Mesoplasma chauliocola: CK556_01435
Help
Entry
CK556_01435 CDS
T05062
Name
(GenBank) ABC transporter permease
Organism
mchc
Mesoplasma chauliocola
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASZ09018
UniProt:
A0A249SN15
LinkDB
All DBs
Position
314161..319317
Genome browser
AA seq
1718 aa
AA seq
DB search
MRAILNLILLFKQSIKSIFKFKIQFLAILLLSFLSVLVLTTSLTIKDRLNSTYDSVVKNV
EKFDYQQSDQLSFLKGETQHKISKELMLLFIPENSKTTIDDKQTININFNSIYGKTYITE
AFEKDDRMLKVFKANVNEKTNFDSIAFFWITRLLLLESFYSDLDLYFNHNSSEADYLENI
PIFPYIDQIENKDFISNDLSTIKLNLEQINFNLNDAELEEENQLNNNLVQINDIVNIQNK
EIYIFASNAFASLFSYIREYTINENWRIDDKKLNGAQIFQFITGQDLNKWQNNNWNNQQW
IVNEQNKLSDVVKTNQIKDQSSNYIKIEGNLSEKENNYEAILRSGLKGKSTPIAAQWNDN
DLILSANIDSLNLNPLSLNSDDTYDDWSNKFSALNNTYVTDELFSGLFAERNIEWITWNS
TNYSKYETNSAWTNNMALNYRMFLKASAAYANMNIEFRKEFNVFDSANQIHYKNVIIDKY
NYTNLKILNSDKGGRMPLNKGEVLISPQYAKAHKIKNNDEIKIGPQVFTVVGIATDTFSY
YPIVDENIPLPQYKNSAIIYASEETFFPIIQNSNSSNKEQVINTTINYFLWSNDSDKENN
INLFKSLNPSVNNIKTFDESSYRYSWILQPRIISGMLIVMLLMSVIICVISILGIIIYIK
KMVRSNIKQIGILKALGFKSFPIACSYGIIGLIILILVIPITWVIGTLMQFIFINMFIPY
FSIQLSEVSISLTALMVGLFAFGFFAIILSVLIAYFETKQEITLMFNSVAKVKITSKLME
LINNVFNNSKFTLRFSLIVSTSALKNTITTITTIFISSFLVFFGLSIPAIVQTTKNGYYN
SLNYSNYHVFEDLVSNAPLSKSTISYTNDLDLIDSNYTETSLMYSYMNPNYSYDSSFDAS
PFSKYMYVKGVNQNQNIMNSFKLLVNDSNNQSSTGSTGLFSIITEQFGNNFANGIGSQFS
VGMIDQALSAIMNSYYDATAYGTNDYYKVNDDYQNNNQFNIITKNLTEAVPLILSAILGN
GTGESTGNWKDDILNIILKNVPTFVEGYLQDPSRKEQYAFGYNVKKVEKKSETLATEMYG
SIDKFSNVKFTGINANQAAFTLPNEKIFTSQVVANNIQDLINNEWDLNQSIIENGYTYYD
AKSKTLSIPIIPNKQALNKYDLKLNSIVNNNYILQPQLKFAGKENNEFLELPRQAWVYND
SDFINSDYFKHNFSKIDSNKNISHNRTGSTNNIAYLDPSDLDNNKFTYKYMYSKQTDNNY
TLNNMAYLFNDFAIDDKNQGISYVRPYYQYENIELYLPQNLISNERKKDKSIWSNYSENN
PNETDKGYFEENIDNSKVPSSVKHAWESLYPEEAINSKYIKIKPYSLSYKKQDITNPGLE
LIVDKTSNYVWYADAIRAGLLKQEVSEVKYLNSDIKIQYKVVGILDSYNSSLILMDQQLA
NTMLNFSNAKKQDVKNNIFEDDPKVKAGETISANGKEFKSEFDRYELHDDNEDIYLKDWT
NMLSEDEQSISYSQHMWSNAKYSNVEEAIDLTTGIWQTISENNGLLMLGQSPLGNISHSS
VKTGILNSKLLLTEKELINQVTELAIAIGSFFIIIVILTTSLLIMLIGDIYIASFQRFMI
LMKSFGYSNWKVQKYAFGVVTIASISAWIIATFLSAIAAYSISIILTEIGLAVPIALTWW
PFVLSAFIVGLAYFGSLIIVTKKVRKGKPSELLNETNE
NT seq
5157 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagggcaatattaaatcttattttgttgtttaagcaatctataaaatcaatatttaag
tttaagattcaattcttagccattttactattatcatttttatcagtattagttttaaca
acatcattaacaattaaagacagacttaattcaacttatgactcagtagtcaaaaacgtt
gaaaaatttgactatcaacaatctgatcaattgtcatttttaaaaggggagactcagcac
aaaatttctaaagaattaatgcttttatttattcctgaaaattctaaaacaacaattgat
gataagcaaactataaatattaactttaattcaatctatggaaaaacttatattactgaa
