Modestobacter marinus: MODMU_0401
Help
Entry
MODMU_0401 CDS
T02167
Name
(GenBank) putative Diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(S)
Organism
mmar
Modestobacter marinus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
EAL
PAS_8
PAS_4
PAS
PAS_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CCH85859
UniProt:
I4ER46
LinkDB
All DBs
Position
complement(402365..404980)
Genome browser
AA seq
871 aa
AA seq
DB search
MTGVRRSAPALTALAALAAVLLVLPPGPAGELPQWDDLVLAATAAWAAWRCSALTRSMRH
RDRLPWQVLGAGALVFAAGSLATGTGIGAELGGQAGGPGLGDVLIMLASFGPTVSAALLG
GRVPGTRWPVLVIDGLLATVALVVVADVLVLSPALAPGALADDREPLLLAYGLYPAVVVG
VVGALCTVTTRAVTRSATGIVLVTGLLALASGLLAVHVARPEPGWAAAADVAVVLALVSG
VRVVQLAAGRPAPSAADAAVAVNPAGAVIVVVALVGVPVALLTALVRGMPLHVGAVAGTA
IVIALLLLRMVGRIRDAGRAREDLVRSEQDFRGLVEASSDGVAIVDADLRLEFTSPAART
LLGVADPDPHPLLLDLLHEEDRPRVRLELTGAVGAVTPTLQLRVPHADGEPRELEVTHHE
RPGSGRRVLHLRDVTTRRRRERELERMAFTDHLTRLPNRAMLFQEMAAPSAAERRLLVLD
LDGFKAVNDTAGHESGDLLLVEVARRLQGLLRTDDLVARLGGDEFAVLIAGDEEAGTEAA
QRVVDVLGQPYRVGGRTFSVGASVGLCRVHPGGGQLAFRLADTALRAAKQAGKGCWRVHS
EDRGGQAAATSDVAAALAGGEVQLRYDVVATSDTGLITGVHTAPVWAHPELGLLPAAELW
AAAERQGQDGALQQWLIRQACAEVAALDGELQVGVDLPPRQLRADELAGEVAAALAGSGM
APRRLVLAFDEEVLQTSSAGLIPALHVVRAAGVHLCLNDFGMGSTLWSQLARVPLDTVRV
DVRGLAAPDDHERTMKVLTAIESSAAAFDVYTLAGEVGSPELYDRIRTQCRMAVTGPVLP
VGLSAPQVATLLRHPSATVVAASVPRPRAEV
NT seq
2616 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaccggcgtgcgccgctcggcgccggcgttgaccgcgctggccgcgctggccgccgtg
ctgctcgtgctgccgcccgggccggccggcgagctgccgcagtgggacgacctggtgctg
gccgcgaccgcggcgtgggcggcctggcgctgcagcgcgctgacccggtcgatgcggcac
cgcgaccggctgccctggcaggtcctgggcgccggcgcgctggtgttcgccgccggcagc
ctggccaccggcaccggcatcggtgccgagctcggcgggcaggccggtgggcccggtctc
ggcgacgtgctgatcatgctcgcctcgttcggacccaccgtcagcgccgcgctgctcggc
ggccgggtgcccggcacccggtggccggtcctggtgatcgacgggctgctcgccacggtg
gcgctggtcgtcgtcgccgacgtcctggtgctctcccccgcgctggcccccggcgcgctc
gccgacgaccgcgagccgctgctgctcgcctacggcctctacccggccgtcgtcgtgggc
gtggtcggcgcgctgtgcaccgtcaccacccgggcggtgacccgctcggccaccggcatc
gtgctggtgaccggcctgctcgcgctggcctccgggctgctcgccgtgcacgtcgcccgg
cccgagccgggctgggccgcggcggccgacgtcgccgtcgtgctggcgctggtgtccggg
gtgcgggtggtccagctcgccgccggccgccccgccccctcggcggccgacgcggccgtc
gcggtcaaccccgccggcgcggtcatcgtcgtcgtcgcgctggtcggtgtgcccgtcgcg
ctgctgaccgcgctggtccggggcatgccgctgcacgtcggcgcggtcgccgggacggcg
atcgtcatcgcgctgctgctgctgcgcatggtgggccggatccgggacgccggccgggcc
cgcgaggacctggtgcgcagcgagcaggacttccgcgggctggtcgaggccagctccgac
ggcgtggccatcgtcgacgccgacctgcggctggagttcacctcgccggccgcccgcacg
ctgctcggcgtcgccgaccccgacccgcacccgctgctgctggacctgctgcacgaggag
gaccggccgcgggtccggctcgagctgaccggcgcggtcggcgcggtcaccccgacgctg
cagctgcgcgtgccgcacgccgacggcgagccccgcgagctggaggtcacccaccacgag
cggccgggcagcggccgccgggtgctgcacctgcgcgacgtcaccactcgccgccggcgc
gagcgcgagctggagcggatggccttcaccgaccacctgacccggctgcccaaccgggcg
atgctgttccaggagatggccgcgccgtcggccgccgagcggcggctgctggtgctcgac
ctcgacggcttcaaggcggtcaacgacaccgccgggcacgagtccggcgacctgctgctg
gtcgaggtcgcccgccggctgcagggcctgctgcgcaccgacgacctggtcgcccggctc
ggcggcgacgagttcgcggtgctgatcgccggggacgaggaggccgggaccgaggccgcc
cagcgggtcgtcgacgtgctcggccagccctaccgcgtcggcggccgcaccttctccgtc
ggcgccagcgtcggcctgtgccgggtgcaccccggcggcggccagctggcgttccggctc
gccgacaccgcgctgcgcgccgcgaagcaggccggcaagggctgctggcgggtgcacagc
gaggaccggggcggccaggccgcggccaccagcgacgtggccgccgcgctcgccggcggg
gaggtgcagctgcgctacgacgtcgtcgccaccagcgacaccgggctgatcaccggggtg
cacaccgcaccggtgtgggcgcaccccgagctgggcctgctgccggcagcggagctgtgg
gccgccgccgagcgccaggggcaggacggcgcgctgcagcagtggctgatccgccaggcc
tgcgccgaggtggccgcgctggacggcgagctgcaggtcggggtcgacctgccaccccgc
cagctgcgcgccgacgagctggccggggaggtcgccgccgcgctcgccggcagcggcatg
gccccccgccggctggtgctggccttcgacgaggaggtgctgcagacctcctcggccggg
ctgatcccggcgctgcacgtggtccgcgccgctggcgtgcacctgtgcctcaacgacttc
gggatgggctccacgctgtggtcccagctggcccgggtgccgctggacaccgtgcgggtg
gacgtgcgcgggctggccgcacccgacgaccacgagcggaccatgaaggtgctcaccgcc
atcgagtcgagcgccgcggccttcgacgtctacaccctcgccggcgaggtgggcagcccg
gagctctacgaccggatccggacgcagtgccggatggcggtgaccgggccggtgctgccc
gtcgggctcagcgcgccccaggtagccacgctgctccggcacccgtcggcgacggtggtc
gcggcgtcggtgccgcgcccccgcgccgaggtgtga
DBGET
integrated database retrieval system
