Lactiplantibacillus plantarum 16: Lp16_0178
Help
Entry
Lp16_0178 CDS
T02698
Name
(GenBank) cell surface protein precursor, LPXTG-motif cell wall anchor
Organism
lpz
Lactiplantibacillus plantarum 16
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SpaA
Cna_B
Big_8
SdrD_B
CarboxypepD_reg
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGO06883
LinkDB
All DBs
Position
193582..196470
Genome browser
AA seq
962 aa
AA seq
DB search
MRLIDFKTWIMGTAAMLTLIVTNQTVSAADTATTATETTQTSGSSTLANQVVLRQTTCSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTKASATGAATETATSKAVTTSESSTQSSSTTATSQTTSGV
TAAQATTDSTDTTATPRATANAKADQRAASAKANNEQATTQNQQQTTNMYSGVVTSQKDS
ARTATTTDQSTASVATLSRMSRASLRSLAQRATVAVQGLDATDATVTDDDGVTYSATDVL
SLYANYIAKYHWSIADDVSVTAGSTATVTLPENVVFTNGTQHIDVQKSDGTVVGTFTAET
GSQTGTLTFNDYYATSDRYNRQGDLTFYVTGTSATTGSSTTGINKVGWADSNSLDADGNP
TKMIWQVVANINSEKWQQVAIVDQLGLYQTHEGTMTLETGHYTDGAFVKDAALGTYDFAT
QQFTYADGVSTPQVTVTVVGQQMTINIDQLDVAVNIFYEVGLTVGHTYTNNAGVTYAPVI
GDATDPNEGSSTGEPKSEQSNVAVRFGGSGTASDDIQSYSLVINKTDGDGQSVAGATYQL
EDSTGTVLRTDLVTDSVGQLRIGNLSAGTYMLVETAAPSGYQIDTAKHVFTVSAVQATAN
VVTGSVVDKRMAKTALTVNKVWADVPAGVQTPTVEVTLQRNGQAYQTLQLTSANGYTGTF
SDLDVTDVYGNAYTYTVIETAIAGYISSQTTSGETVTLTNTYQTGKLTVVKTDSSGANRL
AGAVFAVKNAAGTLVAQLTTDATGQAQLTGLTQGAYTVSEIQAPDGYLINTQAQVLVLNE
QSAYQGQLVFADEVEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPSE
PGEPSEPSEPSEPSEPSEPSEPVLPGHADEDSDSDQVVTTKTETAKLVKQTNLVTTTRPT
KLLGQPIKLVATSKPVVKVTKATNRKSAQQLPQTSEQSMDWLMILGWFLLGLTVVSRQRR
FN
NT seq
2889 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgattaatcgatttcaaaacttggataatgggaacggccgccatgttgacattgatt
gtgacaaatcaaacagtgagtgcggcggacacggctaccactgccactgaaacgacgcag
acttctggctcgagtacacttgctaatcaagtggtgttgcgacaaactacgtgcagtagc
agtagcagtagcagtagcagtagcagtagcagtagcagtagcagtagcagtagcagtagc
acgaaagcatcggcaactggtgcggcgactgaaacggcgactagcaaagcggtcaccacg
tctgagtcatcaacccaatcatctagcacaacagctactagccaaacgacttcaggtgtg
acagccgctcaggcaacaacggacagtactgatacgacagcgacgccccgggcgacggct
aatgccaaagcggatcaacgagcggctagtgcgaaggcgaacaacgagcaagcaacgacc
cagaatcagcaacaaacgactaatatgtacagtggtgtcgttaccagtcaaaaagactcg
gcgagaacggcaactacgacggatcaatcaactgcgtctgtcgcgacactgtccagaatg
agccgggccagtcttcgcagtttagcacaacgggcaacggttgcggttcaggggctcgat
gctactgacgcaacggtgactgacgatgatggtgttacgtatagcgctacggatgtattg
agtctgtatgcgaactatatcgcgaagtatcattggtcaatagccgatgatgttagcgta
actgctggcagtacagcaacggtgaccttacccgagaatgttgtctttaccaatggtacg
cagcatattgatgtccaaaaatcagatggaacggtcgtcgggacttttacggccgagacc
ggtagtcaaaccggaacactaacttttaatgattattatgcgactagtgatcgttataat
cgtcaaggagacttaacgttttatgttactgggactagcgcaaccactggcagtagtacg
actgggattaataaggttggctgggccgatagtaatagtttagatgctgatggtaatccc
accaaaatgatctggcaagttgtcgcaaacattaatagtgaaaagtggcagcaagttgcg
attgttgatcagctgggcctttatcaaacgcacgaaggtaccatgacgttggaaactggt
cattatactgacggtgcctttgttaaagacgcggcactgggcacttatgattttgcaacg
cagcagtttacctacgctgatggggtatcaacaccacaagtaaccgtgacggttgtgggt
cagcagatgacaattaatattgaccaattagatgtagcggtcaatatattttatgaagtt
ggtctgacagtaggacatacgtacaccaataatgcgggtgtaacgtatgcacctgtcatt
ggagatgcgactgatccaaatgagggcagttcgacaggcgaaccaaagagtgaacaatcg
aacgtggccgttagatttggtggttccggaactgctagtgatgacattcagagttacagt
ttggtcattaataaaactgatggtgacggccagtcagttgctggtgccacttatcagtta
gaggatagtacgggtacggtacttcggaccgatttggtgactgattcagttggacagtta
cgcatcggtaacttgtcggctgggacgtacatgctagttgagacggcggctccgagtggc
taccagatcgacacggccaagcacgtcttcacggtatccgcagtgcaagcaacggctaac
gtggtcacaggtagtgtggttgacaaacgaatggctaagacggcgctgactgttaacaaa
gtttgggctgacgtgccagctggagtgcaaacgccgaccgttgaagtgacgttgcaacgc
aatggtcaagcttatcagaccttgcaattaacgtcagcaaatggctatacgggcactttc
agtgatttggatgtgacggatgtttatggcaatgcgtacacttatacggtgattgaaacg
gccattgctggctatatcagtagtcaaacaactagtggtgagacggtgacattaacgaat
acgtatcaaaccgggaaattgacggtggttaagacggattcgagtggcgccaatcgcttg
gccggggcggtttttgccgtgaaaaatgctgccggaacgctggttgctcagttgacaacg
gatgcgactggtcaagcacagcttacaggtctaacgcaaggcgcttatacggttagcgaa
attcaagcaccggacggttacttgatcaatacacaggcgcaagtgcttgtgttgaatgag
caaagcgcttatcaaggccaattagtttttgccgatgaggtcgaaccaagtgaaccgagc
gaaccaagcgaaccgagcgaaccaagcgaaccgagtgaaccgagtgaaccgagtgaaccg
agtgaaccaagtgagccgagtgaaccgagtgaaccaagcgaaccgagtgaaccaagcgaa
ccgggtgaaccaagtgaaccgagcgaaccaagtgaaccgagtgaaccgagcgaaccaagt
gaaccggtgctaccaggacacgctgacgaggatagtgattcagatcaggttgtcacaacg
aagactgagacagctaagttagtcaagcaaactaatttagtaaccacgactcggccaacg
aaattgttaggacagccaataaaattagtagcaacttctaaaccagttgttaaagttaca
aaagcaactaatcgcaagtcggcgcaacaattgccacagactagtgaacaatcaatggat
tggctaatgattttgggctggttcttgctagggctaacagttgttagtcgtcaacggcga
tttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system