Methanosphaera stadtmanae: Msp_0113
Help
Entry
Msp_0113 CDS
T00313
Name
(GenBank) conserved hypothetical protein
Organism
mst
Methanosphaera stadtmanae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PKcGMP_CC
Crescentin
TSC22
Fez1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABC56532
UniProt:
Q2NHV1
LinkDB
All DBs
Position
124456..127770
Genome browser
AA seq
1104 aa
AA seq
DB search
MAFLKDVESEELRELVKSCFKEINTLKEQLNDENKDIKSNKVVKNVLIQSESNNTNLQAK
INELTDKVHKQDTYLKEKELELQEMETRLKEKDLQIKEVESQNSGSSLNEMVLSKYENQI
KALEDKIQTQKTTISELEEAANNSNDYLAEINRLKEEKSLLQSESSQTEVNQLKSIIEKQ
TVELKEIPILKNQLTMEVSSRDQKIKKYEEEIDLLNEKLGENEDVSSIKEDLIQKEDEIS
KYKLEILQFEKQVAALKENSSEDKSEDLTAQITDLESKIAFLEHENNSLREGNVTSDKQG
LDSLIEDITKKSNELIDLRSKYQRLQDTNKINEFKIIELENENAKLNESIDLKESDVSET
VDLELISENKELKNTLLEKEQLLSQSENEVNLLKNTILKNQTEVDDLSEKLAQSREDVTT
LNNKLQDSQLKVGDLNDDVLKLKSLEKTIELKDMDYSKLEDKYQQLKDNYDNLEKSQVDV
DELSSLKEQVNEKDLNIRSLTSQNEASESKIAELEKTLTTRDNEISELKSELDSFDFSKK
ESEINNATNQEIKSIKKELYTKDAEFDKLKLDYNQLRKNSSKQINELNEALDKFTNENEK
ILTEKKYLEDSLDSKNSLLNKLEQENNSLNLIIKDKDSNYNVLKKKFQEIKRNNEEQINL
LKQDVQDKNDKIAALPQKLELKDIEISQLNKIVKSHENDVLSKNNEIKTLRNKVQESREV
IKQLNDKLSENSVVIDEKIRSKEDEIFKLKDNFKNSVNEKDEEISRLKSLLSQRNYKIDE
LTENVGSLNHDLEVLSFKFEDNKEQFNKCEEIIQAKDDVISKKDELIEDINQQINRLENK
IKLKNDDIEELNDDLSKKDTLISNLKEEISESNLKLNKLDDLSSQIKENDTLIEKLNDEL
ALKEQEVQENVRELDTDKSHITELKELIERKNKDIEDHKKLLSEKNTQLLEFKDLKPRIN
ELEVEKSDMMANYQQQITSLNADLEKAQLFKTENEKKIEQISQLKEQLNDKDAQIASYEQ
YKKYFDVLVAKPLPSLTSFQSQIYRLLPDAMSATELYNYIVDLGFIALEKENFAKTLKAL
EKRGYYQRARDGDKIIWVKIGEDK
NT seq
3315 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtttttaaaggatgtagaatcagaagagttgagagaattagtaaaatcttgtttt
aaagaaataaatactcttaaagaacaattaaacgatgaaaataaggatattaaatcaaat
aaagtagttaaaaatgtactaatacaatcagaatcaaataatactaatcttcaagcaaaa
ataaatgaactaacagataaagtacataaacaggacacttatttaaaagaaaaggaactt
gaattacaagaaatggaaactagactaaaagaaaaggatttgcaaattaaagaagtagaa
tctcaaaattctggaagttctttaaatgaaatggttttgtcaaaatatgaaaatcaaata
aaagcattggaagataaaattcaaacacaaaaaactaccatctcagaacttgaagaagca
gctaataattcaaatgattatcttgcagaaattaatcgtctaaaagaagaaaaatcatta
ttacagagtgaatcttcacagacagaagtaaatcaattaaaatcaattattgaaaaacaa
actgttgaattaaaagagattcctatcttaaaaaatcaattaacaatggaagtatcctca
agagatcaaaaaataaagaaatatgaggaagaaattgatttattaaatgaaaaactcgga
gaaaatgaagatgtaagtagtattaaggaagatttaattcaaaaagaagatgaaatttca
aagtataaattagaaattttacaatttgaaaaacaagtagctgcccttaaagaaaatagt
tcagaggataaatcagaggatttaacagcacaaatcactgatttagagtctaaaatagca
tttttagaacatgagaataacagtctaagagaaggtaatgtaacatctgataaacaagga
