Plasmodium berghei: PBANKA_0613800
Help
Entry
PBANKA_0613800 CDS
T01111
Name
(RefSeq) protein SDA1, putative
KO
K14856
protein SDA1
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pbe03009
]
PBANKA_0613800
Ribosome biogenesis [BR:
pbe03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
PBANKA_0613800
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SDA1_HEAT
Plasmodium_HRP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55148711
NCBI-ProteinID:
XP_034420638
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(590066..593137)
Genome browser
AA seq
1023 aa
AA seq
DB search
MNDVKTKRQRVLNHLQHNIYKNAELYSTEFYEQFDKFLFNYSMLLLNASKKNELLCSQLS
FLCHTSHFFSKKKNEKNLKKVDAEKGLINQKGINSEHEEKYIKEVNINEPEIAETDIGNY
SDISIDFGSSSSSIGDKDEDKLENQESRNCNADANTDSSARCNPLQNQDNIINLSNEGKN
NCDINEEEIVFQTNIIENKKKEILSKLNEQTEEVITLINQREEHNKNPLLLYSELNEYIN
FLMIKNKEDINYVEELYFLCCQLVIHYKNNLYPSILLSIVKTFKQIKKYINYVKYIQILI
YMSDIPIHRIKGYIYKCVSNMIIYINKKTKDEKLKNYVLDLLHEAFAENSQRKIIKKKYS
SNINNFVYFKNIKINESMNNFACSILIEMIKKNIYTQKKKNINIISEGIFYKNIKIVKCV
AYALLGKYDIKEFSIKINKDIENKNKNIDELKSISNQTHQKMTKAKIKRLHLKKEKIMDE
LSNNKNLSDDETDVYASNYVNYLFIDSLFDPYSFASKIFNIIYTKYRSNNNNNIKILLLN
ILCRIYQRYKIIEENFFLYFENTIYHLKNKNTLSKYLSIFIQSLHDDIPVQYVQRIVYVL
IKKFLLLNLSEEFVYLIINSIIEIIIKCPNCLNDEIFESVLIFKDYKNKNISILIRRFIN
VAKNTNPHVMSKKLWDKKTAMLVQREKLLPTLSSTRHDQSLLQYSYLLDRASRRKRGRDN
EVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEE
EVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDVKE
EAEGGAKKGEINVNRKKARREKKIKNELMIQKKNEEILSEKILTDDDFKKLKKMKEYIEN
NKNIVLSELAEICNDEYDDDTESDSEKEKIITEDQLLYKKKLKKKEIIKIKNTNNGESRF
KTNKEKEKKKSVMMLMQKLKKKKSAITQYGKLKKKLKGKLASRAKKRQIINKRIAKKLSR
RKR
NT seq
3072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgatgtaaagacaaagagacaacgggttctaaaccatctacaacacaacatctat
aaaaatgcggagctgtatagtactgagttttatgagcagtttgataaattcctttttaat
tatagcatgcttttattaaacgcgtcgaaaaaaaacgaattattatgcagtcagttaagc
tttttatgtcatacaagccacttttttagcaaaaaaaaaaatgaaaaaaatttgaaaaaa
gtagatgcagaaaagggtctaatcaatcaaaaaggaatcaatagtgaacatgaagaaaaa
tatataaaggaggtaaatataaatgaacctgaaatagcagaaactgatattgggaattat
tctgatataagcatagactttggaagtagtagcagcagtattggagataaggatgaagat
aaattagaaaaccaagaaagtcgtaattgcaatgcagatgcaaataccgattcgtctgct
agatgtaaccctttacagaatcaggataatataataaatttatcaaacgaaggaaaaaat
aattgtgatataaacgaagaggaaatagtttttcaaacaaatataatagaaaataaaaaa
aaagaaatattaagtaaattaaatgagcaaaccgaagaagttattacattaataaatcaa
cgtgaagaacataataaaaacccattgttattatatagtgaattaaacgaatacataaat
tttttaatgattaaaaataaagaagatataaattatgttgaagaattatattttttatgt
tgccaattagttattcattataaaaacaatttatatccaagtatattactaagtatagtc
aaaacatttaaacaaataaaaaaatatataaattatgtaaaatatattcaaatattaata
tatatgagtgatatcccaattcatagaataaaaggatatatatataaatgtgttagtaac
atgattatatatataaataaaaaaacaaaagatgaaaaattaaaaaattatgttttagat
ttattacatgaagcttttgctgaaaatagtcaaagaaaaattataaaaaaaaaatattca
tctaatataaataattttgtatattttaaaaatatcaaaataaatgaatctatgaataat
tttgcatgtagtatacttatcgaaatgataaaaaaaaatatttatactcaaaaaaaaaaa
aatataaatataatatcggaaggaatattttacaaaaatataaaaatagtaaaatgtgtt
gcatatgcattattaggaaaatatgatattaaagaattttcaataaaaataaataaagat
atagaaaataaaaataaaaatattgatgaattaaaatctataagtaatcaaacacatcaa
aaaatgacaaaagcaaaaataaaaaggttgcatctaaaaaaagagaaaattatggatgaa
ctttctaataataaaaatttatcggatgatgaaacagatgtatatgcatctaattatgtt
aactacttatttatagattcattatttgatccatattcatttgcatctaaaatatttaat
attatatatacaaaatatagatcaaataataataataatattaaaatattacttttaaat
attttgtgtcgaatctatcaacgatataaaatcatagaagaaaatttttttctgtatttt
gaaaatacgatttatcatttaaaaaataaaaatacattgtcaaaatatttatcgattttt
attcaatcattacatgatgatataccagtacaatatgtacaaagaattgtctatgtttta
atcaaaaagtttttgcttttaaatttatcagaagaatttgtttatttaattattaattca
ataattgaaatcattattaaatgcccaaattgtttaaatgatgaaatatttgaatctgtc
ttaatatttaaagattacaaaaataaaaatatttccatacttattcggcgatttattaac
gttgcaaaaaacacaaaccctcatgttatgtctaaaaaattatgggataaaaaaacagct
atgttggttcagcgtgaaaagcttttgccaactttgtcttcaactcgacacgaccaatca
ctcttacagtattcatacttgctcgatcgagcctcaaggaggaaacgtggtcgtgataat
gaagtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggta
gatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgca
gaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaa
gaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggta
gatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgca
gaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaagtagatgtaaaggaa
gaagctgaaggaggggcaaaaaagggagagataaatgtgaaccgaaaaaaagcaaggaga
gagaagaagataaaaaatgagttgatgatacaaaaaaaaaatgaagaaatattaagtgaa
aaaatattgacagacgacgattttaaaaaattaaaaaaaatgaaagaatatattgaaaat
aataaaaatatcgttttgtccgaattagcagaaatatgtaatgatgaatatgatgatgat
acagagagtgacagcgaaaaggaaaaaataataacagaagatcaattattatataaaaaa
aaattaaaaaaaaaagaaattattaaaattaaaaatacaaataatggagaatctcgattt
aaaaccaacaaagaaaaggaaaaaaaaaaatcagttatgatgcttatgcaaaaattaaaa
aaaaaaaaaagtgcaataacacaatatgggaaacttaaaaaaaaattaaaaggaaaacta
gcttctagagcaaaaaaacgacaaatcataaacaaacggattgctaagaaattaagtagg
cgcaaaagataa
DBGET
integrated database retrieval system