gcatttgaaaaagatgatcgaatgctaaaagtttttaaagcgaatgtgaatgaaaaaaca
aactttgattcaattgcttttttttgaataactagattgttacttttggaaagtttttac
tctgatttagatttatacttcaatcataattcttcagaggctgattatttagaaaatata
cctatatttccatatattgatcaaattgaaaataaagattttatttcaaatgatttaagt
acaattaaactaaatttagaacaaataaattttaatttaaatgatgcagaattagaagaa
gaaaatcaattaaataataacttagttcaaataaatgatattgttaatatacaaaataaa
gaaatctatatttttgcttctaatgcttttgcatctttattttcttatatcagagaatat
acaattaatgaaaattgaagaattgatgataaaaaattaaatggggcgcaaatatttcaa
ttcataacaggtcaagatttgaataaatgacaaaataacaactgaaataatcaacaatga
attgttaacgagcaaaacaaacttagtgatgttgttaaaacaaatcaaataaaagatcaa
agttcaaattatattaaaattgaaggaaaccttagtgaaaaagaaaacaattatgaagct
attttaagatctggtctaaagggaaaatctacaccaattgcagcgcaatggaatgacaat
gatttaattttatctgcaaatatagactcattaaatttaaatcctttaagtttaaattct
gatgatacatatgatgattgatctaataaattcagtgccttaaacaatacatatgttact
gatgaactttttagtggtttatttgctgaaagaaatatagagtggattacttgaaattca
acaaattattcaaaatatgaaacaaacagtgcgtgaacaaataacatggcacttaactat
agaatgtttttaaaagcctcagctgcttatgcaaatatgaatatagaatttagaaaagag
tttaatgtttttgattcagcaaatcaaattcattataaaaatgtaattattgataaatac
aattatacaaatttgaaaattttaaattcagacaagggtggaagaatgcctttaaataaa
ggcgaagtattgatttcaccacaatatgcaaaggcacacaaaattaaaaacaacgatgaa
attaagatagggcctcaagttttcacagttgtgggaatagcaactgatactttttcttat
tatccaattgtagatgaaaatatacctttaccacagtacaaaaattcagccataatttat
gcatcagaagagacttttttcccaataattcagaactcaaattcatcaaacaaggaacaa
gttattaatactacaataaactattttttatgaagtaatgattcagataaagaaaacaat
ataaatttatttaagagtttaaatccaagtgttaataatataaaaacatttgatgaatca
agttatagatatagttgaatcttacaaccaagaattatttcaggaatgctaatagtaatg
ctattaatgtctgtgataatatgtgttatttcaatattgggaattataatttatataaaa
aaaatggttagatcaaatattaaacaaattgggattttaaaagctttaggttttaaatca
ttcccaatagcgtgttcatatgggattataggattaattattttaattttagttattcca
ataacctgagttataggaacacttatgcaatttatttttataaatatgtttattccttat
tttagtattcaactttcagaggtttcaatttccttaactgctttaatggttggtttattt
gcatttggattttttgccataattttgtcagttttaattgcatattttgaaactaaacaa
gaaattactttaatgtttaatagtgtggcaaaagttaaaataacttctaagttaatggaa
ttaataaacaatgttttcaataattctaaatttactttaagatttagtttaattgttagt
acctctgccctaaaaaatacaattacaacaattacaacaatattcatttcttcattttta
gtattttttggtttgtcaattcctgcaatagttcaaacaactaaaaatggatattataat
agcttgaattatagcaactatcatgtttttgaagatcttgtttcaaatgcaccattatct
aagtcaacaatttcatatactaatgatttagatttaattgattctaattacactgaaaca
tctttaatgtattcatatatgaatccaaattatagttatgattcttcttttgacgcttca
cctttttctaaatatatgtatgttaaaggtgtgaatcaaaatcaaaatattatgaacagt
