Pseudoalteromonas carrageenovora: PC2016_3698
Help
Entry
PC2016_3698 CDS
T06565
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pcar
Pseudoalteromonas carrageenovora
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcar00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pcar02000
]
PC2016_3698
Transporters [BR:
pcar02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
PC2016_3698
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec
Plug
STN
FecR_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBJ73867
LinkDB
All DBs
Position
II:604372..607227
Genome browser
AA seq
951 aa
AA seq
DB search
MLKHVCTLNKRILVYFFIAVSCLTAMPSAAKNIHTFVYIPAGSLSDSLREVANAYAVSFS
SNPSLIDDKTTSTLIGDHTLAQALDYLLEDSELTYKIQNDGFVIFPKKVVNDNETLEEIT
VKGIRYSLARSRNLKHNNKTISEAISAQDITDIPNTNLAEALQYIPGVAITREAGEGRQV
SIRGSYPDFSLVTLNGMPVLANNDSPMDSRVQKQRDRSFDFNILPAELFKQIHVIKAYSA
DKIAGGISGTMALKTINPLDNEGFKFVITPELGYNDYTGTGATRYSSLISNTWNNWGVLA
SVAYTNRESLEQGANTFRWRNIAIEGADLSALTQSQAQHLTQGDYIIPRGNRYSVWQATQ
QRFGANLSVEYKNETTHVDFDMLSGFLKGDRHEYHLYPRGDQSTPIIIGLTTIKDIQANK
NNELVYARYENARVATESRAQKIKTAYQQGVLSLTQQVDQNWKINAILGNERSKYDIPFS
NKIYTQGVSDVTIDYRKTPFYADIKYSENLKNPTMWQMHHGDVEQYNSNSEYTFAKLDFQ
YDVNSLITLQFGADWTLFENKMNNAQQNDIFFNEIPDTPQQLIDLPASYVSSQNAHKKQQ
WLKINTNEALKLYGIDPFNVQANNFLITTKAEHIKEYSRGAYTLLSTEQEKWEAHIGVRY
QSESITSYTQAPYSPILYSLWLPTFNGSYFINDNWRFRAGLSKNYSKPLLNSLNFDGSND
TPSSTKYIFNSNLKPYLSYNSDISLEADFSSHSSFNISLFYKDLEDYIVTTQAPLFEGSP
PTTSDSQLLWLSNAETAYQWGAEVSLNYLIHNSDWGINIQAAYNKGKVTYYDSNNGTALF
KKNLPFLSKITASSMIFYDHPKFNFKLGAIFRDKYLVRAGSLLLDENETGFMPTTYWDAS
VNYYFSNYWKLKFSAFNLSNEQERQYSNSTLRAYNSTTSGRTFYLGLSYQY
NT seq
2856 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctaaaacatgtgtgtacattaaataaacgtattttagtgtacttttttattgctgtt
agttgcttaacagcaatgccaagtgccgcaaaaaacatacatacgtttgtttatatacct
gccggttctctcagtgacagcttaagagaagtagcaaatgcgtatgcagtctcttttagt
agtaacccttcacttatcgacgacaaaactacatccaccttaattggcgatcatacactt
gctcaagcattggattatttgttagaagacagtgaattaacatataaaattcaaaacgat
ggttttgttatttttccaaaaaaagtagtaaacgataacgaaacacttgaagaaataaca
gtaaagggtatccgctattcgttggctcgctcacgaaacttaaaacacaataataaaacg
attagcgaagcaatttcagcacaagatattaccgatataccaaatactaacttggctgaa
gccttacagtatattccgggtgtagccattactcgcgaagctggcgaaggacgccaagta
tcaatacgtggcagttatcctgattttagtttggtcacacttaacggcatgcctgtctta
gcaaataacgattcaccgatggatagccgagtgcaaaaacagcgcgatcgttctttcgat
tttaatatattacctgccgaactatttaaacaaattcatgtaattaaagcctattctgcc
gacaaaatagcaggtggaatatctggtactatggcactgaaaactataaaccccttagat
aatgaggggtttaaatttgttattacccctgagcttggctacaacgactatacaggtact
ggcgcaacgcgttattcaagcttaatttctaacacctggaataattggggggtacttgca
agcgttgcgtacacaaacagagaatcgttagagcaaggcgctaatacatttcgctggcga
aatattgccatagaaggcgctgatctctcggcgttaactcaatcacaagctcagcattta
actcaaggcgattatataatccctcgcggtaatcgctactcggtatggcaagcaacccag
cagcgctttggggcaaacctatctgtagagtacaaaaatgaaaccacccatgttgatttt
gatatgctctcaggttttttaaaaggtgataggcatgaatatcatttatacccaaggggg
gatcagtcaacgcctataattatagggctaacaacaattaaagacattcaagctaataaa
aataatgagcttgtgtatgcacgttatgaaaatgcaagagtcgctactgaaagtagagcc
caaaaaataaaaacggcatatcagcaaggcgtgctctcgcttacacaacaagtagatcaa
aattggaaaataaacgccatattaggaaacgagcgctcaaagtatgacattcctttcagc
aataagatttatacccaaggtgtaagtgacgttacaattgattatcgtaaaacgccattt
tatgcagatattaagtacagcgaaaacttgaaaaatccgacgatgtggcaaatgcatcat
ggtgatgtagagcaatacaattcaaatagtgagtacaccttcgcaaaattagattttcaa
tatgacgttaatagtttaataactcttcaatttggggctgactggactctgtttgaaaat
aaaatgaataacgcacagcaaaacgatattttttttaatgaaatacccgatacaccacaa
caattaattgaccttcctgcatcgtatgtttcatcgcaaaatgcacataaaaaacagcag
tggttaaaaataaacacgaatgaggcactcaagctttatggcattgacccatttaatgta
caagccaataattttttaatcacgactaaagctgaacatataaaggaatatagcagaggt
gcttatactctattgagtacagagcaagaaaaatgggaggctcatataggtgtacgttac
caatcagaatctataacatcttacactcaagcgccttactctccgattttgtatagtcta
tggcttccaacttttaatgggtcatattttattaacgataattggcgatttcgtgcagga
ctttccaaaaactattcaaaaccattactaaattcactcaattttgatggctcaaacgat
acccccagtagtacaaaatacatatttaactcaaatctaaaaccttacttatcttataat
agcgatatttccttagaggctgattttagtagtcacagttcgtttaacatatcacttttt
tataaagatttagaggattacatagtcacaacacaagcgcctttatttgaaggttcgccg
cctacaacctccgatagtcaattactttggctaagtaatgcagaaacggcctatcagtgg
ggagccgaggtaagtttaaactacttaatacataattctgattggggcattaatatacaa
gctgcttataataaaggtaaagtcacctattacgactcaaataatggcactgctttattt
aaaaaaaacctgccttttttatctaaaattaccgcatcaagtatgattttttacgaccac
cccaaattcaattttaaactcggcgctatttttagagataaatatttagtgcgtgctggc
agccttttactcgatgaaaacgaaaccggatttatgccgaccacctattgggatgcaagt
gtaaattattatttttctaattattggaaacttaaatttagcgcatttaatctcagtaat
gaacaagagcgacaatacagtaattcaaccctcagagcttacaactcaaccacaagtgga
cgtaccttttacttagggttgagttatcagtattaa
DBGET
integrated database retrieval system
