Metabacillus sp. KUDC1714: HUW50_20525
Help
Entry
HUW50_20525 CDS
T06752
Name
(GenBank) LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein
Organism
meku
Metabacillus sp. KUDC1714
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
Big_6
Big_13
Glyco_hydro_18
Gmad2
Glft2_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNF29662
UniProt:
A0A7G7FXM8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4458765..4463978)
Genome browser
AA seq
1737 aa
AA seq
DB search
MDISRYELKRDLNNYYTLIIYLDPLLTEFSTELGETRLKKDDLNKHIRSLIKERFPHVPI
KAAKVMAGSLIITTLYLTGSATSAGAEANSSTQLTQGNQFDVYTVQSGDSLSLIAKRFNV
STASIKSLNHLASDSIFIGQKLNLPFFTYTVVSGDSLSVIAKRFNTSTAAIGTFNQLTSN
TINIGQKLKIPTSTNPIEETPVDHPTVEDNNGTYTVVSGDSLSLIAKKYSTTVDTIRTLN
LLTTDIIYVGQILKVPQNQQPDTTEEAPPTVKDPEIELTPETPKTDALTTYTVVSGDSLS
LIAKKFSTTVAAIQSQNNLSTTVIYIGQMLTIPKTAVENETPTEPIKEITTTYTVIAGDS
LSVIAKRLNTTVDAIKSTNSLTTDIIFIGQTLKIPTAQTVPVKPADNLAPSIPVLTTANQ
ITSSNHARLNISGATETNANVKVSISDGKNEPNNFEVKADANGKFQQVVDVSMLQDGNIT
ITASATDAAGNQSSGSKLIVKKDTVSTAPTISSTTINKSSSGTYPILGTADPGSIVTIVI
SDGENLEITTQSVTNERGEFRAIVDLTRLNDGEIFITANAKDSLENESQASKITVIKDSS
INQPTMELPPSINSDSVGTVAIRGKSEENASVMIKATDGVSEVEASVTSTKEGDYKANLD
LTSLNDGKITITATAIDRFGNKSEKNTGIIAKDTFASEPMIDNKKHVTNVNAHEYTIFGV
AERDATVKITVTDENNSKINTSVTANDNGEFQANVDLRSLSDGQLTITAQGIDLSGNHSG
TLVNKLLKDTDIPLVPIFNNNFFINNENQSSYLLTGSAEGNAQINVIISNNDGQSIQVSG
TADETGSYRIPIDLTTFNDGDVTFKITQNDFAGNISPSISKTLIKDTTAPTNLEVDQLNT
IFSGNANSYKVAGSAEPNITLEITLSDEKTNVIKSLTTNQDGSFEIPFDVSTLMDGNITV
SFLTRDAAGNSGTPEPITIKKDTTAPTKAILTVPPFVNSQNMKQYDITGSSVEEGSLIKM
VVTDGTTAITKSTKVINGSFNTQLDLSSLKNGPISFEITQIDLAGNTGIVQATSLEKDTT
VENPIISKNGFKYENLQSIYTMIGLAEPNATIEITIFDANGNELLTKSSSADSKGYYSTF
MHLDLDVLNTSGEITASVSQTDLAGNTSELTSVGLYTYKVAASDSLVSIAKRYNTTVEAL
MSLNQLTSEAIQTNQQLRLPISASEVINLGYMYFGNTNEYINMINQTANSVNIVSPSYFD
INSDGSLKLTYQVDPHFISMMHQQGKRVVPFLSNHWDRTIGRAMLENKEQAAQQIADAIE
HYNLDGVNVDIENVTEIDRENYTEFVRLLREKIPVSKEVSVAVAANPNGWSSGWHGSYDY
TELAKYADYLMIMSYDESYTGGEAGSVASYSWVEKSIQYALDQGVTSDKIVVGVAHFGRY
WIEGVSYGGFGISNSKVEEMIQKYNGSVTFDEISKTPKATITINEGDPITFVSGSSLSPD
TYTIWYENEESIRHKLSLVNQYNLRGVGNWSIGQENPEVWNSYTTSLPTIVPVTSPEFTN
VDKDEGKDYKLYTVVSGDSLWSIANKNNTTVTILRDINNLNTDTVLIGQTLKIPSGENNI
TVTEPETSTMSYTVVSGDSLSVIAKRYNTTVTSIKEQNNLISDSIYVGQVLNISTTTTST
ENVTPPKDPEITTYTVVSGDSLSVIANRFNTTVTLIKETNNLTTDTIYVGQTLKITH
NT seq
5214 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacattagtaggtatgaattaaaacgtgatttgaataattattacacacttatcatt
tatcttgatcctctgttgactgaattttcaacagaattaggagaaactcgactaaagaaa
gatgatctcaataagcatattcgatctctaatcaaagagagatttccgcatgttcctatt
aaagctgcgaaggtaatggctggatctttaatcattacaactttatatctaacaggatca
