Listeria monocytogenes J1-220 (serotype 4b): LM1816_09727
Help
Entry
LM1816_09727 CDS
T02801
Symbol
lapB
Name
(GenBank) surface-anchored adhesin LapB
Organism
lmoz
Listeria monocytogenes J1-220 (serotype 4b)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
Big_3_4
Bact_surface_Ig-like
Y_Y_Y
Big_13
PKD_4
PKD
DUF4959
HYR
DUF4625
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
EGF36311
LinkDB
All DBs
Position
complement(1790677..1795833)
Genome browser
AA seq
1718 aa
AA seq
DB search
MKSKFFTGMMIFLLALICLTGMKAEAKSVGDISPDDISPEISDNRFQSAEGKVLPNFEVD
MSISDQSNGKLSIDEDFELTSDGDIILIGTVQGQYIQGTPILNENGQLNKIPNRDQGIIM
RVDRTTKKVEWARVVNYEDGNYNSQYAADKWFSSYKSITTNSSKSAFYVGGEVVNYYGDS
GGGSTLIVKSIDANGNFQIAHKSYVSYGVPSRSDLTYAYFMDIQMEGNTLIMSASARYAA
QGKQFIRYTLEPASLSITKNEFNPLDNTFWAKYQRTDVLKIDNKGLMAYNADVNGANQLK
MSIRESENNYKEITLFDSVPEILANSSPYIFMEDRGDGNVFVVMSTPTTWYIALVNIASE
QVVETKKMTMNSSTTLNSVIYSEGKGLLLGGSTHAEESIFGSEPLNKNNGYYLALGNDLN
VTDSQILRTNQHNSLTTIINGVGNKVDGFFSYDGLNNDGYIQNVEYPNTYDVNPNGAMIF
AEFNLQPAPVLDTGNPILAFYQGERRADFDELEGVKAYSGIDSSDITKSITKNTFDLYTV
GVQQQLYQIEYLPGSGNKTTGTRNIQLLHPLETPKLEKSYADSHGAFKVGEVVPANAIHA
FNGLDSANNVTYVVTAVDDEKITVDASIKRTEGTKTAVISKEITLMTSTADETAVIDVTS
VALAAGKYTSLTDVRSEGHFHIYAETMDNVSIDPKYVKLTEDPENPVDWNAPGVYYVTAS
LDPASGYTAKDVKVSVAVVDVGSPKVISVNMKPYNPTTALVVAEDDINGAGVYKINWAIK
DANGLIIQQGVEESGATIRVQTPVPIDLSTLNDGNYTLSVSAADRIGHTSEASEKAFTVD
RQAPVVTADDKITYEINTKKTEEQFLNDVNVKTEAGAVIKTNFDTMVRMDSPGDYTVLVE
ATDAAGNQSDPIYVIVTVEDTVAPIISADEAISYNQGNTRTEAQFLADIHATTDEPATIT
SDFADQVKFDTPGVYAVTLKANDISGNQAIPRTVNVTVKDVIAPVITADEAIIYEKGITK
SATDFLTDVHAATNDGSAITSNFATVVDLNTPGDYDVTLNSTDAGGNKSDPITVTVTVRD
TTPPVITADTTITYEKGTTKTAAAFLTDVNATTNDGSAVTSNFNPNSLKQVGTYQVTLSA
IDENGNYALPVKVTVIVQDTQKPVISSSATSITYERGEKKQETGFFLDLAIKTDDGTPVT
SDFDTAVNLDTAGSYTVTLNAEDESGNKADPVTITVIVADTEKPIITADTTITYAKGTTK
TAAQFLTDIHATTNDGSTITSNFDPTVLTQEGTYKVVLNAKDDSNNEADPVTVTITVVDT
KGPIINALNTITYERTINKNEADFLADIEATTDDGSTITTDFNSKDLDTVGTYTVTLNAE
DASGNKATPVKVTMKVEDNIPPIITADQSITYERGITKTEQAFYTDINAATSDNSAISSD
FSKIDLTKTGNYEVLLQATDQSGNKALPLKINVLVQDTIAPVIKTTSREITNERGVPMTE
QQLLARIGANTDDGSKITTDYNPAIVNTSGDYLVHLYAVDAAGNQATPVEITIHVKDTTA
PIITADKKTSYPVGTDKTVTEFLQDIHATTDDGSKITTDFDPNMLKTKGTYTIHLNAVDA
DGNKAKTIDVSLTVEEKVTPPTPPTPPTPPTPDDGGNNTNNGSNGTNDRNANITVNPTKQ
NTTATNESIPALGDTTSTIPVIVGMFLLATSLVLIRRK
NT seq
5157 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaattttttacaggtatgatgatttttttgctagcattaatttgtcttact
ggaatgaaagcagaagcaaaatcggtgggagatatttctccagatgatatttcaccggaa
atttcggataatcgctttcaatctgcagaagggaaagttttgcctaattttgaggtagac
atgtcaattagtgatcaaagtaacgggaaattatcgattgatgaggattttgaattaacc
