Pedobacter cryoconitis: AY601_1560
Help
Entry
AY601_1560 CDS
T04341
Name
(GenBank) 4-alpha-glucanotransferase
Organism
pcm
Pedobacter cryoconitis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_77
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AMP98475
UniProt:
A0A127VB07
LinkDB
All DBs
Position
complement(1800869..1804831)
Genome browser
AA seq
1320 aa
AA seq
DB search
MFNPISTYRIQFHADFTFNDFRKLIPYVHQLGVKTIYASPIFTAVPGSMHGYDGLNPIQI
NPEIGSLAELKLIAKELAAVKMGWIQDIVPNHMAYDFRNPWLMDVLKKGEKSKYRNHFDI
ISQDLAKEPLMAPFLGAALEEEIANKNLSLVAQKGEWFLKYHESYWPLRKGTDLKGSILE
ITGQQFYRLCSYQESNERMNYRRFFTVNSLICLNMQSKITFDDFHVLIKELVDQKIFQGL
RIDHIDGLFDPKQYLENLRALCGKDVYIVAEKILEPGEILPAEWPIQGTTGYDYLGLANQ
LYTNEQSEKKFNNFYENLTDDHQSVEEQILEKKRKILSTAMQGELENLYQLLLNIIPEGP
ERMAIGDFGVFKHIISELLILCPVYRFYGNAYPLPPQEMEAMEKLFAALEKDKELVKPVQ
FIKKALLYEHISFYQRLMQFSGPLMAKGVEDTLMYTYNRHIGNNEVGDSPAVFGLKASDF
HEAILNRGENWPLTMNSTATHDTKRGEDARARLSILTDLKGEWLQQVKEWNVLNATDGAS
PDENDTYFIYQTLVSTYDEREDSEVYQKRFLDYIEKALREAKEKSGWENPDMDYEAATSA
FVKRILDTKREFWTVFSDFFRRLAHLGMVKSLSSLILKHGVPGIPDTYQGTELWDFSMVD
PDNRRPVDYALRVQYMDDFLKKSFHIKLLWQESSAGEIKLLILQKLLKFRAAYAELFRIG
LYIPLKVTGLHAADFIAFARRYKTDWAIFVVPVNVAALLNAQNNLHFELGDTQVVLPAGA
PSVYLDLIENQSCKAENSVLVLQDIFKSVPFGVLHQKVEHQERGAGILMHITSLPSAFGI
GDMGPEAFNFMDFLASSGQKYWQILPLNPLLDTQAYSPYASGSVMAANPVLISPELLIKD
GFLEPDVIKAKHRKVKRKVNFTSAVQEKKLMLSLAYQRFKQKSNGKDQAFSDFSSNEAYW
LEDYALYEVLKTLNDNKPWYEWQKELKDRELTALSKVREQHEDAINEVKWYQFIFFKQWN
ELKAQAVNLNIKLIGDLPFYAALDSCDVWANQELFEISPSGEMKAIAGVPPDYFNADGQL
WGMPVYNWKAMKKSNYEWWVQRIKRNIELYDLIRLDHFRAFSSYWEVPADSSSAKFGNWK
QGPGSQVFDVLEAHFGTIPFIAEDLGEIDAEVTALRDHYQLPGMKVLQFAFGEDSPASVH
APHNFTSVNCLVYTGTHDNNTTRNWYAKDISHGDRSRIDSYTGIKVSKRNIAQVLIRLAY
ASTAKVVIVPLQDILNKGAKARMNVPASIKRNWVWRVKSKELNDAIGVYLRDLVQLYGRS
NT seq
3963 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaatccgatctcgacttaccgcattcaatttcatgcggattttacttttaatgat
tttcgtaaattgatcccttatgtacatcaattaggtgtaaagacaatttatgcttcgcca
atttttactgctgttcctggtagcatgcatggttatgatggtttaaatccaatacagatt
aacccggagattggttccttagctgaacttaaattgatcgctaaagagctggctgctgta
aaaatgggctggatacaagatattgtacccaatcatatggcttatgattttcggaatccg
tggctaatggatgtgttaaagaaaggggagaaatcaaaatatagaaatcattttgatatc
atctcacaggatttagcaaaagaaccattaatggctcctttcctgggcgctgcactggag
gaagagattgccaataaaaatctttcactcgtagcgcaaaaaggggaatggtttttaaaa
tatcacgagagttactggccattgagaaaggggaccgacctgaaaggttcgatcctggag
ataaccgggcagcagttttaccggttgtgttcttatcaggaaagtaatgaacgaatgaac
tatcgccgcttttttacggtaaatagtttgatttgtctgaatatgcagtcgaagattact
tttgacgatttccatgtgctgattaaggaacttgtagaccagaaaatatttcagggattg
agaattgaccacattgacgggctttttgatcccaagcaatacctggaaaatttaagagcg
ctttgtgggaaggatgtttatatcgttgcggagaaaattttagaacctggagagatttta
cctgcggaatggccaatacaaggaactacaggatacgattatctcgggttagccaatcag
ctgtataccaatgagcagtcggaaaagaagtttaacaatttttatgaaaacctgaccgat
gaccatcagtctgttgaagaacagatcctggaaaaaaaacgtaaaattctaagtactgct
atgcagggggagcttgaaaatctctaccagcttttgctgaatattatacctgaaggacca
gaacggatggccattggcgattttggggtatttaagcacattatctccgagcttttaatt
