Microbulbifer variabilis: MJO52_14480
Help
Entry
MJO52_14480 CDS
T08656
Name
(GenBank) cellulose binding domain-containing protein
Organism
mvb
Microbulbifer variabilis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CBM_2
Lipase_GDSL
Lipase_GDSL_2
COBRA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
USD20278
LinkDB
All DBs
Position
3265567..3268683
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MRIKLLKAGFTSLFLLGITPLSMAATNCKVNMVVQSQWDKGYMASVVVRNTGTEPINGWN
LNWQWPGDQVIDGSWNAKISQNGNTATAEGTGDFANIPVGEARSFGFNIAYSGGTQVPSK
INASCQNQQTPPPTTSEPPKTSPPLSAIESYNYILGTQTISPKYSFTGEGSLVESAKAIR
AMGSNLLKIALSTGLYDELNGLGLDYQFKRMLEEVPAYREVLDMDFSHYMFWVEDSGSWM
DNKGMSQEELTWQYDKIYAMAEYLLTKYSGSGKTFMIGHWEGDWNLVQKADGTRDDNQVK
IDPLRIQGLIDWLNIRQKAIEDAKANIPHSNVNLYHYVEVNRVESAMQGKERITNAVLPH
TNVDLVSYSAYDLTTKEKHSDFATLHAELTKALDFIESKLPKKTGLPFEKRVFIGEYGYG
ESWFKDWGTRSGEAQDMLSRNVIKTSLEWGSPFILYWQMYGNEYDSWIKEFVGYWLIDNN
GNKKEIYQTHKNFYTDAKSYLNNYHTKQGALPSESEFRAFALKWFESSTATKPDNTSEPT
SGTNTGNGTNTGTEPTPTTPAEQPQASGQCTVEYAIQNDWGNGFMANVVIRNTGDQPLDA
WQIKWQWPGNQKVTHFWNAEVVDHSGSVTASGQDVIPPGEARAFGFNGEYSGTNSQPTLN
ATCQASGSSQVGTGNPATPPVAGNRPDDRGSSSQDGAGKIKLWFIGDSITYGMTTLPYNS
MGFRSQIWQQIVEASDGKSSFPLSSSDNNGSLTISYNGQPVETIGTVSGPTGSDGVEKKT
GNYWHTGIPGASTSDMQCFLNPTGHQIPAGYSSASCADAIAYFNSVVTEMCRESGNSAGW
LDNQTCPLNLNLAASDAIIVPIQLGTNDITHLNRNGATQCSAAPKAGSLTAKRLDEVVES
IISSNNTRDKTTLVGKIYSHLSAMGIPDNKIAFVISTIPRRTNLDGQDPSNHCTDYYNTK
IKSTIASITPPVKILLVDQGNIVPTGDSVHPTTAGHKVMACNLLYGYNYGHSGNFNCPTP
NSTPKTGLLHAFAAVSVK
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgtattaaattactcaaagcgggtttcacctccctattcttactcggcatcacacct
ctctccatggccgcaaccaactgtaaggtcaatatggttgtccaaagtcaatgggataag
ggctatatggcctctgtagtggtccgcaatactggcacagagcctattaatggatggaac
cttaattggcaatggcccggagaccaggtaattgacggctcctggaatgccaaaatttcc
caaaatggcaatactgcaacagcggaaggtacaggtgactttgccaatattcccgtgggg
gaggctcgctcttttggctttaatatcgcctactctggaggaacacaagtcccctccaaa
atcaatgccagttgtcagaatcagcaaacccctccaccgacaacatcagagccaccgaaa
accagcccgcccttatcagcaatagagagctacaactatattttgggcacccagactatc
agccctaagtacagcttcacaggcgaaggctctcttgtcgaatccgctaaagccatccgc
gcaatggggtccaacctacttaagatcgccctgtctaccggcttgtacgatgaacttaat
ggcttgggccttgactaccagttcaaacggatgctggaagaagtacccgcttaccgagag
gtgcttgatatggacttctcccactatatgttctgggtggaggactccggatcttggatg
gacaataaaggcatgtctcaggaagagctcacctggcagtacgataagatttatgcgatg
gccgagtatctgttaacgaaatacagcggctcaggtaaaacgtttatgatcggtcattgg
