Methanobrevibacter sp. AbM4: Abm4_0864
Help
Entry
Abm4_0864 CDS
T02687
Name
(GenBank) adhesin-like protein with transglutaminase and PMBR domains
Organism
meb
Methanobrevibacter sp. AbM4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PMBR
Transglut_core
Big_3_5
CarboxypepD_reg
MG4
Peptidase_C71
Wzt_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
15798357
NCBI-ProteinID:
AGN16753
UniProt:
R9SLQ4
LinkDB
All DBs
Position
1073460..1077854
Genome browser
AA seq
1464 aa
AA seq
DB search
MSKKFRYFSLILVLIIFLCVGAVSATDPDNGTTVSMSNSSVQDSVQNVYDNESTNSIGLS
TSAIGSANNLSATVSDDNNNNNTGDAPNGNVSSTVSTSVTNSTLENNSTPNNISVNNSTS
NNIGRNNSSNEVKNTTISTKNNTIVGNSSLVKPKAAGSANSNTFSISQIISAAKYVKNYY
ASHGKLPSTVTIGSVKVSLAQFLYYESKAISQLNSGNKANIKIIGSMDEPSSPNSGDSVS
GKLTKSAYVDSATRTYKFILNYLQGPNYSTTTLKRVSYNRLIEAFSVALDYYGSNNKLPD
YLTLKYGSKTTAGANSVSYVSINQIIAASKVVKEYYAANGKLPSTVMIGSVKCTLSQFLY
YESKAISQLNSGNKANIAIVKSLREPSSPNMGDVNGGNLAKSGYVDSATRTYKFILNYNQ
GPNYSTTTLGRVSYNNLIRAFADVLVSYGSNNRLPSSVAINNNINVKKTTTITINSGSVY
KNGNKYSVVLKDASGKVLANQKIQFKISGINTVYYATTDAKGVASFVINLNSGNYTITSS
FGGNSNYQGSSKSSKISVLGNSSSKNSNTFSIFVFGSDMNNVNLATLASNHIGNIFLNYY
AIEKYGTSAVTNFIANARKYNINVYIWMQCFYDGNWVNPSTCGQAYWTKKINEAISYAKI
TGVTGIALDYLRFGGNAYKYSNGTSSITLFTRTLTNSVKLVNPNIKVAAIIMPETTQNVY
YYGQDSDQLGKIVDILMPMIYKGNYKASSSWIKSTTAYFKAHSGTAQVWTVLQSYKSDDD
VTKLSASELKTDAQNALDGGAVGVSYFRYGYTNYVNSTTLNGGISSMEDSNNITKTNPKV
SASNVTMYYKDGSKFVIVLKDFKGNALANKEIYLKIGNSVYKLVTDSNGKAQYVINLNPG
TYTVTYGFNGDSYRYSTNSTGKIVVKKLSYVIKANDLTTTSKTGYYTFSVYDNLGKKIVN
QYVNVTIAGKLYTVKTDSNGNVKIAYNLSKGTYTAKISIVGNNIYNSNSASKKITINSQP
ATYLTINQIINAAKVVKKYYADHGSLPSTVTIGSTKVTIAQYLYYASRAISQINSNNMAN
IPIIASVDSASNPNMGDAVNGNLNKAGYVDSATRTYKFILNYMQAPNYSTTTLNRASFNT
ITEAFSVALDYYLSNKKLPDYLTITSGKETTAHSNTVTTKYVTINQIISAAKVVKEYYAK
NKKLPNTVTVGSYKCTLAQFLYYESRAIAQINANNWNNIPVIGSLDEPSSPNMGDAVNGN
LNKAGYVDSATRTYKFILENKQGPNYSTTTVGKVSYNALIEAFSRVLAYYGNNKQLPSYT
AIDTTNGEDTSSITALAKSLTSGLSSDYNKAVTMFNWIRDNVLYDYYYNSQQGAALTLAK
KSGNCCDQSNLYVAMCRAVGITVRYVHGYCHFTDGWYGHVWTEVYVNGKWYSADCISKRN
TFGSINNWNTATATIYNRYTNLPF
NT seq
4395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgaagaaatttagatattttagcttaattctagttctcattatctttttatgtgtt
ggtgcagtttctgctactgatccggataatggaactacggttagcatgtcaaattcttcg
gttcaagattcagttcaaaatgtttatgataatgaaagtacaaattcaataggtttaagt
acgtctgctattggaagtgcaaacaacttatctgcaactgtttcagatgataataataat
aataatactggggatgctcctaacgggaatgtttccagtacagtaagtacatccgttacc
aatagtacattagaaaataattctacacccaataatattagtgtaaataattccacatca
aataatattggtaggaataattcttctaatgaagttaagaatactacaatttcaacaaaa
aataatactattgtaggtaattcttctcttgtaaaacctaaagctgcaggttctgcaaac
tctaatacttttagtattagtcaaattattagtgctgctaaatatgttaaaaattattat
gcttcacatggtaaattaccaagtaccgtcactattggttcagtgaaagttagtttagct
cagttcttatattatgaatctaaagctatatctcaacttaactccggtaataaggcaaat
attaaaattataggatctatggatgagccttccagtccaaatagtggtgattccgtaagc
ggtaaattaactaaatccgcctatgttgattcagctaccaggacttataaattcatatta
aattatttacaaggccctaactattcaacaaccactcttaaaagagtatcttataataga
ttaattgaagcatttagtgttgctcttgattattatggatctaacaataagttacctgat
tatttaacccttaaatatggttctaaaaccactgcaggtgcaaattctgttagttatgta
agtattaatcaaatcattgctgcatctaaagttgttaaagaatattatgcagctaatggt
aaacttccaagtaccgtgatgataggttctgtaaaatgtactttatctcagttcttatac
tatgagtctaaagctatttcacagttaaattcaggtaataaagcaaatattgctattgtt
aaatctttaagagaaccttccagccctaatatgggagatgttaatggtggtaatttagct
