Candidatus Izimaplasma bacterium HR1: KQ51_00445
Help
Entry
KQ51_00445 CDS
T03291
Symbol
inlA_1
Name
(GenBank) Internalin-A precursor
Organism
mbj
Candidatus Izimaplasma bacterium HR1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
Glyco_hydro_5_C
RMC1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AIO18333
UniProt:
A0A088T088
LinkDB
All DBs
Position
423928..430695
Genome browser
AA seq
2255 aa
AA seq
DB search
MKRIFRPLLVFLLLIVVFFASACSRNAENEHLPEYCQTYSGFTSFASKDFYDLLIDSGIS
INRSDYFDAISVISLTFEVDEPNRSIDLSGIQCFQNLTDISLTGQSFKDLSPISALSNIQ
SIELIGTNVVSIDSFKNLSKIKSLEISDTRTLQSVDGVEEMTKLTHLDLSNNGIVDIFGL
NNLINLRTLYLNDNEIIEFPSINNLEFLEILDISDNNINVLGDDLSGLSNLRTLNAENNE
ICDLSTLDDLVSLETLILSNNDLGCGGIGVSPNFESLENAPNLIELRLDNNDLTSIEGLR
GRDISLTTLYLNDNNLTDITPIAEYTDIIELYLDNNNISSINDLSGMTGLTSIDLSHNSI
VDISDLMSIENVEIINLSFNNIVIIPDISAAWGSLTTLDLSSNVLTDTSGVSGHPTLESL
ILYNNGLTELSGINELPNLDNLVIFDAELEALLEPGDVFPNTITVIRDSFTNVPELPLQA
GDNIFDFGFEVEDNLQIYNSINGLTDIATIRFEDMNIALIDELSINIPGLTSIYVENNNL
TDIRFILGNPNLERLDISGNPVANLQVISGLSTTDLDNLEEIDASDISADNDIVDAFIDL
PSILNINLANTQIVSIDNSFNDLATLNLITFDSDSLETITDSFNNIFATYNSSNIFALDA
GKIGVISGSFNNGHYHRIDLKDQITTIITTSITDSFNNLVIENSSGVDLSGSNFETITNS
FNNLETSLLLLNDSNVYTITNSFVSSTIDGLNLGENYLQTVPSLDQATSIETLLIYSNLL
NTLSFLDGIPGVITLNISDQTTKDTHTATLVSIDGINNMPTLTTLLHANIGVSQIDGLKN
IGISEFILSFSDNNDILVDTISATSFTGTDLTELDLGGHQFTDVTFLDNVDNLVYLTIGI
DLADLSDFSGQDFELTLVHLTIENLQSITDFVYLSEYDEIINLTIESSLTTTLNNLDGLD
KLANLTFDFSQITSIIDSFNNLPDYNPDNDYLVDNYTSLVAITNSFDIYGTASHYDAVEI
PASITVTNSFNNLIIVTISTNELDLTPNFDTLSFDNIEEIILIYGDYSSFTFLNGYTLLT
DVTIANLNVNIIDLANDSIELLHIISADNAVDTITVDLNANATVNLSSFRTGTITFNTDA
LSYDVTALNADIVINTSVASLNLSVDVDDLTLNASNVTAIDLNNYQTTNTIFNTDALIDL
TRNTTFEVNATTFTINSTVISPSYSTRAANLIINNNIATSYTITVSGGKVTINNTQAVIT
VNANSTELEISQDTLTDLTLNGSIGIVDISSTNIDNLLGSASITTLNLSTSVASIVVSNN
SITTLILTDNNITTLDLSTSGADVELYTTNNQPLSGTVISDVFTLNANNISSVIIETGSN
INSLQLSNNNSLDTVNYNDASIQFINIDTNQTTINITGTTFTNITLDGASYTNIVIDASL
AFVVVNSSGTVVNANLKVDEITFDNTSLVTLNLNALSVLDEITISNSSSFTTFNSNDVDL
SFISFESTETIIVIDATNVGLIGLNGDNFTDVTIDAGDGIVNMNSNNSLPLNLDIISSNF
SLLGDTSSITFLGTTDIDTFGVTDLSLTSITSNTANIDTMNIDTSSANLNVSGSNIQTFI
IDTYITSLDLILSSTTDVTISSETGVDVTTNTNEITLTASGDSNITSSTLGTIDFDLSTN
DLELILNKANLSFSLDGTANQVTLNGTDIDNLDALATTNIVTLVLNTLNVSSLDFTTGNI
NELVFNTNLNDVSITGDELNTIIVNGDNLNSLTVNSTALSSELTVNSTNGSLDLNGSTST
VLIDNDSLTSLNIDDYTTTDLTLQANSLTSFDDGTSVSSTLSITTNQGVFTLTSDAQAIN
YSGLTTGTLNLISTNTGNIDTNTETLDLDVTNADIYVSGTNLIQITGNVVSLHFGVSTGT
LTLELVATGFVDINGNNITTLQVNSPSNIDTLSVGSTSVSLIDTNDATISQLNYSGSFTN
