Plasmodium berghei: PBANKA_0210600
Help
Entry
PBANKA_0210600 CDS
T01111
Name
(RefSeq) ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative
KO
K11838
ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 [EC:
3.4.19.12
]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Pathway
pbe03083
Polycomb repressive complex
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09126 Chromosome
03083 Polycomb repressive complex
PBANKA_0210600
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
pbe01002
]
PBANKA_0210600
09182 Protein families: genetic information processing
04121 Ubiquitin system [BR:
pbe04121
]
PBANKA_0210600
Enzymes [BR:
pbe01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.19 Omega peptidases
3.4.19.12 ubiquitinyl hydrolase 1
PBANKA_0210600
Peptidases and inhibitors [BR:
pbe01002
]
Cysteine peptidases
Family C19: ubiquitin-specific protease family
PBANKA_0210600
Ubiquitin system [BR:
pbe04121
]
Deubiquitinating enzyme (DUB)
Ubiquitin-specific proteases (UBPs)
UBP/USP
PBANKA_0210600
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UCH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55147861
NCBI-ProteinID:
XP_034419832
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(383882..392643)
Genome browser
AA seq
2788 aa
AA seq
DB search
MINNNDGNEENYRSRGDNSSDSDDENIENDQINNYSNYNNFNKFHEQNMNPCNIDEIYVD
DNYDQNNIFKQNNNHIRNVSNVSNVSSISNATTNHNSSHDGIGEIEGQHSYVANSQNIFL
EKKQTENNFEINKNVNFNESYSYKNLRGVAENEIELIVDNFFDKIESNDEIYSEWKVCPN
FIFRILFIPKTKSNNYIYPVSSAFIETMSKDDWVNDWGFSNVQYYIILINQVDYRHSFYK
IDNFNFSHINTDRGWHNFIPFDKIKEPGFINKKGEIILRAGVFPFGSESYKNSRDVNYNS
KIRTGFVGLKNHGATCYMNALLQLLYHINIFRKSVCMMIFNIENIIGSKTLEFFKNKLEK
KKRKKQRNKFKHITEIDKKSKYKNKENNFEKTDKTSLKRENLKAYQVWKHRKKKIKKKYE
ENIKSDENNQTTSSISYNNIKNETNISINSVYNDISISTKNQYNNISGNDNSIQISDIKN
TNIYGYENSRDDNNEKGKENEHPSDYILDKINYINNANNNISKSLDSEFILKKNENIKEE
DKITNNNYTEYEMKNKKKKKIKNKKILKCSNEIKENNDSENESMSVSHICSSDNLSSKSN
ASKNKNKNKYIINSHENNKKENYSSMNNSNNDKNQHMNNDHIQTSCGGSYEHTVDNISDK
SDIENKIPKRNSLIKNNEEKPKNYYDVSSYCDSYSDDNFSSLSIESSYTTSYVSCSESSG
SCFYKRKRRKKKTGNTNIDGNYYENERTKEIDYKNILIEEENEKKNILPTSLALQNLFYK
LHTQNEAVSCKELIRSFGWNANDVFTQQDTHELLKLLLDKVEEQMKGTVVDGSVKKMFEG
EVETYIECIDIDYKSVRKETYEDIQLDVHGCNNIYESLDKAIEAEILEGDNIYETDGYGM
QRAKKGMRFLNFPNICIFLLKRFTFDLNKMETVKLNNKFEFYKELDLSKYCKDTEQQYTL
QAVSVHQGNMNSGHYYSFSYKHDEKFWLKCDDDKIYRVSEHSVINDNFGGYDIEIENNMY
NFDICDKIKQRMKNYSAYMLVYVKKSLIPKLIKECDPALVNPQVVKRCKLEEIINKHRTK
LKQNILQYVKIKVYDKYSYIYKSFSGLPSNNIQSLFHTKFNKNKTLSDIFFQIFKIIKNI
YTRKKQKQLMYYSKIHHKSNKKQKITSSHSMINKLSNYSHLDQTNNNLTCQNKQTIMNNH
NDSIIISPEVNTNYHMQNEMIMDNGNNNLNNNNQTYIKMEKVDEKRYNNINCHDINNNYN
