Populus alba (white poplar): 118048883
Help
Entry
118048883 CDS
T07314
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
palz
Populus alba (white poplar)
Pathway
palz03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
palz00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
118048883
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
palz03019
]
118048883
Messenger RNA biogenesis [BR:
palz03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
118048883
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
118048883
NCBI-ProteinID:
XP_034914623
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
456 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETSEEKLRDYFGQYGDVLQAVVMKDKTTGRPRGFGFVVFADPAVL
DMVLQDKHTIDGRMVEAKRALSREEQQTNARAGNLNPARNTSGGGNIRTKKIFVGGLPPT
LNEDGFRQYFETFGFVTDVVIMYDQSTQRPRGFGFISFDTEDAVDRVLQRTFHDLNGKQV
EVKRALPKEANPGGGGRSMGGSYQNYGASGGNTSSYDGRMERYMQPQGTGGGFPPYGSSG
YSTAGYGYGPATNGVGYGGYSGYTGAGAGYGGPAGAAYGNPNVPNAGYVSGAPRNSWNSQ
GSSGYGAMGYGNAASWGAQNAGAGSGGPGSVPAGQSPGGASGYGNQGYGYGGYGGNDGSY
GNPAGYGAVGGRSGGTPNSNVGGPGGAELQGSGGGYMGSGYGDANGNSGYGNAAWRSEQS
QASGNYGAPQANGPHGGQVGYGGGYGSSQARKAQQQ
NT seq
1371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttattggagggatttcatgggagacatcagaggag
aagcttagagactactttgggcaatacggagacgttttgcaggctgtcgttatgaaagat
aagactactggtagacctagaggctttggctttgtcgtctttgcagatcctgccgtgctt
gatatggttcttcaagataagcacaccattgatggtagaatggttgaggcaaagagggcc
ttatcaagagaggagcagcaaaccaatgccagggccggaaacctgaatcctgctagaaac
accagcggtggtggaaatattcggaccaagaagatatttgttggaggattgcctcccact
ctaaatgaagatggatttcgtcagtattttgaaacctttggctttgttactgatgtagta
ataatgtatgaccagagcacccagcgacctcgtggatttggctttatttcttttgacacc
gaagatgctgttgaccgggtgttacagagaacattccatgatttgaatggtaagcaagtt
gaagtaaaacgggctcttcctaaggaggccaatcctggtgggggtggccgctccatgggt
ggcagttaccagaactatggtgcatctggtggcaacacaagctcttatgatggtcgaatg
gagaggtatatgcagcctcaaggtactggaggtggttttcctccttatggctcatctggc
tatagcacagctggatatggatatggtcctgccactaatggtgttggttatggtggttat
agcggctatactggagctggagctggttatgggggacctgcaggtgcagcttatgggaat
cctaatgttccaaatgctggctacgtaagtggtgcacccagaaattcatggaacagtcaa
ggttcatctggctatggtgctatgggttatgggaatgctgcttcttggggcgctcaaaat
gctggggctggcagtggtggccctggttcagtacctgctggtcaatctcctggtggagcc
tctgggtatgggaatcaaggttatgggtacggtggttacggtggaaatgatggatcatat
gggaatccagctgggtatggtgctgttggaggacgttctgggggcactccaaacagtaac
gttggtggtcctggtggagcagaactacaggggagtggcggtggctacatggggagtgga
tatggtgatgcaaatggaaattctgggtatggaaatgcagcgtggagatctgagcaatca
caagcttctggaaattatggggctcctcaagcaaatggtcctcatggtggacaggttgga
tatggcggtggttatggtagttctcaggctcggaaagcccaacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
