Plasmodium berghei: PBANKA_1104700
Help
Entry
PBANKA_1104700 CDS
T01111
Name
(RefSeq) trafficking protein particle complex subunit 8, putative
KO
K20305
trafficking protein particle complex subunit 8
Organism
pbe
Plasmodium berghei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pbe00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
04131 Membrane trafficking [BR:
pbe04131
]
PBANKA_1104700
Membrane trafficking [BR:
pbe04131
]
Endosome - Golgi transport
Tethering complex
TRAPP complex II
PBANKA_1104700
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TRAPPC-Trs85
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55150409
NCBI-ProteinID:
XP_034422256
LinkDB
All DBs
Position
11:199745..206527
Genome browser
AA seq
2225 aa
AA seq
DB search
MAHIIEKELKNIIKDIYVSPILTNSSRIAKREISFFFGLDINELLNSLGGSDCLIIDEKE
NIDLSLNASININYINKNNTLSEKTLSNKNLKLSFIDVDDYENLKLEHIEKVLIDTISYN
EPQYSDIYNKSNLDAYFSKNNKDDIYTNIKYFEHICLNSKIIHNHIKNDIKKRQIQNSQY
DSNTFADQKLGKINTKKKKKSQHTNDSTTSDSSSEQNNITRIQKYNAFFLPWFYNYFKTS
WKYMHLYNSLPISPLGIICICSTKDNDIINLYKSMINYNIKKNNVYTNPNIPKCIILLHV
SNSDDDEIETDVQKNFVNIQSNFLNYKCHLLIIKARRFIDAWNKYYNDKEPQINLNFHNS
LSRNINEPNENIPQDIKQTIEKNTYIIDNEKDKQFDNVIYENNKYINESQTKQYPKLNYI
QKFYAKYLTPNPFKEINNNSNISVYKNVKDVEDFQKIKKELTNLNKIYEYINSDNIIYIC
KNTPLYIDNIYFCSCLNHIDIISLKIFIHNFIKTKVLSYITSITNNINNLILSNKKSIKN
QLKFMWKKTKFSFTTSDAALYVAEQTGNAIISAAHNVLASNIDISQGKSSFKNTQLIDGT
NNNNQTNYSTYENEKIIQKNDPENYDKNLNFGVVGNDHYDSALQKNKEEGIITNISKIEN
IEENEMNTYNKESLEHMYKTLSDIYFILEEYELSYNILKICINEFKHSKEYGYLANLYEL
FSLCIFNMNNVNKKDILYYLDMSYQMYYKIFYLNNMFICSIINYYMSIVCEIKTEEAASI
LANANFDFSCIDDKINTKNSMSKLEFQINNIRSALLLEQITYSYKKHKHNKIKNKNSSFI
IDNIQKNNFPRTASQEIPMNHQNQIKELTYNTSTNSLVDGKDMHKTETDKHIKSVNNNNN
SVIYNTKNDALYIHNMRQGDVYAQNRDNNSNFEHIKKINKMDEIEDVNQTNNLKYKSRKY
LFDLTLAGHTFNKCGFKKLALFCYSKSLKKYEKKKMKHIYEHLHFMMARQAFSINLYYEA
LQHYICILNSISKYYEQSYVLNKNIDIYSTSIDKEINYIREFAYVYKIYMDKVLNMFTKL
NGKEVNTFSENDYIFRIDHGNSENSNISYTFNKYNNPDDIIKPLNLKIPLICQRNDESLF
ANSIYVSKTNIYKLKKNNSINNINYFDIFENNLFKIKNYNTTILDMYSIMSKDINYTYSD
NINCLNYLFITYKNFINAIYNNLIDLENSEIYVPENVMQKKNECSNETHQNIKNENIEIS
EKTNQNTIITNNYINQNYNFFQKSVNISPFFSIENKNLFISYTNELRQKLKNSIEFSNSA
QIKNIYQTNFSKHELQINNKYIQYATKNDFIFVTFTLNNPLHTKVECQATHLCAYFYNKK
INQDIIVEKKILILEPKESRTFTLYLRPLKHGLLFISGIVWDLFGLVKTYQNFYTHGLKQ
LNKKFDKIHKLKYDEIFNVDDDIQKKQKIIKKLNKENNKYIWSNSIGMIQKRSLKKTDSY
EIDHRLLYYIYDKTHLFDFIFENIYSKDRRKQNNYEVDLIELLEGEGMEIKFKIVNHSEI
PLTYLSLCITPCTLFTCYKLVYNSNRTFHILSDISNSSQKCYNTESNNDNPVFVYNELYC
ENYVDINNCSVFKQKFKNKNIQNIKIKGNFKKNDTFVLYLKVDTTYSGFHKCMITMLCGN
