Candidatus Lokiarchaeum ossiferum: NEF87_003899
Help
Entry
NEF87_003899 CDS
T09593
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lob
Candidatus Lokiarchaeum ossiferum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NHL
DUF5128
SGL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYP47614
LinkDB
All DBs
Position
complement(4542623..4545994)
Genome browser
AA seq
1123 aa
AA seq
DB search
MRKKKEEYRLSMLVLIFLVSFNIGNSNFSPESKVITETNEVERRMDVPQKAFNEEYLDQF
GTHVLNPGTFNQPCGVAINSSGFIHIVDWGGRVQIFDPEFNFVRSFGSSGFGDGEFNLPY
DILINSTGNIFVSDRQNGRVQVFDQFGNFIKIIGEYIFQKPRGIALNSSEHLYVADTQQN
QIFICSPSGEIIKTIGSYGSGDGQFYSPAGLAINSSGYLYVADKYNYRIQVFDPNGLFIN
SFGTSGMDDPDFDYPENIVINSTGYLFITDSGNNHVKVFDQDGNFIRLIGQSGYDGLIFN
PKGITIDLSGNLLIAELDRDRILNYSQTGEYFSSFGITAFSEIGQLNIPSGIAINGSGYA
YVSDSENGRVQVFNPSGEYVRSIGSPGVDSYNLYKPWGVVINETNWVFVLDDSDIKVYDP
EGNYQYMIGEEDTGSEELLFPRGIAINSSNYIYVVDQNRQKIQVYDPSGNFHRSFGTFDY
ASAIAINSSGFTYITDQLDGGNHVIRVFNPLGSQVNQFGSYGSDDGQFSSPQGIAINQTN
YVYVSDTENDRIQIFDPQGNYIDQFGTSGYNDGQLSKPLGIAFNSLNQTFVVDSNNHRIQ
KFGEGIYYKPNAPFLSNFGFPSTKFNSIILNWTDVDDAQSYNLYRHRSPITEINSSILLK
NVVSNYTSDTLNDGGGIYYYVCTTINGSGESNPSNPVSIEYVVPDAPILSNIIPDQTTCH
EIILNWTQVDGVESYNLYRHIGPIISINSSIFIKNMYTNETTDILPSGGTFYYAVTAVNG
AGESILSESKIVTFLSPNAPILSKIFPNPSTSSVILLNWTQVNGAESYNLYRHTGPITSI
NSSIFLKTVLTNMTEDQLPSNGEYFYAVTAHNSAGESPVSKNVSIQYFTLDPPVLSNLDP
LNYNNEIILNWTDIEGVDYYNVYRHIFPITTLNSSIFLSTSVISAYTDSLKEFGQYYYVI
TTVNSLGESTPSNMIYINFTPLIPPVISEPTLDFNNIRGVVYLEWSTVEGADFYNIYRHN
SYISSINSSIFLQKTENINFTDTLDSYGKYYYVITAINSNGESLESNVIMVEYSENSTIS
ETPTVPVPSKIPGYSFIDEVLLSTITLGIIVLSKRRKMNFLGK
NT seq
3372 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaaaaaaaagaagaatatcgcttatccatgctagttttaatatttttggtaagt
tttaatattggaaattctaattttagcccagaatcaaaagttattactgaaacgaatgaa
gtagaaagaagaatggatgtacctcaaaaagcatttaatgaagaatatttggatcaattt
ggaactcatgtgttaaatccaggaacctttaaccaaccttgtggagttgcaataaacagt
tcaggatttatccatattgttgattggggcggcagagtacaaatatttgatccagaattt
aattttgttagatcctttggaagttctgggtttggagatggggaatttaaccttccttat
gatattttaatcaatagtaccgggaatatatttgtttcagacagacaaaatggcagagtt
caagtttttgaccaatttgggaacttcattaagattatcggagaatatatcttccaaaaa
ccccgagggattgcattaaatagttcagaacatttatatgttgcagatactcagcagaat
cagatatttatttgttcacctagtggtgaaatcattaaaactattggttcatatggatct
ggtgatggccaattttattccccagctggtcttgcgattaatagttctggctatttatat
gtagcagataaatataactatcggatccaagtgttcgatcctaatggtctgtttataaat
tcctttggtacatcaggaatggatgatccagattttgattatccagaaaatattgtaatt
aatagcaccgggtatttatttatcaccgattctggcaataatcatgttaaagtttttgat
caagacggaaattttatcagactaatagggcaatctgggtatgatgggctaatttttaat
