KEGG   Methanocaldococcus lauensis SG7: MLAUSG7_1478
Entry
MLAUSG7_1478      CDS       T07631                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase domain protein
  KO
K03725  putative ATP-dependent RNA helicase [EC:5.6.2.-]
Organism
mesg  Methanocaldococcus lauensis SG7
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mesg00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mesg03019]
    MLAUSG7_1478
Messenger RNA biogenesis [BR:mesg03019]
 Prokaryotic type
  Archeal mRNA degradation factors
   Exosome components
    Others
     MLAUSG7_1478
SSDB
Motif
Pfam: DEAD DUF5814 Helicase_C ResIII Helicase_dom4_arc MTHFR Helicase_C_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAB3289899
UniProt: A0A8D6PYY4
LinkDB
Position
I:complement(1385473..1387908)
AA seq 811 aa
MIIIRKPKKKKDEIEIVKVNGKIEDGVEIKDNQKIFANYKKIGNKYKLYRCRLGDKLIQP
SKVIELLKREDIFILKGNEEIGELLKSYNLKFDYIKLCPFCLLKNIYKRLTRNNRCKYGN
LEICIDCGVREIREEVKINEEFIEKFLRRFKDVDKVLSLLRIRNPLNNPELTRYDIITCS
KEDKIRNYKIDELNIPEELRKIIKDRGIYELLPVQTLAVKGGLLKGEDLLIVSATSSGKT
LIGELAGIKNLIEKGKKFLFLVPLVALANQKYLEFKERYEKLGFKVSLRVGLGRIGKKSD
DIETSLDAEIIVGTYEGIDYLIRTKKLKDVGTVVIDEIHSLNMEERGARLDGLIGRLRFL
FKDAQKIYLSATIGNPKELSKQLNAKLVLYNGRPVPLERHIIFCKNEFAKLNIIRDIVKR
EWQTISKFGYRGQCLIFTYSRKRAEYIAKSLKSKGIKAEFYHGGMEYLRRRKVEEDFANQ
KIQCVVTTAALSAGVDFPASTVILESLAMGAEWLNPAEFQQMCGRAGRKGMHEIGKVYLL
VEIGKKYHMKMENTEDEVAFKLLNAVPEDVKVEYSEDEEEEQILATISAGIENIKDIDRV
PYLGRVFQLNKILNSLESYSMIKIYKDKVKLTNYGKSVAISFLYPKIAEKIKEGVLENKP
ILELITEIMPFENVYISNNLKVKLSKILNINIPSRFFDALEVIRENLQKIEKIGDKKLKD
DLISIIVEFEGVNVEEKILELIVNLRLSKKTPGQISKTLYMDYKIQTYSGDIYYYLEQLL
NLLDAIERIANIFNKKYAENVHKLKERIENP
NT seq 2436 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattattattagaaaaccaaaaaagaaaaaagatgaaattgaaatagttaaagttaat
ggtaagatagaagacggagtagagattaaagataatcaaaaaatatttgcaaactataag
aagattggtaacaaatacaaactatacagatgtagattaggagataagttaattcagcca
tctaaggttatagaactgctaaaaagagaggatatatttatattaaaaggaaatgaagag
attggagaactcttaaaatcttacaatttaaagtttgattatataaaattatgtccattt
tgtttattaaaaaacatttacaagagattaacaagaaataatagatgcaaatatggaaat
ttagaaatatgtattgattgtggagttagagagattagagaggaagttaaaattaatgaa
gagtttatagaaaagtttttaagaagatttaaagatgttgataaagttttatctttacta
agaataagaaatccactcaataatccagaattaacaagatatgacataataacttgtagc
aaagaggacaaaattagaaattataagatagatgaattgaatatacctgaagaacttaga
aaaataattaaagatagaggaatttatgaacttttgcccgtccaaacattggctgttaaa
ggaggtttattaaaaggagaggatttattaattgtctcagcaacttcttcgggaaaaacg
ctaattggagaattggctggaattaaaaatttgatagagaagggaaaaaagtttctattt
ttagtcccattagttgcattggctaatcaaaaatatttagaatttaaagaaagatatgaa
aaattaggatttaaagtaagtttaagagtaggtttgggaagaattggaaaaaagtcagat
gatattgaaacatcgttagatgcagagattattgtaggaacttatgaaggtatagattat
ttaattagaactaaaaaattaaaagatgtagggactgttgtaattgatgagattcattct
ttgaatatggaggagagaggagcgagattagatggattaattggtagattaagattttta
tttaaagatgctcaaaagatatatttatctgcaacaattggaaatcctaaggagttatct
aaacaattaaatgctaaattagttttatacaatggaaggccagttccattagagaggcac
ataattttctgtaaaaatgagtttgctaaattaaatataattagagatatagttaaaaga
gagtggcaaacaatctcaaagtttggttataggggacagtgtttaatcttcacatactca
agaaaaagggctgaatatatagcaaaatctttaaaatctaaggggattaaggctgaattt
tatcatggaggtatggagtatttaagaaggagaaaagttgaagaagattttgctaatcaa
aaaattcaatgtgtggttacaactgccgctttatcagcgggtgttgattttcctgcttca
acagttatattggaaagtttggctatgggggctgagtggttaaatccagcagagtttcag
cagatgtgtggaagggctgggagaaagggtatgcacgaaattggaaaggtttatctttta
gtggagattgggaaaaagtatcacatgaaaatggagaatactgaggatgaagtggcattt
aaattattaaatgcagttcctgaagatgtaaaagttgaatatagcgaagatgaagaggaa
gagcaaatattagccacaatttctgcgggaattgaaaatataaaagatattgatagagta
ccatatcttggaagggtttttcaattgaataaaattttgaatagtttagagagttattct
atgataaaaatatacaaggataaagtaaaactaacaaattatggaaaatctgttgctatt
tcatttttatatccaaaaatagcagaaaaaattaaagaaggagttttagaaaataagcca
atacttgaattaataacagaaataatgccttttgaaaatgtctatatatcaaataattta
aaggtaaaactttcaaaaattttaaatataaatattccttcgagattctttgacgctttg
gaagtaataagagaaaatttgcaaaaaattgaaaagattggagataaaaaattaaaggat
gatttaatttcaataattgttgaatttgagggagtaaatgttgaagaaaagattttggaa
ttaattgttaatttaagattaagcaaaaaaacgcctggacaaatttctaagacactatat
atggattataagattcaaacatactctggagatatttattactatttagagcaactttta
aatctattggatgccatagaaagaattgctaatatatttaataaaaagtatgctgaaaat
gtccataaattaaaggaaaggatagaaaatccttaa

DBGET integrated database retrieval system