Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_3203
Help
Entry
PC2016_3203 CDS
T06565
Name
(GenBank) neutral peptidase B
KO
K01399
pseudolysin [EC:
3.4.24.26
]
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Pathway
pcar01503
Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
pcar02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
PC2016_3203
09160 Human Diseases
09175 Drug resistance: antimicrobial
01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
PC2016_3203
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01002 Peptidases and inhibitors [BR:
pcar01002
]
PC2016_3203
Enzymes [BR:
pcar01000
]
3. Hydrolases
3.4 Acting on peptide bonds (peptidases)
3.4.24 Metalloendopeptidases
3.4.24.26 pseudolysin
PC2016_3203
Peptidases and inhibitors [BR:
pcar01002
]
Metallo peptidases
Family M4: thermolysin family
PC2016_3203
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M4
Peptidase_M4_C
Sde0182_C
PKD_4
HYR
FTP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ73385
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(27237..33545)
Genome browser
AA seq
2102 aa
AA seq
DB search
MYKTLSSGLIAFCFINSLSSHAAVSQRVNKSSASEINSLLNHNVALASKASAGSYFIEVE
SSGSVSAKQTSLSKKMQQHFAGVPIWGQQITVQSSNQHISGFFAKNISLKSLNNTANSQF
DEYSAVNALLIKAKLVDSTSYKVINNQRYIYIDNGAAHFVRLIELDVTENGVEKKPIGLV
SESDYRVFKLWNNIHSAHGTGPGGNTKTGQYEYGTDTEALDITQRDGMCFLENDKVKTVT
MESGFEPSEAYSFACDRNTHKEVNGAFSPLNDAHAFGTAVFDMYQQWYNTAPLTFQLLMR
VHSGNNWENATWNGQAMTFGDGADNFYPLVSLDIVSHEVSHGFTSQNSNLIYSDQSGGIN
ESFSDMAGETAEYFLRGETDWLSGADISKIDPALRYFETPSLDGLSIDRASDYYSGMDVH
FSSGVFNRAFFLLSNTTGWDPKKAFEIMLFANQNYWVNSSDFIDGACGAINSAIDLRYSA
NDVISAFNEVGVTCDNIQFIDADTDLMDDNWELLYGLDPSDAADAALDLDQDGLTNLEEY
TANTLPNSADTDSDDLSDYDEINVYLTEPNNADSDSDRMPDGWEVSFSLNPLNADDAQLD
LDSDTWSNVIEFFGNSDPSDASSEPVVFPETTFDFDDAAVPDLLISSNLQTPWVTTQINE
DSGFVLTNNDITDNQSTSVEFSFLNSEQGYVNFNYALDTEVGYDYFTVYINGSVVLDESG
VSEWKSASFPVAAGLNTVKFKYSKDVSVSTPADAVYIDNLYIGPNFPDADNDGMSDSWEL
LYNLDMTNSEDASLDADNDGLSNLLEFLNAGLPNNSDTDGDTIPDGWEYNNSLDLTNSSD
ASEDADSDGFSNLTEYLANTDPQSNTSFPVALNLTTSFEGSALPSWMVETEGSSAPWFIT
DGFSTDGVQSIRSGIINDSQFSGFTVTGLFEESVLAFDYKIESESCCDFLTITIDGQPVF
DRAERGNSNISEVTSILLNISEGLHNIEFKYYKDGYASSGADTVWLDNFALFSQSDLTDT
DNDQLPDYWELVNGLNRLDASDAASDADTDGLTAFEEFNLGTNPNSADSDGDELSDGYEV
SNDLLPLDAADANLDYDADGYTNIQEFYSQSLANDAMSLVQTFSQLNESFEDGLLPTKFT
EIAINAWAWQANTDWFTEGNASLSSQLTPVSNVGGFAIAGLFEAGFINLDYWVNNTDALQ
ITLNGSPLEISNSIQARLLLPVDDGFNIIKVKYESLYLQQQPLSVDNITWSADIDLTSDF
DSDGIPDYWEAEYGLNALEPYDANYDADYDGLTNLQEYQLSGNPLSTDSDGDGIEDSEDS
