Lactobacillus intestinalis: KBW87_08415
Help
Entry
KBW87_08415 CDS
T08339
Name
(GenBank) YSIRK-type signal peptide-containing protein
Organism
liq
Lactobacillus intestinalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Muc_B2
MucBP_2
YSIRK_signal
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTW41136
LinkDB
All DBs
Position
unnamed2:complement(58380..65414)
Genome browser
AA seq
2344 aa
AA seq
DB search
MIPKNNIKERIRKMDSQREHHAIRKLTTGAASVLIGLTFMGTTGRSVKAATGNENSEAGI
ELEVKANNTDTSQLEAVSQETTQNNPTSEVTTEMPVAENTKAQTTDQAVTQNDTATETPA
QNAQNEATTSHAAETTAPVASQTENNTEVATETAPVQNTETVESQATKNTNSVENQTNTV
TTAENNNQVESQPQNNVNTENITVDNSTNEQQVAEKVENSTEAKDSNASTIETQTTEKAE
TTPEVPAPSAPKADTEVSDKVVNLGETGDKELTTDDKVKDPNKDKEADKVENDNIIDLNA
ADTEGKVVISATDPNNYPTDAGKLVGDDKYIYQIVTLNDTSSRLVLAINRNDHNDESIYA
YVTNSNYSSASQTFEIKVGNNRVITVGNHKYQINNTGKSDVTIDNGNGTTTKVPTENTST
ITGQPGWIDTDTISPIYGLGNTTNNNYTALGEIIPVYTENSVIKYYYKDSEGKLHEIEGS
DQYPNIIVSGLTGQEFEIKNVDQFKQIINGYYLIPDNFPSGDFKGTLSQFKEGEYYKKVY
YEYGSSNVEFYVVYNQISPDGTMRISLFDGDKTTAVESHVVAPGQAVQFSNYNYLGRNPF
VTSTPHEVQFIYSQLGSIIPVDEQGNVLGPSVQFNNGSDAFSAGATKAPEILGYTLKYQE
QAVITPTGDLSKDIYVVYVPNNASAEVIFQDVTTGTPVVLDTLTTNGSHGYDISFTTNPL
DMIKEFENKGYVLVSNGYGEGGHKFDSTNPQSFLITFKHGVFEITPENPGKPDQPINPDD
PAPNRPTYPADSDKLTTTITQTIKYVYSNGLTAAPDSVQTITFTAKAYIDKVTGEYVLVD
NQGNIIGKADGLTWNADSDTFGEVISPTIPNYTADKTSIPTMTVNRDDNNITITVTYTRT
AQKAEFVFQDITDNKEISSNTVEGEFDREINFNPQTVIDQLISQGYELVNNPFVVGTKFK
DGEVNPNANKFIITLKHGIEEVTREETVDRVIHYVYQDGSTAKPSITQTATFVGTGTRDK
VTGQEILTWSENVILSEVTSPTISGYTPNRLTVSEVEVSHDSSDIEETVTYIAGEQTAEI
YYVDIFNSNDPLQLGSDSVIGKFGEEINFNLDPANIIKLYESQGYKLVSNSFTPGTKYGN
SEENPDVNVFYVYFTHATKEDTTTVQVSQTINYKYEDGTTARPSNVQTITFTGTGLIDVV
TGKLIGDYTWTTDKNYFDAVKSPDIINYTPTIKVVGQSDVITHEDTNRVIDVIYAANIQQ
ATITYIDKTTGQTIKVDSVEGKYKDKINYSTQSVIDELVNKGYVLVSDGFSPDAIFTEGP
NKFWVYLEHGIKDADEQTATTNRVIHYVYADGSTARPSVIQTITYKGTGKIDAVTGELIG
SYTWTTGSYDEVESPKIQGYSPDILIVESVADVQHTAGNSEVQVTYIANKQSAQITFIDV
TDNKVISSSEAVGNYGDKIIFTDNPEELIKQLEAQGYVLVSKSYEGDFNHSFSHDNDNNI
FEVRVKHGTESVTDHKTITQTIKYQYENGTMAAQDHVVTLTFTGQGMIDKITGKYVIVNA
NGDVIGEASGLTWTADNGDTFARVDSPTISGYGPNKLFVEEMVVNQDSNDIVEVITYYAG
EQTAEITYIDETTGEILSVDSVLGKLGEDINFTTAPSKVIEQLLASGYELVSNNFTQGTK
YGNSEENPNVNIFEVRVKHGVIHVNPENPGKPDTPINPDDPNSPVYPTDSIILDKDVERV
IEYVFADGTTAAPSVVQVVKFQGSGYIDKVTGKYITVDQDGKIILDENGKPVEGKLTWVP
VSGSWDAQVSPTINGYTPDMSEVLAQVVNPEDANQTVKVTYNANRETAQITYIDETTGQV
IRTDYAYDVYDNPITFENDPHKIIEELEKMGYVVVNPSGFTFINGETKYGDSSKDAQVNH
FVVRVTHGYVEIKPDDNIKGDDPINPDDPDGPTYPFGADELNKDINRVIHYVYENGTTAK
PSVTQTLNFEGTAYIDKVTGQLVQVKDGKIVVDENGKIVQGTITWVASDGTTFEEVVSPS
