Lactococcus petauri: lgb_01627
Help
Entry
lgb_01627 CDS
T08464
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lpet
Lactococcus petauri
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_6
pAdhesive_17
Big_13
bMG3
SdrD_B
CarboxypepD_reg
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQU60860
LinkDB
All DBs
Position
complement(1686188..1691272)
Genome browser
AA seq
1694 aa
AA seq
DB search
MKNEKWKNYLKSSQYIKKHLLSAGISGNVLLAGVVVAGAYTLFPNPIVANAAVLGVEIFG
DTTSSNNTTSSLANPYPEGSQQNVNFTISGNSAVTTNVLSGTRYAVIVIPPELRGTITPG
QATGSTNVSVDLTKVPLITGLVGTLNNTLSGLTSIVDTVTSTAGLKFDTSRLYADLNLLS
NVMTIDQGAWSQAATLSPDGSMIIVDLDKGLGPILANNVINILQDLKLAVNDLNVTVTAS
DPLGTLHLTAATLNTTLAPIKTALTVAIDGVLTPVLNDAGVLTQQLLDVSLLGSTTVNVP
TTINIPTTSMTQGTVTSKFVGTIVQSDILDVSLFSGSDSSSNIYWNGLAVLPTPPVISTV
TGNSQAGYVVKGTADPGITVKIINPATGQEIGSGLADSSGNYSITLPAGSVGANADINAT
ATDTAGNVSAPTAGKTPADADTTAPDAPVITGVTGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIKDSTG
AVIGTATADGSGNYSVSLPASVGPNADITATATDAAGNVSAPTAGKTPADADTTAPDAPV
ITGITGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIKDSTGAVIGTATADGSGNYSVSLPASVGPNADIT
ATATDAAGNVSAPTAGKTPADADTTAPDAPVITGITGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIKDS
TGTVIGTATADGSGNYSVTLPASVGPNANITATATDAAGNVSAPTAGKTPADADTTAPDA
PVITGVTGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIKDSTGAVIGTATADGSGNYSVTLPASVGPNAN
ITATATDAAGNVSVPTAGKTPADADTTAPDAPVITGITGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIK
DSTGAVIGTATADGSGNYSVTLPGSIGPNADITATATDAAGNVSVPTAGKTPADADTTAP
DAPVITGITGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIKDSTGAVIGTAIADGSGNYSVSLPASVGPN
ADITATATDAAGNVSAPTAGKTPADADTTAPDAPTITNVTGNSTDGYTVTGTAEASSKVE
IKDSTGAVIGTATADGSGNYSVALPASVGPNADITATATDAAGNVSAPTAGKTPADADTT
APDAPVITDITGNSTDGYTVTGTAEAGSKVEIKDSTGAVIGTATADGSGNYSVTLPGSIG
PNADITATATDAAGNVSAPTAGKTPADADTTAPDAPVITGITGNSTDGYTVTGTAEAGSK
VEIKDSTGAVIGTAIADGSGNYSVSLPASVGPNADITATATDAAGNVSAPTAGKTPADPK
DTTAPNAPTITNVSGNSTKGYVVTGKAEAGSTVKIKNASDTVIGSVVADGSGNYSVTLPG
SVGPNADITATATDAAGNVSAPTAGKTPADPKDTTAPNAPTITNVSGNSTKGYVVTGKAE
AGSTVKIKNASDTVIGSAVADSSGNYSVTLPGSVGPNADITATATDVAGNVSAPTAGKTP
ADPKEPTDSTAPDAPTITGVTGDSTKGYVVTGKAESGSTVKIKNAAGTVIGSAVADSSGN
YSVTLPGSVGPNADITATATDASGNVSAPTAGKTPADPKDTTAPDSPKVTDVTKNPDGGY
DVGGTAEPGSTVTITDGNGNVVGSGKTDDSGHFHITLPAGSVKPGDVLNITATDAAGNES
APSHFQIPSNTVVPVTFGGSGGQYSNGLPAYYAKGVTLPATGESDNTLPTVIGFSLLAFL
SLLLTNLRRRKDVN
NT seq
5085 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaaatgaaaaatggaaaaattatttaaaaagtagtcaatatataaaaaaacattta
ttatcagccggtatatcaggaaatgtacttctagcaggtgtcgtagtagctggggcttat
