Lutibacter profundi: Lupro_08835
Help
Entry
Lupro_08835 CDS
T04235
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
KO
K03723
transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:
5.6.2.4
]
Organism
lut
Lutibacter profundi
Pathway
lut03420
Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lut00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
Lupro_08835
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
lut03400
]
Lupro_08835
Enzymes [BR:
lut01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
Lupro_08835
DNA repair and recombination proteins [BR:
lut03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
TRCF (transcription-repair coupling factor)
Lupro_08835
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrB_inter
TRCF
DEAD
Helicase_C
CarD_TRCF_RID
ResIII
RecG_dom3_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMC11357
UniProt:
A0A0X8G789
LinkDB
All DBs
Position
complement(2003782..2007162)
Genome browser
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
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NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system
