KEGG   Leptotrichia hofstadii: JCM16775_1198
Entry
JCM16775_1198     CDS       T06149                                 
Name
(GenBank) autotransporter beta-domain protein
Organism
lhf  Leptotrichia hofstadii
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter
Other DBs
NCBI-ProteinID: BBM38489
UniProt: A0A510JGN9
LinkDB
Position
1243282..1249236
AA seq 1984 aa
MANDLQSLRKGLKSFAKRCKDFKYTESALLTFLLCGTIVSNNLFSAEVKKQTSVGSNTQA
LNNFVKNEKLKIKTSRSRHKKLLNGLNLELIELMEQGEHVTKSPWSSWQFAINEFSNDWN
GTYKGRGDKTGGFIYAREVGKAKYTQKTNNNRYGTTRLNLIDTAEPKVPIHMNASINPRV
LTKGRITPPDKTVNVPTLPETVEFTPVSPSIPTITPSTITITPITLSAIWNSSGLDTVGL
NRDVTTPGSYDLLPTTKARNQTDPGGKNWNGARIAETIMDIGGTPGKGFTIAAGVTINIK
RDGTRAAVIDAGNWGLSTLQTTSVTNNGKINLYNQTTAGLEVQGNPLVGDFSLINNGEII
GHGSKQVALTLTPEQPNAHGSIQTLKNNTKIDMAGSQSVGLNIVNRKLYRSRENAALNTI
YPGGFYNDLKTVAINSSGAEITLGGTNSYGIAFGALGHDSQLTEGSVFQNSGDINVNNDS
SGGIAVKAAKYWVDVSGKDKTFTATDTISATLENTSTGKITVKGTNSFGIYSEEINGTNH
GAINIEGSKDYSIALRANKTGTVIPTLTNNGTVSISSTGKENIGFYTKNAKVVNNAGKTV
SITAGQNIGMAVYGTSKTDYGEGTNAGTITANSAGSIGVITSNYGKVTNTGTIGVTGGNT
SDNNKGTVAVIVGKNSTIDSSNGTINATVTDNKSIGVYSDGTLKLGTGTISADVGAINYF
ADNNGEIEVVSGKTSTATTGQKSLLFYNGTNGTGKVKISGTLNATVAGGTDATNRGTAFY
YVPSTTSATGSAVGYNNTVNYGAFGASDISGYFATTFSGTIANLNLTMQNDSRLFLASKV
KMNLSDTNISSVPGGPTITGSNYKNFMLYLSEVKVDNAVDLDNATDLYNTLEISNSSIIN
QNKISGNDDGRVAMAQENKTVSKPAVTLMNDTAGTIELNGKNALAIYAKYGNVVNRGQIT
LTGKDSTGLYGVENSKVINESTGKITLDGESGAAMYYTNTSATKLTSEIMQNDGTIDGES
DSSIGMIYDAGKLDASVSSGTATLVKNTGTISLTGDKNVGIFTKPDTLNKGYVTENSGNI
ILTGDSATLSNPNVGIYTTGKNNTIKTNAGSKIETGAKTVGIFGYAVENSGDITVGSGGV
AIYSQNGDIALSDGTIKTGNDEAVGLYLVGENQNAHVNVNAKFDLGDNSFGIVNANATGN
NYITSSATSVGLGSRSVYAYSADKLGVIANYTDISTKNATSRENFGIYSSGRVDNHGNIN
FENGIGNVGIYVTGTDGKAFNLNGGTITISKSDVVGNNYSIGMAAKNGAVAENEGIINVT
GDNGIGMYASGPGSKVINKATGVINLSGDSTIGMYLDDYAVGENYGTIQTTPNSTGEGIM
GVYVLNNAVIKNYGTIRINAVDGIGVYVGKDASLEGNTSTNDINATGTDSEHIYRTSGTD
TSKGVKGIRFSLPHLGSLTADVIRNDVNVTPTLVDTDIATPSPNYVHLAAGDINLNTFDP
LFTQNNGGGSSIGMYVDTSGVRYTNPIQGLENLTRLRKINLIFGIEATQYTDSKDIQIGN
NIIAPYNAAIMSVSHVNPAAKWEIFSSSLLWIATATQNPDQTIANVYLSKIPFNSFAEDG
DIDNYNFLTGLEEKEALKDVTERKIFNKLNGLGKGEAHILAQAVDEMKGHQYSNIQQRIY
ETGNTLSKEFKYLQEEWRNPSKQSNKIKAFGNKGELKTNTAGVIDYTNNAYGVAYVHEDE
AIKLGNSSGWYAGVANNQFKLKDIGHSRENQTMIKAGIFKTMAPKQDHNGSLTWRISVET
FAGRGNMKRKYWVVDDTYEAKGDYNIYGVALKNEIGKTIRTTEKTSIRPYGLLNMEYGKY
SNIKESGPMALEIKGNDYFSVKPEAGLAFNFKQTLGARSNLKINVTAAYENELGKLNNVQ
NKARFRGTQSEYYNLHGDKENRKGNGKFDLNLGWDNTLFGITVNAGYDTTGKNFRSGIGF
RAIY
NT seq 5955 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcaaatgatttacagagtttacggaaaggattaaaaagctttgcgaaaaggtgtaag
gattttaagtatacagaatctgcattacttacgtttttattatgcgggacaatagtgtca
aataatttattttcggctgaagttaagaaacagacaagtgttggaagtaatacacaagca
ttgaataattttgttaaaaatgaaaaattgaaaataaaaacatcgaggtcaagacataaa
aaactattaaatggattgaatttagaattaattgagcttatggaacaaggggaacatgta
acaaaaagtccatggagcagctggcaatttgcaataaatgaattttctaatgattggaat
ggaacttataaaggtcgtggagataaaacaggaggatttatttatgctagagaagtagga