DINNNTDSNKQTNNINNNSLIYPDMFIEKKQCSYLFFRMINVIPIIKLITYPLNKYNSEQ
NFIYFLFHNLCKNGIYLYNLYLEHTNNNTDKKEKYVHMNFTEKNVETEHKYIKLFNFYSS
NILFIKKKQTLTSLFYSDKNIIHNNISENYSLNNTHVLTPPLYTSFFLNINWIFKQSGIL
KKGCIKKKVIFPNDILTFSIDLFDKDIFINNKKDKLIKIGVNIYNNSNFDIFDCYVHARE
MEAMSFLSSIDENDDKASITSFDDNDTESIDYKYMNCDYEDQNVYDQNNEHSSEHNSDFS
EIYEHLTKDFKNIKSDNFIKNEHIENQTKIEEKNKIISHYSYKSVLYDEINIQKNSINAK
MNISKYNPITENYYKSDNNDFEISVLNYSSCFNNKNNEDIQNMKKKLNYSSEKNNITDFP
LDLPQKYKLTHQKKKKKLYKHFVHNTFIHDYNNPNDFLRLTYDEINKRENKNPEHFISIN
GFTFVGIIQKHIKKIKKHTQKKIFFNILFTKEGIYNINKFHVVFKLNGEFFMFKPLNELI
VQIHK
NT seq
6678 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacatataattgaaaaagaattaaaaaatataataaaagatatatatgtatcccca
atattaactaatagtagtagaatagcaaaaagagaaatatcatttttttttggattagat
attaatgaattattaaattcattgggtggatctgattgtttaataattgatgaaaaagaa
aatatagatttaagtttaaatgctagcattaatataaattacataaataaaaataataca
ttatctgaaaaaacattaagtaataaaaatttaaaattatcttttatagatgtagacgat
tatgaaaatttaaaattagagcatattgaaaaagtcttaatagatacaatttcatacaat
gaaccacaatattctgatatatataataaatcaaatttagatgcatattttagtaaaaat
aataaggatgatatttatacgaatataaaatattttgaacatatatgcttaaattcgaaa
attattcataaccatataaaaaatgatataaaaaaaagacaaatccaaaattcacaatat
gattctaatacttttgcagatcaaaagcttggaaaaatcaacacaaaaaaaaaaaaaaaa
agtcaacacacaaatgattccactacatctgattcttcttctgaacaaaataatataact
cgtatacaaaaatataatgctttttttttgccatggttttataattattttaaaacttca
tggaagtatatgcatctatataatagtttacctatttcccctttaggtattatatgcata
tgtagcacaaaagataatgatattattaatttatataaatctatgattaattataatatt
aaaaaaaataatgtatatactaatccaaatattcctaagtgtataatactactacatgta
tcaaatagcgatgatgatgaaatagaaacagatgttcaaaaaaattttgtaaatattcaa
tcaaattttttaaattataaatgtcatttattaattataaaagctcgtagatttatagat
gcatggaataaatattataatgataaagaaccgcaaataaatttgaattttcacaatagt
ttatcaagaaatataaatgaaccgaatgaaaatatacctcaagatataaaacaaacaata
gaaaaaaatacatatatcatagataatgaaaaagacaaacaatttgacaatgtaatatat
gaaaataacaaatacataaatgaatcacaaacaaaacaataccctaagcttaattatatt
caaaaattttatgcaaaatatttaactccaaatccttttaaagaaattaacaataatagt
aatatatctgtttataaaaatgtcaaagatgtagaagattttcaaaaaataaaaaaagaa
ttaactaatttaaataaaatatatgaatatataaattcagataatataatatatatatgt
aaaaatacacctctatatattgacaatatatatttttgttcgtgtttaaaccatatagat
attatatcattaaaaatatttatacacaattttataaaaacaaaagtactttcatatatt
acttcaattactaataatataaataatctaatattaagtaataaaaaaagtataaaaaat
caattaaaatttatgtggaaaaaaacaaagtttagttttacgacatctgatgcagcttta
tatgttgctgaacaaacaggcaatgctattatatcagcagcacataatgtattagcatct
aatatagatatttcgcaaggaaaaagtagttttaaaaatacacaattaattgatggaaca
aataataataaccaaacaaattattctacttatgaaaatgaaaaaattattcaaaaaaat
