Planktothrix agardhii: NIES204_28940
Help
Entry
NIES204_28940 CDS
T05658
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
pagh
Planktothrix agardhii
Pathway
pagh02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pagh00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
NIES204_28940
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4347
HemolysinCabind
Calx-beta
Peptidase_C80
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBD55583
UniProt:
A0A2Z6CI70
LinkDB
All DBs
Position
complement(3262484..3268645)
Genome browser
AA seq
2053 aa
AA seq
DB search
MELPTMNKQVIFVDSSVQDYQSLIDNADTAQIVILDNISSGIEQITNALANQKNIESVQI
LSHGSEGSLKLGTDVLNGNDIENFNTQLKQWGNALTENGDILLYGCDVAAGETGKNFVER
LSEITGADVAASNDLTGNQALGGDWDLEIVTGKIEATVPFNQEAMADYDYTLANFDVTVA
NDDGTGTLAGTLSKAILDANKAAGDDTITLQTNVTVKGVMKTLVNSNIDFIGNNHTVSGD
NAFRPFFVKSGTVNFSNMTVTNSKAQGGAAYDGGRGAGMGGGLFIYNGTVGVNNVTFSNN
TAIGGTGAGAYSGGYGGGGMFGSTTSGGSGGGLFANGSGTGGGYGGNGNYGGGIGLFGGG
GTIRNDPQTVGGAGGFGGGGGAGRGQRGGNGGFGGGGGWGPGGGGNGGYGGGGGGVINTT
GTGGRFGGNGIGTNGRSGGGGAGLGGAIFIRQGSLTLNNATFSNNTATGGNGARTSPSSS
ETNPGQGKGGAIFAMTSLTNTNGNDQGMPTALPTVTSLGATFTGNNAGNQANTPAANTPA
NGQGSNQDNKDVYGTILLNTAPVLADTVVTLTPILEDADVPTGAVGNLISSIAAIGTNIT
DSDTGAVAGVAITGADTTNGSWFYTIDGGTTWTALGAVSDTNARLLAANANTRIYFQPTP
NYNGTVTNGITFRAWDQMAGANGSTADTSTNGGSTVFSALTDTAAITVTAVNDKPSFSNA
GNQILTAWTSTAQSVSNWANTVIFGPANESTQTVSNYTVTNTDNTLFTAQPSVATDGTLT
YTPSGKPGTATVSVQLQDNGGTANGGVDLSDIATFNITIPAPKVNLTASPTTASEAGATA
ITLTATAEGNVVGAQTLDLALTGTASVADFTGTIPTQITIPDGSNTGQVTITVNNDLLAE
GTETATLTISNPSTGIALGTTTNQSVTINDNPGITVTPTTGLTTTEAGGTANFTVVLNSQ
PTADVTIPLTSSNTAEGTIDKTSLTFTAANWNVAQTVTVTGVDDLIDDGDIAYNIVTVAA
TSTDANYSGFDASDVAVTNTDNDIKGITVTPTTGLTTTEAGGNATFTVVLNSQPTADVTI
PLTSSNTAEGTIDKTSLTFTTANWNTPQTVTITGVDDSVDDGDIAYNIVTVAATSTDTNY
SGVNASDVAVTNTDNDTKGITVTPTTGLTTTEAGGKATFTVVLNSQPTANVTIPLTSSNT
AEGTIDKTSLTFTATNWNTPQTVTVTGVNDSVDDGDIAYNIVTATATSTDANYSGFDASD
VAVTNTDNDTKGITVTPTTGLTTTEAGGKATFTVVLNSQPTADVTIPLTSSNTAEGTVNQ
SSLTFTATNWNTPQTVTVTGVNDSVDDGDIAYNIVTAAATSTDTNYSGVNASDVAVTNTD
NDTKGITVTPTTGLTTTEAGGKATFTVVLNSQPTADVTIPLTSSNTAEGTVDKTSLTFTS
ANWNVAQTVTVTGVDDSVDDGDIAYNIVTAAATSTDSNYSGFNASDVAVTNTDNDTKGIT
VTPTTGLTTTEAGGNATFTVVLNSQPTANVTIPLTSSNTAEGTIDKTSLTFTSANWNVAQ
TVTVTGVDDSVDDGDIAYNIVTAAATSTDANYSGFDASDVAVTNVASTPIPTVTPTPIPT
VTPTPIPTVTPTPVPTVAPTPVPTVAPTPVPTVAPTPVPTVTPTPVPTVAPTPVPTVAPT
PVPTVTPTPVPTVTPTPVPTVTPTPVPTVTPTPVPTVTPTPVPTVTPTPVPTVTPTPVPT
VTPTPVPTVAPTPEPIPETPVFNGSADIYDSTNFITTIEFPTQELKVTDNEPISRTAEAN
VIFALEGNDTVLGGKDNDQIIGNDGADELYGNLGNDIITGNGGNDWINGNLGEDLIDGGD
GEDELFGGQENDLIKGGNGDDTILGNKGEDITEGNEGDDLLSGNEANDTISGNSGDDMIY
GGQGNDLLDGSEGNDLLSGDQGDDTLDGGEGNDILTGGQGNDWLVGAEGDDTLTGGAGND
RFYLASSFGNELITDFTNGADIIALTGGLTFEQLQITSFNDSTLIKIASSQQQLAELLGV
DSRLIGKSNFVLG
NT seq
6162 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaattgccaactatgaacaagcaagtcattttcgtagactcctcggtacaagattat
caaagcctaattgataacgccgataccgctcaaattgtaattttagataacatatctagc
gggattgaacaaattactaatgccttagctaatcaaaaaaatattgaatctgtacagata
ctttctcacggtagcgaaggcagtttaaaactcggtactgatgtactgaatgggaatgat
atagaaaattttaatactcagctaaaacagtggggaaatgccctcacagaaaatggcgat