HPGDASRGENSPPEFVSSLEPITVEATSQYTNITRLYTPLATDNGHLEPQVYTSSGSYFP
LGEHQITWIARDNVGNETAAIQTVTLVDTTPPVLQQYRFEVFGNTLVAIQDAIIDSRVVF
DDVSEIALIEIEDSFVFRTGNVPIPVSAVDGAGNRVSGEVTAMIYPEVSLQPITHVYQNG
NVLVDIFISGPNPYDYTGFSLKANNSTQYIRAEQHGPIKVELAREFLANATNISVIPNRN
AFIGKNDNSQLVFLSEAAQAQFITDFYQNGKAVNKTIQRSLPDFNATIKLVNLPSTGSDV
SLELIGPTGVDFYIYKTADSQWDVSFSANLSEQTNNIDLTLRVKQGDELLATKQTSLRIV
DSVIFDDPELDTDGDGIPDIEEGVGDSDKDGIADYLDSTSTTNTAILASGDSAHSIDEFN
HLAVGSIKEALAAGYIADMSISEQALSTYFPDLDIIEPHFQAKSDVINLHVTLSNSSSTA
EIALPEHVNSILSSDMQVRLLTASGWQSAPILSGNVYEQACSRCFSFAITDGSSFDLDGE
VNGVIEIVAKLAQESLNQAPVLNVDMPATIEELATIELDASASTDPDGDTLSYEWRVDHP
QLSIAAEDTQGKAVLSVGEFEQTVDANVTLVISDGYEQFTEVFTVTFLHVNQLPSVELST
YSVSVEEAKQVTVTASASDKESSELTFKWVQTMGIEVAIDDVDSNTLKFTAPSVSQTTEL
GFKLVVSDGEGETEQSLTVTVTNVASTASSSREDSSGGGGSLAFILLLLTCAVAYRRALI
FK
NT seq
6309 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtataaaacactctcatcaggattgattgcgttttgctttataaactcgctcagttca
catgcggcggtttcgcagcgtgttaataaatcatccgcatcagaaattaactcgctttta
aatcataatgtagcattagccagcaaagcatctgcgggttcttactttatagaagtagaa
tcttctgggtctgtttctgctaagcaaactagtttatcaaaaaaaatgcagcagcatttt
gcaggtgtgcctatttggggccagcaaattacagtgcagtctagcaatcaacatattagt
ggtttttttgctaaaaatattagcctcaaatctttaaacaacacagctaatagccagttt
gatgaatactctgctgttaatgcacttttaattaaagctaagcttgttgattcaacctct
tataaagttatcaataaccaacgatatatttatattgataacggagcagcacattttgtt
cgcttaattgagttagatgtcactgaaaatggtgtagaaaaaaaaccaataggcttggta
agcgaatctgattaccgtgtatttaagctgtggaataatattcacagtgcgcatggcacg
gggcctggtggtaatacaaaaacaggccagtacgaatacggtacagacaccgaagcgttg
gatataacgcagcgtgatgggatgtgttttttagaaaacgataaagttaaaactgttacg
atggagtctggctttgagccaagtgaagcgtactcttttgcctgtgatcgcaatacacat
aaagaggtgaatggggcattttctcctttaaatgatgcgcatgcatttggtacggctgta
tttgatatgtatcaacagtggtacaacacggcgccacttacttttcaattattaatgcgt
gttcacagcggtaacaattgggaaaatgccacatggaatggtcaggcaatgacttttggt
gatggtgccgataatttttatccattggtatcccttgatattgtttctcatgaagtcagc
catggttttaccagtcaaaattctaatttaatatattcagatcaatcgggtggtattaac
gagtctttctctgatatggctggtgaaacagctgaatattttttacgtggagagactgat
tggctatctggcgctgatatttctaaaatagatcctgcacttcgttattttgaaacgccg
tcactagatggactttcaattgacagagcgagcgattattactcaggcatggatgttcat
tttagtagcggtgtttttaatcgcgctttctttttactttcgaatactactggatgggat
cctaaaaaagcgtttgaaataatgctttttgctaatcaaaattattgggttaactctagt
gactttattgatggtgcctgtggcgctataaactcagccattgacctaagatacagtgca
aacgatgtaatctcagcattcaatgaagtaggtgttacctgcgataacatccagtttatc
gatgctgatactgatttaatggatgataactgggaactcctttacggattagacccaagc