gatccagaaaattatgacaagaatcttaattttggtgtcgttggaaatgatcattatgat
agtgcattacaaaaaaacaaagaagagggaatcataactaatatatccaaaatagaaaat
attgaagaaaatgaaatgaacacatataataaagagtcattagaacatatgtataaaact
ttaagtgatatttattttattttagaagaatatgaactatcttataatatattaaaaata
tgtataaatgaatttaaacatagtaaagaatatggttacctagcaaatttatatgaatta
tttagtttatgtatttttaatatgaataatgtaaataaaaaagatatattatattatctt
gatatgagttatcaaatgtattataaaattttttatttaaataatatgtttatatgttct
ataattaattattatatgtctatagtttgtgaaattaaaaccgaagaagcggctagtata
cttgctaatgcaaattttgatttttcatgtattgatgataaaattaacacaaaaaacagt
atgagcaaattagaatttcaaattaataatattcgatctgctttattattagagcaaatt
acatatagttataaaaaacacaaacacaataaaattaaaaataaaaattcaagttttata
attgataatatccaaaaaaataatttccctcgcaccgcatctcaagaaattcctatgaat
catcaaaaccaaattaaagaactaacttataatacttcaacaaattcattagttgatggt
aaagacatgcataaaactgaaactgacaagcatattaaatctgtaaataataataataat
tcagtaatatataacacgaaaaatgatgcactatatattcacaacatgcgtcaaggtgat
gtttatgcgcaaaatagagacaataattcaaatttcgaacatattaaaaaaataaataaa
atggatgaaatagaagatgttaatcaaacaaataacctaaaatataaatcgagaaaatat
ttatttgatttaacattagcaggccatacatttaataaatgtggatttaaaaaattagct
ttattttgctattcaaaatctttaaaaaaatatgaaaaaaaaaaaatgaaacatatatat
gagcatttgcatttcatgatggcacggcaagcatttagcataaatctatactatgaagca
ttacaacattatatatgtattttgaattctatatctaaatattatgaacaatcttatgtt
cttaataaaaatattgatatatattcaacctcaattgataaagaaattaactatattcga
gaatttgcttatgtttacaaaatatatatggataaagtattaaatatgtttactaaactc
aatggaaaagaagttaataccttttcagaaaacgattatatttttagaattgatcatgga
aatagcgaaaatagtaacatatcatacacatttaataaatacaacaatcctgatgatatt
ataaaacctttaaatttgaaaattccattaatttgtcaaagaaatgatgaaagtttattt
gcaaattcaatttatgtatctaaaacaaatatatataaattaaaaaaaaacaatagtata
aataatattaattattttgatatatttgaaaataatttatttaaaataaaaaattacaat
acaactatactagatatgtatagcattatgtcaaaagatattaattacacttatagtgac
aatattaattgtttaaattatttatttattacttataaaaattttattaatgccatatat
aacaatcttatagatttagaaaatagtgaaatatatgtccctgaaaatgttatgcaaaaa
aaaaatgaatgttcaaacgaaactcaccaaaatataaaaaatgaaaatattgaaatatct
gaaaaaacgaatcaaaatactattatcacaaacaattatatcaatcaaaattataatttt
tttcaaaaatcagtaaatatttctccatttttttccatagaaaataaaaatctttttatt
tcatatacaaatgaattaaggcaaaaacttaaaaatagtatagaattttctaatagtgct
caaattaaaaatatatatcaaacaaatttttcgaaacacgaacttcaaattaataataaa
tatattcaatatgcaacaaaaaatgattttatttttgtaacttttactttaaataatcca
cttcacacaaaagtagaatgccaagccacacatctatgtgcatatttttataataaaaaa
ataaatcaagatattattgttgaaaaaaaaattcttattttagaacccaaagaatctcga
actttcacattatatcttcgcccgctaaaacatggattactatttatatcaggaattgtt