atcctattgtatggatgcgacgtagccgccggagaaactggcaagaattttgttgaacga
ttaagtgaaattaccggggcagatgtcgctgcctctaacgacttaaccggaaatcaagca
ttaggtggcgactgggatttagaaatagtaacgggcaaaatagaagccaccgtacccttt
aatcaagaggcgatggcagattatgactatacactggctaactttgatgtcacggtagca
aatgatgatggcactggcactctagcaggtacattaagcaaagccattttagacgcgaat
aaggccgcaggcgatgacactattaccctacaaacaaacgttactgttaaaggggtaatg
aagaccctagttaacagcaatattgattttattggcaataaccatactgtcagtggcgat
aatgcttttcgtcccttcttcgtcaagtcgggaaccgtgaatttctccaacatgacagtc
accaacagtaaggcacaaggaggagctgcttacgacggcggtcgtggcgctggcatgggt
ggcggtttattcatctacaatggcactgtgggggtgaataacgtcacctttagtaacaat
accgcgatcggcggtactggggctggcgcctatagtggcggctatggtggcggcgggatg
ttcggtagtaccacatctggtggcagtggcggcggtctgtttgccaatggcagtggaact
ggcggcggctatggcggcaacggcaactacggtggtggcattggccttttcggtggaggt
ggcaccatcagaaacgatccgcagaccgtcgggggcgcaggggggttcggcggcggcggc
ggtgctggtcgcggccaacgtggtggcaacggcggcttcggcggcggtgggggctggggc
cccggcgggggtggcaacggcggctacggtggcggtggtggtggtgtcataaacaccact
ggtaccggtggcaggtttggtggcaacggcattggcactaacggccgatccggcggcggt
ggcgctggccttgggggtgccatctttattcgccaaggatctttgactctaaacaacgca
acctttagtaacaacactgccacaggcggtaatggcgcccgaaccagtcccagtagtagt
gaaaccaaccccggccaaggcaaaggtggggcaatatttgccatgacatccctcaccaac
accaatggcaacgaccaaggaatgcccaccgcactccctactgtcacctcattaggggcc
acctttaccggcaataacgctggcaaccaagctaacactccagctgctaacactcccgcc
aacggtcaaggatctaaccaagacaataaggatgtttatggcacgattcttcttaatacc
gcccccgttcttgccgataccgttgtcaccctcactcccatcctagaagatgcagatgtt
cccactggcgcagtcggcaacctcatctcatccattgcagctatcggtacaaacatcacc
gactccgacactggcgcagtcgcaggggtagccatcaccggggccgacaccactaacggc
agttggttttacaccatagatggcggtactacttggactgctttgggcgcagtatccgat
accaatgctcgcctactggcagctaatgccaatacccgcatttatttccaaccaactccc
aactacaacggcactgtcaccaacggcattaccttccgcgcttgggatcaaatggcgggt
gctaatggcagcactgctgacactagcaccaacggcggtagcacagtcttcagcgccctc
accgacaccgcagccatcactgttaccgcagttaatgacaaacccagttttagtaacgct
ggcaaccaaatcctaacagcttggacaagtacggctcaaagcgttagtaattgggcaaat
actgttatcttcggccccgccaatgaatcaactcaaactgttagcaactacaccgttact
aacaccgacaataccttatttaccgctcaacccagtgtagcaactgatggcacgctgacc
tacactcccagtggtaaacccggtactgctaccgttagtgtgcaactgcaagataacggc
ggtacggccaatggtggtgtcgatctttccgacatagctacttttaatattaccattccc
gcaccaaaagttaacctgactgccagcccaactactgctagtgaagccggggcaactgct
attaccttgaccgctactgctgaaggtaatgttgtcggcgctcaaacccttgatttagca
ttaacgggtactgctagtgtggctgactttactggtactattcctactcaaataactatc
ccagatgggagtaataccggacaagtaaccattacagttaataatgatttacttgcggaa
ggtacggaaacagctactttaacaattagcaacccatccacaggaatcgcattaggaact
actactaatcaaagtgtgacgattaatgataatccaggaattactgtcacacccaccaca
ggtttaaccaccaccgaagcgggaggtacggctaattttacagtagttctaaatagccaa
cccacagccgatgtcaccatcccattaactagcagtaacaccgccgaaggtacaatagac
aaaaccagtttaaccttcaccgcagctaattggaatgtggcgcaaaccgtcacagttacg
ggagtagatgatttaatagatgatggagatattgcctacaatattgttacggtggcggct
accagtaccgatgctaattatagtggttttgatgcttcagatgtggcagttactaatacc
gataacgatatcaaaggcattactgtcacacccaccacaggtttaaccacaacagaagcc
gggggaaatgccacatttacagtcgttttaaatagccaaccaacagccgatgtcaccatc
