Plasmodium berghei: PBANKA_0703700
Help
Entry
PBANKA_0703700 CDS
T01111
Name
(RefSeq) ATP-dependent RNA helicase DBP10, putative
KO
K14808
ATP-dependent RNA helicase DDX54/DBP10 [EC:
5.6.2.7
]
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pbe03009
]
PBANKA_0703700
Enzymes [BR:
pbe01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.7 DEAD-box RNA helicase
PBANKA_0703700
Ribosome biogenesis [BR:
pbe03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Helicases
PBANKA_0703700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DEAD
Helicase_C
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55148868
NCBI-ProteinID:
XP_034420783
LinkDB
All DBs
Position
7:175716..178931
Genome browser
AA seq
1071 aa
AA seq
DB search
MKLKKNTKKNTLKNTKKSYVKKNEKGNSSRRSYGIGKKTSNKLDKEKHINKLNKNRAPNS
KKKYSWLFDKNENIEKSDNDENEPKKGIKKKFVLYKNRKKKGKVVLSCFQNLGLSKQMCK
SISTNLKYNRPTNIQKLCIPKILNKKDVICISETGSGKSLVYLSTLIDMLKDHNKFFGIR
GLIILPTKELVIQIYKLAKKICTNYFNLKINIIIGGISLCKQFEILKENIDILICTPGRF
SYILDETKLSLEKVEMIIIDEADRLLELNYYNDMNNIYKCIGNKNLNKQTILVSATLPTN
VENYFKLKLNNPEIVFVNSDNNISSQINLHFLFCRSYEKYAILIKLILLFKQQKLGKTII
FFCTKYHILFFSKILNFLKINHSILYGNSDTSFRFNQINNFTKHEDIQFLLVTDLASRGI
HIPSVQNVINYNLPFSPKIFLHRIGRACRTECQSGYGISIVTYQDILYAYEICFFIGKKL
KFIKKSTTNSIPHLEQNTNILKEEIETSKNEIINNGKENSVYLGAIQNISEYLELIDHVK
KIDSELISLNKSIDMSYKLYYSMRPKVSKYASTKFIKKIKKIGGIYKLCLLNHPNPIYDI
PENIETKKNKRENKNDEVMNEIDNVFENLTNYLKNNTNSQKNEQNIIDSNNINMDNPNNT
YESDHIKNESQNRLNNESNLLEAYKDMNINQQISKNFPQNYIESFLHEFQYKNNTKLKNI
SEEIKEKLDKLKEKIQKNKNIKNNYMSNDINGLLETITLGLNNEEIQNWENEELEYNNNF
DKTNILDEEKNKNEKKKKLSKRAQKKLEKKKNTNQLDGIQKKKDISLDEILKKINDKKMK
RDSNNKILELNAPGFDLLPDEEEELNKQRFVKKQIWDKKKNKFVLTEVDKFQDKKINKKM
DAKPTSDKNTTSIYQKWVKRTKNRIKNVGELEDNYDNNKRNKIKEIFIENQKTYEQDMKQ
TNLKVLKETHPEITEALSKNIKLTKKQQRIYKKYITGKYNNQNTNELKTLNQIQQDKKKQ
LKKRLKTDRNFRAKYSHIMKKKHQQKLEKIKNLKSARSRSLAIVRKKIEKK
NT seq
3216 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacttaaaaaaaataccaaaaaaaataccctaaagaacaccaaaaaaagctatgta
aaaaaaaatgaaaaaggaaatagcagtagacgtagttatggaattggaaaaaaaacaagt
aacaagcttgataaagaaaaacatataaataaattaaataaaaatcgtgcaccaaattca
aaaaaaaaatattcttggctatttgataaaaatgaaaatatagaaaaaagtgataatgat
gaaaatgaaccaaaaaaaggaataaaaaaaaaatttgttttatataaaaatcgaaaaaaa
aaaggaaaagttgttttaagctgttttcaaaacctaggattaagcaaacaaatgtgtaaa
agtataagcactaatttaaaatataatagaccaacaaatattcaaaaattatgtatcccc
aaaatattaaataaaaaagatgttatttgcattagtgaaacaggatctggaaaatcacta
gtctatttaagcacattgatagatatgttaaaggatcataataaattttttggaattaga
ggtttaataatattaccaacaaaagaactagttatacaaatatataaattagcaaaaaaa
atatgcacaaactattttaatttaaaaataaatataataataggaggaataagtttgtgt
aaacaatttgaaatactaaaagaaaatatagatatacttatatgtacacccggaagattt