ttagactctttaattgaagatattacaaaaaaatctaatgaattaatagatttaagatct
aaatatcagcgtttacaagatacaaataagataaatgaatttaagataattgaattagaa
aatgaaaacgccaaattaaatgagtcaattgatcttaaggaatctgatgtatcagaaact
gttgaccttgaattaatcagtgaaaacaaggaacttaaaaatactctcttagaaaaagaa
caattattatcacaaagtgaaaatgaagttaatctattaaaaaacacaatacttaagaat
caaacagaagtagatgatttatctgagaaattagcacaatctcgagaagatgtcacaact
ttaaataacaaattacaagatagtcagctaaaagtaggtgatttgaatgatgatgtttta
aaactcaaatctttagaaaaaactattgaattaaaagatatggattattctaaattagag
gataaatatcaacaattaaaagataattatgataatttagaaaaatctcaagtagatgtt
gatgaattatcttctcttaaagaacaagtaaatgaaaaggatttaaatattagatcttta
acatctcaaaatgaagcatctgaatcaaaaatagctgaacttgaaaaaacattaacaact
cgtgataatgaaatatctgaacttaaatcagaacttgattcttttgactttagtaaaaaa
gaatcagaaataaataatgctacaaatcaagaaattaaatctattaagaaagaattatat
actaaagatgctgaatttgataaattaaaactagattataatcaattacgtaaaaattca
tctaaacaaataaatgaattaaatgaagctctagataaatttacaaatgaaaatgagaag
atacttactgaaaagaaatatcttgaagattccctggatagtaaaaattccttacttaat
aaattagaacaagaaaataattcattaaatcttattattaaagataaagattcaaattat
aacgttcttaagaagaaattccaagaaatcaaaagaaataatgaagaacaaataaatctt
cttaaacaagatgttcaagataaaaatgataaaattgcagcattacctcagaaacttgaa
ttaaaggatattgagatttctcaattaaataaaatagttaaatctcatgaaaatgatgtt
ttatctaaaaataatgaaattaagactttaagaaataaagttcaggaatctcgtgaagta
ataaaacaattgaatgataaattatctgaaaattctgtggttattgatgaaaaaatacgt
tctaaagaagatgaaatatttaaattgaaagataactttaaaaatagtgttaatgaaaaa
gatgaagaaataagtagattaaaatcattattaagtcaaagaaattataaaattgatgaa
ttaacagagaatgtaggttcattaaatcatgacttggaagtgttatcctttaaatttgaa
gataataaggaacaattcaataaatgtgaggaaataattcaggcaaaagacgatgttatt
tctaaaaaagatgaattaattgaagatattaatcagcaaattaatagattagaaaataaa
ataaaacttaaaaatgatgatattgaagaattaaacgatgatttatctaaaaaagataca
ttaatatctaatcttaaagaagaaatttccgaatctaatcttaaattaaataaattagat
gatctttcaagtcaaataaaagagaatgatactttaattgaaaaattaaatgatgaatta
gcacttaaagaacaagaagtacaagaaaatgtaagggaattggatacagataaatcacat
ataactgaacttaaagaacttattgaacgtaaaaataaggatattgaagatcataagaaa
ttattatctgagaaaaatactcaattactcgaatttaaagatttaaaaccacgtataaat
gagttagaagttgaaaaatctgatatgatggctaattatcaacaacaaatcacatcttta
aatgctgatttggaaaaagctcagttatttaaaacagaaaatgagaagaaaattgaacaa
attagtcaattaaaagaacaacttaatgataaagatgcacaaattgcaagttatgaacag
tataaaaagtactttgatgtattagtagcaaaaccattacctagtttaacaagtttccaa
tcacaaatatatcgcttgttacctgatgctatgagtgctactgaattgtataattatatt
gtagatttaggtttcattgcacttgagaaggaaaactttgcaaaaacacttaaagcactt
gaaaaacgtggatattatcaacgtgcccgtgatggagataaaatcatatgggtaaaaatt
ggtgaagataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
