Leptodesmis sichuanensis: KIK02_19465
Help
Entry
KIK02_19465 CDS
T07779
Name
(GenBank) tandem-95 repeat protein
Organism
lsc
Leptodesmis sichuanensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
Cadherin_3
PPC
FG-GAP
CshA_repeat
FG-GAP_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UIE37130
LinkDB
All DBs
Position
complement(4133626..4139925)
Genome browser
AA seq
2099 aa
AA seq
DB search
MVGQNSYASTGLLAMPDIAGNSLATATTLNLTTSVQSFPDLVTSTTSDYYRFSLLTRSSV
DLSLTNLDANADVALLDSEGNLLTVNSVPQRSANSGNLAESINTILDPGTYFIRVTAAPS
VAIANYTLNVTKGTNAVNSAILWRNPFSDETGIWQVTGASLTSTQLLTSNPGAGWVADAT
GDFNKDGQSDIFWRNFNTGATQIWLMNGVSVASIVPTPAAPLGWYVGGTGDFTGDGQTDL
LWRNDAAGIVGIWAMNGTQFVAPSIISEGVPDIWRVAGVGDFNKDGKPDIVWQNSQNRLA
GVWLMDGISLSSSVFLSSDVPSDWFIAGTDDFNNDGSVDLLWRNYSTTANGVWLLNGVSF
VSAYSLPPALSDWISTVPYKALGEPNPIDIAGDTLATAFDLGTNVTGTGSYQNTISSVST
DFYKFTLGSSSQVNLSLTGFTANLDLQLLDENGGILQTVAAPDLTPEFIARTLTAGTYYI
QVIPNNAGDRSPYSLQISVNNLPVLATNTPLPVNEQGTANLTSSQLRVTDNDNTAAQITY
TLGSLPTNGTLSVNGAIATPGTTFTQADLDSGNRIQYIHNGSETTSDSFIFTVADGAGGS
IGTTTFNISVTPVNDSPVLTVPGSLTLDQNTNVLISGIQVADPDSGAGALTVTLSVQNGT
LTLGRTNNLTGLQGNGTSTLSFSGQLDLINFVLQSLVYRSNATFQGTDVLTIGVNDNGNT
GLGGPLGDSKSTTLTVSAVNQPPLISLPASVSISEDIPSPIVGITIADPNANSGLVTASI
LAVNGVVSLNSTAGLSVSGNNAIKQKNLVFTGTLSAVNNALNNLIYQSDPNFNGPDSLII
SVNDNGNTGNGIPLSDTKTLGITVTPVNDAPVLTVPPAQTANENIDLRITGITVQDVDAG
AGNLSVAISAANGKLTLGSINGLTFQTGTGTQDSTLIFTGSLSAINAALNTLIYRGNLNF
RGSDAISISVSDNGNTGFGVALGDSKTIAVNVLGINQPPTITLPTSPTVNSDTDLSIAGV
GIADPDAAGGTMAVTITAANGLVSLKSTNGLTFTQGNGNPSNRLTFSGPLFAINDALATL
TYRSYPGFTNAFDRVTISVNDNGNTGTGLPLSDTKTLFVNVGDAVNVAPIATNDTYGVSQ
NNTLNGSSVLGNDTDPDFTLPLTAQLAAGPTRAATFTLNPNGTFTYTPITNFNGSDSFTY
RVTDALGAISNIATVTITVTPVNQPPVAVNDSYTTGSSGSLLITAPGILANDTDIDSSNL
SAVLVSSPANGTLNLNSNGSFTYVPRAGFTGTDSFTYRANDGSLNSLNTATVNIIVTLTP
NQPPVANGDTFTTPANSTLTVGNVLTNDTDPDNNIPLTASLLVAPANAATFTLNPNGTFT
YIPRANFTGNDTFTYVARDSLGSTSTPATVTFSVTSVTPSNQPPVANGDTFTTPANSTLT
VGNVLTNDTDPDNNIPLTASLLVGPANAATFTLNPNGTFTYIPRANFTGNDTFTYVARDS
LGGTSTPATVTFSVTSVTPTNQPPVANGDTFTTPANSTLTVGNVLTNDTDPDNNIPLTAS
LLVAPANAATFTLNPNGTFTYIPRANFTGNDTFTYVARDSLGGTSTPATVTFSVTPGAAP
TANNDTLSVNAGSSLNIPAPGILSNDTDPLGRPLSATVVSTVTNGTLSLAPTGALVYTPN
AGYSGNDRFTYVATDGTGTSNTATVSIRVNAIPVARNDSGYTAIVGTPLTVSGGVLGVLG
NDTDADNPTLTANLVSQPANGSLSLSPNGSFVYIPNANFQGTDTFTYTASDGQATSNTAT
