Lactiplantibacillus plantarum JDM1: JDM1_1104
Help
Entry
JDM1_1104 CDS
T00946
Name
(GenBank) cell surface SD repeat protein precursor
Organism
lpj
Lactiplantibacillus plantarum JDM1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACT61991
LinkDB
All DBs
Position
1182919..1187844
Genome browser
AA seq
1641 aa
AA seq
DB search
MTITNKVGLDSGYSVSGTPTYVWYVSTDGATWTTISGATSATYTTTATTSGTYYYQAVVS
GKRVTALILTSNFEAAGNVITIVVTNPEGTYTEIASSYASQANSAASVATSQAAAASSAI
SLASSSANLTGSLASYYTSQANSSYNAASSYASVASEAASIATMASTSAASYEAEGAYTS
ANIWAGMASSYASVATEYASSASSAASEAAASLDTALKNAVNEDGGDTAADYLASSYASM
AASSANVAGDQASLAASYAANAANAYNVAGSSFNTTATSSYNAAASSAAVAASSYAAAAS
EAASLAASYAADGNYNSAALQQSYAALRLTYATDQLNAASSAASAITQTVVQAQSSYYNS
IATAASSAASAAESAAGNAISVASSLSAKYASNTTLGSSYVAQTNNYAVTTLGAAAAATS
AAEMAAQYTSQASSAVAAGDYAMASSYVTNASAAASEATSYAALSTSNAALGSTAASNAT
NYSNNTNSYKSTNTGNATTILGIVISGGMTSQPAAVTSTVSGGTFTLSASSALGLGGVAL
SSKTTWYVQVNGTWMTLDKASAYIESYDAVDSAGLLSTSSSLTVTIKAGYTGSLLFQAVQ
GFSWDLLNLATVYTFASNLAEVDVYSSNIPATNISIAGDDYVINPTNSSSGSNDKVTSQF
TSTTNPENATGTITWTTSDSSIATIDDSGLLTVVSNGTVTITATITNADGTSYSSSKTIT
IGSGLEDATVDAGSDLTWVPDGSTTGTGTNVTYQWYYSSTADGTGTALSGQTGTTLNLSD
LTVGQSGYYYLVITGSNTTNGTTTTTTVTLGRAYLTVNAVSTEAADSAASEAANYANQAT
EYGSVASSYANIAGEYASKNSEASSYAEQATAAASDAQSAATAASTAASNAAAAQSNADS
AEAAGENSAASSYAEEAKKKASEASEAKKKASSAADDAGYYADLAANVSEDDSDSDSDGD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSGSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSD
SDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSGSDNDSDSDSDSNNDSDSDTITD
SDSNDGTNSDNGSNSGSDGSSSSNTGSGSGNTTGSTGNNSGTGTGTTTSSTASNNGAAST
STTSLSAAATSGVSATAATLAVTTPSSDGAATTSATAATSVVYAAASAQDVDATSDQTDS
DSKSSNDSDKDKKSADTDSADDKVGSSNTDENGKTASDTSNNAGTIFGGLLTAAAAAGLG
WWFFLFGRRRKDDDEDDENQK
NT seq
4926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgacaattaccaacaaggtgggtttggattcaggatattcagtaagtggtacaccaact
tatgtttggtatgtctcaacggatggagcaacttggacgaccattagtggtgcaacatcg
gcaacgtatacaacaactgcaactacttcagggacgtattattatcaagcagtcgttagt
ggtaagcgggttacagcattaatcttgacttcaaattttgaagcagctggtaatgtgatt
accattgttgttaccaatccagaagggacctacactgaaattgccagcagttatgccagc
caagccaacagcgcagcctcagtggcaacctctcaagctgccgctgcaagtagtgcgatc
agtttggccagttcttcagctaacttgacgggctcattagctagctactacacatcacag
gctaattcttcatacaacgcagctagctcatatgcgagtgtggcttcggaggcggcaagt
attgcaactatggccagtacttcggccgcttcttatgaagccgaaggggcgtataccagt
gctaatatctgggcaggaatggcatcgagttatgcgagtgttgcaactgaatatgctagt
tctgcaagtagtgcggcatctgaggcagcagctagtctcgatactgctttgaaaaatgcg
gttaatgaagatggtggtgataccgctgctgattatttagcatcaagttatgccagtatg
gctgcgtcatcggcaaatgtggccggtgaccaagcctcgttagctgcatcctatgcggcc
aacgctgctaatgcatataacgttgctggttcttcatttaataccactgcaactagcagt
tataatgcagcggcaagttctgcagctgtagcggctagttcatacgctgcggcagctagt
gaagcagcaagtcttgctgcttcatatgcagcggacgggaattataattcggctgccttg
caacaaagctacgcggctttgcgtttaacctatgccacagatcaattgaatgctgcttcg
agtgcggcgagtgcgattacccaaacggtcgtgcaagcacaatccagttattataattcg
attgcaacggctgcttctagcgcagcgtcagcagctgaatcggcagccgggaacgcaatc
agtgtcgcgagttcattaagtgcaaagtatgcgtcaaacaccacgttgggtagctcatac
gttgcacaaactaataattatgccgtgacaactctgggtgcagcggcggccgcaacttca
gctgcggaaatggcagctcagtatacaagccaggcttcatcggcagtagctgcgggcgat
tatgctatggccagctcatatgtgaccaatgcctcagcagcagctagtgaagcaacctca
tatgcggcattgtctacatccaatgcggctttaggtagtacggcggctagcaacgcgacg
aattattcaaacaatacgaattcatataaaagcactaatacgggtaatgcaacgacaatt
ctagggattgttatttctggtgggatgacttctcaacccgcagcagtgacgtcgaccgtt
tctggtgggacctttaccttgtcagcttcgtcagcattaggactaggtggggttgcacta