gatgccgctgatgctgcacttgatttagaccaagatggtttaactaatcttgaggagtac
acagctaatactttaccaaattcagcagataccgactcagatgatttatcagactacgat
gaaataaatgtatatcttactgagcctaataatgcagactctgactctgaccgcatgcct
gatggctgggaagtatcgttttcattaaacccattaaatgcagatgatgctcaacttgat
ttagactcagacacatggagtaatgtaatcgagttttttggtaacagtgacccttcagac
gcaagctctgagccggtcgtttttcctgaaacaacctttgacttcgatgatgcagctgtt
ccagatttgcttatttcgtcaaatttacaaacgccttgggtaacaactcaaattaatgaa
gattctggctttgtgttgactaataacgacattacagacaaccaatcaaccagtgttgag
tttagctttttaaatagcgagcaaggctatgtaaactttaactacgcattagacacagaa
gttggttatgactattttactgtttatattaatggttcagttgttttagatgaatctggc
gttagcgagtggaaaagtgcttcgtttcctgttgctgccggacttaatacagttaagttt
aagtattctaaagatgtatccgtttctactcctgcagatgctgtatatatagataattta
tatatagggcctaattttcctgatgcagataacgacggtatgtctgattcttgggaatta
ctgtacaaccttgatatgactaacagtgaagatgcttcacttgatgctgacaacgatggc
ctatctaatcttttagagtttttaaatgctggtttaccaaacaactcagacaccgatggc
gatactatccctgatggctgggagtataataatagtttagatttaaccaactcttcagat
gcatcagaagatgcggacagtgatggcttttcaaacttaacagagtacttggcaaacact
gacccgcagtctaatacttctttccctgttgctttaaatcttacgacctcttttgaaggc
tctgcactacctagttggatggttgaaacagaaggttctagtgctccttggtttattaca
gatggcttttcgactgacggtgtgcaaagtattcgttcaggtattatcaacgactcacag
tttagtggttttactgtaacaggtttatttgaagagagtgtattagctttcgattataaa
attgaatcagaatcttgctgtgactttttaactattactattgatgggcaaccagttttt
gaccgtgctgaacgaggtaattcaaatatctcagaagtaacgtctattttgcttaacata
agcgaagggcttcataatattgaatttaaatattataaagacggttatgcttcatcgggt
gctgatactgtatggcttgataactttgctttattttctcaatctgatttaacagataca
gacaatgaccaacttcctgattactgggaattagttaatggattaaatcgccttgacgca
agtgatgcagcctccgatgctgatactgatgggcttacggcgtttgaagaatttaaccta
ggaacaaatccaaattcagcagattcagatggtgatgaactcagtgatggatatgaagta
agtaatgaccttttaccattagatgctgcagatgctaatttagattacgatgcggatggt
tatacaaatattcaggagttttactctcaaagccttgctaatgacgcaatgtcattagtg
cagactttttcgcaattaaacgaaagttttgaagatggtcttcttccgactaagtttact
gaaattgccatcaatgcttgggcttggcaagctaacaccgattggtttacagagggtaat
gcaagtcttagttcacaattaacgcctgttagtaatgtgggtggatttgctattgctggg
ttatttgaggctggttttattaacttagattactgggtcaataatactgacgcgttgcaa
ataactttaaatggtagccctttagagataagtaatagtattcaggctcgtttattgtta
ccagtagatgatggttttaacattattaaagttaaatatgaaagtttataccttcagcag
caaccgttatcagttgataatattacttggtctgcagatatagaccttaccagcgacttt
gattcggacggtatccctgattattgggaggccgaatatgggctaaatgcgttagaaccc
tacgatgctaattatgacgccgactatgatggtttgactaatttacaagagtatcaactt
tcgggtaacccgcttagcactgattcagatggcgatggtattgaagacagtgaagatagc