VSISVRSVSTPVAVSDTYRAATNGTLTVSQLNGVLTNDTDPNVSGNARTATIVTGPVSGL
ATLNPDGSFIYRPNPNFQGVDTFVYRFSDGLTVSNAATVTISVAPNTPPVVNPDRYTIAT
GSTLTVIPTQGILLNDTDADPGTVLTATLNTTTQNGTLSFNSNGTFRYTPNAGFSGLDSF
TYQASDGIALSNPTTATITVAAAPTAVTDIYSVAAGQTLTIDAPGLLANDIDPAGLPLSL
IPAVPPTPRNGQLINYPNNGSFIYVPNPGFVGTDSFAYRATNGVLSSAPVTVIINVTSP
NT seq
6300 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggtagggcagaatagctatgccagtacagggttattagctatgccagatatcgccgga
aactctcttgctaccgctacaacactgaatctgactacaagtgttcagagtttcccagac
ctcgtcacttctacgacaagcgattactaccgctttagcctgctcacccgcagcagtgtt
gatttgtcactcactaatctggatgccaatgcagatgtcgcccttctggacagtgagggt
aatctgctgaccgttaatagcgttccccagcgatcggccaactcagggaatttggctgag
tccatcaacacaatactggatccagggacttacttcattcgggtcactgcggccccgtcg
gtggcgatcgccaactataccctgaatgtcacgaagggaaccaatgccgtcaacagtgcc
attctatggcggaatccgttttcagatgagaccggcatctggcaagtgactggtgctagc
ttgacctcaacgcaattgctcacttctaacccaggtgctggctgggtggccgatgcaact
ggagatttcaataaagacggtcaatcggatattttttggcgaaattttaatactggggca
actcaaatctggctgatgaatggagtcagtgttgcatccattgtgccgacacctgcggct
cctctgggttggtatgtaggaggaaccggagattttacaggggatggccaaacggatctg
ttatggcggaatgatgctgcagggatagttggtatttgggccatgaatggcacccaattt
gttgcgccctcgattatctctgagggggtgcctgatatttggcgagtcgccggagttggc
gattttaataaagatggaaagccggatatcgtttggcaaaacagccagaatcgcttagcc
ggagtttggctaatggatgggatcagcctgtcctcaagtgtttttctatccagcgatgtt
ccatcggactggttcatcgcggggacagatgactttaacaatgatggctctgttgatcta
ctttggcgaaactatagtacgacggctaatggagtttggctactcaatggagtcagcttt
gtcagtgcctattccttaccccctgccctatctgattggatctccacagttccctataaa
gcactgggtgaaccgaatccgatcgatattgcgggtgatactcttgcaaccgcgtttgat
ctgggtaccaatgtaacgggtactggcagctatcagaacaccattagcagcgtcagcaca
gacttctacaaattcactctggggagcagtagtcaggttaatctgtctctcactggcttt
acggccaatttagatctgcaattgctggatgaaaatggcggcattcttcaaactgtggcg
gcccctgacttaacacctgagtttattgccagaactttaactgcaggaacttactacatt
caagttattcccaataacgcaggcgatcgcagtccctactccttgcaaatcagtgtcaat
aatctacccgtattagcgacgaatactcctctacctgtgaatgaacaggggactgccaat
cttaccagcagtcagttaagagtcacagataacgataacactgctgctcaaataacctat
accctgggcagtttaccaacgaacggcactctgtcagtgaatggggcgatcgctacacct
ggaaccaccttcactcaggccgatctggatagtggcaaccgaattcagtacatccataac
gggagcgaaacgaccagcgatagcttcatctttacggttgccgatggagccggaggaagt
attggcacgacgaccttcaacatttccgttacccctgttaacgactcccctgtattaact
gttcccggttcgctcaccctggatcaaaacactaacgtcctgatcagtggcattcaagtg
