Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1: lilo_1298
Help
Entry
lilo_1298 CDS
T02485
Name
(GenBank) cell wall surface anchor family protein
Organism
lls
Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Phage_tube_C
Big_6
pAdhesive_17
CarboxypepD_reg
Big_13
PUA_3
PEGA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAL51295
LinkDB
All DBs
Position
complement(1416759..1420877)
Genome browser
AA seq
1372 aa
AA seq
DB search
MEMQKQKPPRKKNKIITKRKVLSATMSGTLLMTSVVIPTAYSLLSNQITAQAAALNIDLL
QNITSSNNSGTSTTNRWTSNSGSHNVDFTISGHALANVSLLSGPRYAALAIPQELRGFVV
ANGNTSVTTNLTIDFNQIALINAIVSAGDTFVAGVATILGNNPAASINLTQVTTQLNLLK
GIQNIGGGTFSTPTTLNGNSMLSAPLNDGMGAILSQNVTAILQNLRTAVNSLTATGLAAP
AANTALALIKPPLITAIDAVLVPLVNGTGGILDLLLNASALGDTSITIPTKITAPTTIAS
NIDAKFVGSAVQTNLLDVNILSGADGISYVYLAGDVNLTLVAPTGNLSATTSAIGASDAT
ATLPTTLKNNAGTDIPVTSVITNSSGTTVTNGQLSAGTYTVTYSATGYSSVTQTLVVTDP
ADTTAPDAPIVTSVTGNSTNGYTVTGTAESNSTITIKNGAGATVGTATTQPNGSYSVNLP
GSVGPNAPLNVTAADAAGNVSNPTPTTTPADPINPVLVAPTVNLTATTSAIGATDATATL
ATTLKDSEGADVPVTAVITNASGTAVTNGSLSAGTYTVTYSASGYDDVTQTLVVTDPADT
TAPDAPTVGNVTGNSTNGYTVTGTAEPGSTITIKDGSGATVGTGTANETGDYTVALPGSV
GPNAPISVTATDTAGNVSDPTPATTPADPTLVAPTGNLSATTSAVGASDAMATLPTTLKD
SEGADVPVTAVITNASGSAVTNGNLAAGTYTVTYTAGGYEDVTQTLVVTDPADTTAPDAP
TVGNVTGNSTNGYTVTGTAEPVSTVTIKDGSGATVGTGTVNETGDYTVALPGSVGPNAPI
SVTATDAAGNVSDPTPATTPADPVSPVLVAPTGNLSATTSAIGASDAMATLPSTLKNSEG
ADVPVTAVIKNASGSAVTNGNLAAGTYTVTYTAGGYEDVTQTLVVTDPADTTAPDAPTVG
NVTGNSTNGYTVTGTAEPGSTVTIKDGSGATVGTGTANETGDYTVTLPGSVGPNAPISVT
ATDAAGNVSDPTPATTPADPVSPVLVAPTGNLTAITSAIGASDAMATLPTTLKNREGADV
PVTAVITNASGNAVTNGSLSAGTYTVTYSASGYDDVTQTLVVTAPADTTAPDAPTVGGVT
GNSTNGYTVTGTAEPGSTVTIKDGSGATVGTGTANEAGAYTVTLPGSVGPNAPISVTATD
AAGNVSAPTSAKTPADPKAPSDTTAPNPPSVDTVTGNTDTGYTVGGKGEPGSTITIKNPA
TGEVLGTTIVDKDGNYSIKLPTGVKPGTQLTATATDAAGNVSDPTDFIIPVLTSGMAIGN
SGDNMGGKYFSSGKLPATNGADTGWLGVIGTVILSLLGSLLFWRKNKKEDES
NT seq
4119 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaatgcagaaacaaaaaccaccacgtaagaaaaataaaattattactaaacgtaaa
gtattatcagcaacgatgtcaggaactctattaatgacatcggtagttattccaacagct
tacagccttctttctaatcagatcacagcacaagcagctgccttgaatattgacctattg
caaaatatcacttcaagtaataatagtggtacaagtacaacaaatcgatggaccagtaat
tcagggagtcacaacgtcgattttacaatctcaggccatgctttagctaatgtctcttta
ctttcgggcccaagatacgctgctttggcgattcctcaagaattgcgtggatttgttgta
gcgaacggaaacacttctgtaacaactaatctcacaattgatttcaatcaaattgcgctc
atcaatgcgattgtgagtgctggtgatactttcgttgcaggggttgctaccattttaggt
aacaatccggcagccagtattaacttgacacaagtaacgacacaattgaatttactaaaa
ggtatccaaaatattggtggagggactttttcaacacccaccactcttaatggaaattca
atgcttagtgcacctttaaatgacggaatgggggcgattttatcccaaaacgtcacggct
attttgcaaaatttacgaacagctgttaatagcctaaccgcaaccggtttggcggctcct
gcggctaatactgccttagctttaattaaacctccactcattacagcaatcgatgctgta
ttagtgccattagttaatggaactggtggaattttagatctccttttaaacgcttcagca
ttgggtgatacaagtattacaattccgaccaagatcacagcaccaactactattgcaagt
aacattgatgccaaatttgtaggatcagcggttcaaaccaatttattggatgtcaatatt
cttagtggtgcagatggtatttcctatgtttatttagcaggtgatgtcaatttaacgtta
gtagcgcccacaggaaacctgagcgcaacaacatcggcaattggagcgtcagatgcgaca
gcgacccttccaacgactttaaaaaataatgctggtacagacattccggtaacttcagtc