tcatcaaaaacaacttggtatgttcaagtcaacggcacttggatgaccttagataaggcc
agcgcttatattgaatcatatgatgcagttgacagtgctggtttactgtcaaccagtagc
tcattaacagttactatcaaagcgggctatactggatcattactattccaagccgtacaa
gggttttcttgggacttattaaacttggctacagtttatacatttgcaagtaatttagcg
gaagtagatgtttatagtagcaatattccagcaacaaacatttccatagctggtgatgat
tacgtcattaatccaacgaacagttcgagtggctcaaacgataaggttactagccagttt
acatcaacgactaaccctgagaatgctacgggaacgattacctggacgacaagtgattca
agcattgcgacaattgatgattctggccttttgaccgttgtgtctaatggaacggtgaca
atcacagcaacaattacaaatgcagacggaactagctattcatcttcaaagacaattaca
attggtagtggccttgaggatgcaactgttgatgcaggaagtgatttgacgtgggttcca
gatggctcgactacgggtactgggactaatgttacttatcaatggtattattcttcaaca
gcggacggtactggaacagcgctgagtggtcagactggtacgacacttaatctgtcggat
ctgacagtagggcaatccggttattactacctagttattactggatccaatacgactaac
gggactactaccacgacaactgtaactttaggccgggcttacttgactgttaatgctgtt
tcaactgaagcggcagattctgcagctagcgaagcagctaactacgcaaatcaagcgacg
gaatatggttcagttgctagttcttatgcgaacattgcgggcgaatatgcaagtaaaaac
tcagaagcaagctcctacgcagaacaagcaacggcagcagcttctgatgcacagtcagcc
gcaacagctgcttcaactgcagcctctaatgcggcagccgcccaatcaaatgcagattct
gcggaagctgctggcgaaaactcggctgcttccagttatgcagaggaagctaaaaagaaa
gcgtccgaagcatctgaagctaaaaagaaagcttcaagtgccgctgatgatgcaggctac
tatgctgatttagctgctaatgttagtgaagatgactcggatagtgattctgacggcgac
agtgattcggatagcgacagtgattcggactctgacagtgattcggattccgacagtgat
tctgactcagacagcgactcggattctgatagtgattcggattctgatagtgattcggat
tccgacagtgactcggattctgatagtgattcggatagtgacagcgactcagattccgac
agtgattcggactctgacagtgattcggattccgatagcgactcggactcggacagcgac
tccgactccgacagtgattccgactccgattctgacagtgactcggactcggacagcgat
tcagatagcgacagtgattccgactcggatagcgatagtgactcagattccgacagtgat
tcggactctgacagtgactcagattccgatagtgattccgactcggacagtgattcagat
agcgacagtgattccggctcggatagtgactcagattccgatagtgattcggacagcgac
agtgactcagattcggacagtgattccgactccgactctgatagtgattcggattcggat
agtgactccgacagcgattccgattcagactcggacagcgattcagattccgacagtgat
tcggactccgacagtgattcggatagcgacagtgactcagattccgacagcgattcagac
agtgattcggattcggatagcgattccgacagtgactcagactctgatagtgattcggat
tcagacagtgattcggactcggacagcgactcggattcggatagtgattccgactccgac
agtgattctgattctgatagtgacagtgactccgactcggacagcgattcagactcagac
agtgattccgactcggacagcgactccgattctgacagtgattccgactcggatagtgac
tcggattctgacagtgattccgattcggactcggacagcgattccgattctgactccgac
agtgactcagactcggacagcgactccgattctgacagcgattcggattctgacagtgat
tccgactctgatagcgattctgactcggacagcgactcagattcggatagcgacagtgac
tccgattctgacagtgattccgactcagacagcgattccgatagtgactccgattcggac
tcggatagtgattccgattcggacagcgattcggactcggacagcgattcggactcggat
agtgattcggattccgacagtgactcggactcagatagtgattcagattccgacagtgac
tcggactcagatagtgattccgactcagacagcgactcggattccgatagtgattcggat
tccgacagcgactcggattccgacagtgacgctgactcagacagcgactcaggttccgac
aacgactcagactcagacagtgattcgaataacgacagtgactccgatacaatcacagat
tcagattcaaatgatggaaccaattctgacaatggtagtaattctggctcagatggaagt
tccagttcaaatactggatcaggttcgggcaatacgacgggctctactggaaataattca
ggtactggcactggtacgacaacttcatcgactgcttctaacaacggtgctgcttcgaca
agtacgactagcttgagtgctgcagcaacaagtggtgtctcggccacagccgcaacgttg
gcggttacgacaccatccagtgacggtgctgcaacaacgtcagcaactgctgctacatca
gtggtttatgccgctgctagcgctcaagacgttgatgcaacttctgatcagactgattca
gattcgaagagtagtaatgattctgataaggataagaagtcagctgatactgatagtgct
gatgataaggtcggctcaagtaatactgacgagaatggtaagactgcatctgatacaagt
aataatgccggaacgattttcggtggcttgttgaccgcggctgcagctgctggactcggc
tggtggttcttcttgttcggtcgtcgtcgtaaagatgatgatgaagatgatgagaatcaa
aaatag
DBGET
integrated database retrieval system
