Apilactobacillus kunkeei: APS55_03840
Help
Entry
APS55_03840 CDS
T04112
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lku
Apilactobacillus kunkeei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_70
Choline_bind_3
KxYKxGKxW_sig
Choline_bind_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALJ31412
LinkDB
All DBs
Position
867986..872263
Genome browser
AA seq
1425 aa
AA seq
DB search
MNFSKNDRKIHFKMYKSGKQWITAGIMVGSVVFALTGINSNVSAKADTNQSVQQGSGSET
KLESNVDAKSGSNSVSSKSGEVASTVVSSVANVSTESDSTVVSSAKPSSVTVAGANQQNS
KAPSTSVESSTNNMDIASNASDEFKLHTKVIDGKTYYFNNNSELKSQVVVDNSTVYYFGN
DGALTDVKSNFASGTIAASDKTAIYSADGNNITNVNGFITADSWYRPKQIQLNDNEWRDS
TSNDFRPLLSVWWPTQKVEINYLNYMSQQGLVSGSFSSSNTSDQLNAAAATIRLNIEKNI
QANNGSVDKIKTIFTNFVNSQSQWNIGSENYDMNDGFQGGALKYGNNSQTVDANSNYRLI
NRTPTQQDGNVNYKVSGYSGYEFLLGNDVDNSNPVVQAETLNWLHYLMNFGSITQNDKNA
NFDGVRVDAADNMDADILNIIGKYYRDAYGINKNDKNANDHIAILEDWSKNDAYYLKNHG
ADQMSIDGGYLGALQSSLMSNPSARTSISRFITYGLVNRRKDSTDNVNIPNYQIVRAHDN
GVQDVIAKIIQDHIDPNSTGYTPSWSQINKAFKIYNDDQKRTNKKYTQYNIPSAYALILT
NKDTTPRVYYGDMYTDNGQFMATKTPYYNSISEMLKGRVKYVAGGQAMKTVSVNKGKDKV
LVSVRFGKGASSVTSKGTKHTRKSGIAVIESNNPKLKLGKKDKVVIYMGAAHKNQAYRPL
VKTTKKGIATYSTDKSAKNSVIYTDSRGRLILTGSTIKGYANPQVSGYLSMWVPVGASAK
QDVRTAPSSKTSKDGRSFHSNAALDSNVIFEAFSNFQSMPTKESQYSNVVIAKKAKLFSD
LGFTNIELPPQYRSTTDGSFLDSTVQNGYAFNDRYDLGFNTPTKYGTAEQLATAIKALHA
KKLKVLVDFVPDQLYTLPNKQVVSATRVNTVGKTSPNTNLINLLYEANSEGSGTDYQYKY
GGEFLSDLQKMYPDLFTTKQISTGETIDPSKKIKIWDAQYLNGTNIQGRGAEYVLSNSYG
SDYFTVKTLNNPNIDATILPKELLGQSVKYGIQMVNGKPQYITTSGYTAKNSFLMDESGN
WYYVDENGDFVNSPRIINGYQYYFLPNGMNIRDSIVKESDGSLSYYQPNGTKAINSGYFV
SDNIGQIIYITDTGKVYTGVLSSNGNDQFFDSNGYQVKNAMVMVNGKKEYFNNGSGNLVK
NSFFSYNNNWYYANKKGYVVKGHQTINGKKYFFYNNGVQAKNTVIVNKNKTLSYYAKSNA
QLVTKSFKYKGKKITIKKGAIYAPNKLVVIPAGKYLLDGKSHAKSGVHKVSGHYYSFDRS
GKMKTSGTAKLKSVTYKVRSNGTLNFKTGKVVTAKDLKAVKKQLAAKKKAVKAETKKVSA
AKKAVKRNSSKKNKATYKKSTKTLRELKASVKQFNSYIEKFNKRK
NT seq
4278 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttcagtaaaaatgatagaaaaatacattttaaaatgtataaatctggaaaacag
tggattactgccggtattatggttggatctgttgttttcgcgttaacaggaattaatagt
aatgtatctgccaaagctgatacaaatcaatcagttcaacaaggtagcggttctgaaact
aaattggaaagtaacgttgatgccaaatcaggtagcaattcagtttcaagtaagtctgga
gaagttgcgtctactgttgtctcttctgtcgcaaacgttagcactgaaagcgattcaact
gtggtttcatctgctaaaccatcatctgtaacagttgctggtgctaatcaacaaaactca
aaggcaccatctacttcagttgaatcatcaacaaataatatggatattgcatcaaatgct
tctgatgaatttaaattacatactaaagtaatcgatggaaaaacatactactttaataat
aattctgagcttaaatctcaagtagttgttgataattcaacagtatattactttggaaat
gatggtgcgttaaccgatgtaaagagtaattttgcgtcaggtacgattgctgcttcagat
aagacagctatttattcagctgatggtaataatattaccaatgttaacggatttattact
gcagattcatggtatcgtccaaagcaaattcaattaaatgataatgaatggagagattcc
acttcaaatgattttagaccactattaagtgtatggtggccaacacaaaaagttgaaata
aattatttaaactacatgagtcagcaaggattggtttcaggaagttttagttcaagtaat
acttctgaccaattaaatgcagctgctgccacaataagattaaatattgaaaaaaatatt
caagcaaataacggcagtgttgataagattaaaactatttttactaattttgttaattca
caaagccaatggaatattggtagtgaaaactatgatatgaatgatggctttcaaggtgga
gcattaaaatatggaaataatagtcaaacagttgatgcaaattcaaactacagattaata
aatagaacaccaacacaacaagatggaaatgttaattataaagtaagtggttactctgga
tatgagtttttacttggtaatgatgtagataattcaaatccagtggttcaagcagagaca
