Oceanisphaera profunda: CBP31_03255
Help
Entry
CBP31_03255 CDS
T04856
Name
(GenBank) ligase
KO
K02847
O-antigen ligase [EC:
2.4.99.26
]
Organism
opf
Oceanisphaera profunda
Pathway
opf00540
Lipopolysaccharide biosynthesis
opf01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
opf00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00540 Lipopolysaccharide biosynthesis
CBP31_03255
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01005 Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
opf01005
]
CBP31_03255
Enzymes [BR:
opf01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.26 O-antigen ligase
CBP31_03255
Lipopolysaccharide biosynthesis proteins [BR:
opf01005
]
Core region
CBP31_03255
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Wzy_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ART81760
UniProt:
A0A1Y0D2L2
LinkDB
All DBs
Position
complement(739171..740445)
Genome browser
AA seq
424 aa
AA seq
DB search
MCTARRFTSFAVFLMGALALVVDSGYSIGPTLLLLASISLLWRKPVLNLSTEDKWLMAVI
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ARVQHAFTDIELYVSGENKATSLGARFEMWQGALTLIAEKPLTGWGWDGYYQGMQTLVDK
GEVIQFAADNHAHNEYLDNFARRGIFGLLSLLALYLVPLRLFARRLTESNLELRALATAG
AILPVAFMDFGLSQVFFGHNSGVMVYAFWLAVLWGTMRAYEKAFAYKTTVLNEDDLTLDL
KPNT
NT seq
1275 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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gtggtcgacagtggttatagcattgggccgacattacttttgttggctagcatatctttg
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gagaaagcgttcgcctacaaaaccacagtgttgaatgaggacgacttaacactagatcta
aaaccgaatacataa
DBGET
integrated database retrieval system
