Listeria monocytogenes serotype 7 SLCC2482: LMOSLCC2482_1729
Help
Entry
LMOSLCC2482_1729 CDS
T02221
Name
(GenBank) cell wall surface anchor family protein (LPXTG motif)
Organism
lmz
Listeria monocytogenes serotype 7 SLCC2482
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
InlK_D3
Big_3_4
Bact_surface_Ig-like
Y_Y_Y
Big_13
PKD_4
PKD
HYR
DUF4959
DUF4625
Big_3_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBY04250
LinkDB
All DBs
Position
complement(1738034..1743172)
Genome browser
AA seq
1712 aa
AA seq
DB search
MKSKFFTGMMIFLLALICLTGMKAEAKSVGDISPDDISPEISDNRFQSAEGKVLPNFEVD
MSISDQSNGKLSIDEDFELTSDGDIILIGTVQGQYIQGTPILNENGQLNKIPNRDQGIIM
RVDRTTKKVEWARVVNYEDGNYNSQYAADKWFSSYKSITTNSSKSAFYVGGEVVNYYGDS
GGGSTLIVKSIDANGNFQIAHKSYVSYGVPSRSDLTYAYFMDIQMEGNTLIMSASARYAA
QGKQFIRYTLEPASLSITKNEFNPLDNTFWAKYQRTDVLKIDNKGLMAYNADVNGANQLK
MSIRESENNYKEITLFDSVPEILANSSPYIFMEDRGDGNVFVVMSTPTTWYIALVNIASE
QVVETKKMAMNSSTTLNSVIYSEGKGLLLGGSTHAEESIFGSEPLNKNNGYYLALGNDLN
VTDSQILRTNQHNSLTTIINGVGNKVDGFFSYDGLNNDGYIQNVEYPNTYDVNPNGAMIF
AEFNLQPAPVLDTGNPILAFYQGERRADFDELEGVKAYSGIDSSDITKSITKNTFDLYTV
GVQQQLYQIEYLPGSGNKTTGTRNIQLLHPLETPKLEKSYADSHGAFKVGEVVPANAIHA
FNGLDSANNVTYVVTAVDDEKITVDASIKRTEGTKTAVISKEITLMTSTADETAVIDVTS
VALAAGKYTSLTEVRSEGHFHIYAETMDNVSIDPKYVKLTEDPENPVDWNAPGVYYVTAS
LDPASGYTAKDVKVSVAVVDVGSPKVISVNMKPYNPTTALVVAEDDINGAGVYKINWAIK
DANGLIIQQGVEESGATIRVQTPVPIDLSTLNDGNYTLSVSAADRIGHTSEASEKAFTVD
RQAPVVTADDKITYEINTKKTEEQFLNDVNVKTEAGAVIKTNFDTMVRMDSPGDYTVLVE
ATDAAGNQSDPIYVIVTVEDTVAPIISADEAISYNQGNTRTEAQFLADIHATTDEPATIT
SDFADQVKFDTPGVYAVTLKANDISGNQAIPRTVNVTVKDVIAPVITADEAIIYEKGITK
SATDFLTDVHAATNDGSAITSNFATVVDLNTPGDYDVTLNSTDAGGNKSDPITVTVTVRD
TTPPVITADTTITYEKGTTKTAAAFLTDVNATTNDGSAVTSNFNPNSLKQVGTYQVTLSA
IDENGNYALPVKVTVIVQDTQKPVISSSATSITYERGEKKQETGFFLDLAIKTDDGTPVT
SDFDTAVNLDTAGSYTVTLNAEDESGNKADPVTITVTVADTEKPIITADTTITYAKGTTK
TAAQFLTDIHATTNDGSTITSNFDPTVLMQEGTYKVVLNAKDDSNNEADPVTVTITVVDT
KGPIINALNTITYERTINKNEADFLADIEATTDDGSTITTDFNSKDLDTVGTYTVTLNAE
DASGNKATPVKVTMKVEDNIPPIITADQSITYERGITKTEQAFYTDINAATSDNSAISSD
FSKIDLTKTGNYEVLLQATDQSGNKALPLKINVLVQDTIAPVIKTTSREITNERGVPMTE
QQLLARIGANTDDGSKITTDYNPAIVNTSGDYLVHLYAVDAAGNQATPVEITIQVKDTTA
PIITADKKISYPVGTDKTVTEFLQDIHATTDDGSKITTDFDPNMLKTKGTYTIHLNAVDA
DGNKAKTIDVSLTVEEKVTPPTPPTPDDGGNNTNNGSNGTNDRNANITVNPTKQNTTATN
ESIPALGDTTSTIPVIVGMFLLATSLVLIRRK
NT seq
5139 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagtaaattttttacaggtatgatgatttttttgctagcattaatttgtcttact
ggaatgaaagcagaagcaaaatcggtgggagatatttctccagatgatatttcaccggaa
atttcggataatcgctttcaatctgcagaagggaaagttttgcctaattttgaggtagac