cacccaggtgatgcaagccgcggtgaaaatagtccgcctgagtttgtatcaagccttgag
ccaattacggttgaagcgacttcacaatatactaatattacccgtctatatactccactg
gcgactgataacgggcatttagaacctcaagtatatacaagttcagggtcttactttcca
ctaggtgagcaccaaattacatggattgcacgtgataatgttggcaatgaaacagcggct
attcaaacggttacactagttgatacaacgcctccagttttacagcagtatcgttttgaa
gtttttggtaatacgctagtagcgatacaagatgcaattattgacagtagagttgttttt
gacgatgtgtcagagatagcgcttattgaaatagaagatagctttgtatttagaacgggt
aatgtgccaattcctgtttctgctgttgatggtgcaggtaaccgcgtatcgggtgaagta
acagcgatgatctatcctgaagttagtcttcaacctattacgcatgtataccaaaatggt
aatgtacttgttgacatatttatcagtggccctaatccatatgattacaccggtttttct
ttaaaagctaataatagtactcagtatattagagctgagcagcatggacctattaaggtt
gagttagcgcgcgagtttttagcaaatgctacaaatataagtgttatacctaatcgcaat
gcttttataggcaaaaatgataacagccaactcgtgtttttaagtgaagcggcacaggcg
cagtttattactgatttttatcaaaatggtaaagcagttaataaaactattcagcgttct
ttacctgactttaatgcaaccattaagttagtaaatttaccgagtacaggtagtgatgta
tcacttgagcttattggccccacaggtgttgatttttacatttataaaacagctgattca
cagtgggatgtttcatttagcgcaaatctttctgagcaaaccaataatatagatttaact
ttacgtgtaaaacaaggtgatgaactactagcaactaagcaaactagtttacgtattgtt
gatagcgttatatttgatgaccctgagctagatactgatggcgacggtatacctgatatt
gaggaaggggtaggtgatagtgataaagatggtattgctgattacctagatagcacttct
actactaatacagctatcttagcttcaggtgatagtgctcacagtattgatgagtttaat
cacttagctgtaggtagcattaaagaggctctagcagcgggttatattgctgatatgtct
atttctgaacaggcacttagcacttatttcccagatttagacattatagagcctcacttc
caagctaaaagtgatgttattaaccttcatgttacgctttctaattcatcaagtaccgca
gaaattgcgctgcctgaacacgtaaattctattttaagctctgacatgcaagtgaggtta
ttaaccgcttcaggttggcagtctgcccctattttgtcaggcaatgtgtatgagcaagca
tgctcacgctgttttagttttgcaattacagacggtagttcatttgaccttgatggagag
gttaacggcgttattgaaatagttgcaaaactggcgcaagagagtctaaatcaggcgcct
gtattaaatgtggatatgccagcaacgatagaagagcttgctactattgagcttgatgcg
tctgcttctactgacccagatggagatacgttatcttacgagtggcgtgttgatcatcct
cagttatctattgcagctgaagatacacaaggtaaagccgtgcttagcgttggtgaattt
gaacaaactgttgatgcaaatgttactttggtaatatctgatgggtatgagcagtttact
gaagtatttacagttacttttttacatgtaaatcaattgccgagtgtagagctaagtaca
tattctgtttcggttgaagaagctaagcaagttactgttacggcctctgcaagtgataaa
gagtcatctgagcttacgtttaagtgggttcaaacaatgggaattgaagttgctattgat
gatgttgactctaacacccttaagtttacagcgccgagtgtttctcaaactacagagtta
ggctttaaacttgttgtatcagatggtgaaggtgagactgagcaaagtttaactgttacc
gttactaatgtagcaagtacagcttcttcaagtcgtgaagatagcagtggcggtggtggc
tcattagctttcatattattacttttaacatgtgctgtagcttacagacgagcacttatt
tttaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