gcaacaagtgcaggtgcagaagcaaatagttccacccagcttacacaaggaaatcaattt
gatgtgtacaccgtacaatccggtgatagcttatctcttatagcaaaacgatttaatgtg
tcaacggcctctattaaatcgttaaatcatttagcatcagactctatttttattggacaa
aagttaaatcttcctttcttcacttatactgttgtttcaggtgatagcctttctgttatc
gccaaacgttttaatacgtcaactgcggcaataggaacatttaatcaacttacaagtaat
acaattaatattggtcaaaagctaaaaatacctacatccactaatcctattgaagaaaca
cctgttgaccatccaacagttgaagataataatgggacgtacacagttgtttctggtgat
tcattgtcattaattgcaaaaaaatacagtacaacagtcgataccattcggactttaaac
cttttaacgactgatattatatatgttggccaaatattaaaagttccgcaaaatcaacag
cctgatacaacagaagaagcaccaccaacagttaaagatccagaaatagaactaactcct
gagacaccaaaaacagatgctctaactacatatacggttgtttcaggggattcattatca
ttaatagcgaaaaagttttctacgactgtcgctgcaattcagtctcaaaacaacttatca
acaaccgttatttatatcggacaaatgttaaccattccaaaaacagctgtagaaaacgag
accccaacagaaccaattaaagaaataacaacaacttataccgttatcgcaggggattct
ttatctgttatcgcaaaacgtttaaacacaaccgtagacgctattaagtcaaccaatagt
ctaacaacagacattatctttattggtcaaacactcaaaatacctacagctcagacagtt
cctgtgaaacctgcagataatttggctccttctattcctgttttaactacagccaatcag
attactagttcaaaccatgcacggttgaatatatcaggagcaacagaaactaatgcaaat
gtaaaagtttccatttcagacggaaagaatgaaccaaataacttcgaggtaaaagctgat
gctaacgggaaattccaacaggttgttgatgtatcgatgttacaggatggaaatattacc
attacagcttcggcaacagatgctgcaggaaatcaaagttcaggatcaaagttaattgtt
aaaaaagatactgtttcaacagctcctaccatctcgagtacaacgattaataagtcatca
tctggtacttaccctattctaggtacagcagatccaggctctatcgtaacaatcgtcata
tcagatggagaaaatttagagattactactcaaagcgtaacaaatgaacgcggagaattc
cgagccattgttgatttaactcgtttaaatgatggtgaaatattcattacagccaatgca
aaagattctttggaaaatgaaagtcaagcatcgaaaatcactgtaataaaggattcttct
attaatcaaccaacaatggaactgcctccttcgataaatagtgattctgttgggacagtt
gcaattagaggaaaaagtgaagaaaacgcttccgttatgataaaagctacagatggagta
tctgaggttgaagctagtgtgacaagcactaaagaaggtgactataaagcaaatttggat
ttaacttcacttaatgatgggaaaattacaattactgctaccgctatcgaccgctttggt
aacaaaagcgagaaaaatacaggaataattgctaaggatacatttgcatctgaacctatg
atcgataataaaaaacacgttacaaatgtaaatgcacacgaatacacaatttttggtgtt
gctgagcgtgacgctacagtcaaaattactgtaacagatgaaaataattctaaaattaat
actagtgtaacagctaatgacaatggtgaatttcaagcaaatgttgatttacgttctctt
agtgacggtcaactaacaataactgctcaaggaatagatttgtctggtaatcatagtggt
accctagttaataagctgttaaaagatactgatattcccttagtccctatatttaataat
aatttttttattaataatgaaaatcaaagctcttacctccttacaggatctgctgaagga
aatgcccaaataaatgtaatcatctctaataacgatgggcagtcgattcaagtaagcgga
actgctgatgagactggtagctacagaattccaattgacctcaccacttttaatgatgga
gatgtaacattcaaaataacgcaaaatgattttgcagggaacattagtccttccatctca
aaaacattaataaaggatacaaccgctccaacaaatctagaggttgatcaacttaatact
atttttagtggtaatgctaactcctataaagttgctggctcggcagaaccaaacattacg