ttaaattggttacactacttgatgaattttggaagcattacgcaaaatgataagaatgca
aattttgatggtgttcgtgtcgatgctgcagataatatggatgcagatattttaaatatt
attggaaaatattacagggatgcatatggaattaataagaacgataaaaatgcaaatgac
catattgctatcctagaggattggagcaaaaatgacgcatactatctaaaaaatcatggc
gctgatcaaatgtctattgatggtggatatctaggtgcattgcaatctagtctaatgtct
aatccaagtgcaagaacatctatttccaggtttattacatatggattggttaatagaaga
aaagattcaactgataatgtaaatattccaaattatcaaattgttagagctcatgataat
ggtgtacaagatgtcattgcaaagattattcaagatcatattgatccaaattccactgga
tatacaccatcatggtctcaaattaataaagcttttaagatatataatgatgatcaaaaa
agaacaaataaaaagtatactcagtataatattccttcagcttatgctttgatattaact
aataaagatacaacacctcgtgtttactatggcgatatgtatactgataatggtcaattc
atggcaacgaagacaccatactacaactcaattagtgaaatgttaaagggaagagttaag
tacgtagctggtggtcaagctatgaagactgtttctgtaaataagggtaaggacaaagtg
ctagtttctgtaagatttggtaagggtgctagttcggttacttcaaaaggtactaagcat
actagaaagtctggtattgctgttattgaaagtaacaatcctaaacttaagttaggtaaa
aaagataaggttgttatttacatgggtgccgctcacaagaaccaagcctacagaccgtta
gttaaaactactaagaagggtattgctacttactctactgataagagcgccaaaaatagt
gttatctacactgattcaagaggtcgtttaatccttactgggtccacaattaagggctat
gctaatccacaagtatcaggatacttatcaatgtgggtacctgttggtgcatctgcaaaa
caagatgttagaactgctccaagtagtaaaacaagcaaagatggaagatcattccattca
aatgctgctttagattcaaatgttatctttgaagcattctctaatttccaaagtatgcca
accaaagaatcacaatattctaatgttgtgattgcgaagaaggcaaaattatttagtgat
ttaggatttactaacattgagttaccaccacaataccgttcaacaactgatggatcattc
ttggattcaacagttcaaaatggttacgcttttaatgatagatatgatctaggttttaat
actccaaccaagtatggaactgctgaacaattagctactgcaattaaagctcttcatgct
aaaaaattaaaagtattggttgacttcgttccagaccaattatatacgttgcctaataaa
caggttgtttcagccacacgtgtaaatactgttgggaagactagtcctaatactaattta
atcaatttattgtatgaagcaaatagtgaaggttctggaacagattatcaatacaagtac
ggtggagaattcctaagtgatttacaaaaaatgtatccggacttatttactactaaacaa
atttcaacaggtgaaacaattgatccatctaagaagattaaaatatgggacgctcaatac
ttgaatggtacaaatattcaaggacgtggtgcggaatatgttctaagtaattcatatgga
tctgattactttactgttaagacattaaataatccaaacattgatgccacaatcttacca
aaggaattattaggtcagtctgtaaagtatggaattcaaatggttaatggtaagcctcaa
tatattacaacgagtggatatacagccaagaattcattccttatggacgaatctggtaat
tggtattatgttgacgaaaatggtgattttgtaaactctccaagaataataaacggatat
caatactacttcttaccaaacggtatgaatattagagactctatagtaaaagaaagtgat
ggatcactatcttattaccaaccaaatggaactaaggcgattaattctggatattttgta
agtgataatataggacaaataatttacatcactgatactggaaaagtgtacacgggtgta
ttgtcttcaaatggtaatgatcaatttttcgacagtaatggttatcaggttaagaatgcc
atggtaatggttaatggaaaaaaagagtatttcaataatggttcgggaaatcttgtaaaa
aacagtttcttctcatacaataacaattggtattatgctaataagaaaggttatgttgtt
aaaggtcaccaaaccattaatggcaagaagtacttcttctacaacaatggtgtacaagct
aaaaataccgttattgttaacaagaataagacattgtcttattacgctaaatctaatgca
caattagtaactaagtcatttaagtataagggtaagaagattaccattaagaaaggtgct
atttacgcaccaaacaagttagttgttatccctgcgggtaagtacttactagatggtaaa
agtcatgctaaatcaggtgttcataaagtttcaggacattattattcatttgatcgtagt
ggtaaaatgaagacatctggtaccgctaaacttaaatcagtaacttacaaagtaagaagt
aatggaactcttaactttaagacgggtaaagtagttactgctaaagatttgaaagctgtt
aagaaacaattagctgcaaagaaaaaagctgttaaagctgaaactaagaaagtatcagct
gctaagaaggcagttaagagaaatagttctaagaaaaataaagcaacatacaaaaaatct
acaaaaactttgagagaattaaaagcatcagtaaagcaatttaattcatatattgaaaag
tttaataaacgtaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system