Prunus avium (sweet cherry): 110761912
Help
Entry
110761912 CDS
T05161
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At2g04860
Organism
pavi
Prunus avium (sweet cherry)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
PPR_3
Alpha-amyl_C2
Alpha-amylase
E_motif
PPR_long
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110761912
NCBI-ProteinID:
XP_021820188
UniProt:
A0A6P5T1M9
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1194 aa
AA seq
DB search
MNIRCHPTQPIAHTTSKGNMNFLLSFCFCLCVSRLPSFATPAVLFQGFNWDSSKKGGWYN
SLKTTIPELASSGITHVWLPPPSHSNATEGYDPGRLYDLDSSSYGNKDELKSLIATMHEK
GIKAIADIVLNHRSAVKQDENGIWSIFEGGTEDGRLDFNASLICRDDNDHPFGTGNPDTG
DNFPYTADVDHTNPRLQTELSDWLNWLKTDIGFDGWRLDYVIGYGSSITKLYMEKTSPEF
AVAEYWRWNISKGQDGKLDKNQDAHRNEIVNWIEAAGGVVTAFDLTTKYILNVAVQGELW
RLKDSNGKPPGLIGIKPESAVTFIDNHDTWSQRLLPFPDDKVLLGYAYILTHPGTPTIFY
DHFFEWGWPKEPIRNLTAIRVRNGINSRSSVTILAAEADLYMANIDDKIIMKIGPRLDLG
DLDPTKSNFHVATSGGDFAVWEKNQNYKRSRAPVKSGAKQLNMNLASSVGLSTKPNLPCL
HSLLNSYIESRNRKQALLLFRQLLQYNVKPSDLTFSLLLKACTSSSSSSSASNSVNVKRE
ANQIHTHLLKSGVDRFMYVSTALLDLYMKLGCVKNAHRLFDDMPDRDIVSWNALICGFSR
NGCDFEALKLFVQMCKGGFFPHQTTLVSLVPSCGRQELVSQGKSIHGFGIKAGLDSDSHV
KNALTSMYAKCADLEAAEHLFEEIVEKSVVSWNTMIGAYGKNGFFDEAMLAFKRMQEENV
PANLVTMVSLLSANADPESTHCHATKTGLVNDASVITSLICQYATCRNTESGELLYKSLP
QKNLVSLTALMSSYTEKGNLFQVMSCFAHLQQLEIKVDAVAMVCILHGIKDPIEFGLGLA
FHAYGLKSGLSADSLVANGLISLYSRFDKIETAFSLLSEIHEKTLISWNSLISGCVQAGR
PSDALEVFFQMKMSGHSPDAITISSLLSGCCQLGYLRFGERIHNYVLRNNLEVEDFVGTA
LIDMYIKCGKIEHAERVFKSIKEPCLATWNSMISGYSLYGLEHEALACFSEMQKQGLKPD
KITFLGVLAACTHGGLVQEGRKNFQIMREQFNMVPDLQHYACMVGLFGRAGLFEEALMFI
RNMEMEPDFAVWAALLSACCIHQEVKLGEYVAKKLFFLDSNNGGFFVLMSNLYAVKGMWD
EVARVREMMRETGGDGCPGISVIEMTSLEDMNVNLSSSKSSLNANAWQPLLSLY
NT seq
3585 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatataagatgccatccaacccaacccattgcacatacaacttcaaaaggcaatatg
aattttctcctttcattctgcttttgcctctgcgtttctcgtttgccctccttcgcaact
ccagcagtgttatttcaggggttcaattgggattcaagtaaaaaaggaggatggtacaac
tccctcaagaccaccattcccgaactcgctagctctggaattacccatgtctggcttcct
cctccttctcactctaatgcaactgagggatatgacccgggaaggctatacgatctcgat
tcatcaagctatggaaataaggacgaattgaagtccctgattgctactatgcatgagaag
ggaatcaaagccatcgctgacattgtgttaaaccacagatcagctgtcaaacaagacgag
aatggaatatggagcatctttgaaggtggaacagaagacggacgtctcgacttcaatgcc
tcattgatctgcagagatgacaatgaccatccttttggaactggaaatccagacacaggg
gacaactttccttacactgctgatgtggaccacacaaatccaaggctacaaaccgagctc
tctgattggttgaattggttgaaaactgatatagggtttgatggatggaggttggattat
gtgattggatatggctccagtatcaccaagctctacatggaaaagacttcaccagaattt
gcagttgctgagtattggcgttggaacatttcaaaagggcaggatggcaaacttgacaag
aaccaagatgcacataggaatgaaatagtgaattggatcgaggctgctggtggcgttgtc
acggcgttcgatttgacaaccaagtacatcttgaatgttgctgtgcagggtgagctatgg
aggctcaaggattctaatggaaaaccaccagggttgattgggatcaaaccagaaagtgct