cttgaaattactctttcagatgagaaaacaaatgtaataaagtctttgacaactaaccaa
gatggttcttttgaaataccatttgatgttagtacattaatggatggaaatatcactgtt
tcatttttgacaagggatgcagctggaaatagcggaactccagagcccatcaccattaag
aaggatacaactgcacctactaaagcgattttaacagttccaccctttgtgaattcacaa
aatatgaagcaatatgacataactggctctagtgttgaagaaggttcactaatcaaaatg
gttgtaacagatggaacgactgcgataacaaaatcaacgaaagttattaatggtagtttt
aacacacaactcgatttatcaagtttaaaaaatggtccaatctcttttgaaatcactcaa
atagatcttgctggaaacacaggtattgttcaagccacatcgcttgaaaaggatacgaca
gtagaaaatccaattatttcaaaaaatggtttcaaatatgaaaaccttcaatctatttat
acaatgattgggttagcggagccaaatgcgacaattgaaattaccatttttgatgctaat
gggaatgagctattaacaaagtcatcctctgctgattctaagggttattattcaacattt
atgcacctagatctagatgtgctgaacacatctggtgagataactgcttcagtctctcaa
acagatttagctggaaacacgagtgaactaacatctgtaggcctttacacttataaggtt
gcagctagcgattcgttagtttcgattgctaaacgttataacacaactgttgaggcctta
atgtctcttaaccaattaacaagcgaagcgattcaaactaatcaacaattacgcttgcct
atttcagcaagtgaagtgattaaccttggatatatgtattttggaaatacaaatgaatac
attaacatgataaatcaaacagcaaattcagtaaatatcgtgtctccaagttactttgat
ataaattcagatggatcattaaagctcacctatcaagtagaccctcattttattagtatg
atgcaccagcaaggtaaacgagttgttccatttttaagtaaccattgggatcgtactatt
ggtcgtgcaatgctagaaaataaagagcaagctgcacagcaaattgctgatgcgattgag
cactacaatttagatggtgtaaatgttgacattgagaatgtaacagagatagatcgtgaa
aattatacagaatttgttcggttgttgagggaaaaaattccagtttctaaagaagtatct
gttgctgttgctgcgaatcctaatggatggtcctcgggctggcatggttcctatgattat
acggaattagccaaatatgctgactatttaatgattatgagttacgacgaaagctatact
ggcggggaggcaggttctgtagctagttactcatgggtagaaaaatctattcaatatgca
cttgatcaaggtgtgacaagtgataagattgtcgttggtgttgcacattttggacgttat
tggattgaaggagtttcatacggaggatttggcatttcgaattctaaggttgaggaaatg
atccaaaaatataatgggtcggtaacgtttgatgaaataagtaaaacgccaaaagcaacg
attactattaacgaaggtgaccctattacatttgtgagtggtagctcactttctcctgat
acgtatacaatttggtatgaaaacgaagaatctattcgacataaactttcattagtaaat
cagtataacctacgtggagttggtaactggagtataggacaagaaaatcccgaggtatgg
aatagttacacaacctcactacctactattgtgcctgtcacctctcctgaatttacaaat
gttgataaagacgaaggaaaagactacaaactttacactgtagtttcaggtgatagttta
tggtcaattgcgaacaaaaataatacgacagtaactatccttagagacataaacaattta
aatacagatactgtactgataggacaaactttaaaaataccttctggtgaaaataatata
acagtaactgaaccagagacctcaactatgtcttataccgttgtttctggtgattcacta
tcggttattgctaagcgttataacactactgttacgtcaattaaagaacaaaacaactta
atatcggattctatttatgtagggcaggttttaaatataagcactaccactacctctaca
gagaatgtgactccaccaaaggatccagagataacaacctatacagtagtctctggtgat
tcattatcagttattgctaatcgatttaacacaactgttacgctgataaaagaaacaaat
aatttaacaactgacaccatctatgtagggcaaactttaaaaataactcattag
DBGET
integrated database retrieval system