aaatcaggatatgttgattcagctaccaggacttataaattcatattaaattataatcag
ggtcctaactattcaactacaactcttggaagagtttcatataataatttaattagagct
ttcgctgatgtacttgtatcttatggtagtaataaccgtttaccttctagtgtagcaatt
aataacaatataaatgttaaaaaaacaaccactatcaccataaactctggtagtgtttat
aaaaacggcaataaatatagtgttgtccttaaagatgcatctggtaaagtccttgctaat
caaaaaattcagtttaaaataagtggtattaatactgtttattatgcaacgactgatgca
aaaggagttgctagttttgttattaatttaaattcaggtaattatactataacctcctcc
tttggtggtaatagtaattatcaaggatcttctaaatcttcaaaaattagtgttcttgga
aattcaagttcaaagaatagtaatacattttcaatttttgtatttggaagtgatatgaac
aatgtaaatttagctacacttgcttcaaatcatataggtaatattttcttaaactattat
gctattgaaaaatacggaacttctgcagtaacaaatttcattgcaaatgcaaggaaatat
aatattaatgtatatatctggatgcaatgtttctatgatggtaattgggtaaatccttca
acctgtggccaagcttattggactaaaaaaataaatgaagctatctcttatgctaaaata
actggtgtaactggcattgctttagattatttaagatttggaggaaatgcttataaatat
tctaatggaacatcttccattacattgtttactagaaccttaactaactcagttaaatta
gttaaccctaatattaaagttgctgcaattataatgccggagactacacagaatgtttat
tactatggtcaagattctgatcaattgggaaaaattgtggatattctcatgcctatgatt
tataagggcaactacaaagcaagtagttcatggattaaatcaactactgcttacttcaaa
gcacattcaggcactgcacaagtatggaccgtattacaatcatacaaatctgatgatgat
gtcactaaattaagtgcatctgaattaaaaactgatgctcaaaatgcactagatggtggt
gctgttggtgtttcatactttagatatggttatacaaactatgttaactctactacctta
aatggtggtataagtagtatggaagatagtaataatattactaaaacaaatcctaaagta
tcagcttccaatgtaactatgtattataaggacggttctaaatttgttattgtgctaaaa
gatttcaaaggtaacgctttagctaataaagaaatttatcttaaaataggtaattctgtt
tataaattagttacagacagtaacggtaaagcacaatatgtgattaatttaaatccggga
acttatactgtaacctatggtttcaacggagattcctaccgttatagtactaattcaact
ggaaaaattgtagttaaaaagttatcttatgttataaaggcaaatgaccttacaactacc
agtaaaactggatattatacttttagtgtatatgataatcttggtaaaaaaattgtaaat
caatatgttaatgttaccattgcaggaaaactttatacagttaagaccgattccaatgga
aatgttaaaattgcatacaatttaagtaaaggaacatataccgctaaaataagtatagtt
ggaaataatatttataatagtaattcagccagtaaaaaaattactattaatagtcagcca
gctacatacttaactattaatcagatcatcaatgctgctaaagtagttaaaaaatactat
gcagatcatggctcacttccatcaaccgttactattggttcaactaaagtcactatagct
caatacttatattatgcatctagagctatctcacaaattaactccaataatatggccaat
atacctattattgcttcagttgattcagcaagtaacccaaatatgggggatgcagttaat
ggtaatttaaacaaagcaggctatgttgactctgcaactaggacctataaattcatatta
aattatatgcaggctcctaactattcaacaaccacacttaatagagcatcatttaataca
attaccgaggcattcagtgttgctctagattactatctttcaaataaaaaattaccggat
tatcttactataacatcaggtaaagaaactactgctcatagcaatactgtaacaactaaa
tatgtaacaattaatcagattattagtgctgctaaagtagttaaggaatattatgcgaaa
aataaaaagttaccaaatactgtaactgttggttcatataaatgtaccttagctcaattc
ttatactatgagtctagagctattgcacaaatcaacgccaataattggaataatattcct
gttatcggttcattagatgaaccatcaagcccaaatatgggggatgcagttaatggtaat
ttaaacaaagcaggctatgttgactctgcaactaggacctataaattcatattagaaaac
aaacaaggccctaactattcaacaacaactgttggaaaagtttcatataatgctttaatt
gaagcattcagtagagtcctcgcatattatggtaataataaacaacttccaagctatact
gccattgatacaacaaatggtgaagacacatcatccattactgctcttgcaaaaagttta
acttctggtcttagttcagactataacaaagctgttactatgtttaattggataagagat
aatgtcttatacgattattattataattcccaacaaggtgcagcattaactttagctaaa
aaaagtggtaattgttgtgatcaatctaacctttatgttgctatgtgtcgtgctgtagga
ataactgtacgttatgttcacggttactgtcactttacagatggctggtatggtcatgtt
tggactgaagtatatgtaaacggtaaatggtattctgcagattgtatttcaaaaagaaat
acatttggttccattaacaattggaacactgctactgcaacaatatacaatagatatacc
aatttaccattctga
DBGET
integrated database retrieval system