tcagatggtgatattattttgattggaacagtgcaaggtcagtacatacaaggaaccccc
attttaaatgaaaatgggcaattaaataaaattccaaaccgtgatcaagggattataatg
cgtgtcgatcgaaccacaaaaaaagtggagtgggcacgtgttgttaactatgaggacggt
aattacaattcacaatatgcagctgacaaatggtttagttcgtataaatcgattacaacc
aactcgagtaaatctgccttttatgttggcggggaagtagtcaattattacggtgattct
ggtggtggtagtacattaattgtaaaatcaattgatgcaaatggtaactttcaaatagcc
cataaatcatacgttagttacggtgttccatcaagatcagatctaacctatgcctatttt
atggatattcaaatggaaggtaacacattaatcatgtcagcttcagctaggtatgctgct
caagggaaacagtttattcggtatactttagaaccagcttcattatcgattactaaaaat
gaatttaacccattagataacactttctgggccaaatatcaaaggaccgatgttcttaaa
atcgataataaaggtctaatggcttataacgcagatgtaaatggtgcgaaccaacttaaa
atgtctattcgtgaatcagaaaataattataaagaaattactttatttgattctgttcct
gaaattttagcaaattcttctccttatatatttatggaagatcgtggcgatgggaatgtg
tttgtggtcatgtcaacccccaccacatggtatatcgcgcttgttaatatcgcgtcagaa
caagtagttgagacgaaaaaaatgacgatgaactcctctacaacgctaaacagtgtgatt
tacagtgaaggaaaaggtctgcttttaggtggtagtacacacgcagaagaaagcattttc
ggcagtgagccattgaataaaaataacggatattatttagcgcttggaaatgatttgaac
gtaacggatagccagattttaagaacgaatcaacataattcattgaccactattattaat
ggcgtcggcaataaagtagatggtttctttagctatgacggattaaataatgatggatat
atccaaaatgtagagtacccgaacacctatgatgtgaacccgaatggagcgatgattttt
gcagaatttaatttgcaaccagctccagtgcttgatacaggtaatccaattttagcattt
tatcaaggggaacgtcgtgcagattttgatgaactggaaggggtgaaagcatactctgga
attgattcatcagatataacaaaatctatcactaaaaatacgtttgatttatatactgta
ggcgtacaacagcaactttatcaaattgaatatttgccaggtagtggaaataaaaccact
ggtacacgaaatatccaattgcttcacccacttgagaccccaaaactagagaaaagctac
gcagatagccatggagcttttaaagttggtgaagtagttcctgcaaatgctattcatgca
tttaatggtttagatagtgctaacaatgtgacttatgtagttaccgcagtagatgatgag
aaaataactgtagatgcttcaattaagcgaacagaaggaacgaaaacagctgtaattagt
aaggaaattacacttatgacttcgacagctgatgaaactgcagtaatcgatgtgacgagt
gtggctctagcagctgggaagtatacatccttaacagatgttcgaagtgaagggcatttt
catatttatgcagaaaccatggataacgtgtccatcgatcctaaatacgttaaactaaca
gaagaccctgaaaacccagttgattggaatgcgccaggtgtttattatgtgactgcatca
cttgacccggcgagtggatatacagcgaaagatgtgaaagtaagtgtcgctgtagttgat
gttggaagtccgaaagttatttctgtaaacatgaaaccgtacaatccaacaaccgctctt
gtcgttgcggaagatgatattaatggcgcaggcgtatataaaatcaactgggcaattaaa
gacgcgaatggacttattatccaacaaggtgtggaagagagtggtgctaccattcgagtt
caaacgccagttccaattgatctctctacattgaatgatggcaattataccttgtcagta
tcagcggctgacagaattggtcatacatcagaagcttcagaaaaagcgttcacagtagac
agacaagcgccagttgtgacagctgacgacaagatcacgtatgaaataaacaccaagaaa
acagaagagcaatttttaaacgatgtaaatgtaaaaacggaagccggagcggtgattaaa
accaattttgatacgatggtgagaatggattcgccaggcgattatacggttttagtggaa
