Marinomonas mediterranea: Marme_2642
Help
Entry
Marme_2642 CDS
T01449
Name
(GenBank) Pectate lyase
Organism
mme
Marinomonas mediterranea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RicinB_lectin_2
Ricin_B_lectin
fn3
Pur_ac_phosph_N
DUF4990
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADZ91873
UniProt:
F2JXH3
LinkDB
All DBs
Position
complement(2921835..2923934)
Genome browser
AA seq
699 aa
AA seq
DB search
MNAKYFRNNHWKVLSGAIFMGSGALLSSSVVAADYCTDAPKDGEIYKIVNVGADKLLAAE
DGTKKANVQIEANTGLASQRFYLNQSSDSGGWAIKATDTGYAVTVDGGSKANGGNLLQKP
YSESASQEWSLQQDASGSYSGAYQIVNLNSSLAMTVAGADEGANVYQNEDAGVSSQRWWL
EPVNADCDGGASVSLSGSAGDGSVTLSWTDSGTGSTYQIMQDTDGEPSGRVRVGKVSSST
HSYTATGLNNGTTYYFWIKFKNSDGTSSDSNVFSATPSASSSGGSTSTADISSSAAAPTA
AAASKAGANRDPMVNGFPSFITAKVSGATVVSSVSALESAISSASGGDVIYIREGTYSTS
STIELTESGNASKPIVLSVYPGDDRPVFNFSSQSESSNNRGFELSGSYWHIYGFDIKNAG
DNGMFVSGSHNTIEFMSFYRNSDTGLQLGNGAAYNFVKNSDSYYNADSSLENADGFAAKL
TVGTGNYFYGCRAWQNLDDGFDGYLRDNGSTILTTHEYTWMIRNGYQENGSLGVGDGNGF
KTGGSDNKDLAHNGIYINTIAAGNTADGYDQNSNRGSVTIYNAVSYKNSRNFGLGDSGSR
EFKKLTIKNSISYNGSNSDQLNADSMSVSKNSWQVASVSSSDFQSLDIDELLQDRQEDGS
LPVIDFFHLKSGSDLIDAGTDVGLNYNGSAPDLGSFESN
NT seq
2100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacgcaaagtactttagaaacaatcattggaaggtgttatctggagcaatttttatg
ggaagtggcgcattgctgtcttcctctgttgttgctgcggattactgtacggacgcacca
aaggatggtgaaatttataaaatcgtcaatgtcggcgctgataaactgttggctgctgaa
gatggaacaaagaaagcaaatgttcagattgaagcgaataccggcttagcctcgcagcgt
ttttatttaaaccaaagttctgattccggcggctgggcaatcaaagcgacagatactggt
tatgctgttactgtcgatggcggctctaaagcgaacgggggcaacttacttcaaaaaccc
tattctgaaagcgctagccaagagtggtctctgcaacaggatgcttcaggttcatactct
ggtgcatatcaaattgtaaatctaaattcttccttggcgatgaccgttgcaggggctgac
gaaggtgcgaacgtctatcaaaacgaagacgccggagtgagttcacagcggtggtggctt
gaacctgttaatgcagactgtgatggtggtgccagcgtttcactatccggcagtgccgga
gacggttcggtcacgttaagttggacggattctggcacaggttctacctatcaaattatg
caggacacggacggagagccatcgggacgagtgcgtgtgggtaaggtgtcttcatccacg
cacagttatactgcgacggggttgaacaatggaacaacgtactatttttggattaaattc
aaaaacagcgacggtacttcatcagactcaaatgtcttcagtgcgacgcctagtgcgtct
tccagcggaggatcgacttccactgccgatatttcaagctctgctgcggcaccaacagca
gccgcggcttccaaggcgggcgctaaccgtgatccaatggtaaacggttttccttcgttc
attaccgctaaagtatcgggcgcgacggtggtttcaagtgtgagtgcacttgaaagtgcg
atttcttcagccagtgggggagacgttatttacatccgggagggaacatacagtacgtcg
tcgacaatcgagttaacggagagtggaaacgcctctaagccgattgttctgagtgtatac
ccgggtgatgatcgtcctgttttcaatttctcttctcaatctgaaagtagtaataatcgc
ggttttgagttgtcaggcagttattggcatatctatggatttgatataaaaaatgcaggg
gacaatggcatgttcgtgtcaggatctcacaacaccattgagtttatgtctttctatcgt
aactcagatacgggattgcagctaggtaatggcgcagcgtacaacttcgttaaaaactcg
gattcgtattacaacgcagactcgagtttagagaatgccgatggctttgctgcgaaacta
acggttggtacagggaactacttctacggttgccgtgcttggcagaatttagacgatgga
tttgatggttatctgcgtgacaatggttcgactattctgacgactcatgagtatacgtgg
atgattcgcaacggttatcaagaaaacggctcgctaggcgtgggtgacggcaatggattt
aaaaccggtggcagcgataataaagaccttgctcacaatggcatctatattaataccatt
gctgcgggcaacacggcagatggttacgaccagaacagtaaccgaggttctgtgaccatt
tacaatgctgtgtcctacaagaatagccgtaactttggattgggtgatagcggatctcgt
gaatttaagaaactgacgattaaaaactctatttcttataatgggtccaattcagatcag
ctgaacgcagattcaatgagcgtctccaagaacagttggcaagttgcctcagtgtcctca
tctgacttccagagcttggatatcgatgagctactacaagatcgtcaagaagatggctca
cttccagtgattgactttttccacctgaaaagtggaagtgacttaattgacgctggtact
gatgttgggctgaattacaatggttcagcacccgatttaggttcatttgaatcgaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
