Oceanotoga sp. DSM 15011: OF820_05780
Help
Entry
OF820_05780 CDS
T08543
Name
(GenBank) carbon starvation protein A
Organism
ocs
Oceanotoga sp. DSM 15011
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CstA
CstA_5TM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UYP01195
LinkDB
All DBs
Position
1171862..1173280
Genome browser
AA seq
472 aa
AA seq
DB search
MITFLVSIGLLILGYFTYGKVVEKIFGIEENRKTPAIELEDGVDYVPMKGWKIFLIQFLN
IAGLGPIFGAIAGALWGPIAYLWIILGSIFAGGVHDFFSGMLSVRHAGASASEIVGTYLG
NTIKQIMRVFTVVLLILVGVVFVTGPAGLLNNLTSWSTNMWVIVIILYYLFATVLPVDKI
IGKVYPIFGLSLMIMAIGIGFNLIFKGYNMPEMTFSNLHPASTPIFPFLFITIACGAISG
FHATQSPMMARCLTNERQGRKIFYGAMIAEGIIAMVWAAAAMSFYNGTNGLSEVLANGGP
AVVVNEISNTLMGKIGGILAVLGVIAAPITSGDTAFRSARLTIADSFKLNQRKPLNRYLI
AIPLFIVGFALTKINFSIIWRYFSWSNQTLAMIVLWAAAAYLAFNKKNHWITTIPAIFMT
AVTVSYILQAPEGFKLNSLFSNIFGIIIAIVFFILFISRIKKTKIEPLTDEI
NT seq
1419 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataactttcttggtttctataggtcttttaattttaggttattttacatatggtaaa
gtagttgaaaagatttttggaatagaggaaaacagaaaaacacctgcaatagaacttgaa
gatggtgttgattatgttcctatgaaaggttggaaaatttttctaatacaatttttaaac
atagccggtcttggcccaatatttggagcaatagctggtgcattatggggacctattgca
tatttgtggataatattaggaagtatatttgctggtggagttcatgactttttttccgga
atgctttctgttaggcatgcgggagcaagtgcttcagaaatagtaggcacatatttagga
aatacaataaaacaaataatgagagtattcaccgtagttctattaattcttgttggagtt
gtttttgtaacaggtcctgcaggacttttgaataatctcacaagctggagtaccaatatg
tgggtaatagtaattatactttattatctttttgcaacagtacttccagtggacaaaata
ataggaaaagtttatcctatttttggactttcattgatgataatggcaattggaattgga
tttaacttaatatttaaaggttataatatgccagaaatgacattctctaacttacatcca
gcctcaacacctattttcccttttctttttattacaatagcctgtggagcaatatctgga
tttcatgcaactcaatctccaatgatggcaagatgtttaacaaatgaaagacaaggaaga
aaaattttttatggtgcaatgatagctgaaggtataattgcaatggtttgggcagcagct
gcaatgtcattttacaatggcacaaatgggttatcagaagtattggccaatggtggtcca
gcagtagttgtaaatgaaatttcaaatactttaatgggaaaaataggtggaatacttgca
gtattaggagtaatcgcagcacctataacttctggagatactgcttttagaagtgcgaga
ctaacaatagctgattcttttaaattaaatcaaagaaaacctttaaatagatacttaata
gcaatacctctattcatagttggatttgctttaactaaaataaatttttcaataatatgg
agatatttctcatggtcaaatcaaacactcgcaatgatagtgttatgggcagcagcggca
tatcttgcattcaataaaaaaaatcattggataacaaccataccagcaatatttatgaca
gctgtaacagtttcttatatattacaagctccagaaggatttaaattgaactctttgttc
tcaaatatatttggaataataattgccatagtatttttcatattattcatatcaagaatt
aaaaaaacaaaaatagaaccattaacagatgaaatataa
DBGET
integrated database retrieval system