ccaaaagggataaccattgatctttccggaaatttattaattgcagaattagacagagat
cggattctgaattattcccaaacgggtgaatatttttcttcatttggtataacagcattc
tctgaaatcgggcaattaaatattccttcaggaatagctattaatggatcaggctatgca
tacgtatcagattcagaaaatgggagggtccaagtatttaatccttctggggaatatgtt
cgatcaattggctctccaggagtggattcctataatttatacaaaccttggggtgtggtt
ataaacgaaaccaattgggtttttgttttagatgattctgatataaaggtgtatgatcca
gaaggcaattatcaatacatgataggagaagaggatacaggaagtgaggaactccttttt
cctagaggaatagcaataaattcatcaaactatatttatgttgttgatcagaaccgtcaa
aaaattcaagtgtatgatccatcaggaaatttccatcgttcatttggaacttttgattat
gctagtgcaattgctatcaacagtagtggatttacttatattaccgatcaattagatggt
ggaaatcatgttataagagtttttaatcctttgggatctcaggttaaccaatttggatct
tatggatcagatgatggtcaattttcttctcctcagggaattgcaataaatcaaacgaat
tatgtatatgtatctgacaccgagaatgatcggatccaaatttttgaccctcaaggtaat
tatatcgatcaatttgggacttctggttataatgatggacaattaagtaaacctctcggt
attgcatttaattctctcaatcaaacctttgtggtggattcaaataatcatcgaatacag
aaatttggagaaggtatatattacaaaccaaatgctccttttttatcaaactttgggttt
ccttcaacaaaatttaattctattattctaaattggactgatgttgatgatgctcagtca
tataatctctaccgccatagatctcctataacagaaattaatagttcaatccttctgaaa
aatgttgtctcgaattatacttcagatactttaaacgatggagggggaatttattactat
gtatgcactaccattaatggatcgggtgaatcaaatccatcaaatccagttagcattgaa
tatgttgtacccgatgcacctatattatcaaatattatccccgatcaaacaacttgccat
gaaattattttgaattggactcaagtagatggtgtagaatcttataatctctatcgccat
attggcccgattatttccataaatagttcaattttcatcaaaaatatgtatacgaatgaa
accacagatattcttccatctggtggaacgttttactatgccgtgactgccgttaatggc
gcaggtgaatcaattttatctgaatcgaaaatagtcactttcctttctccaaatgcaccg
attttgtcaaaaatatttcctaacccatcaacaagttcagttattttattaaattggact
caagtaaatggagcagaatcttataatctttatcgtcataccggtccgattacttccata
aatagctctatttttctaaaaactgtcttgactaatatgactgaagatcaacttccatcg
aacggtgaatatttttatgcagttactgcacacaattctgcaggagaatcgcctgtgtca
aaaaatgtctcaatacaatatttcacactagatcctccagtattatccaatttggatcca
ttgaactataataatgaaattatcttgaattggacagatatagagggtgttgattattat
aacgtatatcgccatatatttccgatcactactttaaatagttcaattttcctatcaaca
tcagtaatttctgcatacacagactctcttaaagaatttggacagtattattatgtgatc
accacagtcaacagtcttggtgaatctaccccttcaaacatgatctatattaattttacc
ccactcattcctcccgttatttcagaaccaacattggatttcaacaatattcgtggagtc
gtctatttagagtggtcaactgttgaaggtgcagatttttataacatttatcgccataat
tcatatatttcttcaataaacagttcaatttttctccagaagacagaaaatataaatttt
acagatacccttgactcatatggtaaatactattatgtaattacagccattaattcaaat
ggtgaatctctcgaatcaaatgtaataatggtcgaatattctgaaaattcaacaatttca
gaaacacctactgtaccagtaccatctaagataccaggatactcgttcattgatgaggtt
cttttatcaacgataacattaggaattattgttctaagcaaaagacgaaaaatgaatttt
ttgggtaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