ccattaactagcagtaacaccgccgaaggtacaatagacaaaaccagtttaaccttcacc
actgctaactggaatactccccaaaccgtcaccattaccggagtagatgatagcgtagat
gatggagatattgcctacaatattgttacggtggcggctaccagtaccgatactaattat
agtggtgttaatgcttcagatgtggcagttactaatactgataatgataccaaaggcatt
acagttacacccaccacaggtttaaccacaacagaagccgggggaaaagctacatttaca
gtagttttaaatagccaaccaacagccaatgtcaccatcccattaactagcagtaacacc
gccgaaggtacaatagataaaaccagtttaaccttcacagcaactaactggaatactccc
caaaccgtcacagttaccggcgtaaatgatagcgtagatgatggagatattgcctataat
attgttacggctactgctaccagtaccgatgctaattatagtggttttgatgcttcagat
gtggcagttactaataccgataacgataccaaaggcattacagttacaccaacaacaggt
ttaaccacaacagaagccgggggaaaagctacatttacagtagttctaaatagccaaccc
acagccgatgtcaccatcccattaactagcagtaacaccgccgaaggtacggtaaatcaa
tccagtttaaccttcacagcaactaactggaatactccccaaaccgtcacagttaccggc
gtaaatgatagcgtagatgatggagatattgcctacaatattgttacggccgcggctacc
agtaccgatactaattatagtggtgttaatgcttcagatgtggcagttactaatactgat
aatgatacgaaaggcattacagttacacccaccacaggtttaaccacaacagaagccggg
ggaaaagctacatttacagtagttttaaatagccaacccacagccgatgtcaccatccca
ttaactagcagtaacaccgccgaaggtacagtagataaaaccagtttaaccttcacatcg
gctaattggaatgtggcacaaaccgtcaccgttactggagtagatgatagcgtagatgat
ggagatattgcctacaatattgttacggccgcggctaccagtaccgatagtaattatagt
ggttttaatgcttcagatgtggcagttactaatactgataacgataccaaaggcattaca
gttacacccaccacaggtttaaccacaacagaagccgggggaaatgccacatttacagta
gttttaaatagccaaccaacagccaatgtcaccatcccattaactagcagtaacaccgcc
gaaggtacgatagacaaaaccagtttaaccttcacatcggctaattggaatgtggcacaa
accgtcaccgttactggagtagatgatagcgtagatgatggagatattgcctataatatt
gttacggcggctgctaccagtaccgatgctaattatagtggttttgatgcttcagatgtg
gcagttactaatgtagcttccacaccaattccaacggtaactccaaccccaattccaacg
gtaactccaaccccaattccaaccgtaactccaaccccagttccaacagttgcaccgaca
ccagttccaacagttgcaccgacaccagttccaacagttgcaccgaccccagttccaacc
gtaactccgaccccagttccaacagttgcaccgacaccagttccaacagttgcaccgaca
ccagttccaacggtaactccgacaccagttccaacggtaactccgacaccagttccaacg
gtaactccgacaccagttccaacggtaactccgacaccagttccaacggtaactccgaca
ccagttccaacggtaactccgacaccagttccaacggtaactccgacaccagttccaacg
gtaactccgacaccagttccaacagttgcaccgacaccggaaccaattcccgaaactccg
gtattcaatggcagtgcggatatctatgactccaccaattttataacaaccatcgaattt
cctacccaagaactcaaggttaccgacaatgaacccatatcacgtacagcagaagccaat
gtcatctttgccttagaaggtaacgataccgtcctcggtggcaaagataacgaccaaatc
atcggaaatgatggagcagatgaactctacgggaacctgggtaacgacatcattacgggt
aatggcgggaatgattggattaacggcaacctaggagaagacctgattgatggaggtgat
ggagaggatgaactctttggaggtcaagagaatgacttaattaaaggtggcaacggagat
gatactatcttgggaaacaaaggagaagacataacagaaggaaacgaaggtgatgatctt
ctctctggtaacgaagccaatgacaccatttcgggtaactcaggagacgacatgatttat
ggcggtcagggcaatgaccttctcgacggcagcgaaggcaatgatttgctctcgggtgat
caaggtgatgataccctcgatggcggagaaggcaacgatatcttaaccggaggtcagggt
aatgactggttagttggagccgagggcgatgacaccctaactggtggtgcgggtaatgac
cgcttctatctggccagtagttttgggaatgagctaattaccgactttactaacggagcg
gatattatcgctttaaccggaggtttaacttttgaacagttacaaatcacctcttttaac
gactccaccctaattaaaatagccagtagtcaacaacagttggctgaactgttgggagtc
gatagtagattgataggtaagagtaattttgttctaggataa
DBGET
integrated database retrieval system