gctgacccagactctggagcaggtgctttaacggttactctatcggtacaaaacggaact
ctcaccttaggccggacaaataacctcactgggttgcagggaaatggcacttcaacgctg
tcgttcagtggtcagttagatctgatcaactttgttctgcagtccctggtttaccggagt
aatgcgacgtttcagggaacggatgtcttgacgatcggggtcaatgacaatggcaatacc
gggttgggtggccccctcggcgactcgaaatctacgactctgaccgtttctgctgtcaat
cagcctcctctgatcagccttcctgcatcggtgagcatcagtgaagatattccttccccg
attgtgggtattacgatcgccgatcccaatgcgaattcaggactcgttacagccagtatt
ttggcggtgaacggagttgtttctctgaattccacggctggactgagtgtgagcggtaac
aatgccattaagcaaaagaatctagtcttcacaggcacgctgtctgccgtgaataacgcg
cttaataacctgatttatcaaagtgatcccaacttcaatggccccgattcattaatcatc
agcgttaatgacaatggtaatactgggaacggcattcccctctccgataccaagacgcta
ggtattaccgtcactccggtcaacgatgctccggttctgaccgttccacccgcccagact
gctaacgaaaatatcgatctcaggattacgggcattactgttcaagatgtggatgctgga
gcaggaaatttaagtgtggcgatttccgctgctaatggcaagctgactttgggttcaatc
aatgggctaacattccagacgggaacaggaactcaggatagcacgctgatctttacaggc
tcactctcagccattaatgcggccctgaatacgctgatttatcggggtaatctcaatttc
cgaggctcagatgccatttcaattagtgtcagtgataacggtaatacaggctttggggtt
gccctgggagactctaagacgatcgcggtcaatgtgttgggtatcaatcagccgccaacc
attaccttaccgacttcacccacggttaactccgatacagatttatctatcgctggcgtg
ggtatcgctgatccggatgcggcaggcggcactatggcagttacaattacagccgccaat
ggtctggtcagcctgaaatccaccaatggcttaacgttcactcagggcaatggcaacccc
agcaatcgccttacctttagtggccccctatttgccattaatgatgcgctggctacgctc
acctatcgcagctaccctggctttaccaatgcgttcgatcgcgtgactatcagcgtcaac
gataatggcaacaccggtaccggattacccctatctgacactaaaaccctgtttgtcaac
gtaggcgatgctgtgaatgttgctcccatagctaccaacgatacctatggtgtgtcgcag
aataatactctgaacggtagtagcgtcttagggaacgatacggatcccgatttcactctg
cccttaaccgctcaactggctgctggccccaccagagccgctaccttcaccctgaatcct
aacggtacgtttacctacacacccattactaacttcaacggcagcgacagtttcacctac
cgggtcacagatgctttaggagccatctcaaacatcgctaccgttaccatcaccgttacc
cctgtgaatcagccacctgtggccgtaaatgacagctacacaacaggttcaagtggttct
ctcttgattacagctcctggcattctcgcaaatgacactgacattgatagttctaattta
tcggcagttttggtttcatccccagctaatggtacgttgaacctcaactccaatgggtca
tttacctatgtgccacgagcaggcttcacgggaacagacagttttacctaccgggccaat
gacggcagcttaaactccctcaataccgccaccgttaacattattgttactctgactcca
aatcaaccgccagtggctaatggtgacacctttaccaccccagctaacagcactttaacg
gtggggaacgtcctgaccaatgacaccgacccagataacaacattcccctgactgccagt
ctgctagttgctcctgcgaatgcggctactttcacgctcaacccgaatggtacttttacc
