Neobacillus novalis: QNH39_24240
Help
Entry
QNH39_24240 CDS
T09082
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 3 N-terminal domain-containing protein
Organism
nnv
Neobacillus novalis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_3
CBM_6
CBM_35_2
Glyco_hydro_3_C
Glyco_hydro_30
Glyco_hydro_59
CBM_35
Glyco_hydro_30C
BclA_C
Endotoxin_C
Gram_pos_anchor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WHY85681
UniProt:
A0AA95ML34
LinkDB
All DBs
Position
complement(4886136..4892492)
Genome browser
AA seq
2118 aa
AA seq
DB search
MRKYKRGIAIFTIAVMMSYVLQGFFSPLTANAASVSGDPIYLDENQPINVRVADLLSKMT
TDEKLGQMIQAEKASITPAQVKQYNIGSVLSGGGSFPNGKQADSLPDNWKKLVDGYQDAA
LGTRLGIPIIYGVDAVHGNNNVIGATIFPHNIGLGAANNVALTKEIGAASAAEIKATGIH
WDFAPTTATAQDIKWGRTYEAFSDNANISAQLGAAYIKGLQGENPSADLAKNNTVVATAK
HFIGEGYTDNGKNKGNISSLTEDEILAKELNIYKQAVDAGVRTVMASYHSIQGLKMHANK
RLLTDVLKGELGFDGYVITDYNGVDQISVDQDGNPVSGLKNQLKTAVNAGVDMFMQPQNW
QTALGHLKTLAADGDIKMDRIDDAVSRILKVKFEAGLFKNPKTDPSLAKEFGSKEHKKIA
RQAVGESLVLLKNDVVNGSPIMSQLSKMNKVFVAGSSADDIGMQSGGWTISWQGSAGKTT
PGTTILDGIKEKVGADKVTYNKHGRGAAGHDVAIVVIGENPYAESNGDTSEIKLSFEQEQ
TIQNIRNADQDIPIVVILVSGRPMIITDELKDWAGVVAAWLPGTEGGGVADILFNDSNDF
KGKLPIRWPFFMEAYPSFYGEQSENFLFNTGYGLVKGEQTPNLPEPPEKPTVEGHAIPGK
IEAEDWLTQSGVDTEQTQDEGGGLNVGWADPGDWIDYQVNVNEPGSYNIDVRYAANEKTG
LKFINEKGKNIGEMSVSSTGGYQSWKTFTIKNVVLEKGNQKLRVSYTGGALNLNWYQFTR
TGDIPADYNPNPDPPALPEDDVAAVVKDNAVENWVTVARDSQNMGWYYNSRWQEGDPKLE
KQENINIMQQVDESSVNTFHIDPTQKFQSIMGIGSSVDEATIYNMSKMSEEKRYELLKQL
IDPVEGVGMSMMRLTMGTSDFTAREFYSYDDMPAGKTDEKLEHFSIEKDRQFHIIDTVKQ
MKEINPAIKFFASPWSPPGWMKTSDSMIKGSLKEGYEEILAEYYLKYFQAYRAEGIEIEA
MTLQNEPLLEIDYPSMHLPWKQAVKVSKHLREKLDANGFKHVKLWMFDHNPSDAQAYAAN
FLKDADGYAAVEGTAFHDYGGDLSEMTKLQKQFPDKNVYLTERSVWGTNGADRIAQYFRN
YARSYNSWVVMLDSDISTHQWVGTPDPTTIVQDSANPDNYWLTPEYYISGHYSKFVKPDY
IRIGSDYGSADTVTNVSFMSPDQKEIVTVVTNQTKQAQKFKLVSEGTQFIATLPANSVAT
YRWDRLDAHKVPGKMKAIDYDQAEGSFTTKDGYIGEINKQSEVTKLDYLLNVNEAGDYYV
DFGFAGYKEKPQLDLAINGELAGTINLQSTGWWENWAKKRIQLHLNKGIQRLTITAHETD
YNFNDITFTKITNDIHTIPGRIQAEEFTDASGILVQDLDKGLSVGYLDPGDWLDYQINVN
ESGTYKVTYRYASGNPNPSLEWIVDGHSIHTAALNSTGGWDTYKLANDEITLTAGNHVLR
LQVREGMNIDWISVGTTLSLEKSTITEGAEDGHIVDVFVENDTFVNELDINEWKLNGPKG
TTISKVERISDNHVKVTLSGNRTVDYDTDIIAKLTVSQNQFEGWAKSGSTAAFDISETVV
FKAIDDIESITVEPKTQQAGDGELTVTISGGTFTEEAVQQISLTGKAVTNGNIVLSEVIY
NSPTKVTIKYSQDDRPIYEDVTLTVNVPVEAYDDSTNGTTLSDTFILLGTTNQEEATAIP