attaccaatagttcaggaactacagtaactaatggtcagctgtcagctggtacttatacc
gtgacatattcggccacaggctattctagcgttacccaaaccttggttgttacagacccc
gcagataccactgctccagatgcaccaattgtcacaagtgtgactgggaatagtacaaat
ggttatacggtgacaggtacagccgagtcaaattcaacaattactatcaaaaacggagcc
ggagcaacggtcggtactgccactactcaaccaaacggaagttacagtgtaaatcttcca
ggttcagttggccccaatgccccacttaatgttaccgccgcagacgcagcagggaatgta
agtaatccaactccaacaacaacaccagccgatccgattaatccagttctcgtagcccct
actgtgaacttgactgcaacgacctcagcgattggtgctacagacgcaacagctacactt
gcaaccactctgaaagacagtgaaggtgccgacgttccagttacagcagttatcacgaat
gcttcaggaactgcagtcactaatggtagcttgtcggctggcacttatactgtgacatac
tcagcttcagggtatgacgatgtcactcaaactctagttgttacagaccccgcagatacc
actgctccagatgcaccgacagtaggcaatgtgacaggaaacagcacgaatggttatacg
gtcacaggtacggctgaaccaggatcaaccatcacaattaaagatggcagtggggcaacc
gttggaacaggaactgcgaatgaaacaggagattatacggttgcccttccaggctcagtc
ggccctaacgcaccaattagtgttacagcaaccgataccgcaggaaatgtgagtgatcca
actccagcaacgactccagcggatccaactctcgtagctccaaccggtaacttgagtgca
acaacctcagcggttggcgcctcagacgccatggctactcttccaacaactctgaaagac
agtgaaggcgctgatgttccggttacagcggttatcacgaatgcttcaggaagtgcggtt
actaatggtaacttggcagcaggtacctacaccgtcacttatacggccggcggttatgaa
gacgtcactcaaactctagttgtcacagacccagcagataccactgctccagatgcacca
acagtaggaaatgtgacaggaaacagcacgaatggttatacggtcacaggtacagctgaa
ccggtctcaacggtcacaattaaagatggcagtggggcaaccgttggaacaggaaccgtg
aatgaaacaggagattatacggttgccctcccaggctcagtcggccctaacgcaccaatt
agtgtcacagcgaccgacgccgcaggaaatgtgagtgatccaactccagcgacgactcca
gcagacccagtaagtccagttctcgtagctccaactggtaacttgagcgcaacgacctca
gcgattggcgcctcagatgccatggctactcttccatcaactctgaaaaacagtgaaggt
gcagatgttccagttacagcagttatcaagaatgcttcaggaagcgcggtcactaatggt
aacttggctgcaggcacctacaccgtcacttatacggccggcggttatgaagacgtcact
caaaccctagttgttacagacccagcagataccactgctccagatgcgccaacagtaggc
aatgtgacaggaaacagcacgaacggttatacggtcacaggtacagctgaaccgggctca
acggtcacaattaaagatggcagtggggcaaccgttggaacaggaactgcgaatgaaaca
ggagattatacggttaccctcccaggctcagtcggccctaacgcaccaattagtgtcaca
gcgaccgacgccgcaggaaatgtgagtgatccaactccagcgacgactccagcagaccca
gtaagtccagttctcgtagctccaaccggtaatctaactgcaatcacttcggcaattggt
gcctcagacgccatggctactcttccaacaactctgaaaaaccgtgaaggcgctgatgtt
ccggttacagcggttatcacgaatgcttcaggaaacgcagtcactaatggtagcttgtcg
gctggcacttatactgtgacatactcagcttcagggtatgacgatgtcactcaaactcta
gttgttacagcccccgcagataccaccgctccagatgcaccaacagtaggcggtgtaact
ggcaacagtacgaatggttacacggtcacaggtacagctgaaccaggttcaacggtcaca
attaaagatggcagtggggcaaccgttggaacaggaactgcgaatgaagcaggagcttac
accgttactcttccaggttcagtcggtcctaacgcaccaattagtgttacagcaaccgat
gccgctggaaatgtgagtgctccaacctcagcgaaaactccagctgatcctaaggctccg
tcagatactacagctcctaatcctccaagtgtagataccgtgactggtaacactgataca
ggttatacggttggtggaaagggggaacctggatccacaataacaattaaaaacccagca
actggtgaggttttgggaactactatagtggataaagatggaaactatagcatcaaactt
ccgacgggggttaaaccgggtactcaacttacggctaccgcaactgatgctgcaggaaat
gtaagtgatccaacagactttattattccggtcttgacttctggaatggcaataggtaat
agtggggataatatgggtggtaagtatttctcaagtggtaaattaccagcaacaaatggt
gcagacactggctggcttggtgtaattggaacagtcattctatctctgcttggtagtcta
ttgttctggcgtaagaataaaaaggaggatgaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