aaagcaaaatatactcaaaaaacgaataacaatcgttatggaacaacaagattaaattta
atagatacggctgaaccaaaagtaccaatacatatgaatgcttcgataaatccaagagtt
ctaacaaaaggacggataacaccacctgataaaacagtgaatgttccgactttaccagaa
actgttgaatttacaccagttagtccaagtattccgacaataactccgtcaacaattaca
atcacaccgattacattatcagcaatttggaatagtagtggattggatactgtaggattg
aatagagatgtaacaactcctggtagttatgatttacttccgactacaaaagcaaggaat
cagacggatcctggtgggaagaattggaatggagcaagaatagcagaaacaattatggat
ataggaggtactccaggaaaaggctttactattgctgcaggggtaactataaacataaaa
agagatggaacaagagctgcggttattgatgcaggaaattggggactaagtacactacaa
acaacatcagtaactaataatggaaaaattaatctttataatcaaactactgcaggtcta
gaggtacaaggtaatccactagttggtgatttttcattgataaataatggagaaataatc
ggacatgggagtaagcaagtcgctttaacattgacaccagagcaaccaaatgcacacgga
agtattcaaactttgaaaaataatactaaaattgatatggctggaagtcagtcggtagga
ttaaatattgttaatcgaaaactttatcgaagtagagagaatgcagcattaaatacaatt
tatccaggtggtttttataatgatttaaaaacagtagcaataaatagcagtggtgctgaa
ataacacttggtggaacaaatagttatggtattgcttttggagcattgggtcatgatagt
caattaactgaaggctcagtatttcaaaattcaggagatataaatgttaataatgatagt
tcaggtggaattgctgtaaaagctgctaaatattgggttgatgtttcaggaaaagataaa
acatttacggcgacagatactatttctgcaacgcttgaaaatacttctactggaaaaatt
actgtaaaaggaacaaattcatttggaatttattctgaagagataaatggaacaaatcat
ggagctataaatatagaaggcagtaaagattactcaatagctcttcgtgcgaataaaact
ggaactgtgataccaacattaactaacaatggtacagtttctatttcaagtactggaaag
gaaaatattggtttttatacgaagaatgcgaaagttgttaataacgctgggaaaacagtc
agtataactgctggtcaaaatattggaatggcggtttatgggactagtaagactgattat
ggagaaggaactaatgctggaacgattacagctaattcggctggatctattggagttata
acttctaattatgggaaagtaacaaatacaggaactataggtgttactggtggaaatacg
tcagataataacaaaggtactgttgcggtaattgttgggaaaaattcaacgattgatagt
agtaatggaacgattaatgcaactgtaactgataacaaatctattggggtttattctgat
ggaacattaaaattaggtactggaacgatttcggctgatgtaggagcgattaactatttt
gctgataataatggagaaattgaagttgtaagtggaaaaacatctacagctacgactgga
caaaaatcgctattattttacaatggtacaaatggaactgggaaagttaaaataagtggg
actttgaatgcaacagttgctggtgggacagatgcaactaatagagggactgcattttac
tatgtaccaagtacgacttcagctactggaagtgcggttggatataataatactgtaaat
tacggtgcttttggagcttctgatattagtggttattttgctactacttttagtggaaca
attgcaaatcttaatttaacaatgcaaaatgattcaagattgtttttagcttcaaaagtt
aagatgaatttaagtgatacgaatatttcatctgtgcctggtggtccaactataacagga
agtaactataaaaatttcatgctttatttaagtgaagttaaagtagacaatgcagttgat
cttgataatgctacagatctgtataatactttggaaatttctaattcatcaataattaac
caaaacaagataagcggaaatgatgacggtcgtgttgcaatggctcaagaaaataaaaca
gtatcaaaaccagcagtaactctaatgaatgacacagcaggaacgattgaactaaatggg
aaaaatgcgcttgcaatttatgcgaaatacggaaatgtagttaatagagggcaaattacg
ctaactggaaaggattcgacaggactttacggtgttgaaaactcaaaagtaattaatgaa
tcaactggaaaaattacattagacggtgaatctggagctgcaatgtactatacaaataca
tctgcaactaaattaacttctgaaataatgcaaaatgatggaacaattgatggagaaagt
gattcttcaatcggaatgatttacgatgcaggaaaattagatgcgtcagtttcaagtgga
acagcaacattagtaaaaaatacaggaacaatctcactaacaggagataaaaatgtagga
