Paenibacillus chitinolyticus: PC41400_24280
Help
Entry
PC41400_24280 CDS
T06610
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pchi
Paenibacillus chitinolyticus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLH
Cadherin-like
Glucodextran_B
fn3
Pur_ac_phosph_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QAV20629
UniProt:
A0A410X1Z0
LinkDB
All DBs
Position
5335822..5340075
Genome browser
AA seq
1417 aa
AA seq
DB search
MKLKLRKRRLTPIFLTFLLFFLSVLPVPFGINKAMAATNWQAIGNSLTGLNVEVTHDASA
PSLVQFNNEVYAAWSEGYNQNTIHIKKYNGTKWDYVDGGAGFQADASEAAMDPVMTVYNN
ELYITWRETSNKGNQIRVKKYNGSNWTFVDGGGSTGLNMNSPAAAYTPHLVVYKNDLYLI
WVENTNRYYQIRVKKFNGSAWTSADDGGDFGLNANPSLNANSPASVVYNGNLYISWDESD
WPKSRLRVKKYDGSTWSFVDGPKGLNNDDSSYAENGSLKVFNNALYAAYSEDNGSGRQLR
VKKFDGSSWASADGGGSVGLNVDASKDVRSPHFDVYDNALYLIWSEESGTNFGEEIRVKK
YDGTNWDEASQGIFALNTSRPVAMRPQLSATNDNLIAAWIEFNGYQYHIRVMKYDGAAWL
PAYEEINVGLNGNLIDAYDPDLKEYKDELYAAWVEAGKIKVNKYSNGSVLPVSGLQGLNV
DPTKVAESPKLAVFHNQLYAFWVERDNANVRVLRVKKFVDGSTWINDEDCCRNGLNADPL
NQALNPNLLTTDNGMYAVWAEAGRVGNDIQVKKFDGSWKSLGRAASYTFGDPSLAMFQNE
LYGSWLELNGNSYQTRVKKFNGQEWVYADNGEVGGTDDVSSSLIVFNNELYVVWGENSSD
RILLKVKRFDGIRWESVENIADSSGGKSLSALKVYGDTLFATWTEWTGRTERVRVKQFNG
TSWYAADDGGANGLNVDASRRAVAPVMEVHNGDLYVSWFEYNGVSNQIRMARYTGAIIPP
EPPVPPVNPVIPAPPTGLVATPGDGQAFLQWNSVTGATYYQVYQGTSPGSYGSSSAVTVS
GATYSTLITGLSNASTYYFAVQAGNADGVSPLSAEVSVIPQAGHKTELHTLALSQGTLTP
AFDFRTLAYTAEVPNIVSSLTVTASVYDPLSTLKVNGAAVLSGQKSSPINLAAGSNIISA
EVTAADGATKIYTINVTREAASSSSGGNSSGSDNSPSTPSGGQTTNDQNASGTVTFENGQ
KVINVSVDAAKLIEQLEKGGDKQTLVIPVNQDADKVSVTLNGDALKAMDNFKQAVIAIET
PNGSYKLPAAQIDFAALSAQFGQQVKPSDLSIRVDIAKSDATKVNFIGSAADKGQFTVMV
APVDFTVSATYKDKTVSLDQFSKFVEREIPIPSGIDPSKITTAVVLNDDGSIRQVPTRFI
TRGGISYAVVKSLTNSTYVLIAHQKTFTDTEEHWAKDIIHDMASRLVVNGVEDAHFAPNA
PITRAEFTAIIVRALGLDNKGKSLVFKDVDTTDWFNSAVAKAQEYGLIDGYEDGSFQPEK
TVTREEAIVMMVRAMKLADLEPNVNDTDIKSILATFADGASVDAWARQGVSAAVKSKLIN
GTDIGLLPKRDITRAESTVLIHRMLEKAELIDGVRTK
NT seq
4254 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaactgaaattgcgcaagcgaagattaacccctatttttttaactttcctgcttttc
tttctatctgttctgccggtgccgtttggcattaacaaggctatggccgcaacgaattgg
caggcgatcgggaacagcctaaccggtttaaatgtggaagttacacacgatgcttctgct
cccagtctcgttcaatttaataacgaagtttacgcagcgtggtctgagggctacaaccaa
aatacgattcatatcaaaaagtataacggtacgaaatgggactatgttgacggaggcgct
ggcttccaagcagatgcctccgaagctgcaatggaccctgtcatgacggtttataacaat
gaactgtacataacatggcgtgagacatccaacaaaggtaatcagataagagtcaaaaag
tataatggttctaattggacctttgtagatggtgggggcagtaccggcttgaatatgaat
tctccagctgccgcgtatacccctcatttggtagtttataaaaacgatctctacctcatc
tgggttgagaatactaacagatattatcaaatcagagtaaaaaaatttaacggttcggcc
tggacatctgcagatgacggcggtgacttcggattaaatgcgaatccttctttgaatgcg
aattcccccgcgtcagttgtttataacggtaacctatacatatcttgggacgagagtgac
tggcctaaatcccgattgcgggtcaaaaagtacgacggttcaacttggtcttttgtcgac
gggcctaagggtttgaataacgacgattcttcttatgcagaaaacggtagtctgaaagta
tttaacaacgctttgtacgctgcatattctgaagataacggatcgggaagacaactccgg
gtaaagaagtttgacggatcgagttgggcatctgctgatggcggcggcagtgtcggatta
aatgtggatgcttcgaaagatgtgagatccccacattttgatgtgtacgacaacgcattg
tacttgatttggtcggaggaaagcggcacaaattttggcgaagaaatccgggtaaaaaaa
tatgatggcacaaattgggatgaggctagccaaggcatttttgccctaaatacttcgcgg
cctgttgcaatgcgtccccaattatccgcaacaaatgataatctaattgctgcttggatt
