatcatggatctcttacataattgt
aaagcggctgcagctacagcagaaacagctgaaatacgccagcgagctatcaatgctggt
agaatgtgtggtacagcttataaagaactattagaatatgttcacgtggcactggctaaa
ccttctcaagaaagtcgacagaacctatctatggtatcaagaaaagttgccaatgctgtc
acagaattgattcagtcagctgaagctatcaaaggtcaagaatgggtagatcctgatgat
cctacagttatagctgaaaatgaattgttgggtgctgctaactctatagaagctgcagct
aagaagttagccagtttgaaaccaagacaagctgctagacaagcagatgaaaatttgaat
tttgaagaacaaattttagatgctgcaaaatgtattgcagctgcaacagctgctcttgtc
aagtctgcttctgctgcacaaagggaattggttgcacaaggaaaggttggatctacgttc
caccgtcataccttagatgaagatggtcaatggtcacaaggtctaatctcagctgcaaaa
atggtagcagcagctacacatagtttgtgtgaatctgctaatgctatggtacaaggtcat
gctactgaagagaaactaatagcatcagctaaacaggtagctggttctactgcccagtta
ttgatggcttgtaaagtgaaagctgacccaggatctgttgctatgcagagattacaggct
gctggtaatgctgttaaaagagcaacagaggctttagtaagatctgcccaacaagcacaa
gattatgttgatgatacaagtgttactgttgataaacgtctagttggtggtattgctagg
gacataatggcacaagaagaagttctgagaaaggaaaaagaattagctgatgcaagaaag
aaattagcgttggtccgtcgagaacgatataaagatagaccagacgaatatgattcatcc
tcatcattttaa
DBGET
integrated database retrieval system