Lactiplantibacillus plantarum WCFS1: lp_1303a
Help
Entry
lp_1303a CDS
T00115
Symbol
sdr
Name
(GenBank) cell surface SD repeat protein precursor,membrane-anchored
Organism
lpl
Lactiplantibacillus plantarum WCFS1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
KxYKxGKxW_sig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCC78671
UniProt:
F9UN82
LinkDB
All DBs
Position
1193143..1203279
Genome browser
AA seq
3378 aa
AA seq
DB search
MKFLRHKSFRGDPQVHYKMFKVGRTWVFTAMASFVLTAAPQLVSHADTVSADTSSDTASS
ATSSASSGADTSSAAASAAALAAATASSTSTSTTSDSSTASSSSETASNSNSESSSDSSS
SDDSASDASSASETSTTNATSTSSTSSSSVSTASSSASSASSSSSSSSSSATSSSLTDSS
SSSAASSSTTSLSSSASVAASTVSTASSVASTTKSASTAASTAAIAAYSSVSAASSHTDS
TAAKAASSSASLAGSYATLASSYASLVNNLTTQAAVSAAQSAYQEALNAADLSRHYNSIA
NMYLDALTNGVGSNVDNAIAYSGANSLAYSAASAASSYAALASTATSTASSAATQGLINL
ASSNYSAASSAASAATVAASSAAEAANSAYLAMQYDKNNTAVTSAYTVASSTAAAASTAA
VNATTAAVAASSAYAAVSSNAANNDYEATSTAYAVTSSAATEALGQYAAGSTASSAASFA
NSTAISDLASAASSSANVANTAKSTASSAASVAATQTGTQASAYASSAATAASSASSAYA
VASTAAKSAVSASDPATADSYARVAQSASSLAASYAATAESNATLAAKFSTDVANEQTVS
SNATLTTSTATQSVSTGDTVTITNKVGLDSGYSVSGTPTYVWYVSTDGTTWTTISGATSA
TYTTTATTSGTYYYQAVVSGKRVTAIILTSSFKAAGNVITIVVTNPEGTYTEIASSYASQ
ANSAASVATSQAVAASSAISLASSSANLTGSLASYYTSQANSSYNAASSYASVASEAASI
ATMASTSAASYEAEGAYTSANIWAGMASSYASVATEYASSASSAASEAAASLDTALKNAV
NEDGGDTAADYLASSYASMAASSANVAGDQASLAASYAANAANAYNVAGSSFNTTATSSY
NAAASSAAVAASSYAAAASEAASLAASYAADGNYNSAALQQSYAALRLTYATDQLNAASS
AASAITQTVVQAQSSYYNSIATAASSAASAAESAAGNAISVASSLSAKYASNTTLGSSYV
AQTNNYAVTTLGAAAAATSAAEMAAQYTSQASSAVAAGDYAMASSYVTNASAAASEATSY
AALSTSNAALGSTAASNATNYSNNTNSYKSTNTGNATTILGIVISGGMTSQPAAVTSTVS
GGTFTLSASSALGLGGVALSSKTTWYVQVNGTWMTLDKASAYIESYDAVDSAGLLSTSSS
LTVTIKAGYTGSLLFQAVQGFSWDLANWFTVYTFASNLAEVDVYSSNIPATNISIAGDDY
VINPTNSSSGSNDKVTSQFTSTTNPENATGKITWTTSDSSIATIDDSGLLTVVSNGTVTI
TATITNADGTSYSSSKTITIGSGLEDTSVDAGSDLTWVPDGSTTGTGTDITYQWYYSSTA
DGTGTALSGQTGTTLNLSDLTVGQSGYYYLVITGSNTTNGTTTTTTVTLGRAYLTVNAVS
TEAADSAASEAANYANQATEYGSVASSYANIAGEYASKNSEASSYAEQATAAASDAQSAA
TAASTAASNAAAAQSNADSAEAAGENSAASSYAEEAKKKASEASEAKKKASSAADDAGYY
ADLAANVSEDDSDSDSDGDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDGDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSNSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDS
DSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDSDADSDSDSDSDSDSNNDSDSDTITDSDS
NDGTNSDNGSNSGSDGSSSSNTGSGSGNTTGSTGNNSGTGTGTTTSSTASNNGAASTSTT
SLSAAATSGVSATAATLAVTTPSSDGAATTSATAATSVVYAAASAQDVDATSDQTDSDSK
SSNDSDKDKKSADTDSADDKVGSSNTDENGKTASDTSNNAGTIFGGLLTAAAAAGLGWWF
FLFGRRRKDDDEDDENQK
NT seq
10137 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatttctgagacataaatcttttaggggagatccgcaagttcactacaagatgttt