IDGYTPDEDKVQAVDGISADHGDLTETVVYKADKLTAQIEYIDQTTGEVLDSDKVDGVIN
EVIKFSKDPAEVIATLIKLGYKVVTNDYTEGAVYQKDAQKNIFKVYLVKDTTSGGDDKPD
PEPTPDPTPTPDPEPTPDPEPTPEPEPTPDKKPTPEPDEDKPTPSTPDKDDKDKDDSSNK
GDAGNKGNNNGGNAGDGNNKVDHEVVVGEASKSEAVDNTSSDQVAESKNAESTEEAPMVY
AATVDENAPASEVDHDNGTTNTQEAKERLPQTGVQESKAGIFGLLLAAVGSLFGLAGTRK
RKDK
NT seq
7035 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattccgaaaaataatattaaagaaagaattcgtaaaatggattcccaaagagaacat
catgcaattcgtaaattaactacgggggcagcttctgttttaattgggttaacatttatg
ggaactactggtcgaagtgtaaaagctgcaactggaaatgaaaatagtgaagcagggatt
gaattagaagtaaaagcaaataatactgatacttctcaattagaagcagtttctcaagaa
actactcaaaataatccaacttcagaagtaacaactgaaatgccagttgctgaaaacact
aaagcacaaactactgatcaagcagttactcaaaacgatactgctacagaaacgcctgct
caaaatgctcaaaatgaagcgaccacttctcacgcagctgaaactactgctccagtagct
tctcaaactgaaaacaacactgaagtagcaactgaaactgctccagtacaaaatactgaa
acagttgaatctcaagccactaagaacactaattcggtagaaaatcagacaaatactgta
actactgcagaaaataacaatcaagttgaatctcaaccacaaaataatgtaaatactgaa
aacataacagtagacaactctactaatgaacaacaagtagctgaaaaagttgaaaattcc
actgaagcgaaagattcaaatgcttcaaccatagaaacacaaactacagaaaaagctgaa
actactccagaagttccagctccctctgcgccaaaggcagatactgaagttagtgataaa
gttgtaaacttgggtgaaactggagataaagaattaactaccgatgataaggtaaaagat
cctaataaggataaagaagctgataaagtcgaaaatgataacattattgacttaaatgca
gctgacactgaaggtaaggtagtaattagtgctacagatcctaataactatccaactgac
gctggtaaattagttggtgatgataagtatatttaccaaattgttactttaaatgataca
agttctagattagtcttagcgattaacagaaatgatcataatgatgaaagtatctatgct
tatgtaactaatagcaattacagtagtgctagtcaaacatttgaaattaaggttggaaac
aacagagtaattacagttggtaatcataaataccagatcaacaatactggtaagagtgat
gtaacgattgacaatggtaatggtactactacaaaagttccaacggaaaatacttctact
attactggtcaaccaggctggatagatacggatacaattagtccaatttatggattaggc
aacacaactaataataactatactgccttaggggaaatcatccctgtatatactgaaaat
tctgtaattaaatattactataaagatagtgaaggcaaattacatgaaattgaaggttca
gatcaatatccaaatataattgtttctggtcttactggtcaagaatttgaaattaaaaat
gtagatcagtttaagcaaattattaatgggtattacttaattccagataattttccaagt
ggtgactttaaaggtactctttctcaatttaaagaaggagaatactataagaaagtctac
tatgaatatggaagtagcaatgtagaattctatgtagtgtacaatcaaatttccccagat
ggaactatgagaattagtttatttgatggtgataagactactgctgtagaaagtcatgtt
gttgctccaggtcaagcagtacaatttagtaattataactatcttggccgtaacccattc
gtaacttcaactccccacgaagttcaatttatctatagtcaattgggttcaattattcca
gttgatgaacagggtaatgtacttggaccttctgtacagtttaataatggttcggatgca
tttagtgcaggtgcaactaaggctccagaaattttgggatatactcttaaataccaagag
caagccgttattactccaactggagacttaagtaaagacatttatgtcgtttacgttcca
aataacgcttctgcggaagtgatcttccaagacgtaactactggaacacctgtagtttta
gacactttaaccactaatggtagtcatggctatgacattagctttactactaatccatta
