Mycoplasma leachii 99/014/6: MLEA_001080
Help
Entry
MLEA_001080 CDS
T02144
Symbol
rnr
Name
(GenBank) Ribonulease R
KO
K12573
ribonuclease R [EC:
3.1.13.1
]
Organism
mlh
Mycoplasma leachii 99/014/6
Pathway
mlh03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mlh00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MLEA_001080 (rnr)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mlh03019
]
MLEA_001080 (rnr)
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
mlh03016
]
MLEA_001080 (rnr)
Enzymes [BR:
mlh01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
MLEA_001080 (rnr)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mlh03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MLEA_001080 (rnr)
Transfer RNA biogenesis [BR:
mlh03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
MLEA_001080 (rnr)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
S1
OB_RNB
CSD2
RNase_II_C_S1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBV66849
LinkDB
All DBs
Position
complement(124422..126536)
Genome browser
AA seq
704 aa
AA seq
DB search
MESKIIEVLKTNKHKVSLNKLLTYFNALDYSLIKNYLDQLEKNNKITISLENNIYLLDQI
YKKGTIKLNPKGFGFINDINEIDGEDHFIAGVDLNNSIHQDEVVYILKQEEDNRLKAIVI
DLIKRNKVYLIGEINRSFDKRFLDFIPNDKSFDSFRFVIVNKNEFKYEEFNIIKAKIISC
KERKIFIRLIRIIGNSKKASDRILAIAEEFEIKTSFDKQTLDNAKQINLSTDKLEKEFLK
RQNNSLVNKTIVTIDGIDSKDLDDAICVEKLKNNNYKLFVAIADVSYFVRYKTALDKEAL
LRGNSTYLANKVIPMLPNILSDDLCSLNPNTKKLVFVCEMEFDNNANMLNKKVYESVIIS
KARLNYDEVNNYFKTKTWTHCEQTKKMLDVAYELYKKLEDLKAKKGTISFDVREPKIILD
KNLNVIDIKTKTADQAEKLIEQFMVSCNEAVAELIYQKDLPFLYRNHNKPDEDELINWYK
SLKTFGINPKLTNKQILDPIFINHTLTQIKEQIKDETEVELLNISLLRYMDKAKYGLENI
GHFGLASDCYTHFTSPIRRYSDLLVHRYLKQYLITKDLNQTSLENNTNYINKVSNIINDT
ETKSVECEREVIKACMCEYMLNKVNTTYTATISAVLKFGIFIQLDNLVEGLVHISNMNSN
LVYDETNHILIKPDNTYYRMGQKVKIKLISVDIKKRTIDFVLIE
NT seq
2115 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatctaaaattattgaagttttaaaaactaacaaacataaagttagtttaaataaa
ctattaacttattttaatgctttagattattcattaattaaaaactacttagaccaatta
gaaaaaaataataaaattactatttcattagaaaataatatttacttattagatcaaatt
tataaaaagggaactattaaattaaatccaaaaggttttggatttataaatgatattaat
gaaattgatggtgaagatcattttatagctggagttgatctaaataatagtattcatcaa
gatgaagtagtttatattttaaaacaagaagaagataatagattaaaagctatagttatt
gatctaattaaaagaaataaagtttatttaattggtgaaataaatagaagttttgataaa
agatttttagatttcattccaaacgataagtcatttgatagttttagatttgtaattgtt
aataaaaacgaatttaaatatgaagaattcaatattattaaagcaaaaattataagttgt
aaagaacgtaaaatttttataagacttataagaattattggcaatagtaaaaaagcaagc
gatcgcattttagcaatagctgaagaatttgaaataaaaaccagttttgataaacaaact
ctagataatgcaaaacaaattaatttatcaactgataaactagaaaaagaatttttaaaa
agacaaaataattctttagttaataaaacgatcgttacaattgatggaattgattcaaaa
gatttagatgatgctatttgtgttgaaaaattaaaaaataataattataaactatttgtt
gctattgctgatgtttcttattttgttagatacaaaaccgctttagataaagaagcttta
ttaagaggtaattcaacttatttagcaaataaagtaattccaatgttaccaaacatttta
tctgatgatttgtgttcattaaatccaaacactaaaaaactagtttttgtgtgtgaaatg
gaatttgataataacgcaaacatgttaaataaaaaagtttatgaatcagtgattatttct
aaagctagattaaattatgatgaagtaaataattattttaaaactaaaacatgaactcat
tgtgaacaaactaaaaaaatgttagatgtagcttatgaattgtataaaaaactagaagat
ctaaaagctaaaaagggaactattagttttgatgttagagaaccaaaaattattttagat
aaaaacttaaatgtaattgatattaaaacaaaaacagctgatcaagctgaaaaattaatt
gaacaatttatggtaagttgtaatgaagcagtagctgaattaatctatcaaaaagattta
ccatttttatatagaaatcataataaaccagatgaagatgaattaattaattgatataag
tcactaaaaacatttggaatcaatcctaaattaactaataaacaaattttagatccaata
tttattaatcacactttaactcaaatcaaagagcaaattaaagatgaaactgaagttgaa
ttattaaatatttctttattaagatatatggataaagctaagtatggattagaaaacatt
ggtcattttggtttagctagtgattgttatactcattttacttctccaattagaagatat
tcagatttattagttcatagatatttaaaacaatacttaattacaaaagatttaaatcaa
actagtttagaaaataatacaaattatattaataaagtaagtaatattattaatgatact
gaaactaaaagtgttgaatgtgaaagagaagttattaaagcatgtatgtgtgaatatatg
ttaaataaagtaaacactacttatacagcaacaatttcagcagttctaaaatttggaatt
tttattcaattagataatttagttgagggattagttcatatttcaaatatgaatagtaat
ttagtttatgatgaaactaaccatattttaattaaaccagacaatacttattatagaatg
ggacaaaaagttaaaattaaactaattagtgttgatattaaaaaaagaacaattgatttt
gttttaatagaataa
DBGET
integrated database retrieval system