gaatttaacggctatcagtaccacatcagggtcatgaagtatgatggtgccgcatggtta
cccgcttatgaagagatcaatgtcgggttaaatggaaatctgatagacgcatatgaccct
gatttaaaagaatataaggacgagttatacgccgcctgggttgaagcagggaagattaaa
gttaacaaatattccaatggatccgttttgcccgtatctggtctccaaggcttgaatgtg
gatccgacaaaagtggctgaaagtccgaaacttgccgtgttccataatcagttatacgca
ttctgggtagaacgcgacaatgcaaacgtccgtgtactgcgggtcaaaaaattcgtggac
ggatctacttggataaacgacgaggattgttgcagaaacggattaaacgccgatcctcta
aaccaagccttgaaccctaacctattgacaacggataacggaatgtatgcggtatgggcc
gaagcaggccgtgtgggaaatgacattcaagtgaagaaattcgatggaagttggaaatcg
cttggtcgagccgcttcgtatacgttcggcgatccgagcttagccatgttccagaacgaa
ttatacggatcttggttagagctgaacgggaacagttaccaaacgagagttaaaaagttc
aatggacaagagtgggtatatgcagataacggagaggttggcggtaccgacgacgtttcc
agctctttaatcgtgttcaacaatgaactgtacgttgtgtggggtgagaacagcagcgat
cggattcttctgaaagtaaagcgtttcgacggaatcagatgggagtcggttgagaacatt
gcggattccagcgggggtaaaagcctctctgctctgaaggtatacggcgatacactgttt
gcgacttggacggaatggactggacggaccgaacgagtgcgcgttaaacagtttaatggt
acaagttggtatgctgctgacgatggcggtgcgaacggtctaaatgtggatgcatcgaga
cgggcagtagctcctgttatggaagtacataacggcgacctttacgtttcctggtttgaa
tataacggggtgtctaaccaaatacgaatggctcgttatacgggagccattatcccgccc
gagccgccggtacctccggttaatccggtaattccggcgccgccgacgggacttgtcgca
acaccgggagacggacaagcgttcttgcagtggaacagtgttacaggcgctacttattat
caggtctaccaaggaacatcaccgggcagctacggctcctcctcggcagtgacggtaagc
ggagcaacttactctactctcattaccggcctctcgaacgcctcaacctattattttgcg
gttcaggcaggcaatgcggatggagtcagcccactttcggcagaagtgagtgtcataccg
caggcgggtcataaaacagaattgcacacattggctttgtctcagggaacgcttacgcct
gctttcgatttcaggactctcgcctacacggccgaagttccgaacatcgtctcgtcgtta
acggtgaccgcttcggtttacgatcccctttcgacattgaaggtgaatggagcggcagtt
ctgagcggtcaaaagagcagccctattaatcttgctgcaggaagcaatatcatctctgct
gaagtgactgcagcggacggagcgacgaaaatttatacgattaacgtaacacgggaggcc
gcatcctcgtcatcgggaggaaattcgtccggttccgacaattccccgagtacgccaagc
ggcggccagacgacgaatgatcaaaatgcttccggtaccgtaacattcgaaaacggtcaa
aaagttataaacgtatccgttgatgctgccaagctgatcgagcagcttgagaagggtgga
gacaaacaaacactcgtcatccccgtgaatcaggacgcggataaagtgtctgtgactctg
aacggagacgccctgaaagcaatggacaacttcaaacaagctgtgattgctattgagacg
cctaacggcagctacaagctgcctgccgcacagattgattttgctgctctatcagctcaa
ttcggccagcaagtgaagccaagcgatctttccatacgcgtagatattgcgaagagcgat
gcaaccaaggtaaacttcattgggtcagcggcggataaaggtcaattcaccgtcatggtt
gcgcctgtagattttacggtttcagccacttataaggacaagacggtaagtctggaccaa
ttcagcaaatttgttgaacgtgaaattccgattcctagcggcatcgaccctagtaaaatc
acgacggcagtcgttctgaatgacgatggatcgatccgtcaagtgccgacgcgcttcata
acccgtggtggcatcagctatgcggttgtgaagagcttaaccaacagcacttatgtactg
atcgcgcatcagaagactttcacagatacggaagaacattgggcgaaagacattatccat
gacatggcatcgcggctggtggtaaacggtgttgaagatgcgcactttgcgcctaatgca
ccgatcacgcgcgcggagttcactgcaattatcgtccgggcgcttggcctggataacaaa
gggaaatccctggtctttaaagatgtagatacaacggattggttcaattctgctgttgca
aaagcacaggagtacggcttaattgacggctacgaagacggtagtttccagcctgagaag
acggttactcgtgaggaagcgatcgtgatgatggtccgagccatgaaactcgcggatctg
gagccaaacgttaacgatacagacataaaatccattctagccacattcgctgatggcgct
tcggttgatgcatgggctagacagggcgttagcgcagccgtaaaaagtaagttgatcaac
ggtaccgatatcggactactgcccaagagagacattactagagccgaaagcactgtgctc
attcatcgaatgctggaaaaagctgaattaattgacggcgttcggacgaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