GEINLEKDFYKLSGVSFANGPSDTRKITDVQSGDWIEYVIDVPKDGQYVLTLGVVTNSDV
GEGIVFKSENGDTLAAFTIPNIWGAWSEVKQTVSLPSGKQKIRVFAANGGFELNKIKFEK
LQALHSDEDVIKVEAEDYYNASQAIIQPGSTRTNIGYTTANGWIDYLINVPPGNYKVTYH
YSTTEGGVGARASVGNNQVTTNLTSTGDWGAYQNASSGNTLYIPKGDQTVRMEVLVNGFN
LDWFELEMVDPENPGPTDPGPTDPGPTDPGPTDPGPTDPGPTDPGPTDPGPTDPGPTDPG
PTDPGTTDPGTTDPGTTDPGTSPGTDLGNGTQSGNGQDHEDKLPNTATSMFNNILAGLVF
FLIGGFLYTRNRRNTANK
NT seq
6357 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgaaaatataagagaggtatcgccatttttacaatcgcggttatgatgtcttatgtt
ttacaaggtttcttttccccattaacggcgaatgcagcgagtgtcagcggcgacccaatt
tatttagatgaaaaccagccaatcaatgtgagagtggctgatttgctaagtaaaatgact
accgatgaaaaacttggacaaatgattcaagctgaaaaagcctctattacaccagcacaa
gtgaaacaatataatattggctctgtgctaagcggaggcggttcatttccaaatggtaaa
caggcagacagtttaccagataattggaaaaaattagtggatggctatcaagatgctgca
ttagggacacggcttgggataccaattatttatggtgtcgatgccgttcatggaaacaac
aatgtgattggtgccactattttccctcataatatcggattgggtgctgccaataacgtg
gcgttaacaaaagaaattggcgctgcatctgccgctgaaataaaggcaacaggtatccat
tgggactttgctccgacaacagctactgcccaagatattaaatggggcagaacttatgag
gctttctcggataatgctaatatctcagcccaattaggcgccgcctatattaaaggtttg
caaggagagaaccccagtgcagatttagcaaagaataatacggttgtagcaacagctaaa
cattttatcggggaaggatatacagataacgggaaaaacaaaggaaatatctcttctctt
acagaggatgaaattctggctaaagaattaaatatttataaacaagctgttgatgccggt
gttcggaccgttatggcatcatatcatagtatccaaggattaaagatgcatgcaaataaa
cggctgcttacggatgtcttaaaaggggaattaggttttgatggttacgtcataacggac
tataatggcgtagatcaaattagtgttgaccaggacggcaaccctgtaagcggtttgaaa
aatcaattgaaaactgccgttaatgccggtgtcgatatgttcatgcagccgcaaaactgg
cagacagctcttggtcatttaaagacattggctgccgatggcgatatcaaaatggaccgt
attgatgatgctgtatcaagaattcttaaggtgaaatttgaagcagggttatttaaaaat
ccaaagacagatccaagtttagccaaggagtttggcagtaaagaacataaaaagattgca
cgtcaagctgtaggagaatctcttgttctattaaagaacgatgtggtcaatggttcaccg
attatgtctcaattaagtaagatgaataaggtttttgttgctggttcgagtgccgacgat
attggtatgcagtcaggaggctggaccatcagctggcagggcagtgctggtaagactaca
cccggtactactatattggatggtatcaaggaaaaggttggagcagataaggtaacctat
aataagcatgggcgtggcgccgcggggcatgatgtcgcgattgttgtcatcggagaaaat
ccttacgccgaaagcaatggggataccagtgaaataaaactatcctttgaacaagagcaa
acgattcaaaatatccgtaatgcagatcaagacattccgattgtggttattctagtttca
ggcagacctatgattatcacagacgagctgaaagattgggctggcgtggtggctgcctgg
ctgcctggaacagaaggcggcggtgttgcagatatcttgtttaatgacagcaacgatttc
aaagggaaattgccgattcgctggccattctttatggaagcgtatccatccttttatgga