ctatgcccggtttaccggttttatggaaatgcttatccgctgcctccacaagaaatggag
gctatggaaaagttgtttgcagcattagaaaaagataaagaactagtaaagccggtccaa
ttcataaaaaaagcattgctttatgagcatatatctttttatcaaaggttgatgcagttc
tccgggccgttaatggcaaaaggtgtggaagatactttaatgtatacttataacaggcat
atcggaaataatgaagttggagattctccggcagttttcggactaaaggcctctgatttc
catgaggctattttgaacaggggtgaaaattggccgttaactatgaattcgacggctaca
catgataccaaacgtggcgaagatgcgagggccaggctgagtatcctgactgatctcaaa
ggagaatggttacaacaggtgaaagagtggaacgtattaaatgccacggatggagcttct
cctgatgaaaatgatacttattttatttatcagaccttagtgtcgacttatgatgagcgc
gaagatagtgaggtttatcaaaagagattccttgactatattgaaaaagcattgcgggag
gctaaagagaagtccgggtgggaaaatccggacatggattatgaagctgcaaccagcgct
tttgtgaaaaggatattggatactaaacgtgaattctggactgtcttcagcgattttttc
cgaaggctggcacatctgggtatggtaaaatcgctgtcctctttaattcttaaacatggg
gttccagggattcctgatacttatcagggaactgagctttgggattttagtatggtagat
cctgataaccgaaggcctgtagattatgcattacgtgtgcagtatatggatgactttttg
aagaaatcattccatatcaaattattgtggcaggaaagctcggcaggagaaattaaattg
ctgattttgcagaaactgttaaagttcagggcagcatatgctgaattattcaggattgga
ttatatatcccgctaaaagttactggcctgcatgcagctgattttatagcttttgcccgc
aggtataaaacagattgggcaatatttgtggtacctgtaaatgttgcagcgcttttgaat
gcgcagaataatttacatttcgagttaggggatactcaggttgttttacctgcaggggct
ccttcagtttacctggatttaattgaaaatcagtcttgtaaagcggagaatagtgtactt
gtattacaggatatttttaaatcggtaccgtttggagtgctgcatcaaaaagttgaacat
caggaaaggggagctgggattttgatgcatattacatctcttccttctgcatttgggata
ggtgacatggggcctgaagcttttaattttatggattttctggcttcctcgggtcaaaaa
tactggcagatattacctttaaaccctcttttggatacacaagcttattctccatatgca
tccggttcggtcatggctgcgaaccctgttttaattagtcctgaacttttgatcaaagat
gggtttctggagcctgacgttataaaagccaaacatcgaaaggtgaaaagaaaagtcaat
tttacttcggctgttcaggaaaaaaagcttatgttaagcttggcttatcaacggttcaaa
caaaaatccaatgggaaggatcaggcattttcagacttttcttccaatgaggcttactgg
ctggaagattatgcattgtatgaagtcttaaagactttaaatgataacaagccgtggtat
gaatggcaaaaagaactgaaggacagggaattgacggccttatcgaaagttagagaacag
catgaagatgcaataaatgaggttaaatggtatcaatttatatttttcaagcagtggaat
gagttgaaggcgcaagcggttaacctgaatataaagttgattggcgacctgccgttttat
gctgcactggattcttgtgatgtatgggcaaaccaggagctatttgaaatcagtccttca
ggagagatgaaggcaattgcaggagttccgccagattattttaatgctgatggacagctt
tggggaatgccggtttacaattggaaagcgatgaaaaaatccaattatgaatggtgggtt
caacgaataaaaagaaatattgagttatatgatttaatccgtttggatcatttccgcgct
ttttcatcttattgggaagttcctgcagacagtagttctgcaaagtttggcaactggaaa
caggggccgggaagccaggttttcgatgttttagaagcccatttcggaactatcccattt
attgcagaggatttgggagaaattgatgctgaagtaacagcgcttcgtgatcactatcag
ctgcctggtatgaaggtcttacagtttgcttttggagaagatagtccggcgtccgttcat
gcacctcataattttacttcggtaaattgcctggtttatacgggaactcatgataacaat
accaccagaaactggtatgcgaaagatattagtcacggtgacaggtcaagaattgacagt
tatacaggtataaaggtttctaaaagaaacatcgcacaggtattgatcaggttagcttat
gcatcaacagctaaggtagtaattgttcccctgcaggatattttgaacaaaggggcaaaa
gcaaggatgaatgttcctgcatcgattaagcgaaattgggtatggcgtgttaaatcaaaa
gagttaaatgatgctataggtgtttatttacgtgatttagttcagctgtatggccgttcg
taa
DBGET
integrated database retrieval system