gctaccgatgcagcgggcaaccaatctgatcccatttatgtcattgtaacagtagaagat
acggtagcaccgattataagtgcagacgaagcgattagttataaccagggaaatacacga
acagaagcacaatttctggctgatattcatgcaacaacagatgaaccagcaacgattaca
agtgattttgcggatcaagtgaaatttgatacaccaggagtctacgcagtcacattaaag
gcaaacgatattagcggaaaccaagcaataccaagaacagtaaatgtcacagttaaagat
gtcattgctccagtaattacagcagatgaagcgattatttacgaaaaaggcataaccaaa
tctgctactgatttcttaacagatgtgcatgctgctacaaacgatggctcggcaatcacc
tctaattttgcaacggtagtagatttaaatacaccgggggattacgatgtcacacttaac
tcgacagatgcaggtggcaataaatctgacccaatcaccgtaacagttaccgtacgtgat
acaacaccaccagttattacagcagatacaactatcacttacgaaaaaggaaccacgaaa
actgcagctgcctttttaacggatgtaaatgcaacaacgaatgacggctcagcagtaact
tctaacttcaacccaaatagtttgaagcaagtagggacttatcaagtgacgttaagcgct
attgatgaaaatgggaactatgctttgccagtcaaggtaactgttattgtgcaagatacg
caaaaacctgtaatatcatctagtgccacaagcattacgtatgaacgcggcgaaaagaaa
caagaaacaggattcttcctagatttagctattaaaacggatgacggcacaccagttaca
agtgattttgatacagcggtaaatctggatacagcgggaagttatactgtgacgctaaac
gcagaagacgaaagtggcaataaagcagatccagtcactattaccgtcattgtcgctgat
acagaaaaaccaattatcacagcagatacaacgataacctacgcaaaaggaacaaccaaa
actgctgctcaatttttaacagatatccacgcaacgacgaatgatggatcaaccatcacg
agcaattttgacccaactgtccttacgcaagaaggaacttacaaagtcgtattaaatgca
aaagatgatagcaacaacgaagcagatccagtaactgttactatcaccgtggtagataca
aaaggaccgattatcaatgcattaaatacaatcacctatgaaagaactatcaataaaaac
gaagcggattttttagcagatattgaagcaactacagatgatggctctacaataacaacg
gattttaatagtaaagatcttgatacggttggtacctacacagtcacattaaatgcagag
gatgcaagtggcaataaagcaacgcccgtaaaagtgacaatgaaagtagaagataacatt
cctcccatcatcacagctgaccaatcaatcacttacgaaagaggcattacaaaaacagag
caagctttctacaccgatattaatgccgcaacaagtgacaacagcgcaatcagctctgat
ttttcgaaaatcgatttaacaaaaacaggaaattatgaagtcttactccaagcaacggat
caaagtggaaacaaagcattgccacttaaaattaatgtgctagttcaagatactatcgct
ccggttataaaaacaaccagccgagaaataacaaacgagcgtggtgtaccaatgaccgaa
caacaactacttgcaagaattggcgccaatacagatgacggttccaaaataaccaccgat
tataaccctgcaattgttaacacatcaggggattatctagttcatctgtatgctgttgat
gccgcagggaaccaagccacacctgtagaaattactattcatgtaaaggatactaccgcg
ccaatcattacggcagataagaaaactagttatcctgttggaacagataaaacggtaacg
gaatttttacaagacattcatgctacaacggacgatggttctaaaatcacgacagatttc
gatccaaatatgttgaaaacaaaaggaacatatactatccacttaaatgcagtagatgca
gacgggaataaagctaagacaatcgatgtaagcctcacagtagaagagaaagtgacgccg
ccgacaccaccgacaccaccgacaccaccgacaccagatgatggtggaaataatacgaat
aacggcagcaatgggacaaatgatagaaacgccaatataacggtaaatcctaccaagcaa
aatactaccgctacaaatgaaagcatcccagcattaggtgatacaacatcaactattcca
gttatcgtaggtatgttccttttagccacttcacttgttcttattagacgcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system