gagcaaagtgaaaacttcttatttaatacgggatatggtttagtaaagggtgagcaaaca
cctaacctccctgaaccacctgaaaaaccaactgtcgaaggacatgccattccgggtaaa
attgaggcagaggattggttaacgcaatccggagtggatacggaacagactcaagatgaa
ggcggcggtctaaacgttggctgggctgatccgggagactggattgactatcaggttaat
gttaacgagccgggaagctacaatatcgatgttcgctatgcagcaaatgaaaaaacaggc
ctaaaattcataaatgaaaagggcaaaaatattggtgaaatgtcagtttccagtactggg
ggctatcaaagttggaagacattcaccattaagaatgttgtattagaaaaagggaatcaa
aaacttcgtgtctcatatacgggtggggccttaaaccttaactggtatcaatttaccaga
acgggagatatacccgccgattacaaccctaatccagacccgccggcattaccggaagat
gacgttgcagcagtggtaaaagataatgctgtagaaaactgggtgacagtagcgagagat
tcacaaaatatggggtggtattataactctcgctggcaagagggagatcctaaactagag
aagcaagaaaatattaatatcatgcagcaagtggacgaatcaagtgtaaatacttttcat
attgatcctactcaaaaatttcaatcgattatgggaattgggtcttccgttgatgaggct
acgatttacaacatgtcgaaaatgagtgaggagaagcgctacgaactgttaaagcaattg
attgaccctgttgagggtgttggcatgagcatgatgaggctgacgatgggaacatctgac
tttacagcccgagaattttattcttatgatgatatgcctgctggtaagacagacgaaaaa
ctagaacatttttcgattgaaaaggaccgccagtttcatattattgacaccgttaagcaa
atgaaagaaattaatcctgctatcaagttttttgcatcgccatggagtccaccaggctgg
atgaaaacatcagacagtatgattaagggttcacttaaagagggatatgaagaaatactg
gctgaatattatttgaaatatttccaggcctatcgcgcagagggaattgaaattgaagcg
atgacgcttcaaaacgaaccacttcttgaaattgactatccaagtatgcatttaccatgg
aaacaggcggtaaaagtgtccaagcatttaagagaaaagcttgatgctaacgggttcaag
catgtgaaactatggatgtttgatcataatccatctgatgcacaagcgtatgcagcgaat
tttctaaaagatgcagatggctatgcagcggttgaaggtactgcctttcatgattatggc
ggtgatttgtccgaaatgacaaaactgcaaaagcaatttcctgacaagaatgtttattta
actgaacgttccgtatggggaactaatggagccgaccgtattgcccagtacttcaggaac
tatgcaagaagctataactcttgggttgtcatgcttgatagtgatattagtacccatcaa
tgggtaggtacaccagatccgacaaccattgttcaggattccgctaatccggataactat
tggctgactcccgaatattatatcagcgggcactattcgaagtttgttaaaccggattat
atccgtattggaagtgattatggttcagctgatacagtaaccaatgtctccttcatgagt
cctgatcaaaaggaaatcgtaacagttgttactaatcaaaccaagcaggctcaaaagttc
aagctggtttctgagggtacccagttcattgcgactttacccgccaattcagttgctact
tatcgttgggaccgtttagatgcacataaggtacccggtaagatgaaagcaattgattat
gatcaagcagaaggcagctttacgacaaaagatggttatatcggagaaattaacaagcaa
agtgaagtgaccaagttagattaccttttaaatgttaacgaagccggtgactattacgtt
gactttgggtttgccgggtataaagaaaaaccgcagctcgatcttgctataaatggtgaa
ttggcaggaaccataaaccttcaatcaacgggctggtgggaaaattgggcgaaaaaacga
attcagttacacttaaacaagggaatccaacgtttaaccattaccgctcacgaaactgat
