Lactobacillus ultunensis: H4B44_05020
Help
Entry
H4B44_05020 CDS
T07197
Name
(GenBank) PD-(D/E)XK nuclease family protein
KO
K16899
ATP-dependent helicase/nuclease subunit B [EC:
5.6.2.4
3.1.-.-]
Organism
luu
Lactobacillus ultunensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
luu00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
luu03400
]
H4B44_05020
Enzymes [BR:
luu01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
H4B44_05020
DNA repair and recombination proteins [BR:
luu03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
AddAB pathway proteins
H4B44_05020
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ADDB_N
PDDEXK_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QQP29418
LinkDB
All DBs
Position
999979..1003461
Genome browser
AA seq
1160 aa
AA seq
DB search
MIKILTGRQTDPVQEKILEEAVENYKQHPENETFIIVPNHIKFTTEVRAINKLATSKHQS
ETAVKNLHVLSFSRLAWFFLKDAEQGLPMQLDDAASAMLLTHIVEQEKDKLLIFEKTNTG
LINQLYRTILQVYDGNLDLDNIEEDNLDEETKSKVHDLRIIYDAFIKEIAGKFSTKNEVQ
VQLNDILGKSKNLNTTSFYFCDFSHFTLQETLTIKLLMRKAKNVVLAFKTRIGDINPQAE
EGDYDYVIQQTIKHFTSFLHERDMDYVVDSLPISPKPTARELLNGLWTETIPKVDELDQV
QLVKADSRYAEAYFVARTIYQQVALGKFRYHDFLVLAPDLKEYETYLIPILRQHHIPFFN
DLQQEMKYHPLVVLIESLFNLRDLKDNPFQTSNMLAILKTHLLIPSWYKEEAEYIHDVDE
LENFVLAHGINHGLWRKSFSHFVDAEVIRLDKMDEEVAKIDRLRGYLVDKVTTLFESLGG
EEDSQKALTIFFDFLTQNGVAAKLEQWRDAANEAGDLQQAQQPEQLWDLLIQLLKDYLTI
NPEKFDLEEFFNMLINAFKEANFSQIPSTLDAVNLSEMGMVQTSGYEQVFIIGATSGNLP
AIQKMPGFLTTENLNQLQTSFDSDSYLEDNQQLNNLDQNYQFGLSLSLAQKKVYVSCPVL
NASNESLDPSIYYKRLESYGAHEFWQHDLPEKMQDLLSFITNPDSSLGYLAYMNSINSSK
TIDELLEITQKALPQKTDDILKASQFDNQPEDIGQDLASQLYGQNLNSSVSQLETFYENS
YEYFLTYGLKLRKRFENEFDVIQAGNYFHETFDRLVKQLNKRHLDLADLNSVELEQMLNS
VRDVMKDEGKYAQLMNDPFNQYLFKCLDHTTSKVAHNWRKSLTKTPLRAKYSELSFGIGE
KIKGLSFEVPDLSGVHKVDLRGKMDRVDLANFTDNSQVLAQVIDYKSSAKKFDLGMFYNG
IALQMVSYLDVLIKNGQFFAGDEQLSLLGAFYQTVTRQLERLNSNKLIDSKLNIRESATD
SKPKLMYNGLISNDPQILTEAEPLLENSSSQPSQLYTGVKTKAKGGFSLPTNRSFSEEEI
ELLLEYDEYLIKEASSQILSGKIKLNPYKYGKTRSALTYSDFKDIFFFDAMLRQNQYHEI
SNMKKKELLTKIKEKLGKED
NT seq
3483 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaaaattttaacaggacggcaaaccgatccagtacaagaaaaaattctggaagaa
gcagttgaaaattataagcaacatccagaaaacgaaacttttatcattgtccctaatcat
attaagtttaccacagaagttagagcaattaacaaacttgcgactagtaaacatcaaagt
gagacagctgttaaaaatttacatgttttatcattctcacgtcttgcttggttcttttta
aaagatgcggagcaaggtttacctatgcaactagatgatgcagctagtgcaatgctttta
actcatattgtggagcaggagaaggataaacttttaatttttgaaaaaaccaataccggt
ttaattaatcagttatacagaactattttacaagtttatgatggcaatttggatttagat
aatatcgaagaagataatctggatgaagaaactaaaagtaaagttcatgatctcagaatt
atttatgatgcttttatcaaagaaatagccggcaagttttcaactaaaaatgaggtccag
gttcagttaaatgatattttaggtaaaagcaaaaatttgaatactaccagtttttacttc
tgtgatttttctcattttacattgcaggaaaccctaactatcaaattattgatgcgtaag
gcgaagaatgttgttttagcttttaagactagaattggagatattaatcctcaagctgaa
gagggtgattatgactatgttatccaacagacgattaaacattttacgtcttttttgcat