tgggatctgttcgggctcgtaaagacatatcaaaatttttacacacatggattaaaacag
ttaaacaaaaagtttgacaaaatacataaattaaaatatgatgaaatatttaatgtagat
gatgatatacaaaaaaaacaaaaaataattaaaaaattaaataaagaaaataataaatat
atatggtctaatagtataggaatgattcaaaaaagaagtttgaaaaaaacagatagttac
gaaatagatcatagattattatactatatatatgacaaaacacatttatttgattttata
tttgaaaatatttattctaaagacagaagaaaacaaaataattatgaagttgatttaata
gaactattagaaggagagggaatggaaatcaaattcaaaattgttaatcattcagaaata
cctctaacatatttgagtttgtgtataacaccgtgtaccttgtttacatgttataagctt
gtttataatagcaatagaacatttcatattttaagtgatatatctaattcctcacaaaaa
tgttataacacagaatcaaataatgataatcctgtttttgtatataacgaattatattgc
gaaaattatgtggatataaataactgttccgtttttaagcaaaagtttaaaaataaaaat
atacaaaatataaaaataaagggaaattttaaaaaaaatgacacatttgttttatatctt
aaagttgatacaacatatagtggatttcataaatgtatgataactatgttatgtggaaat
gatataaataataataccgattcaaataaacaaacaaacaatataaataataattcttta
atatatcctgatatgtttatagaaaaaaaacaatgttcttacttatttttcagaatgatt
aatgttatacctataattaaacttatcacatatcctttaaataagtataacagtgaacaa
aattttatttatttcctttttcataatttatgtaaaaatggaatttatttatataattta
tatcttgaacatactaacaataatacggataaaaaagaaaaatatgtacatatgaatttt
acagaaaaaaatgtagaaacagaacataaatatataaaattatttaatttttattcttca
aatattctatttataaaaaaaaaacaaactttgacatctctgttttattcagataaaaat
ataatacacaacaacatttcagaaaattattctctgaataatacacacgttttaacccca
cctctttacacttccttctttctaaacataaattggatatttaaacaatctggtatttta
aaaaaaggatgtataaaaaaaaaagtcatatttcccaatgatatattaactttttctatt
gacctatttgacaaagacatatttataaataataaaaaagacaaacttataaaaattgga
gttaatatatataacaattcaaatttcgatatttttgactgttatgtacatgccagggaa
atggaagcaatgagctttctttcctcaattgatgaaaatgatgataaagcaagtattaca
agttttgatgataatgatacagaatctatagattataaatatatgaattgtgattatgag
gatcaaaatgtttatgaccaaaataatgaacacagttctgaacataattccgatttttct
gaaatatatgaacatctaaccaaagattttaaaaatatcaaatctgataattttataaaa
aatgagcatattgaaaatcaaactaaaatagaagaaaaaaataaaataatttctcactat
tcttataaatcagtgttatatgatgaaataaatattcaaaaaaattctataaatgcaaaa
atgaatatatcaaaatataaccccataacggaaaattattataaaagtgacaataatgat
tttgaaatatcagttttgaattattcttcatgttttaataataaaaataatgaagatatt
caaaatatgaaaaaaaaattaaattatagttcagagaaaaacaatattacagattttcca
cttgacttgcctcaaaaatataaattaactcaccaaaaaaaaaaaaaaaaactttacaaa
cattttgttcataatacatttatacacgattacaacaaccctaatgattttcttcgatta
acatatgatgaaattaataaaagagaaaataaaaatcctgaacattttatttcgataaat
ggttttacatttgtaggaataatacaaaaacatattaaaaaaatcaaaaaacacacacaa
aaaaaaatattttttaatatcctttttacaaaagaaggaatttataatataaataaattt
catgtagtgtttaagttgaatggtgaattttttatgtttaaacctttaaatgaattaatt
gtccaaatccacaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