tttaaactattagtcaacgattctaataatcaatcaagtacagggagtacaggtttgttt
tcaattattactgaacaatttggtaataactttgcaaatggaattggttctcaatttagt
gtagggatgattgatcaagcgctaagcgcaattatgaattcatattatgatgcaacagca
tatggaacaaatgattattataaagtgaatgatgattatcaaaataacaatcaatttaat
attattactaagaatttaacagaagctgttcctttaattttatctgcaattttgggaaat
ggaactggagaatctaccggaaattgaaaagatgatattttaaatattattttaaaaaat
gttcctacgtttgttgaagggtatttacaagacccttcaagaaaagaacaatatgcattt
ggttataatgttaaaaaagtggaaaaaaaatctgaaactttagcaacagaaatgtacgga
agtattgataaattttctaatgttaaatttactggaattaatgctaatcaggcagctttt
actttaccaaatgaaaaaatatttactagtcaggtagtggcaaataatattcaagattta
attaacaatgaatgggaccttaatcaaagtattatagaaaatggctatacatattatgat
gcaaaatctaaaactttatctattccaattattccaaataaacaggctttaaataagtat
gatttaaaactaaattcaatagttaataataattatatcttacaaccccaattaaaattt
gcaggtaaagagaataatgaatttttggaattgccaagacaagcatgagtatacaatgat
tcagattttattaattcagattatttcaaacataactttagtaagatcgatagtaataaa
aatattagtcataatagaacaggttcaactaataatattgcgtacttagatccatctgat
ttagataataataaatttacttataaatatatgtattcaaaacaaacagataataactat
actttgaataatatggcttatttatttaatgattttgctattgatgataaaaatcaaggt
atttcttatgtaagaccatattatcagtatgaaaacattgaattatatctgccacaaaat
ctaatatcaaatgaaagaaaaaaagataaaagcatttgatctaattattcagaaaataat
cctaatgaaactgacaaaggttattttgaagagaatatagataattcaaaagttccaagt
tctgtcaaacacgcttgagaaagtctatatccagaagaggcaatcaattcaaagtatatt
aaaattaaaccttattctttaagttacaaaaaacaagatataactaatcctggtttagaa
cttatagttgataaaacatctaattatgtttgatatgcagacgcaataagagctggttta
ttaaaacaagaagtcagtgaagttaaatatttaaattctgatattaaaatccaatataaa
gttgtaggaatacttgattcttataatagttctttaattttaatggatcaacaattagca
aatacaatgttaaatttttcaaatgcaaaaaaacaagatgttaaaaataatatttttgaa
gatgatccaaaagtaaaagcaggagaaacaattagtgcaaatggaaaagaatttaaatca
gaatttgatcgatatgaattacatgatgataatgaagacatttatttgaaggattggaca
aatatgctttcagaggatgaacaatcaataagttactcgcaacatatgtgaagtaatgca
aaatactcaaatgtagaagaagcaattgacttaaccacaggaatttgacaaactatttct
gaaaataatggattattaatgttagggcaatcacctttaggtaatatttcacatagttct
gttaaaactggaattttaaattctaaattacttttaacagaaaaagaattaattaaccaa
gtaacagaattagcaattgcaataggtagtttctttattataatagtaatactaacaact
tcgctcttaattatgttaattggtgatatttacatagcttcattccagagatttatgatt
ttaatgaaatcttttggttattcaaattgaaaggttcaaaaatacgcttttggagtagta
actatagcttcaatatcagcttgaattattgcaacttttttaagtgctatagcagcttat
tctatttcaataattttaactgaaattggattagctgttcctattgctttaacttggtga
ccatttgttctttctgcgtttattgtaggactagcttattttggaagtttgattattgta
actaaaaaagtaagaaaaggtaaaccatcagaattactgaatgaaacaaacgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