SKNNDLMMKTQFSKIGNVQTKENFDDISENSNNQSDTSISTKSSVPSGCTTTTLDNYIKY
ISKKQKFKTEKKKSKNSKIKHKKATKKKNKIIKKNEKITKRPKKEKNMQNQQNNYSHYSR
FKSNSSYDSEDTASNSFSSDDSSHISHSDNFSDSGNISTNTASNTTTTSPPVSSSSSSSF
ASTSSSSQFSSYCYSNKRNCFFVLIPTNDTYRYLPLDLKNNGKLYLYELLKKTNREPNDL
FPTIDILYLPYNKRTAISASRSSKNKNILLFLKYFDIYAEENINDTSLLCLDVIHCDINL
KPKHLETRMINKVLKAMNKQFIIKHNYNILKEYIQNINNNDLCSDESTNFKIFVEYKNKC
NLIKQKKTIAHNKIITSDLLIFNFISNYDLEKKKKYIFSLGNKKQDLYITKENISSYDLF
LNANILSKIFYRKKKLIQKNSINTHYIICNRNGIFYKIQDNDNVNEINNIAITHQDQKQE
NILYSDSNNLCQNINNNYFDNINNLGNEIDLNHSGLKKHDSNSKKFNSNKNQYLDKINKN
ENMLHQNSIQCKDNNKDEIITNSKLNYSSNRQNQISNFSEISKSAQNHDSINFNILNNNS
NNKHDNLNDHEINNLYLCLKKYTKNSEQSHIFYEYSLIDQNLADKLDQFIIINNRYILKE
KKKYSINPEYILHNTQNIFSLESKDICRDYQYPFYSPHSSDLSSIEFETLDCNNEMATSP
EGALKKKKKKKKKKNYAQNTKQNNADISDETSQLPNNINYFDSNLCFPKIEKNIINITNL
GSHTIKKAHCYYYNSRKNDDIIDPLENLNESNISAALMSNENGASNELIDVNYSDISSRS
SANSVLTYTSESTDYYLDIIEEELAESVYTSKIYDHKKEAKRAQNNSKKKKTKNFNNIKN
QDEEYTHNNIYNKKTNLSLSEYDHVISKSELIPSTYNNVETTNDSIYNMESHLDNIHYEK
SIQIKSIDNAPKINDKIDDSNNIGINLISNNTTLHIDTDSIKDITHSYNNAILEMKNGTN
DMNDDDKPTTQHIDIDQNFKNNNLSKKANRIIKKCGGIPSKEEPILPFYVICDYLDFVER
KMYVNRFRFKLYDPIYQLGKYRNCSGVILKSDLKKSCLNYIDSHFLFLKKELCKIDLDID
IRCPTKQIFKHVCYKMNIDPTHILIYPYPPLNSPINFIPYNIDSFTCPPEHENDSYHQYS
DNMNCNDPNYTDENTNSASGQISFETLIKQRTMELEHNSLTEQKTFCLSLLPFHYKYFTR
LYPHDSPKYFHYVIQLFNSHVQSISAFTGHIKLKRAKKKHTIGNGNDLKSNNYYNLDAES
VDSTSSSDNSSSTFANNEYDSNDYTTVQDLIDKIKLEMNPYLKKRGINPKHKFRLLFTFG
PKIKYLNSNEQLIHLDFVKTNHIKNIYVTPLRMEPDFTDQQKQMLEANQLKIIHVFNQTP
SKEVFGYSFDVLVEPNDTMLEIKNKIRKRTILPKYIFDKITFFEYENGQRIWRSNDDIIN
WNNKQYAIIIGEHHAPSQSKPQIGMKIA
NT seq
8367 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaataataatgacggaaatgaagaaaattacagaagtagaggggataattcttct
gatagtgacgatgaaaatatagaaaatgatcaaataaacaattatagcaattataataat
tttaataaatttcatgaacaaaatatgaatccatgtaacattgatgaaatttatgtagat
gataattatgatcaaaataatatattcaaacaaaataataatcatataaggaatgtaagt
aatgtaagcaatgtaagcagtattagtaatgctacaacaaatcataatagtagtcatgat
ggaatcggagaaattgaagggcaacatagttatgttgcaaatagtcaaaatattttttta
gaaaaaaaacaaactgaaaataattttgaaataaacaaaaatgtaaattttaatgaatca
tattcttataaaaatttaagaggtgtagcagaaaatgaaatagaattaattgtagataat
ttttttgataaaattgaaagtaatgatgaaatatattcagaatggaaagtttgtccaaat
tttatttttagaatattatttattccaaaaactaaatcaaataattatatctatccagtt
tcatcagcttttattgaaactatgtcaaaagacgattgggtaaatgattggggttttagt
aatgtccaatattatattatattaattaatcaagtagattatagacattcattttataaa
attgataattttaatttttcacatataaatactgatcgtggatggcataattttattcct
tttgataaaataaaagaacctggatttataaataaaaaaggagaaataattttaagagct
ggtgtatttccttttggttcggaatcatataaaaatagtagggatgttaattataatagt