aaagtcggccgtacttgggtatttacggcgatggcatcatttgtattgactgctgcacct
cagttagtatctcatgcagatacggtttcggcggatactagtagcgatacggcaagtagt
gccactagtagtgccagctcgggggcggatacgtcttctgcagcagcgagtgcggcggca
ctagctgctgcaacggcaagtagtacgtcaactagtactaccagtgactcgtctacggca
tcttcttcgagtgaaactgcctcgaacagtaattccgaatcttcatcggatagttcaagc
agcgatgacagtgcttcagacgcaagttctgcgagcgaaacaagtacgactaatgcgaca
agtacatcaagtactagtagtagcagtgtttcaacggctagttcgagcgcatccagcgca
agttcaagtagtagttcgagctcgtcaagcgctacttcatcgagtttaactgatagcagc
agttcttccgcagctagctcaagtacgacgagtttgtcaagcagtgctagcgtagcggca
agtactgtctcgacagcaagcagtgttgccagcacgactaagtctgcaagtacggcggct
tcaacggcagccattgcagcttactcgtcggtatcggctgccagctcacataccgatagt
accgcagctaaggcggcttcatcatcagcttcattagctggttcatacgccacacttgcc
agcagctatgctagtttggtcaataacctaacgacgcaagcagcagtgagtgcggcccaa
agtgcctatcaagaagcgcttaacgcggctgatttgtcacggcactacaatagtattgca
aacatgtacttagacgcattgacaaatggtgtggggtccaatgttgataatgcaatcgca
tactctggtgcaaactctttagcatatagtgcagcgagtgcggccagttcatacgcagcc
ctggcttcaacggccacctcaacggccagcagtgctgctacccaaggcttaattaattta
gcaagtagcaattattccgccgcatctagtgcggcatctgcagccacggtagcagccagc
tcggcagctgaagcagccaacagtgcatacttagccatgcaatacgacaaaaataatacg
gccgttacctcagcttacaccgttgcttctagcacggcagctgcggcttcaacggccgcg
gttaacgcaacgaccgctgcggtggcagcttcctcagcctatgccgcggtaagtagtaat
gcggcaaataatgactatgaagccactagtactgcctatgcagttacttcttccgccgca
acggaggcgcttggtcaatatgccgccgggagcaccgctagttcggcagccagttttgcc
aacagtactgcaattagtgatttggcgagtgcggcttcttcaagtgcaaacgtggcgaat
acagcaaagagtacggcttcaagtgcggccagtgtggcagcaacgcaaactggtactcaa
gcgtcagcttatgcttcaagtgctgcaacggccgctagctctgcttcatcagcctacgcc
gtcgcaagtacggctgcaaaatccgctgtcagtgctagtgatcctgccaccgcggactca
tacgctcgggtggcccaatcggcatcttcattggctgctagttacgctgcaactgccgag
tctaacgcgactttagctgctaagttttcgacggatgtcgctaatgaacaaaccgttagt
tccaatgcgactttaacgacgagtacggcaacgcaaagtgtctcgactggagatactgtg
acaattaccaacaaggtgggtttggattcagggtattcagtaagtggtacaccaacttat
gtttggtatgtctcaacggatgggacaacttggacgaccattagtggtgcaacatcggca
acgtatacaacaactgcaactacttcagggacgtattattatcaagcagtcgtgagtggt
aagcgggttacagcaataatcttgacttcaagttttaaagcagctggtaatgtgattacc
attgttgtcactaatccagaaggaacttacactgaaattgccagcagttatgccagccaa
gccaacagcgcagcctcagtggcaacctctcaagccgtcgctgcaagtagtgcgatcagt
ttggccagttcttcagctaacttgacgggctcattagctagttactacacgtcacaggct
aattcttcatacaacgcagctagctcatatgcgagtgtggcttcggaagcagcaagtatt
gcaactatggccagtacttcggccgcttcttatgaagccgaaggggcgtatactagtgct
aatatctgggcaggaatggcatcgagttatgcgagtgttgcaaccgaatatgctagttct
gcaagtagtgcggcatctgaggcagcagctagtctcgatactgctttgaaaaatgcggtt
aatgaagatggcggtgataccgctgctgattatttagcatcaagttatgctagtatggct