ITITTKSDSLNINTSGNAEVTLEYEGATALTLNANLSNELILDIVNSNQLTITGSIAVLE
IGGDSLDTITTTSLTVLTSLTMNGTPIDDLEFISNEVLGNIDTITINTLSVSNIETIMAK
LDGTSITLVSPLVDNDIYDFYYDEEYTRLYNLETSNNARYDAFRTTAINEAWAEILTNQY
MDHLDETLTKAEIDAQIYQSVQDYYEDYLDDAGINPLDVTPTEETNIKNAIQATLDDALL
TLIIGDIYVLVLTSIEEDADTFAIAQQANKTFTLS
NT seq
6768 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaatctttagacctttattagtatttttactactaatagtagtgtttttcgca
agtgcttgtagtaggaatgctgaaaatgaacatctacctgaatattgccaaacatattcc
ggttttacgagttttgctagtaaggatttttatgatttattaatcgatagtggaatcagt
attaatcgttctgattattttgatgctatttctgtcattagtttaacttttgaagttgat
gaacctaatagaagtattgatttaagtggtattcagtgtttccaaaatctaacagatatt
tcactaactggacaaagttttaaagatttaagcccaattagtgctctaagcaatatacaa
agtattgaattaattggaacaaatgtagtaagcattgacagttttaaaaatttgagtaaa
attaaatctttagaaatttctgatacacgtaccttacaaagtgtcgatggtgtagaagaa
atgactaaactaacccatctagatttatctaacaacggtattgtagatattttcggactc
aataatttgattaatttaagaacactatatttaaacgacaatgagattatcgaattccca
tcaataaacaatctagaattcctagaaatactagatataagtgataacaatatcaacgtt
ttaggtgatgatttaagtggattaagcaatttaagaactctgaatgcagaaaataatgaa
atctgtgatttgtccactttggacgatcttgtaagtttagaaacattgattcttagtaat
aatgatttaggttgtggtggtattggtgtcagtcctaactttgaaagtttagaaaatgcg
ccaaatctaatagaactacgtcttgataacaatgatttaacttctatcgaaggattaaga
ggcagagatatcagtttaaccacattgtatttgaatgataataatttaactgatataaca
ccaatagcagaatatacagatatcattgagttatacttagataataataatataagtagt
ataaacgatttatcgggaatgacaggattaacaagtattgatttatcccataatagtatt
gttgatatcagtgatttaatgagtattgagaatgttgaaataattaatctatcatttaat
aatatcgtcattataccagatattagtgctgcatggggcagtttaactactttagactta
agtagtaatgtccttacagatacttcaggggtttctggacatccaacattagaatcatta
atcctttacaataatggtttaactgaactttcaggtattaatgagctaccaaatctagat
aatttggtaatatttgatgctgaattagaagcgctactagagccaggggatgtattcccg
aacacaattacagtgattagagattcgtttactaatgttcctgaattacctttacaagca
ggagataatatctttgattttggttttgaagttgaagataatttacaaatatataatagt
atcaatggtttaacagatatagctacaataagatttgaagatatgaatatcgctcttatt
gatgaattatctataaacatacctggattaacatcaatatatgttgaaaacaataattta
actgatatcagatttatcttaggtaatccaaatcttgaaagattagatattagtgggaac
ccagttgctaatctacaagtaatcagtggtttatcgacaacggatttagataatttagaa
gaaatagatgcttcagatataagtgctgataatgatatcgtagatgcttttatcgactta
ccaagcatattaaatatcaatttagcgaatactcaaattgttagtatcgataattcattc
aatgatttagctactttaaatctaattacctttgattcagatagtttagaaacaataact
gattcatttaataatatatttgcaacttacaatagtagtaatatatttgctttagatgcc
ggtaaaatcggtgtaataagcggttcatttaataatggacactatcatagaatagaccta