tcatatatacttgatgaaactaaattaagtttagaaaaagttgaaatgattattattgat
gaagcagatagattgttagaactaaactattataatgatatgaataatatatataaatgc
ataggaaataaaaatttgaataaacaaacaatattagttagcgcaactttaccaacaaat
gttgaaaattattttaaattaaaattaaataatcctgaaattgtttttgttaattcagat
aataatataagctcacaaattaatttacattttttattttgtagatcatatgaaaaatat
gctatactcattaaattaattttattgtttaaacaacaaaaattaggaaaaactattatt
tttttttgcacaaaatatcatatattattttttagtaaaattctaaattttctaaaaatt
aatcattcaatattatatggaaattcagacacatcctttagatttaatcaaattaataat
tttacaaaacatgaagatatacaatttcttttagttacagatttagcatccagaggtatt
catattccatctgttcaaaatgttattaattataatctaccattttctccaaaaatattt
ttacatagaatcggaagagcatgcagaactgaatgccaatcaggatatggcatatctatt
gttacatatcaagacattttatatgcatatgaaatatgcttttttattggaaaaaaatta
aaatttataaaaaagagcacaactaattctattccgcatttggagcaaaatacaaacata
ttaaaagaagaaatagaaacttctaaaaatgaaataataaataatggaaaagaaaatagt
gtatatttaggagcaatacaaaatataagcgaatatttagaacttatagatcatgttaaa
aaaatagatagcgagttaatatcattaaataaaagtatagatatgtcgtataaattatat
tattctatgcgcccaaaagtatcgaaatatgcaagtactaaattcataaaaaaaattaaa
aaaataggaggaatatataagttatgtttgcttaaccatccaaatcctatttatgatata
ccagaaaatatcgaaacaaaaaaaaacaaaagagaaaataagaatgatgaagttatgaac
gaaatagataatgtttttgaaaatttaacaaactatttaaaaaataatacaaattctcaa
aaaaatgaacaaaatataattgattcaaacaatataaatatggacaatccaaataataca
tacgagtcggatcatattaaaaatgaatctcaaaatcgattaaataatgaatctaactta
ttagaagcatacaaagatatgaatattaaccaacaaatttctaaaaattttccacaaaat
tatatagagtcttttttacatgaatttcaatacaaaaataataccaaattaaaaaatata
tcagaagaaattaaagaaaaacttgataaattaaaagaaaaaattcaaaaaaataaaaac
ataaaaaataattacatgtcaaacgatattaacggcctattagaaacaataacccttggg
ctcaataatgaagaaattcaaaattgggaaaatgaagaattagaatataataacaatttt
gataaaacaaatatattagatgaagaaaaaaataaaaatgagaaaaaaaaaaaactaagc
aaaagagctcaaaaaaaattagaaaaaaaaaaaaatacaaaccaacttgatggtatacaa
aaaaaaaaagacatatctttagatgaaatattaaaaaaaataaatgataaaaaaatgaaa
agagattctaataataaaatattagaattaaatgcacctggttttgatttacttccagat
gaagaagaagaattaaataaacaacgttttgttaaaaaacaaatttgggataaaaaaaaa
aacaaatttgtattgacagaagttgataaatttcaagataaaaaaataaataaaaagatg
gatgcaaaaccaacatctgataaaaatacaactagtatatatcaaaaatgggtaaaacga
acaaaaaatcgaataaaaaatgttggagaattagaggataactatgataataacaaacga
aataaaattaaagaaatatttatagaaaatcaaaaaacttatgaacaagatatgaaacaa
acaaatctcaaagtactaaaggaaacgcatcctgaaataactgaagccttatctaaaaat
ataaaattaacaaaaaaacaacaaagaatatataaaaaatatattactggaaaatataat
aatcaaaataccaatgaattaaaaactttaaatcaaattcaacaagataaaaaaaaacaa
ttaaaaaaacgactaaaaacagatcgaaactttagggcaaaatattctcacataatgaaa
aaaaaacatcaacaaaaactcgagaaaattaaaaatttaaaaagtgcccgatcgagatcc
ttggctattgttagaaaaaaaatcgagaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