gcgtcatcggcaaatgtggccggtgaccaagcctcgctagctgcatcctatgcggccaac
gctgctaatgcatataacgttgctggttcttcatttaataccactgcaactagcagttat
aatgcagcggcaagttctgcggctgtagcggctagttcatacgcagcggcagctagtgaa
gcggcaagccttgctgcttcatatgcagcggacgggaattataattcggctgccttgcaa
caaagctacgcggctttgcgtttaacctatgccacagatcaattgaatgctgcttcgagt
gcggcgagtgcgattacccaaacggtcgtgcaagcacaatccagttattataattcgatt
gcaacggctgcttctagcgcagcgtcagcagctgaatcggcagccgggaacgcaatcagt
gtcgcgagttcattaagtgcaaagtatgcgtcaaacaccacgttgggtagctcatacgtt
gcacaaactaataattatgccgtgacaactctgggtgcagcggcggccgcaacttcagct
gcggaaatggcagctcagtatacaagccaggcttcatcggcagtagctgcgggcgattat
gctatggccagctcatatgtgaccaatgcctcagcagcagctagtgaagcaacctcatat
gcggcattgtctacatccaatgcggctttaggtagtacggcggctagcaacgcgacgaat
tattcaaacaatacgaattcatataaaagcactaatacgggtaatgcaacgacaattcta
gggattgttatttctggtgggatgacttctcaacccgcagcagtgacgtcgaccgtttct
ggtgggacctttaccttgtcagcttcgtcagcattaggactaggtggggttgcactatca
tcaaaaacaacttggtatgtccaagtcaacggcacatggatgactttagataaggctagc
gcttatattgaatcatatgatgcagttgacagtgctggtttactgtcaactagtagttca
ttaacagttactatcaaagcgggctatactggatcattgctgttccaagccgtacaaggg
ttttcttgggacttggcaaactggtttacagtttatacgtttgcaagtaatttagcggaa
gtagatgtttatagtagcaatattccagcaacaaacatttccatagctggtgatgattac
gtcattaatccaacgaacagttcgagtggctcaaacgataaggtgactagccagtttaca
tcaacgactaaccctgagaatgctactggaaagattacctggacgacaagtgattcaagc
attgcgacaattgatgattctggccttttgaccgttgtatctaatggaacggtgacaatc
acagcaacaattacgaatgcagacggcactagctattcatcttcaaagacaattacaatc
ggtagcggccttgaggatacgagtgttgatgctggaagtgatttgacgtgggttccagat
ggttcgactacgggtactgggactgatattacttatcaatggtattattcttcaacagcg
gacggtactggaacagcgctgagtggtcagactggtacgacacttaatctgtcagatctg
acggtagggcaatccggttattactacctagttattactggatccaatacgactaacggg
actactaccacgacaactgtaactttaggccgggcttacttgactgttaatgctgtttca
actgaagcggcagattctgcagctagcgaagcagctaactacgcaaatcaagcgacggaa
tatggttcagttgctagttcttatgcgaacattgcgggcgaatatgcaagtaaaaactca
gaagcaagctcctacgcagaacaagcaacggcagcagcttctgatgcacagtcagctgca
acagctgcttcaactgcagcctctaatgcggcagccgcccaatcaaatgcagattctgcg
gaagctgccggcgaaaactcggctgcttccagttatgcagaggaagctaaaaagaaagcg
tccgaagcatctgaagctaaaaagaaagcttcaagtgccgctgatgatgcaggctactat
gctgatttagctgctaatgttagtgaagatgactcggatagtgattctgacggcgacagt
gattcggatagcgacagcgattccgactcagacagtgattcggattccgatagcgactcg
gactcggacagcgactcggactcggacagtgactccgacagtgattccgactccgatagc
gactccgattctgacagtgactcggactcggacagcgattcagatagcgacagcgactca
gattccgacagtgattccgactctgacagtgattcggattccgatagcgactcggactcg
gacagcgactccgactccgacagtgattccgactccgatagcgactccgattctgacagt
gactcggactcggacagcgattcagatagcgacagtgattccgactcggatagtgattcg