tataattttaacgatatcacgtttacaaaaatcacgaatgatattcataccattccaggc
aggattcaggcagaggaatttacggatgccagcggtatacttgtccaagatcttgataaa
gggttaagtgtgggctacttagatccgggcgattggctcgattatcagattaatgtcaat
gaatccggtacctataaagtaacttatcgttatgcatctggtaatcccaatcccagcttg
gagtggatcgtagatggtcactcaattcatacggctgctttaaacagcacgggaggctgg
gatacctacaaactggcaaatgatgaaattaccttgactgcgggtaaccatgtattgaga
cttcaagttcgggaaggaatgaacatcgattggatttcagtagggacaaccttatcacta
gaaaagtccacaatcaccgaaggagccgaagatggccatatcgttgatgtctttgttgaa
aacgatacatttgtaaacgaattagatataaacgaatggaaactcaatggtccaaagggt
acaaccatatcaaaagtggagcgaataagtgataatcatgttaaggttaccttatctggt
aatcgaacggttgattatgatactgatataattgctaaattaactgttagtcaaaatcag
tttgagggctgggctaaatccggatctacagcagctttcgacattagtgaaacggtcgta
tttaaggcaatagatgatatagaaagtattactgtagaacctaaaacacaacaagccggt
gatggcgagctaacagtaacgatttcaggcggtacttttacagaggaagctgttcaacaa
atcagcttaacaggtaaagctgttacaaatggaaacattgttctttcagaagtcatctat
aacagtccgaccaaagtaaccattaagtattctcaggatgacaggcctatttatgaagat
gtaaccctgacagtcaatgttcctgtggaagcttatgatgattcaaccaatggaaccact
ctaagtgatacattcattttactgggaacgacgaatcaggaagaagcgacagcgattcca
ggtgaaatcaaccttgagaaagatttttataaactcagcggtgttagtttcgcaaatggt
ccaagcgataccagaaaaatcacggatgtacaatcaggtgattggattgaatatgtaatt
gacgtccctaaagatggtcaatatgttttaacactgggcgttgtgacaaattccgatgtt
ggtgagggaattgtttttaagagtgaaaatggtgatacattagcagccttcactattccg
aatatatggggggcatggtctgaagtaaaacaaactgtatcgttgccatcaggaaagcag
aaaattagagtcttcgctgctaacggtggctttgaattaaataagataaagtttgaaaaa
ttacaagcccttcactcggatgaagatgttattaaggtagaggcagaagattactataat
gccagtcaagcgatcattcaacctggctcaacacgcaccaatattggctatacgacggct
aatgggtggatagattacttgatcaatgttccaccaggaaattataaagtgacctaccat
tactcaacaacagaaggcggcgttggtgcccgggcatcagtgggcaacaaccaggttact
acgaatttaaccagtactggagactggggagcataccaaaatgcgtcttccggaaatact
ctttacattccaaagggtgatcaaacagtaaggatggaagttctggtaaatggatttaac
ttggattggtttgaattagaaatggtggatccagaaaatccgggaccaaccgatccagga
ccaaccgatccgggaccaaccgatccaggaccaaccgatccgggaccaaccgatccagga
ccaaccgatccaggaccaaccgatccaggaccaaccgatccaggaccaaccgatccggga
ccaactgatccgggaacaaccgatccaggaacaaccgatccaggaacaaccgatccagga
actagcccaggaactgacctggggaatggtacccaatcaggtaatggtcaagaccatgag
gacaagcttcctaatactgcgacatcaatgttcaacaatattcttgctggtttagttttc
ttcctaattggaggattcctctataccagaaatagaagaaataccgctaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system