aaaatacgaacaggatttgttggtttaaaaaatcatggagctacatgttatatgaatgct
ttgttacagcttttatatcatatcaatatttttagaaaatctgtatgtatgatgatattt
aatattgaaaatattattggaagtaaaactcttgaattttttaaaaataaattagagaaa
aaaaaaagaaaaaaacaaaggaataaattcaaacatattaccgaaattgacaaaaaatct
aaatataaaaataaagaaaacaattttgaaaaaacagataaaacatctttaaaaagagaa
aaccttaaagcatatcaagtgtggaaacatcgaaaaaaaaaaataaaaaaaaaatatgaa
gaaaatattaaaagtgatgaaaataaccaaactacttcatctatatcatataataatata
aaaaatgaaacgaatatatctataaatagcgtatataatgatatttccatttcgacaaag
aatcaatataataatatctctggaaatgataactctattcaaattagtgatataaaaaac
acaaatatttatggatatgaaaattcgagggatgataataatgaaaaaggaaaagaaaat
gaacatccttctgattatatattagataaaataaattacataaacaatgcaaataataac
atttcaaaaagtttggattctgaatttattttaaaaaaaaatgaaaatatcaaagaagaa
gataaaataactaataataactatactgaatatgaaatgaaaaataaaaaaaaaaaaaaa
ataaaaaataaaaaaattcttaaatgttcaaatgaaataaaagaaaataatgattctgaa
aatgaatccatgtcagtttcacacatatgttcttctgataatttatcaagcaaaagcaat
gcatcgaaaaataaaaataaaaacaaatatataataaatagtcatgaaaataataaaaaa
gaaaactatagttctatgaataattcaaataatgataaaaaccagcatatgaataatgat
catatccaaacatcatgtggtggatcatatgagcatactgttgacaatattagcgataaa
agtgatatagaaaataaaattccaaaacgaaatagtttaataaaaaataatgaagaaaaa
ccaaaaaactattatgatgttagtagttattgtgatagttattctgatgataatttttca
tcgctttcaattgaatcgtcttatacaacatcttatgttagttgttctgaatcatctgga
tcttgtttttataaaagaaaaagaagaaaaaaaaaaactggaaatacaaatattgatgga
aattattatgaaaatgaacgaactaaagaaatagattacaaaaatatattgattgaagaa
gaaaatgaaaaaaaaaatattttaccaacatctttggctctgcaaaatctattttataaa
cttcatacacaaaatgaagctgtttcatgtaaagaattaataagatcttttggatggaat
gcaaatgatgtttttacacaacaggatacacacgaattattaaaattattattagataaa
gtagaggaacaaatgaaaggcactgtagttgatggatctgttaaaaaaatgtttgaaggg
gaagttgaaacatatatagaatgtatagatatagattataaaagtgtcagaaaagaaaca
tatgaagatattcaattagatgtacatggatgtaataacatctatgaatcattagataaa
gcaatagaagcagaaatattagaaggggataatatatacgaaactgatggatatggtatg
caaagagctaaaaaaggaatgagatttttaaactttccaaatatttgtatatttttatta
aaacgatttacattcgatttaaataaaatggaaacagtaaaattaaataataaattcgaa
ttttataaagaattagatttatcaaaatactgtaaagatactgaacaacaatatacttta
caagcagtatcagtacatcaaggaaatatgaatagtggtcattattattcatttagttat
aaacatgatgaaaagttttggctaaaatgtgatgatgataaaatttatagagttagtgaa
cattcggttataaatgataattttggaggttatgatatagaaatagaaaataatatgtat
aattttgatatttgtgataaaattaaacaaagaatgaaaaattatagtgcttatatgtta
gtttatgttaaaaaatcattaatacctaaattgataaaagaatgtgatccagctcttgtt
aatccacaagttgttaaacgatgtaaacttgaagaaataattaacaaacatagaactaaa
ttaaaacaaaatattttacaatatgttaaaataaaagtatatgataaatatagttatatt
tataaatcattttctggattaccgtcaaataatatacaatctttatttcatacaaaattt
aataaaaataaaactctttctgatatttttttccaaatttttaaaataattaaaaatatt
