KEGG   Plasmodium berghei: PBANKA_0613800
Entry
PBANKA_0613800    CDS       T01111                                 
Name
(RefSeq) protein SDA1, putative
  KO
K14856  protein SDA1
Organism
pbe  Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pbe00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:pbe03009]
    PBANKA_0613800
Ribosome biogenesis [BR:pbe03009]
 Eukaryotic type
  Pre-60S particles
   Other pre-60S particles
    PBANKA_0613800
SSDB
Motif
Pfam: SDA1_HEAT Plasmodium_HRP
Other DBs
NCBI-GeneID: 55148711
NCBI-ProteinID: XP_034420638
LinkDB
Position
6:complement(590066..593137)
AA seq 1023 aa
MNDVKTKRQRVLNHLQHNIYKNAELYSTEFYEQFDKFLFNYSMLLLNASKKNELLCSQLS
FLCHTSHFFSKKKNEKNLKKVDAEKGLINQKGINSEHEEKYIKEVNINEPEIAETDIGNY
SDISIDFGSSSSSIGDKDEDKLENQESRNCNADANTDSSARCNPLQNQDNIINLSNEGKN
NCDINEEEIVFQTNIIENKKKEILSKLNEQTEEVITLINQREEHNKNPLLLYSELNEYIN
FLMIKNKEDINYVEELYFLCCQLVIHYKNNLYPSILLSIVKTFKQIKKYINYVKYIQILI
YMSDIPIHRIKGYIYKCVSNMIIYINKKTKDEKLKNYVLDLLHEAFAENSQRKIIKKKYS
SNINNFVYFKNIKINESMNNFACSILIEMIKKNIYTQKKKNINIISEGIFYKNIKIVKCV
AYALLGKYDIKEFSIKINKDIENKNKNIDELKSISNQTHQKMTKAKIKRLHLKKEKIMDE
LSNNKNLSDDETDVYASNYVNYLFIDSLFDPYSFASKIFNIIYTKYRSNNNNNIKILLLN
ILCRIYQRYKIIEENFFLYFENTIYHLKNKNTLSKYLSIFIQSLHDDIPVQYVQRIVYVL
IKKFLLLNLSEEFVYLIINSIIEIIIKCPNCLNDEIFESVLIFKDYKNKNISILIRRFIN
VAKNTNPHVMSKKLWDKKTAMLVQREKLLPTLSSTRHDQSLLQYSYLLDRASRRKRGRDN
EVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEE
EVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDAEEEVDVKE
EAEGGAKKGEINVNRKKARREKKIKNELMIQKKNEEILSEKILTDDDFKKLKKMKEYIEN
NKNIVLSELAEICNDEYDDDTESDSEKEKIITEDQLLYKKKLKKKEIIKIKNTNNGESRF
KTNKEKEKKKSVMMLMQKLKKKKSAITQYGKLKKKLKGKLASRAKKRQIINKRIAKKLSR
RKR
NT seq 3072 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgatgtaaagacaaagagacaacgggttctaaaccatctacaacacaacatctat
aaaaatgcggagctgtatagtactgagttttatgagcagtttgataaattcctttttaat
tatagcatgcttttattaaacgcgtcgaaaaaaaacgaattattatgcagtcagttaagc
tttttatgtcatacaagccacttttttagcaaaaaaaaaaatgaaaaaaatttgaaaaaa
gtagatgcagaaaagggtctaatcaatcaaaaaggaatcaatagtgaacatgaagaaaaa
tatataaaggaggtaaatataaatgaacctgaaatagcagaaactgatattgggaattat
tctgatataagcatagactttggaagtagtagcagcagtattggagataaggatgaagat
aaattagaaaaccaagaaagtcgtaattgcaatgcagatgcaaataccgattcgtctgct
agatgtaaccctttacagaatcaggataatataataaatttatcaaacgaaggaaaaaat
aattgtgatataaacgaagaggaaatagtttttcaaacaaatataatagaaaataaaaaa
aaagaaatattaagtaaattaaatgagcaaaccgaagaagttattacattaataaatcaa
cgtgaagaacataataaaaacccattgttattatatagtgaattaaacgaatacataaat