aaggatcaaattacaaccattattactacatcaataactgattcatttaacaatttagta
atagagaattcttcaggtgttgatttaagtggttctaactttgaaacaataactaatagt
tttaacaatttggaaacaagtttattattacttaatgatagcaatgtatatacaattact
aattcgtttgtatcaagtactattgatggacttaatctaggagaaaactatttacaaaca
gttccttcattagaccaagctacatcaatagaaactctactaatttatagtaatttatta
aatacactttcattccttgatgggataccaggtgttataacattaaatatctctgatcaa
actacaaaggatacacatacagcgacattagtaagtatagatggtattaataatatgcca
actcttactactcttctacatgccaatattggcgtaagccaaatagatggactaaaaaat
atcggtatatctgagtttatactatcgttttcagataataacgatatcttagttgataca
attagcgctacatcttttactggtactgatttaacggagttagatttaggaggacatcaa
tttacagatgttactttcttagataatgttgacaatttggtttacctgacaataggaatt
gatttggctgatttgagcgatttctcaggacaagactttgaattaactcttgtacatttg
acgattgaaaatctccaatcaataactgattttgtttacctaagtgaatacgatgagatt
ataaatctaactattgaatctagtctaactacaacattaaataaccttgatggattagat
aaattagcaaatttaacatttgatttttctcaaatcacatcaattatagatagttttaat
aatctaccagactataatccagataatgattatttggttgacaattatactagtcttgta
gcaattacgaatagttttgatatatatggtacagcttctcattatgatgcagttgaaatc
cctgcatcaataacagtaacaaattcatttaataatcttatcattgttactataagtaca
aacgaattagatttaacacctaatttcgatactctaagttttgacaatatagaagagata
atccttatatatggtgattattctagttttacgtttttaaatggatatacattactaaca
gatgtaactatagctaatctaaatgtaaatattattgatttagcaaatgatagtattgag
ttattgcatattatttctgcagataatgcagttgatacaataactgttgatttaaatgct
aatgctacagttaatctatcttcatttagaactggtactattaccttcaatacagatgca
ctgagttacgacgttactgcattaaacgctgatatcgttattaatacatcagttgcttcg
ttaaatctatcagtagatgttgatgatttaacattgaatgcttcaaacgtaactgctatt
gatcttaataattatcaaactacaaatacaatatttaatactgatgcactaattgattta
actagaaacacaacctttgaagtaaatgctacaacatttactatcaattctacggttatt
agtcctagttattctacaagagcagcaaatttaataattaacaacaacattgcaacttcc
tatacaataactgttagcggaggaaaagttacaataaacaatacacaagctgttataacg
gttaatgcaaatagtactgaattagaaatctcacaggatacattaactgatttaacacta
aacggaagtataggtattgtagatatttcatcaactaatatagataacttacttggttct
gcttcaattactacattgaacttatcaacaagtgttgcttctatagttgtatctaataac
agtattactacattaatcctcacagataataatataacgacattagatttatcaactagt
ggtgcggatgtagagttatatacaacaaacaatcaaccattatccggtactgtaatttca
gatgtatttacgttaaacgcaaataatatatcttcagttataattgaaactggttcaaac
ataaattcattgcagttatctaacaataattcactggatactgtgaattataatgatgca
agtattcaattcattaatattgatacaaatcaaacaacaattaatattacaggaacaaca
ttcacaaacattactcttgatggtgcaagttataccaatatagttatagatgcaagtcta
gcatttgtagttgttaatagctcaggtactgtcgttaatgctaatttgaaagttgatgaa
atcacatttgacaatacatctctagttacactaaatctaaatgcattaagtgtattagat