gatatgattaaagagttcgaaaataagggctatgttttagtaagtaacggctatggtgaa
ggcggtcacaagtttgattctacaaacccacaatcattcttgattacattcaaacatggt
gtatttgagattactccggaaaatcctggtaagccagatcaaccaatcaatcctgatgat
cctgcaccaaatcgtccaacttatccagctgattctgataaattgactacaactatcacc
caaacaattaagtatgtttactcaaatggcttaaccgcagctccagatagtgtacaaact
attacttttactgcgaaggcttacattgataaggttacaggtgaatacgttttagttgat
aaccaaggaaatattattggcaaggctgatggtctaacctggaatgcggacagtgatact
tttggtgaagtaatctcaccaactattccaaactatactgcggataaaaccagcatccca
accatgacagttaaccgtgatgacaacaatattactatcactgtaacttacacgcggact
gcacaaaaagccgaattcgttttccaagacattactgataataaagaaatcagctctaat
actgtggaaggtgagtttgatagagaaatcaactttaatccacaaactgtaattgatcaa
ttaatcagtcaaggttatgaattagttaataatccatttgtagttggtactaagtttaaa
gatggtgaagtaaatccaaatgcgaataagttcattattacgttaaaacatggtatcgaa
gaagtaactagagaagaaacggtagatcgtgtaattcactatgtttaccaagatggctca
actgctaaaccttctatcactcaaacggctacatttgttggaactggtacccgtgataag
gtaactggtcaggaaattttgacttggtctgaaaatgtaatattgagtgaagtaacttct
ccaacgatttcaggatacacgccaaataggttaacggtttctgaagttgaagtttctcat
gactcttcagatatcgaagaaaccgtaacttatattgccggcgaacaaactgccgaaatt
tactacgtagatatctttaattctaatgaccctcttcaattaggtagtgattctgtaata
ggaaaattcggtgaagaaatcaattttaacctagatcctgcaaatatcattaaattatat
gaatctcaaggttataagttagtttcgaatagctttactccaggaactaagtatggtaat
agtgaggaaaacccagacgtaaatgttttctatgtttactttacacatgctactaaagaa
gacacaaccacggttcaggtaagtcaaactattaactacaaatacgaggatggcactacg
gctcgtccaagtaatgttcaaaccattactttcacaggaactgggttgatcgatgttgta
acaggtaaattaattggtgactacacttggactactgataagaattacttcgatgcagta
aaatcaccagacattattaattacactcctactattaaagtagtcggtcaatctgatgta
attactcatgaagatacgaatcgggtaattgatgtcatttacgcagctaatattcaacaa
gcaaccattacttatattgataaaactacaggtcaaactattaaggttgatagtgtagaa
ggtaaatacaaggacaagattaactactcaactcaaagtgtaatcgatgaacttgttaat
aaaggctatgtattagtaagtgacggctttagtccagatgcgatcttcactgaaggtcct
aataaattctgggtatacttagaacatggtattaaagatgcagacgaacaaactgctact
accaatcgtgtaattcactatgtttatgcagatggctcaactgctagaccttcggtaatt
caaaccataacttataaaggaactggtaagattgatgccgtaacaggtgaattgattggt
agctatacttggactacaggtagttatgatgaagtagaatcacctaagattcaaggttac
agtccagatattttaattgttgaaagtgttgctgatgtgcaacatactgctggcaatagt
gaagtacaggtaacttatattgctaacaagcaaagtgcccaaattacatttattgatgta
actgacaataaagttatttcctcaagcgaagcagtgggtaactacggtgacaagattatc
tttactgataatccagaggaattaattaaacaacttgaagcgcaaggttatgttttagta
agtaagagctatgagggtgactttaaccatagcttctcacatgataacgataacaatatc
ttcgaagtgagagtaaagcatggtactgaaagtgtcacggatcataagactattactcaa
actatcaagtaccaatacgaaaatggtacgatggcggctcaagatcatgtcgtaactttg