acgctattcccaaaccctatcgttgccaatgctgcggtattaggagtagaaatctttggg
gataccacctcttcaaacaacacgacttcaagtctagctaacccctatccagaagggtca
caacaaaatgtaaactttacaatttcagggaattctgcagtaactacgaatgtcttatct
ggtacgcgatatgcagtcattgttattccaccagaactacggggaacgataacaccggga
caggcaaccggaagcaccaatgtctcggttgatttgactaaagttccactaataacagga
ctagtgggaacattaaataatacgttgagtggtttaacaagtattgttgacacagtgacg
agtacagcaggactgaagtttgatacctcgcgactctatgctgatttgaatttattgtcc
aatgtaatgaccattgatcaaggcgcatggtcacaagcagcaactctaagccctgatggc
tcaatgattatagttgatttggataaaggtttgggtccaattttagctaataatgtgatt
aatatcttgcaagacttaaaattagcggttaatgacctcaatgttactgttacagcaagc
gatcctttgggtacattacacttaacagctgcgactcttaatactacgctggcgcccata
aaaactgctttgaccgtggctattgatggtgtattaactcctgttttaaatgatgcaggt
gttttgacacaacaattgttggatgtttctttgctaggaagtacgacggttaatgtacca
acaacgataaatatacctacgacatcaatgacacaaggaactgttacttcaaaatttgtt
ggtacaattgtccaatcagatattttggatgtgagtcttttcagtggatcagatagctct
tcaaatatttactggaatggattagctgtattaccaacaccacctgtaatttcaactgtt
accggaaattctcaagccggttatgttgtaaaaggaacagctgacccaggaattacagta
aagattattaatccggctacaggtcaagaaattggaagcggattagcagatagttcaggt
aactatagtattacgttgccagccggatcagttggcgccaatgcagatattaatgccacc
gcgacagatacggccggcaatgtaagtgcaccaacagccggcaaaacgccagccgatgcg
gatacgacagcccctgatgcaccagtaattaccggcgtcacaggtaactctacagacggt
tacactgtgacaggtacggctgaagcgggttcgaaagtagaaatcaaagattcgactggc
gcagttattggcactgccacagcagatggatctggcaactacagcgtgagcttaccagct
tcagttggcccaaatgccgatattacagcgaccgcaaccgatgcggcaggcaacgtaagt
gcaccaacagccggcaaaacgccagccgatgcggatacgacagcccctgatgcaccagta
attaccggcatcacaggcaattcgacagatggttatactgtgacaggtacggctgaagcg
ggttcgaaagtagaaatcaaagattcgactggcgcagttattggcactgccacagcagat
ggatctggcaactacagcgtgagcttaccagcttcagttggcccaaatgccgatattaca
gcgaccgcaaccgatgcggcaggcaacgtaagtgcaccaacagccggcaaaacgccagcc
gatgcggatacgacagcccctgatgcaccagtaattaccggcatcacaggcaattcgaca
gatggttatactgtcacaggtacggctgaagcgggttcgaaagtagaaatcaaagattcc
accggaacagttattggcacagccacagcggatggttccggcaattacagcgtaacttta
ccggcatcagttggcccaaacgctaatatcacagcgaccgcaaccgatgcggccggtaac
gtaagtgcaccaacagccggcaaaacgccagccgatgcggatacgacagcgcctgatgcg
ccagtaattaccggcgtcacaggtaactctacagacggttacactgtcacaggtacggct
gaagcgggttcgaaagtagaaatcaaagattcgactggcgcagttattggcactgccaca
gcggatggttccggcaattacagcgtaactttaccggcatcagttggcccaaacgctaat
atcacagcgaccgcaaccgatgcggccggcaatgtgagcgtaccaacagccggcaaaacg
ccagccgatgcggatacgacagcccctgatgcaccagtaattaccggcatcacaggcaat
tcgacagatggttatactgtcacaggtacggctgaagcgggttcgaaagtagaaatcaaa
gattcgactggcgcagttattggcactgccacagcggatggttccggcaattacagcgta
actctcccgggctcaattggcccaaacgctgatatcacagcgaccgcaaccgatgcggcc