gaaattactattagtaatagctcttcattcacaactttcaattcaaacgatgtagattta
tcgtttatctcatttgaatcaacagaaacaattatagttatagatgcaactaatgttggc
ctaattggtttaaatggggacaatttcacagatgtaaccattgacgcaggagatggtata
gttaatatgaactcaaataactccctgccattaaatcttgatattattagttctaacttc
tcattattaggtgatacttcaagtataactttcttaggaaccactgatattgatacattt
ggtgttactgatttatcattaaccagtatcacatctaatacagcaaatattgatacaatg
aatatagatacgtctagtgcaaacttaaatgtttctggctcaaatattcaaacattcatt
attgatacatacattacctcattagatttaattttatcttcaacaacagatgttacaatt
tcatctgaaacaggagtagatgttactacaaatacaaatgagattactttaactgctagt
ggagattcaaatataactagtagcacattaggtactattgattttgatttaagtacaaac
gatttagaattaatattgaataaggctaatttaagtttcagtctagatggtacagctaat
caagtaactcttaatggaactgatattgataacttagatgcactagctacaacaaatatc
gtgactctagtgttaaatactctaaatgtaagttctctagattttacaactggaaatatt
aatgaattagtgtttaatactaatttgaatgatgtatcaataaccggagatgagttaaac
acaattatagtaaatggagataacttaaattctctaactgtaaattcaactgccttatca
agtgagttaactgtaaattcaactaatggttcacttgatttaaatggttcaacaagtacg
gttttaatagataatgatagtttaacctcacttaatattgatgactacacaacgacagat
ttaacattgcaggcaaatagtttaactagttttgacgatgggacatcagtatctagtacc
ttatcaataactacaaaccaaggagtatttacactaacttctgatgcccaagcaattaat
tactctggtttaacaacagggacattgaacttgataagtaccaatacaggtaatattgat
acaaacacagaaacactagatttagatgtaactaatgctgatatctacgtttcaggaact
aatcttattcaaataacaggaaatgtagtatctcttcattttggagtatctacaggaaca
ttaacacttgaattggtagcaactggatttgttgatataaatggtaataacataacaact
ctgcaagtgaatagtccatcaaacattgatacattgagtgttggttcgacttctgtatct
ttaattgatactaatgatgcgacaatatctcaattaaactattctggatcttttacaaac
atcacaataactacaaaatcagattcacttaatataaatacatcaggtaatgctgaagtt
actttagaatatgaaggggcaactgcgttaacccttaatgctaacctaagtaatgaattg
attcttgatatagtaaatagtaatcaattaactattacaggaagtatagcagtccttgaa
attggtggagatagcttagacactattacaacaacttcattaacagttctaacatcgcta
acaatgaatggtacaccaattgatgatttggaattcattagtaatgaagtattagggaat
atagacacaataacgattaatacattaagtgtttcaaatatagaaactattatggctaaa
ctagatggaacaagtattacacttgttagtccacttgttgataatgatatatatgatttc
tattatgatgaagaatatacaagattatataatttagaaacatctaacaatgcacgttat
gatgcatttagaacaactgcaatcaatgaagcatgggcagagatactgacaaatcaatat
atggatcatttagatgaaacactaacaaaagcagaaattgatgcacaaatatatcaatct
gtacaagattattacgaagattatcttgatgatgcgggaattaatccattagatgttaca
ccaacagaagaaacaaatataaagaatgcaattcaagcaactttggatgatgcattatta
acacttataataggagacatatatgtattagtacttacttcaattgaagaagatgccgat
acatttgcaatagcacaacaagcaaataaaacattcacattaagctag
DBGET
integrated database retrieval system