gtaacatttattgacaatcatgacacttggtctcagagacttttgcctttcccagatgac
aaagtcctgcttggatatgcttacattctcacccatcctgggaccccaaccatattctat
gatcacttctttgagtgggggtggccaaaggagcctatacgcaatttgactgcaattagg
gtaaggaatggaataaattcgaggagcagtgtgactattttagctgcagaggctgatcta
tatatggccaacattgatgacaagattatcatgaagattgggccaagattggaccttgga
gaccttgacccgacaaagtcaaacttccatgttgctaccagtggaggagacttcgctgtt
tgggagaaaaatcaaaattataaaagaagccgtgcgcctgtaaagtctggcgccaaacag
ctgaatatgaacttggcctcttctgttggtctctctacgaagcctaaccttccctgtttg
cactctctgttaaactcctacattgaaagcagaaatcgaaagcaagcactgcttctcttt
cgccagttgttgcagtacaatgtgaagcccagtgacctcactttctctttgctcctgaaa
gcctgtacttcgtcttcttcttcctcctcagcttcaaattccgtgaatgttaaaagagaa
gcaaatcagattcatacacacttgctaaaatcgggtgttgaccgattcatgtatgtgagt
actgctcttcttgatctgtatatgaaactgggatgcgttaaaaatgctcataggctgttt
gatgatatgcctgatagagacattgtctcttggaatgcgttgatttgtgggttttcgcga
aatgggtgtgattttgaagcgttgaaactctttgttcaaatgtgtaaagggggatttttt
cctcatcagacgactttggttagtttggttccatcttgcggtaggcaagagttagtttct
caagggaaatctattcatgggtttggaattaaggcgggccttgattcagattctcatgtg
aagaatgctcttacctcaatgtatgctaaatgtgcagatttggaggcggcagagcacttg
tttgaggaaatagttgagaagagtgtagtttcatggaatactatgattggtgcttatgga
aaaaatggcttctttgatgaggcaatgcttgcctttaaacgaatgcaagaggaaaatgtt
ccagccaatctggtgaccatggtaagccttctgtcagcaaatgccgatccagagtctacc
cattgtcatgccactaaaactggtcttgtcaatgatgcttctgtgattacttcattaatt
tgccaatatgcaacatgcaggaacacagaatccggcgaacttctttacaagtcattgcct
cagaagaacttggtttccctaactgcacttatgtcaagctatactgagaaaggtaacctg
tttcaggtgatgtcgtgttttgctcacttgcagcagttagaaattaaggttgatgcagtt
gctatggtttgcatcctccatgggataaaagatcccattgaatttggtcttggacttgct
tttcatgcttatgggctaaagagtgggttgagtgctgattctttggttgcaaatgggttg
ataagcctgtactcgaggtttgacaagatagaaactgctttctctttactttctgagata
catgagaaaacattgattagttggaattctttgatatcgggctgtgtacaagctggaagg
ccaagtgatgccctagaggtttttttccaaatgaaaatgtctggacacagtccagatgcc
attaccatctctagcttactatctggttgttgccagcttgggtacttgcgatttggggag
aggattcataactatgtcctaagaaacaatctcgaagtggaagattttgttggaactgct
cttatagacatgtacatcaagtgtggaaaaatagagcatgctgaaagggtgtttaagagc
atcaaagaaccgtgcttggcaacatggaactcaatgatctcgggttatagcttatatggg
ttagaacatgaagctcttgcttgcttctcagaaatgcaaaagcaggggctaaagcctgat
aaaataacttttttgggagttttagctgcgtgtactcatggaggccttgttcaggaggga
agaaaaaatttccaaatcatgagggaacagttcaacatggtgccagatttgcaacactat
gcttgcatggttggtctctttggtcgtgcaggcttgttcgaggaggcattgatgttcatc
agaaatatggaaatggagcccgatttcgcagtttgggcagccttgctgagtgcttgttgc
atccatcaagaggtgaagcttggggaatatgttgccaaaaagttgtttttcttggacagt
aacaatggtgggttctttgtgttgatgtcaaatctatatgcggttaaaggaatgtgggat
gaagtagctagggtgagggagatgatgagagagactggaggggatggctgtccaggaatt
agtgttattgagatgacttcattggaagacatgaatgtaaacttaagctcgagcaagtct
agtttgaatgcaaatgcttggcaacctctactctctctatattaa
DBGET
integrated database retrieval system