tatactagaaaaaaacaaaaacaattaatgtattattctaaaatacatcataaatcaaat
aaaaaacaaaaaattacatcatcacattctatgattaataaattatctaattatagtcac
ctcgatcaaactaataataatttaacttgtcaaaataaacaaacaataatgaataatcat
aatgattctatcattatatcaccagaagttaatactaattaccacatgcaaaatgagatg
ataatggataatggaaataacaatttaaacaataacaatcagacatatataaaaatggaa
aaagttgatgaaaaaagatataataatataaattgccacgacattaacaataattataat
agcaaaaataacgatttaatgatgaaaacacaattttctaaaattggaaatgtgcaaaca
aaagaaaattttgacgatatttctgaaaattcaaataatcaatcagatacaagcatatct
acaaaatcgtctgttccttcagggtgtactacaactactttggataattatattaaatat
atttcgaaaaaacaaaaatttaaaactgaaaaaaaaaaatcaaaaaatagcaaaatcaag
cataaaaaggcaacaaaaaaaaaaaataaaataataaaaaaaaatgaaaaaataacaaaa
cgccccaaaaaagaaaaaaatatgcaaaatcaacaaaataattattctcattattcaaga
tttaaatctaattcatcttatgattcagaagatactgcatctaattcatttagttctgat
gattcatcacatatttcccattcagataatttttcagattctggaaatatttcaacaaat
actgcatctaacactactactacatcccctcccgtttcttcttcctcttcctcatcattt
gcatcaacatcttcatcttcacaattttcttcatattgttattcaaataaaagaaattgc
ttttttgttttaattccaacaaatgatacatatagatatctaccacttgatctcaaaaat
aatggaaaattatatttatatgaattacttaaaaagacaaatagagaaccaaatgattta
ttcccaacaattgatatattatatcttccttataacaaacgaactgctatttctgcatct
agaagttctaaaaataaaaatatattactttttttaaaatattttgacatatatgcagaa
gaaaacataaatgatacatcattactatgcttagatgttatacattgtgatataaattta
aaaccaaaacatttagaaactagaatgataaataaagtattaaaagcaatgaataaacaa
tttataataaaacataattataatattctaaaagaatatatacaaaatattaataataat
gatttatgttcagatgaatcgacaaattttaaaatttttgttgaatataaaaataaatgt
aatttaataaaacaaaaaaaaactattgcacataataaaattattactagtgatttatta
atatttaattttattagcaattacgatttagaaaaaaaaaaaaaatatattttttcttta
ggaaataaaaaacaagatctatatattactaaagaaaatatatcatcttatgatctcttt
ttaaatgcaaatatattgagcaaaattttttatagaaaaaaaaaattaattcaaaaaaat
tcaataaatacacattatataatatgtaatcgaaatggtatattttacaaaattcaagat
aatgataatgtaaatgaaataaataacattgcaataactcatcaagatcaaaaacaagaa
aatatattatactcggattcgaataatttatgccaaaatataaacaataattattttgac
aatataaataatttaggaaatgaaatagacctaaaccattctggccttaaaaaacatgat
tcaaattcaaaaaaatttaattctaacaaaaatcaatatttagacaaaataaataaaaat
gaaaatatgttacatcaaaattctattcaatgtaaagataataacaaagatgaaattatc
acaaattcaaaattaaattattcatctaatagacaaaatcaaatttcaaacttttcagag
atatcaaaatcggcacaaaaccacgattcaattaattttaatatattaaacaataatagt
aataataagcatgacaatttaaatgatcatgaaataaataatttatatttatgtctaaaa
aaatacactaaaaattctgaacaaagtcatattttttatgaatatagcttgattgatcag
aatttagctgataaattagatcaatttataattatcaataatcgctatattttgaaagaa
aaaaaaaaatatagtattaatcccgaatatattttgcataatactcaaaatatattttct
cttgaatcgaaagatatatgtcgtgattatcaatatccgttttattctccacattcatct
gatttatcatctattgagtttgaaacattggactgcaataatgaaatggctacctctcca
gagggagctttaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaattatgcacaaaatacc
aaacaaaacaatgcagatatcagtgatgaaacgagtcaacttccaaataatataaattat
ttcgattcaaatttatgctttcctaagattgagaaaaatataataaacattaccaactta
ggatctcatacaataaaaaaagcgcattgttattattataattctcgaaaaaatgatgac
ataattgatccattagaaaatttaaatgaatctaatattagtgcagcgttaatgtcaaat
gaaaacggtgcatctaacgaattaatagatgtaaattattcagatatatcttctcgttcc
tctgctaactctgttttaacttacacatctgaaagtacagattattatctagacattatt
gaagaagaattagcagaatcagtttatactagcaaaatttatgaccacaaaaaagaagca
aaacgggctcaaaataatagcaaaaaaaaaaaaactaaaaattttaataatataaaaaat
caagatgaagaatacacacataataatatttataataaaaaaacgaatctttctttatca
gaatatgaccacgtcataagtaaatccgaattaataccaagcacctataataatgtagag
acaacaaatgattctatatataatatggaatcacacctagataatattcattatgaaaaa
agcatccaaattaaaagcatagataatgcccccaaaataaatgacaaaattgacgactca
aataatataggaattaatttaatttctaataatactacattacacatagatacagattct
ataaaggatataacccattcttataataatgccatactagaaatgaaaaacggtaccaat
gatatgaatgatgatgacaaacctactactcaacatattgacattgatcaaaattttaaa
aataataacctcagtaaaaaagcaaatagaatcattaaaaaatgtggaggtataccaagc
aaagaagaacccattttgcctttttatgttatatgtgattatttagattttgtagaaaga
aaaatgtatgttaacagattcagatttaaattatatgatcctatatatcaattaggaaaa
tatcgaaattgttcaggcgttatattaaaaagtgatttaaaaaaaagttgtttaaattat
attgattcacattttttatttttaaaaaaagaattatgtaaaatagatttagatatagat
atcagatgtccaacaaaacaaatatttaaacatgtctgctataaaatgaatattgatcct
actcatatattaatatatccttaccccccattgaatagtccaattaatttcattccatat
aatatagattcatttacttgtccgcccgaacacgaaaatgattcttatcatcaatattct
gacaatatgaattgtaatgatcctaattatacagatgaaaacacaaattctgcatctggg
caaatttcttttgaaactttaataaaacaacgcactatggaattagaacataattcttta
actgagcaaaaaacattttgtttatctttgttgccatttcattataaatattttacgaga
ctatatcctcatgattctccaaaatattttcattatgttattcaattatttaattcacat
gtacaatcgatttctgcatttactggtcatattaaattgaaaagggcgaaaaagaaacat
accataggtaatggtaacgatttgaagtctaataactattacaacttagatgcagaaagt
gtcgattctacatctagttcagataattctagtagcacctttgccaataatgaatatgat
tcaaatgattataccaccgttcaagatctaatagataaaatcaagttagaaatgaatcca
tatttaaaaaaaagaggaatcaatccaaaacataaatttagattattatttacctttgga
cctaaaattaaatatttgaacagcaacgaacaattaatacatctggattttgtaaaaacc
aatcacattaaaaatatatatgtaaccccccttcgaatggaaccagactttacggatcaa
cagaagcaaatgctcgaagcgaatcaattgaagataattcatgtttttaatcaaaccccg
tccaaagaagttttcggatacagttttgacgttttagtagagcctaatgacactatgcta
gaaataaagaacaaaataagaaagagaacaattttaccgaaatatatatttgacaaaata
acattctttgaatatgaaaatgggcaaagaatttggagatctaacgacgatattataaac
tggaataacaaacaatatgccattatcattggagaacaccatgcgccatcgcaatcaaaa
ccacagataggaatgaaaatagcatag
DBGET
integrated database retrieval system