gattccgacagcgactcggatagcgatagtgactcagattccgacagtgattccgactct
gacagtgactcagattccgatagtgattccgactctgacagtgattccgactccgacagc
gattccgactcggatagtgactcagattccgatagtgattcggacagcgacagtgactca
gattcggacagtgattccgactccgacagtgactccgattcggatagtgactccgacagc
gattccgactcagattcggatagtgattcggattcagacagtgactccgactccgacagt
gattcggactcggacagcgactcggattcggatagtgattccgattcggatagtgattcg
gattcagacagtgactcagactctgatagtgattcggactcggacagcgattcggactcg
gacagcgactcggattcggatagtgactccgacagtgattcagatagcgacagtgactcc
gactccgacagtgattcagatagcgacagtgactccgactcggacagtgattccgattcg
gatagcgactccgattcagacagtgattctgactcggatagtgattctgactcggatagt
gattctgactcggatggtgattctgactcggacagtgattccgattcggatagcgactcc
gattctgacagtgattccgactctgatagcgactcagattccgacagtgattccgactcc
gatagcgactcagattccgacagtgattcggactccgacagcgattcggactcggacagc
gactccgattcagacagtgattcggactccgacagtgattcggatagcgacagtgactcc
gactccgatagtgattccgattcagacagtgattcggactccgacagcgattcggattcc
gatagtgattccgactcggatagtgactccgattctgacagtgattcagactccgacagc
gattcggattccgatagtgattccgactcggatagtgactcagattccgatagtgattcg
gacagcgacagtgactccgattctgacagtgattcagactcggatagtgactcagattcc
gatagtgattcggacagcgacagtgactccgactcagacagtgactcagattccgacagc
gattccgactcggattcggacagtgattcggactccgacagtgactcggattcggatagt
gattcggattccgacagtgactcagactcagacagcgattcagactcagatagtgactca
gattccgacagcaattcagactctgatagcgactccgattccgacagtgattcggattcc
gacagcgactccgattccgacagtgattccgattcagacagtgattcggactccgacagc
gattcggattccgatagtgattcagattcagactcggacagcgactcggattcggatagt
gattcggactcggacagcgactcggattcggatagtgattccgactcggacagcgattcc
gattcagacagtgattcggatagcgacagtgactcagactctgatagtgattcggactcg
gacagcgactcggattccgatagcgattcagactcggacagcgattcagattccgacagt
gattcggactccgacagtgattccgattccgacagtgactcggactcggacagtgactcg
gactccgacagtgattcagactcagacagtgattcggatagcgacagtgactcagattcc
gacagcgattcagactcggattcggacagtgattcggattcggatagcgattccgacagt
gactcagactctgatagtgattcggattccgacagtgattccgactcggacagcgactcg
gattctgatagtgattccgactccgacagtgattctgattctgatagtgacagtgactca
gactcggacagcgattcagactcagacagtgattccgactcggacagcgactccgattct
gacagtgattccgactcggatagtgactcggattctgacagtgattccgattctgactcc
gacagtgactcagactcggacagcgactcagattctgacagcgattctgattctgatagt
gattccgactctgatagcgattctgactcggacagcgactcagattcggatagcgacagt
gactcagattccgatagtgactccgattctgacagtgactccgattctgacagtgattct
gactcggatagtgattcagattccgatagtgattccgattcggatagtgactcagactca
gacagtgattccgactccgatagtgattcggattctgacagcgattcagactcagacagt
gactcggactcagacagtgattcggatagcgacagtgactcagattccgacagtgactca
gactcagacagtgactcggattcggacagcgacagtgactccgactcggatagtgattct
gactcagacagtgactcagactctgatagtgattcggattccgatagtgattccgattcg