ggcaatgtgagcgtaccaacagccggcaaaacgccagccgatgcggatacgacagcccct
gatgcaccagtaattaccggcatcacaggcaattcgacagatggttatactgtcacaggt
acggctgaagcgggttcgaaagtagaaatcaaagattcgactggcgcagttattggcact
gccatagcagatggatctggcaactacagcgtgagcttaccagcttcagttggcccaaat
gccgatattacagcgactgcgacagatgcggcaggtaatgtaagtgcaccaacagccggt
aaaacgccagccgatgcggatacgactgcccctgatgcaccgacaatcactaatgtgaca
ggtaactctacagatggctatacagtgactggtacagccgaagccagttcaaaagtagaa
atcaaagattcgactggggcagtcattggcactgccacagcggatggttccggcaattac
agcgtggccctaccagcttcagttggcccaaacgctgacatcacagcgaccgcaaccgat
gcggcaggtaatgtgagcgcaccaacagccggcaaaaccccagccgatgcggatacgaca
gcccctgatgcgccagtaattaccgacatcacaggtaactctacagacggttacactgtc
acaggtacggctgaagcgggttcgaaagtagaaatcaaagattcgactggcgcagttatt
ggcactgccacagcggatggttccggcaattacagcgtaactctcccgggctcaattggc
ccaaacgctgatatcacagcgaccgcaaccgatgcggcaggtaatgtaagtgcaccaaca
gccggcaaaacgccagccgatgcggatacgacagcccctgatgcaccagtaattaccggc
atcacaggcaattcgacagatggttatactgtcacaggtacggctgaagcgggttcgaaa
gtagaaatcaaagattcgactggcgcagttattggcactgccatagcagatggatctggc
aactacagcgtgagcttaccagcttcagttggcccaaatgccgatattacagcgactgcg
acagatgcggcaggtaatgtaagtgcaccaacagccggtaaaacgccagcagatccaaag
gataccacagcaccaaatgcaccgacaattactaatgtgtccggcaattccacgaaaggt
tatgtcgtgacaggtaaagcggaagctggttccactgtgaagattaaaaatgcgtcagat
actgtcattggtagtgttgtggcggatggttctggcaactacagcgtaactctaccgggt
tcagttggcccaaacgctgatatcacagcgactgcgacagatgcggcaggtaatgtaagt
gcaccaacagccggtaaaacgccagcagatccaaaggataccacagcaccaaatgcaccg
acaattactaatgtgtccggcaattccacgaaaggttatgtcgtgacaggtaaagcggaa
gctggttccactgtgaagattaaaaatgcgtcagatactgtcattggtagtgctgtggcg
gatagttctggcaactacagcgtaactctaccgggttcagttggaccaaacgctgatatc
acagcgactgcgacagatgtggccggcaatgtgagtgccccaaccgcaggtaaaacgcca
gcagatcctaaggaacctacagatagtaccgcaccggatgcaccgacaattactggagtc
acaggagattctacaaagggttatgtcgtgacaggtaaagccgaatctggctctactgtg
aagattaaaaatgcggcaggtactgttattggcagcgccgtagcagatagctctggcaac
tacagcgtaactttaccgggctctgttggtccaaacgctgatatcacagcgaccgcaacc
gatgcgtccggcaatgtaagtgcaccaacagccggtaaaacaccagcagatccaaaggat
actacagcgccagattcacctaaggttacggacgtcactaagaatcctgacggaggctat
gatgtaggtggaactgcagaaccaggttctacggttacgattacggatggcaatggtaat
gtggttggcagtggtaaaacagatgattctgggcacttccacattacattaccagctggt
agtgtgaaaccaggggatgttcttaatattacagcaacagatgcagcaggtaatgagagt
gcgccaagccattttcaaatcccatctaataccgttgtaccagtgacatttggtggaagt
ggaggtcaatattcaaatggcttgccagcttattatgccaagggtgtaacccttcctgca
acaggggaaagtgacaacaccctgccaacagtaattggttttagccttttagcttttcta
agccttttacttacaaatttaagaagaagaaaagatgttaactaa
DBGET
integrated database retrieval system