Paucilactobacillus hokkaidonensis: LOOC260_107390
Help
Entry
LOOC260_107390 CDS
T03598
Name
(GenBank) vitamin-B12 independent methionine synthase
Organism
lho
Paucilactobacillus hokkaidonensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Meth_synt_2
Meth_synt_1
TetR_C_27
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP85279
UniProt:
A0A0A1GW66
LinkDB
All DBs
Position
753492..754613
Genome browser
AA seq
373 aa
AA seq
DB search
MTTKTKIGPFKYDIVGSFLRTPELKDAIAKHRAGELTDAQFIEIQHAEIKKLVEIETQHG
LKAVTDGEFSRSWWHLDFLWGLKGVKKYDYRESYKFHGAKTRTDNAELNGKVAYNPDHPF
FAAFEYLNSVTPQGVVPKQTIPSPTMLFRDNRSDNWPNFYDNREDYLHDLASAYHQTILH
FYELGARYIQIDDTTWAFLISKLNETKDQPEVHAKYETLAQEAVEVINELLQNLPDDLTV
TTHVCRGNFKSTFLFSGGYEAVAKYLGQLNYDGFFLEYDNDRDGDFAPLATIFNGRKDKT
IVLGLLTSKDGQLEDPDAVIKRINEATQFVPLENLALSTQCGFASTEEGNVLTADEQWGK
IDLVKEISNKVWK
NT seq
1122 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaacaaaaacaaaaattggaccattcaaatacgatattgtggggagtttcctacgt
actcctgaattaaaagatgcgattgcgaaacaccgggcaggggaattaaccgatgcccaa
tttatcgagatccagcatgcagagattaaaaaactagtagaaattgaaacacagcatggg
ctaaaggccgtgacagatggtgaatttagtcgtagttggtggcatttagattttttatgg
ggcctaaagggtgttaaaaaatatgactatcgtgaaagctataagttccacggtgctaaa
acacgaactgataatgctgagctaaatggtaaagtggcatacaatccagatcatccattc
tttgctgcatttgagtatcttaattcagtgacgccacaaggagtggttcctaaacaaaca
attccttcaccaacaatgttgttcagagataatcggtctgataattggcctaatttttac
gataaccgggaagattatctccatgatttagctagtgcatatcatcaaaccattttgcat
ttttacgaattgggagcccgctacatccaaattgacgatacaacgtgggcgttcttaatt
agcaaattaaacgaaactaaagatcaacctgaggtacatgctaagtacgaaacattagca
caagaagcggttgaagtgattaatgaattattgcaaaacctacctgatgatttgacagtg
acgacacatgtttgtcggggtaactttaaatcaacattcttattctcaggtggctatgaa
gctgttgccaaatatttaggacagttgaactatgatggctttttcctagaatatgataat
gatcgcgacggcgattttgctccattagcaacgatttttaatggtcgtaaagacaaaaca
attgttttgggattgttaacttctaaggatggacaattagaagatccggatgctgtgatt
aaacgaatcaatgaagcaacacagtttgtcccattggaaaacttggccttgtcaacacag
tgtggctttgcttctaccgaagaggggaatgtgctaactgctgacgaacagtggggtaag
attgatttggttaaagagatttcgaataaggtttggaaataa
DBGET
integrated database retrieval system