gaaagagatatggattatgtggtcgatagtttgccaatttcacctaagcctacggcaaga
gagctgttaaatggtttatggacagaaactattcctaaagttgatgaattagatcaagta
caactagtaaaagctgattcacgttatgcggaggcttattttgttgcacggacaatttat
cagcaagtcgcactggggaaatttaggtatcatgatttcttagttttagctccagattta
aaggaatatgaaacttacctcatacctatcttaaggcagcatcatattccgtttttcaat
gacttacagcaagagatgaaatatcatcctctggttgtcttaattgaaagtctgtttaat
ttacgtgatttaaaagataacccatttcaaacttcaaatatgttggctatcttaaagact
catttgcttataccatcgtggtataaagaagaagcagaatatattcatgatgttgatgaa
ttggaaaattttgttttagctcatggaattaatcatggcttatggagaaagtctttttct
cattttgttgatgcggaagtcattcgtttggacaaaatggatgaagaagtcgccaaaatt
gatcgtttacgaggttatctagttgataaagtaacaacattatttgaaagtcttggtggg
gaagaagatagtcagaaagctttaacgattttctttgattttttaactcaaaatggagtg
gcagccaagcttgaacaatggagggatgctgctaatgaagcaggggatcttcaacaagca
cagcaaccagagcagttatgggatttgttaattcaacttttaaaagattatttgacaatt
aatcctgaaaaatttgatctagaagaattctttaatatgttgattaatgcatttaaggaa
gccaatttctctcaaattccatcaactttagatgcagtgaacctatctgaaatgggaatg
gttcaaactagtggctatgagcaagtatttatcattggggctacgagtggtaatttgcca
gctattcaaaagatgccaggttttttgactacagaaaatttgaatcagttacaaactagc
tttgattcagattcatatttggaagataatcaacaattaaataatttggatcagaattat
cagttcggcctttctttatctcttgcgcaaaagaaagtttatgtttcttgtcccgttttg
aatgcatctaatgaaagtttagatccttcgatttattataagcgacttgaaagttatggt
gctcatgagttttggcaacatgatttacctgaaaaaatgcaagatttgttgagcttcatc
actaatcctgattcaagtcttggttatttggcatacatgaattcaatcaactcatcaaaa
acaattgacgaattattggagatcacgcaaaaagcattaccacaaaagactgatgatatt
ttaaaggctagccagtttgataatcaaccagaagatattggacaggatttagcttctcaa
ttatacggacagaatttgaattcatcagtttctcaattagaaactttctatgaaaattca
tatgaatattttttaacttatggtttgaaattacgtaagcgatttgaaaatgaatttgat
gttattcaagcgggtaattatttccatgagacgtttgatcgcttagttaaacagttaaat
aagcgtcatcttgatcttgccgatctgaatagcgttgaattagaacaaatgcttaattct
gttcgggatgtgatgaaagatgaaggtaaatatgcacaattaatgaatgatccatttaat
cagtatttgtttaaatgccttgatcatactacctcaaaagtggctcataattggcgtaaa
tcattaactaagacaccacttagagctaaatattcagaattaagttttggtattggagaa
aaaatcaagggtttgagttttgaagtacctgatctgtctggagttcataaagtggactta
cggggaaagatggatcgtgtagatctagctaactttacagacaatagtcaggttttggct
caagttattgactataaatcttctgctaaaaaattcgatttagggatgttttataacggt
attgcactgcaaatggtatcttatttggatgtcctaattaaaaatggtcaattctttgct
ggtgatgaacaattatcattactgggagccttctatcaaactgttactagacaattagag
cgattaaatagcaataagctgattgatagcaagttaaatattcgtgaatctgctactgat
agtaagcctaaattaatgtataacggtttaattagtaatgatccccaaattttaactgaa
gctgaacctcttttagaaaatagtagcagtcagccttctcagctttacactggcgtcaaa
acaaaagcaaaaggtggattcagcttaccaactaatcgaagctttagcgaggaagaaatc
gagttgttgcttgaatatgatgagtatttgattaaggaagcatcaagccagattctttca
ggtaagattaaattaaatccatataagtatggtaaaaccagaagtgctctgacttattct
gactttaaagatattttcttctttgatgcaatgcttagacaaaaccaatatcatgaaatt
tcaaatatgaagaaaaaagagttattaactaaaatcaaggaaaaactaggaaaggaggat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