gacagtgactccgattccgatagtgattctgacagcgattccgactccgacagtgactca
gactcggatagtgattcggattccgacagcgactccgattcggatagtgactcggattcc
gacagtgattccgattcggatagtgattcagatagcgacagcgattccgactcagacagt
gattccgattctgacagtgactcggattccgacagtgattctgactcagacagtgattcg
gatagcgacagcgattccgacagtgactcagattccgatagtgattctgactctgatagc
gactcggattccgacagtgattcggatagcgacagcgattcagatagcgacagtgattca
gattccgacagcgattcggactctgatagtgactccgactcggatagtgattcggattcc
gacagtgattcggattccgacagtgattcggactctgatagtgattcagatagcgacagc
gattcagactctgatagcgattccgatagtgactcagactcagacagtgattccgactcc
gatagcgactcagattccgatagtgattcggattccgacagcgattccgactcagacagt
gattccgactccgacagtgactcagattccgatagtgattctgactctgatagtgattca
gattccgacagtgactcagactctgatagtgattccgactctgatagcgactccgattcc
gacagcgattccgactcagacagtgattccgattcggacagtgacagtgactcagactca
gatagtgattccgattctgacagtgattcggattctgacagtgattccgactctgatagc
gattccgattctgacagtgattcggatagcgacagtgactcagactcggacagtgactca
gatagcgacagcgattccgattctgacagcgactcagactctgatagtgattctgactct
gacagtgattccgattccgacagtgattccgactctgatagcgacagcgattccgacagc
gattcagactcagacagtgattccgattcggactctgacagtgattcggatagcgacagt
gactccgactctgatagtgattccgattcagactcagacagcgactcagactcagatagt
gactccgattccgactctgatagcgattcagattcggacagtgattcggatagcgacagc
gactcagactccgacagtgactcagatagcgacagcgattcggattccgatagtgattcc
gactcagacagtgattccgattccgacagcgattcggactctgacagtgattcggatagc
gacagtgactcggattcggatagtgattccgactcagacagcgattccgatagtgactcc
gattcggactcggatagtgattccgattcggacagcgattcggattccgacagcgattcg
gattccgacagtgattcggactcggactcggacagtgattcggactcggacagcgattcg
gactcggacagcgattcggactcggatagtgattcggattccgacagcgactcagattct
gacagtgattcggattcggatagcgattcggattccgacagcgactcggattcggatagt
gattccgactcggatagtgattcggattccgacagtgactcagactcggacagcgattcg
gattccgacagtgactcggactcagatagtgattcagattccgacagtgactcggactca
gatagtgattccgactcagacagcgactcggattccgatagtgattcggattccgacagt
gattcggattcggacagcgactcggattccgacagtgacgctgactcagacagcgactca
gactcagacagtgattcgaataacgacagtgactccgatacaatcacagattcagattca
aatgatggaaccaattctgacaatggtagtaattctggctcagatggaagttccagttca
aatactggatcaggttcgggcaatacgacgggctctactggaaataattcaggtactggc
actggtacgacaacttcatcgactgcttctaacaacggtgctgcttcgacaagtacgact
agcttgagtgctgcagcaacaagtggtgtctcggccacagccgcaacgttggcggttacg
acaccatccagtgacggtgctgcaacaacgtcagcaactgctgctacatcagtggtttat
gccgctgctagcgctcaagacgttgatgcaacttctgatcagactgattcagattcgaag
agtagtaatgattctgataaggataagaagtcagctgatactgatagtgctgatgataag
gtcggctcaagtaatactgacgagaatggtaagactgcatctgatacaagtaataatgcc
ggaacgattttcggtggcttgttgaccgcggctgcagctgctggactcggctggtggttc
ttcttgttcggtcgtcgtcgtaaagatgatgatgaagatgatgagaatcaaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