atctttacaaaaccagatacattaaacaaagggtatgtaactgaaaatagtggaaatatt
atattaacaggagattctgcaacattaagtaatccaaatgttggaatttatacaaccgga
aaaaacaatacaattaaaacgaatgcaggctctaaaattgagacaggagcgaaaacagtt
ggaatatttggatatgcagtggaaaactctggagatataacagttggaagtggcggagtt
gcaatttattcacaaaatggtgatattgcattaagtgatggaacgataaaaactggaaat
gatgaggctgtaggactttatttggtgggagaaaatcaaaatgctcatgtcaatgtcaat
gcaaaatttgatcttggagataattcatttggaattgtaaatgccaacgcaactggaaat
aactatattacgagtagtgcgacaagtgttggattaggaagtagatctgtttacgcatac
tcagctgataaacttggagtaattgccaattacacagatattagtacaaaaaatgcaaca
agtagagaaaactttggtatttattcatcaggaagagttgataatcatggaaatattaac
tttgagaacggtattggaaatgtcggaatttatgtaactggaacagatgggaaagccttt
aacttaaatggtggaacaataacaataagtaaatctgatgttgttggaaacaattattca
ataggaatggcagctaaaaatggtgcagttgctgaaaatgaaggaataatcaatgttaca
ggtgacaatggaattggaatgtatgcaagtgggcctggttctaaagttataaataaggca
actggagtaataaacttatctggagatagcacaatcggaatgtatcttgatgattatgca
gttggagaaaattatggaacgattcaaactactccaaattctacaggtgaaggaattatg
ggagtttatgtccttaataatgcagttattaaaaactacggtacaatcagaattaatgca
gttgatggaattggagtatatgttggaaaagatgcaagtttagaaggaaatacatcaaca
aatgatattaacgccacaggaactgattcagaacatatttacagaacgagtggaactgat
acttcaaaaggtgttaaaggaataagatttagtttgcctcatttaggctcattaacagcc
gatgtaattagaaatgatgtaaatgtaactccaacattagtcgacacagatatagcgaca
ccttctccaaattatgttcatttagcagcaggagatattaatttgaatacttttgatcca
ttgtttactcaaaataacggtggaggttcaagtattggaatgtatgtagatacttctggt
gtaagatacactaatccaattcaagggttagaaaatctaacaagattgagaaaaataaac
ttaatttttggaatagaagcaacgcagtatactgactctaaagatatacaaattggaaat
aacattatagcaccttataatgcagcaataatgagtgtcagccatgtaaatccagctgca
aaatgggaaattttttcaagtagtttattatggatagcaactgcaacacaaaatccagat
caaacaattgcaaatgtatatctatcaaaaataccatttaattcatttgcagaagatgga
gatatagataactataatttcctaacaggtttagaagaaaaagaagctttaaaagatgtt
acagaaagaaagatattcaataaattaaatggattaggaaaaggagaggcccacatctta
gcacaagcagttgacgaaatgaaagggcaccaatattcaaatattcaacaaagaatatac
gaaacaggaaatactttaagtaaagagtttaagtatttacaagaagaatggagaaatcct
tcaaaacaaagtaataaaataaaagcctttggaaataaaggagaattaaaaactaataca
gcaggagtaattgactatacaaataatgcttatggtgtagcatatgttcacgaagatgaa
gcaattaaacttggaaattcaagtggatggtatgcgggagtggcaaacaaccaattcaag
ttaaaagacataggacattcacgtgaaaatcaaacaatgataaaagcaggaatatttaaa
acaatggcaccaaaacaagatcacaacggttcattaacttggagaatttccgtagaaaca
tttgcaggacgtggaaatatgaagcgtaagtactgggttgtagacgatacttatgaagct
aaaggtgattacaacatttacggagtcgcattaaaaaatgaaattggaaaaacgatcaga
acaactgaaaaaacaagtataagaccatatggattattaaatatggaatacggaaaatac
tcaaacattaaagaatctggtccaatggcacttgaaataaaaggaaacgattatttttca
gtaaaaccagaagcaggacttgcatttaacttcaaacaaacactaggagcaagaagtaat
ctaaaaataaacgtaacagcagcctatgaaaatgaattaggaaaattaaacaatgttcaa
aacaaagctagatttagagggacacaatcagaatactacaatcttcacggagataaagaa
aatcgaaaaggaaatggtaaatttgatttaaatttaggatgggataacacattgtttgga
attacagttaatgctggatatgatacgactgggaagaattttagaagtggaataggattt
agagcaatttattaa

DBGET integrated database retrieval system