atgtcaattagtgatcaaagtaacgggaaattatcgattgatgaggattttgaattaacc
tcagatggtgatattattttgattggaacagtgcaaggtcagtacatacaaggaaccccc
attttaaatgaaaatgggcaattaaataaaattccaaaccgtgatcaagggattataatg
cgtgtcgatcgaaccacaaaaaaagtggagtgggcacgtgttgttaactatgaggacggt
aattacaattcacaatatgcagctgacaaatggtttagttcgtataaatcgattacaacc
aactcgagtaaatctgccttttatgttggcggggaagtagtcaattattacggtgattct
ggtggtggtagtacattaattgtaaaatcaattgatgcaaatggtaactttcaaatagcc
cataaatcatacgttagttacggtgttccatcaagatcagatctaacctatgcctatttt
atggatattcaaatggaaggtaacacattaatcatgtcagcttcagctaggtatgctgct
caagggaaacagtttattcggtatactttagaaccagcttcattatcgattactaaaaat
gaatttaacccattagataacactttctgggccaaatatcaaaggaccgatgttcttaaa
atcgataataaaggtctaatggcttataacgcagatgtaaatggtgcgaaccaacttaaa
atgtctattcgtgaatcagaaaataattataaagaaattactttatttgattctgttcct
gaaattttagcaaattcttctccttatatatttatggaagatcgtggcgatgggaatgtg
tttgtggtcatgtcaacccccaccacatggtatatcgcgcttgttaatatcgcgtcagaa
caagtagttgagacgaaaaaaatggcgatgaactcctctacaacgctaaacagtgtgatt
tacagtgaaggaaaaggtctgcttttagggggtagtacacacgcagaagaaagcattttc
ggcagtgagccattgaataaaaataacggatattatttagcgcttggaaatgatttgaac
gtaacggatagccagattttaagaacgaatcaacataattcattgaccactattattaat
ggcgtcggcaataaagtagatggtttctttagctatgacggattaaataatgatggatat
atccaaaatgtagagtacccgaacacctatgatgtgaacccgaatggagcgatgattttt
gcagaatttaatttgcaaccagctccagtgcttgatacaggtaatccaattttagcattt
tatcaaggggaacgtcgtgcagattttgatgaactggaaggggtgaaagcatactctgga
attgattcatcagatataacaaaatctatcactaaaaatacgtttgatttatatactgta
ggcgtacaacagcaactttatcaaattgaatatttgccaggtagtggaaataaaaccact
ggtacacgaaatatccaattgcttcacccacttgagaccccaaaactagagaaaagctac
gcagatagccatggagcttttaaagttggtgaagtagttcctgcaaatgctattcatgca
tttaatggtttagatagtgctaacaatgtgacttatgtagttaccgcagtagatgatgag
aaaataactgtagatgcttcaattaagcgaacagaaggaacgaaaacagctgtaattagt
aaggaaattacacttatgacttcgacagctgatgaaactgcagtaatcgatgtgacgagt
gtggctctagcagctggtaagtatacatccttaacagaggttcgaagtgaagggcatttt
catatttatgcagaaaccatggataacgtgtccatcgatcctaaatacgttaaactaaca
gaagaccctgaaaacccagttgattggaatgcgccaggtgtttattatgtgactgcatca
cttgacccggcgagtggatatacagcgaaagatgtgaaagtaagtgtcgctgtagttgat
gttggaagtccgaaagttatttctgtaaacatgaaaccgtacaatccaacaaccgctctt
gtcgttgcggaagatgatattaatggcgcaggcgtgtataaaatcaactgggcaattaaa
gacgcgaatggacttattatccaacaaggtgtggaagagagtggtgctaccattcgagtt
caaacgccagttccaattgatctctctacattgaatgatggcaattataccttgtcagta
tcagcggctgacagaattggtcatacatcagaagcctcagaaaaagcgttcacagtagac
agacaagcgccagttgtgacagctgacgacaagatcacgtatgaaataaacaccaagaaa
acagaagagcaatttttaaacgatgtaaatgtaaaaacggaagccggagcggtgattaaa
accaattttgatacgatggtgagaatggattcgccaggcgattatacggttttagtggaa
