Methylomonas methanica: Metme_2018
Help
Entry
Metme_2018 CDS
T01511
Name
(GenBank) Adenylate cyclase
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
mmt
Methylomonas methanica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_4
LRR_8
LRR_1
LRR_9
DHU1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEG00427
UniProt:
G0A597
LinkDB
All DBs
Position
2214273..2215787
Genome browser
AA seq
504 aa
AA seq
DB search
MSNEKQLIPKDSTDLALIKSERLLGITDKILANKSLVVNNDEDWIYELIAWAKKYKIFSN
NLSLNKDTILSLTHLDLRHNQLTEVPDYIGKLINLTCLDLSNNQLTKLPESIGNLTRLTD
LYLQFNKLSDLPESIGRLTNLTNSLWLSNNQLKKLPDSIGNLSNLTGIILSGNQLTELPE
SISKLINLTNLSLSDNKLNILPESIGNLTKLRSLTLSGNQLTKLPKSIGNLRKLSELSLA
GNNLTEVPECIGNLINLTSLSLGSGSRGVLKTKSPESNDTLKKLPESIGNLKMLKSFSIG
STQLTKLPESIGNLTNLRELFLENNQLIELPESIGNLTKLDDLRLSYNQLIKLPDCIGNL
TKLKRIILENNQLIDLPESIGNMTNLVELRLSDNQLIKLPESLGNLTKLEYLQLNHNRLV
EIPEAIGNLTKLTRLSIGDNQIVELPESIGNLSKLTRLCLHKNQITKLPESFGKLKKLKD
LYLNSNPIKYLPAELSHLIKITKF
NT seq
1515 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaatgaaaagcaactaattccaaaagacagcactgatttagctcttattaaatca
gaacgattattgggaattacagataagatactggcaaacaaatcactagtagtaaataat
gatgaagattggatatatgaattaattgcatgggctaaaaaatataaaatattttcgaat
aatttatcactcaataaagataccattctatcattaacccatttggatttaagacacaac
caattaacagaggtgcctgattatatcggtaaattgattaacctgacttgtttagattta
agtaataaccaactgacaaaactgcctgagtctattggtaatttaaccaggcttacagat
ttgtatctacaattcaataaactaagtgatctccctgaatctattggtaggcttaccaac
ctgactaatagtttgtggctaagcaataaccaactgaaaaaacttccagattctatcggg
aatctatccaatcttacgggcattatattatctggaaatcaactgactgaactgcctgaa
tccatctccaagttgattaatttgactaatttgagtttaagcgataataaactaaacata
ctgcctgagtccattggtaatttgacgaaattgaggagtttgaccttatcgggtaatcaa
ttgaccaagctccctaaatcaataggaaacctgcgcaagttatcggagttatctttagct
ggcaataatttaactgaagttcctgaatgtatcgggaacctaattaatctaactagcctg
tcattaggatcaggttcaaggggtgttcttaagactaaatcacctgaatccaatgatact
ctgaaaaaactacctgaatctattggtaatctaaaaatgctaaagtcattttcaatagga
agtactcagctgactaaacttcctgagtctattggaaacttgactaacctaagagaattg
tttttagaaaacaatcagttaattgagctccctgaatctatcggcaatctgaccaaactg
gatgatttacgattaagctataatcagctaataaagctaccggactgtattggtaatttg
acaaaattgaagagaattattttagaaaacaatcaattaattgatcttcctgaatctatc
ggaaatatgaccaatctagttgaattaaggttatccgataatcaactaataaaactgcct
gaatcgcttggtaatttgacaaagcttgaatatttacaattaaaccataatcgactggta
gagattcctgaagctatagggaatctgactaaattgacacgcctttctataggagacaat
cagatcgtagagctcccagaatccattggcaacctctctaaactaactcgtttatgctta
cataaaaatcaaattacaaaattgccagagtcttttggtaagctaaaaaaattgaaagat
ttatatttaaatagcaatccaattaaatacttacctgctgaattaagccatctcataaaa
atcaccaaattctaa
DBGET
integrated database retrieval system