tttttaatgattaaaaataaagaagatataaattatgttgaagaattatattttttatgt
tgccaattagttattcattataaaaacaatttatatccaagtatattactaagtatagtc
aaaacatttaaacaaataaaaaaatatataaattatgtaaaatatattcaaatattaata
tatatgagtgatatcccaattcatagaataaaaggatatatatataaatgtgttagtaac
atgattatatatataaataaaaaaacaaaagatgaaaaattaaaaaattatgttttagat
ttattacatgaagcttttgctgaaaatagtcaaagaaaaattataaaaaaaaaatattca
tctaatataaataattttgtatattttaaaaatatcaaaataaatgaatctatgaataat
tttgcatgtagtatacttatcgaaatgataaaaaaaaatatttatactcaaaaaaaaaaa
aatataaatataatatcggaaggaatattttacaaaaatataaaaatagtaaaatgtgtt
gcatatgcattattaggaaaatatgatattaaagaattttcaataaaaataaataaagat
atagaaaataaaaataaaaatattgatgaattaaaatctataagtaatcaaacacatcaa
aaaatgacaaaagcaaaaataaaaaggttgcatctaaaaaaagagaaaattatggatgaa
ctttctaataataaaaatttatcggatgatgaaacagatgtatatgcatctaattatgtt
aactacttatttatagattcattatttgatccatattcatttgcatctaaaatatttaat
attatatatacaaaatatagatcaaataataataataatattaaaatattacttttaaat
attttgtgtcgaatctatcaacgatataaaatcatagaagaaaatttttttctgtatttt
gaaaatacgatttatcatttaaaaaataaaaatacattgtcaaaatatttatcgattttt
attcaatcattacatgatgatataccagtacaatatgtacaaagaattgtctatgtttta
atcaaaaagtttttgcttttaaatttatcagaagaatttgtttatttaattattaattca
ataattgaaatcattattaaatgcccaaattgtttaaatgatgaaatatttgaatctgtc
ttaatatttaaagattacaaaaataaaaatatttccatacttattcggcgatttattaac
gttgcaaaaaacacaaaccctcatgttatgtctaaaaaattatgggataaaaaaacagct
atgttggttcagcgtgaaaagcttttgccaactttgtcttcaactcgacacgaccaatca
ctcttacagtattcatacttgctcgatcgagcctcaaggaggaaacgtggtcgtgataat
gaagtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggta
gatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgca
gaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaa
gaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggta
gatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgca
gaggaagaggtagatgcagaggaagaggtagatgcagaggaagaagtagatgtaaaggaa
gaagctgaaggaggggcaaaaaagggagagataaatgtgaaccgaaaaaaagcaaggaga
gagaagaagataaaaaatgagttgatgatacaaaaaaaaaatgaagaaatattaagtgaa
aaaatattgacagacgacgattttaaaaaattaaaaaaaatgaaagaatatattgaaaat
aataaaaatatcgttttgtccgaattagcagaaatatgtaatgatgaatatgatgatgat
acagagagtgacagcgaaaaggaaaaaataataacagaagatcaattattatataaaaaa
aaattaaaaaaaaaagaaattattaaaattaaaaatacaaataatggagaatctcgattt
aaaaccaacaaagaaaaggaaaaaaaaaaatcagttatgatgcttatgcaaaaattaaaa
aaaaaaaaaagtgcaataacacaatatgggaaacttaaaaaaaaattaaaaggaaaacta
gcttctagagcaaaaaaacgacaaatcataaacaaacggattgctaagaaattaagtagg
cgcaaaagataa

DBGET integrated database retrieval system