gagggcgactggaacctcgtgcaaaaagccgatggaacacgggacgacaaccaagtgaag
attgacccgctgcgtattcagggattgatcgactggctcaatattcgccaaaaagccatt
gaagatgccaaggccaacattccccactccaacgtcaacttgtatcattatgtagaggtg
aatcgggttgaatccgcaatgcagggtaaagagcgcatcaccaacgcagtgttaccacac
accaatgtcgacctcgtttcctactcagcctatgatctgactactaaagagaaacattct
gatttcgccaccctacacgccgagctaactaaagcactggactttattgagtcaaaactg
ccgaaaaaaactggcctgcccttcgaaaagcgggtgtttatcggtgaatacggttacggt
gaatcttggtttaaagactggggcacccgctctggtgaagcgcaagatatgttgtctcgc
aatgtaattaaaacctctcttgagtggggctctccctttattctctactggcagatgtac
gggaacgaatacgatagctggattaaagaatttgtcggttactggttgattgataacaat
ggcaataaaaaggagatttatcaaacccacaagaatttttacactgatgccaagagctat
ctaaataactatcacaccaagcagggggctctaccctcagagtctgaattccgcgctttt
gccctaaaatggtttgaatcctctactgctactaaacctgacaacacctctgagcccaca
tcaggtacgaacacagggaacggcactaatactggaactgagccaacacccacaacaccc
gcagagcaaccccaagcctcaggtcaatgtacggtggaatacgccattcaaaatgactgg
ggtaatggatttatggccaatgttgtcatacgcaataccggggatcagccactggatgct
tggcaaataaaatggcaatggccgggcaatcaaaaagtaacccacttttggaatgctgag
gtggttgaccactctggttcggtaaccgctagcggccaggatgttattccaccaggagag
gcacgtgcctttggatttaatggcgagtatagcggaaccaatagtcagccaactcttaat
gccacctgccaagccagcggttcatcccaggttggcaccggcaatccagcaactcccccc
gtagccggaaaccggcccgacgatcgcggaagctcctctcaggatggtgccggtaaaatc
aaactttggtttatcggggattcaatcacctatggtatgaccaccctgccctacaactca
atggggttccgctcacaaatctggcagcaaatcgtcgaggcctctgatgggaaatccagc
tttcccctaagcagtagcgataataacggcagcctgaccattagctataatggtcagccc
gtagaaactattggtactgtgagtggcccaaccggatccgatggagtagagaagaagact
ggaaattactggcataccggaattcctggagcaagtacgagcgatatgcagtgctttctt
aatcctacaggccatcaaatcccagcaggttatagctctgccagctgcgcagatgctatt
gcctactttaattctgtcgttactgaaatgtgtcgtgaaagtggtaacagcgcagggtgg
ttagacaaccaaacctgcccattaaacctaaatctggcggcatcagatgctattattgtg
cctatccagctgggcacaaacgatatcacccatctcaaccggaatggtgctacccaatgt
agtgcggctccgaaggctgggagtctaacggccaagcgcctagacgaagtagtggaaagc
attatctctagcaataatactcgagataaaacaacgttggtgggcaaaatatacagccac
ctaagtgcaatgggtataccggataataaaattgcctttgtaatttccaccattccccgt
agaacgaacttggatggtcaggacccttccaaccattgtacagactattacaacacgaaa
atcaaaagtactattgctagtatcactcctccggtaaagattcttcttgttgatcagggc
aatattgtaccgacaggtgattctgtacacccaacaacagccggacataaagttatggcc
tgcaacttgctgtatggctataactatgggcactcaggaaattttaactgtcctacccca
aatagcacaccaaaaactggtttactgcatgcttttgctgctgtatcagtaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system