tacattcctcgtgccaatttcactggtaacgacacctttacctatgtggctcgtgatagc
ttaggcagcacctcaactcctgccactgtcacctttagtgtgacttcagttacccctagc
aatcagccgccagtggccaatggtgacacctttaccaccccagctaacagcactttaacg
gtggggaacgtcctgaccaacgacaccgacccagataacaacattcccctgaccgccagt
ctgctggttggtcctgcgaatgcggctactttcacgctcaacccgaatggcactttcact
tacattcctcgtgccaatttcactggtaatgacacctttacctatgtggctcgtgatagc
ttaggcggcacctcaactcctgccacggtcacctttagtgtgacttcagtcacccctacc
aatcaaccgccagtggctaatggtgatacctttaccaccccagctaacagcactttaacg
gtggggaacgtcctgaccaacgacactgacccagataacaacattcccctgactgccagt
ctgctagttgctcctgcgaatgcggctactttcacgctcaacccgaatggtacttttacc
tacattcctcgtgccaatttcactggtaacgacacctttacctatgtggctcgtgatagc
ttaggcggcacctcaactcctgccactgtcacctttagtgtgactccaggagccgcaccg
acggctaacaatgatacgctttcggtgaatgcgggaagttctttgaatattccggctcct
ggtatcctcagcaacgatacagacccgttgggcagaccgttatccgccactgtagtcagt
acagtgaccaacggtaccctatctcttgctccgactggagccctggtttatacgccgaat
gcaggctactctggcaacgatcgctttacctacgttgctaccgatggcactggcacctcc
aacacggcgacggtcagtattcgagtgaatgccattccggtggccagaaatgatagtggg
tacactgcgatcgtaggaactccactcacggtttctggtggtgtccttggcgtattgggg
aatgatacggatgcagataaccctaccctgacggccaatttagtcagtcagccagctaac
ggtagcctatctttgagtcccaatggctcctttgtctatattcctaatgccaacttccag
ggtacggatacctttacctacaccgctagtgacggtcaggctacctctaacacggctaca
gtctcgatttccgtccgttcagtcagcacacccgttgctgtttctgacacctatcgagct
gcaaccaacggcacgcttacagtgagccagctcaacggagttctgaccaacgacaccgac
ccgaatgtgtccggcaatgctcgaactgcgacaattgtgaccgggccagtcagtggtctg
gccaccttaaatccagatggctcctttatttacagacccaatcctaacttccagggagtt
gatacctttgtgtatcggtttagtgatggtctaactgtttccaatgccgcaacggtcacc
atttctgtggctcctaatacacccccggttgtcaatcccgatcgctataccattgcgact
gggagtactctgacggtaattcctacccagggaattcttttaaatgacaccgatgccgat
cccggtacagtcctcacagcgacactcaataccaccacgcagaatggaaccctgagcttt
aactcaaatggtacgttccgttacacgccgaatgctggtttttcaggcttggacagcttt
acttatcaagccagtgatggcattgcgctatctaatcccacgacggccaccattacagta
gcggctgcccccactgctgtcacagatatctatagtgtggcggcaggccaaaccctgacc
attgatgcaccaggattattagccaatgatattgatccagcaggattgcctctttcattg
atacccgccgttccacccacccccaggaatggacaattgataaactaccccaataatggc
tctttcatctatgttcctaatcctgggtttgtgggaactgatagttttgcgtaccgggct
accaatggtgttctgtcttctgcgccagtgaccgtaatcattaatgtcaccagcccataa
DBGET
integrated database retrieval system