acttttacaggccaaggaatgattgataagataactggcaagtatgtaattgtgaatgct
aacggagatgttatcggcgaagctagtggtttaacttggacagctgataacggcgataca
tttgcgagagttgattctccaactattagtggctatggaccaaacaaattatttgtagaa
gaaatggtagtaaaccaggactcaaatgacattgtagaagtaatcacttactatgctgga
gaacaaaccgcggaaattacttatattgatgaaactactggtgaaatcttaagtgttgat
agtgtacttggtaaattaggtgaagatattaacttcacaactgctccaagtaaagtaatt
gagcaattattagcatcaggttatgaattagtttcaaacaactttactcaaggaactaag
tatggtaatagtgaagaaaatccaaatgttaacatttttgaagtaagagtaaaacatggt
gtgattcacgttaacccagaaaatccaggtaagccagatactccaatcaatccggacgat
ccaaatagtccagtttacccaacagattcaatcattcttgataaagatgttgaacgtgta
atcgaatatgtctttgcagatggtactactgctgcaccaagtgtggttcaagtagtgaag
ttccagggttcaggttacattgataaagtaacgggtaaatatattacagttgatcaagat
ggtaagatcattcttgatgaaaatggtaagcccgttgaaggtaaattaacttgggtacct
gtatcaggtagttgggatgcacaagtttccccaacgattaatggatacactccagatatg
agcgaagttttagctcaagtggtaaatccagaagatgcaaatcaaactgttaaagttact
tacaacgctaacagagaaactgcccaaatcacttatatcgatgaaactactggccaagta
attagaactgactacgcatacgatgtctacgacaacccaatcactttcgaaaatgatcca
cataagatcattgaagagcttgaaaagatgggttacgtagtagtcaatccaagtggtttc
acatttattaatggcgaaactaagtacggcgacagtagtaaagacgctcaagttaaccat
ttcgtagttcgtgtaacgcacggttatgtagaaatcaaacctgatgacaacatcaagggc
gatgatccaattaatccagacgatccagatggtccaacttatccattcggtgcagatgaa
ttaaacaaggacatcaaccgtgtaatccattatgtatatgaaaacggtacaacagctaag
ccgtctgtaactcaaacgcttaacttcgagggtactgcatacattgataaggttactggt
caattagttcaagttaaggacggcaagattgttgttgatgaaaacggcaagatcgtccaa
ggaactattacttgggtagcaagcgacggtaccacatttgaagaagtcgtttctccaagt
attgatggctatacgccagatgaagataaggttcaagcagttgatggtattagtgctgat
catggcgacttaaccgaaactgtagtttacaaagcagataagttaactgctcaaatcgaa
tatattgatcaaactactggtgaagtcttagatagtgataaggttgatggagtaattaac
gaagtaatcaaattcagcaaggaccctgcagaagtaatcgccaccttgatcaagttaggt
tataaggttgtaactaatgactacactgaaggggcagtttaccaaaaagatgctcaaaag
aatatcttcaaggtatacttggtgaaggatacaacttcaggtggagatgataagccagat
ccagaaccaactccggatccaacgccaactcctgacccagagccaacaccagatccagaa
ccgactccggaaccagagccaaccccagataaaaagccaacgccagaacctgatgaagat
aaaccaactccttcaactccggataaggatgacaaggataaagatgattcttcaaacaag
ggtgacgctggtaacaaaggcaataacaatggtggtaacgctggagatggcaacaataag
gtagatcatgaagttgttgtaggtgaagcttcaaaatctgaagctgttgataatacaagc
tctgatcaagttgcggaatctaaaaacgcagaatctactgaagaagcgccaatggtttat
gctgcaactgttgatgaaaatgcgccagcatcagaagtggaccatgataatggaaccact
aatactcaagaagccaaggaaagattgccacagactggtgtacaagaaagcaaagcagga
atcttcggattactcttagctgcagtcggctcattattcggacttgcaggaactagaaaa
cgcaaagacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