gctaccgatgcagcgggcaaccaatctgatcccatttatgtcattgtaacagtagaagat
acggtagcaccgattataagtgcagacgaagcgattagttataaccagggaaatacacga
acagaagcacaatttctggctgatattcatgcaacaacagatgaaccagcaacgattaca
agtgattttgcggatcaagtgaaatttgatacaccaggagtctacgcagtcacattaaag
gcaaacgatattagcggaaaccaagcaataccaagaacagtaaatgtcacagttaaagat
gtcattgctccagtaattacagcagatgaagcgattatttacgaaaaaggcataaccaaa
tctgctactgatttcttaacagatgtgcatgctgctacaaacgatggctcggcaatcacc
tctaattttgcaacggtagtagatttaaatacaccgggggattacgatgtcacacttaac
tcgacagatgcaggtggcaataaatctgacccaatcaccgtaacagttaccgtacgtgat
acaacaccaccagttattacagcagatacaactatcacttacgaaaaaggaaccacgaaa
actgcagctgcctttttaacggatgtaaatgcaacaacgaatgacggctcagcagtaact
tctaacttcaacccaaatagtttgaagcaagtagggacttatcaagtgacgttaagcgct
attgatgaaaatgggaactatgctttgccagtcaaggtaactgttattgtgcaagatacg
caaaaacctgtaatatcatctagtgccacaagcattacgtatgaacgcggcgaaaagaaa
caagaaacaggattcttcctagatttagctattaaaacggatgacggcacaccagttaca
agtgattttgatacagcggtaaatctggatacagcgggaagttatactgtgacgctaaac
gcagaagacgaaagtggcaataaagcagatccagtcactattaccgtcactgtcgctgat
acagaaaaaccaattatcacagcagatacaacgataacctacgcaaaaggaacaaccaaa
actgctgctcaatttttaacagatatccacgcaacgacgaatgatggatcaaccatcacg
agcaattttgacccaactgttcttatgcaagaaggaacttacaaagtcgtattaaatgca
aaagatgatagcaacaacgaagcagatccagtaactgttactatcaccgtggtagataca
aaaggaccgattatcaatgcattaaatacaatcacctatgaaagaactatcaataaaaac
gaagcggattttttagcagatattgaagcaactacagatgatggctctacaataacaacg
gattttaatagtaaagatcttgatacggttggtacctacacagtcacattaaatgcagag
gatgcaagtggcaataaagcaacgcccgtaaaagtgacaatgaaagtagaagataacatt
cctcccatcatcacagctgaccaatcaatcacttacgaaagaggcattacaaaaacagag
caagctttctacaccgatattaatgccgcaacaagtgacaacagcgcaatcagctctgat
ttttcgaaaatcgatttaacaaaaacaggaaattatgaagtcttactccaagcaacggat
caaagtggaaacaaagcattgccacttaaaattaatgtgctagttcaagatactatcgct
ccggttataaaaacaaccagccgagaaataacaaacgagcgtggtgtaccaatgaccgaa
caacaactacttgcaagaattggcgccaatacagatgacggttccaaaataaccaccgat
tataaccctgcaattgttaacacatcaggggattatctagttcatctgtatgctgttgat
gccgcagggaaccaagccacacctgtagaaattactattcaggtaaaggatactaccgcg
ccaatcattacggcagataagaaaattagttatcctgttggaacagataaaacggtaacg
gaatttttacaagacattcatgctacaacggacgatggttctaaaatcacgacagatttc
gatccaaatatgttgaaaacaaaaggaacatatactatccacttaaatgcagtagatgca
gacgggaataaagctaagacaatcgatgtaagcctcacagtagaagagaaagtgacgccg
ccgacaccaccgacaccagatgatggtggaaataatacgaataacggcagcaatgggaca
aatgatagaaacgccaatataacggtaaatcctaccaagcaaaatactaccgctacaaat
gaaagcatcccagcattaggtgatacaacatcaactattccagttatcgtaggtatgttc
cttttagccacttcacttgttcttattagacgcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
