Pectobacterium parmentieri SCC3193: W5S_0584
Help
Entry
W5S_0584 CDS
T02514
Name
(GenBank) Ig family protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
pec
Pectobacterium parmentieri SCC3193
Pathway
pec02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pec00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
W5S_0584
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
He_PIG
Big_9
DUF4347
Cadherin_5
Cadherin_4
BACON
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI88710
UniProt:
A0A0H3I4C3
LinkDB
All DBs
Position
complement(632066..640525)
Genome browser
AA seq
2819 aa
AA seq
DB search
MQWRHFLSSCSKRDRTSSDTVTDLSTPLGYALEARMMFDGAVAATVNQADAGQTASDAAH
NTASATTNDTQKDQSSAQTDHRTGQDATDTQDATSDIAVAGDTARKEVVFIDTSLTDYQT
LVDNVPTGIEVVLLDGSKDGLSQLAEWAKTHSGYDAIHVLSHGGEGELQLGSLTLDSKTA
DARAADLATLGAALTESGDLLLYGCEVAQSSGQSFVSLLAQITGADIAASNDTTGLGGDW
DLEIQTGVIEAAALQIDSYQHALHVSNTEVTLWIDGLDYSTNPVGPGSEVFLDLRDAASS
EWYIDIDPVASTITMTIRNGQGPYVGLESFDLVFNNITNGTLLAITSITKDNSVTTSEAK
LSASVIGTDKTITFHVDNDGTKGDGVLVWHFTSTNLGGSSDTLPSVSGSGTNPTYTENGT
DVGLFTNVIANTNDNGQTFTGATFTVTNVTDSTEYLNINGVKVSLINGNSVSLGSGYGSA
SVSLSAGTASISLSGAILSNADMGTLLSGMTYGNSSENPHTTARVVTLTQVTDSGASNNS
YSPGNIASTVTVVAVNDAPTDLALSNTTFGQSLGSNGIIGTLSATDVDSTTFTYSLVSGV
GSTDNALFTLSGSTLRAVNAATMAAGTYSVRIQVSDGQATYEKVVTLTVADDIAPTFDAT
PTITAPTVSGFTLNTDLNERGTIYYVVLSDGASAPSVTQVINGQNASGSLALAFGSQLAG
SAPYSQSLTLTGLAAATAYDVYVVARDSAGNATVSVVKLDVTTAASSTAPTLSATGSNPV
FIGGMAGAVDLFSGVSADTRDSGQTFNALTLTVSNVSDSGEFISVAGNTISLASNGSGTL
TGIGSYTVTRVGNTVTLQLSGMTASNTQFAGLVDGLRYGNNNSSVTAATRDVSLTAVSDS
GTSNNTTSLSLTSSVNVLASNSALYVTSGDDTGADASFGNSLQDDLNDGGGLSLREALHW
ANQTPGIDRIVFQTDVTLSSSILSPTETLLIDGQSFTLNGGGYSGFQITSSSLTFAIQNL
TLTHFTTTTNEFSGGVLGINTGALDINFRLYNVDITGNTDDGWGNGMIDLSNIQQGTYIF
DLDQVNIHGNTQLGGTDEEGVIKLSVSAQQTLSLSITNSAIYNNIGANAANGSIGVAGLY
LAASGSTNAPNTHVTLMNTTITGQDAGIQFHFTNEASSWVASVRNSIISGNTVDMVIHND
TTTNGSYTLNGGNNLIGSSVDLMSSSDPRLATTASNAINQGDRFSVTGNGDARGLDRVRQ
GAVDIGAYESQFTSGVSPQVDLNGAGSGSDYSATVSTGLSTGVPITDMLATLSQTDGDTR
LWTLTLALSGNTDGSNEYMTLSQQALLAAHAAGINVSGDGSQTLTLTGGATSEAFQTALR
AIVYVNVATTPSGGTRTINVTANDDASRSATSTLTLVVGNPPVVGTPIPSQSVVQDGSLN
FTIPAGTFTDPDVGDILTLGATLADGTPLPSWLTFNPATNTFSGTPGNADVGNLSIRVTA
TDGGNASVYTDFSLTVTNINDAPVVATPIPAQSVAQDDSLNFTVPAGTFTDPDVGDTLTL
SATLADGSPLPNWITFNPATGTFSGTPGNADVGTLSIKVTANDGDASVSTTFSLTVTNVN
DAPVVATPIPAQSVAQDGSLSFTVPAGTFTDPDGDTLSLSATLANGSPLPSWLTFNSATG
TFSGTPGNADVGTLSIKVIANDSGASISTTFSLTVTNANDAPVVATPIPAQSVAQDGSLN
FIIPAGTFTDPDGDTLTLSATLANGSPLPSWLTFNTATGTFSGTPVNADVGSLSIRITAT
DGSNASVYTDFSLTVTNVNDVPVVGTPIPAQSIAQDGSLNFTVPAGTFIDPDGDTLTLSA
TLANGSPLPGWITFNPTTGTFSGTPGNGDIGNLSIKVTANDGDASISTTFSLTVTPANQA
PVVSTPIPPQSVVQDGGFNFTVPAGTFSDPDGDTLTLSATLADGSPLPSWITFNPATGTF
SGTPGNADVGNLSIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTNVNDAPVVGTPIPAQSIAQDGSLNF
TVPAGTFIDPDGDTLTLSATLADGSPLPSWITFNPATGTFSGTPGNADVGNLSIRVTATD
GSSAAAHTDFGLTVTNVNDVPVVGTPIPAQSIAQDGSLNFTVPAGTFIDPDGDTLTLSAT
LADGSPLPSWITFNPATGTFSGTPGNGDVGNLTIKVTANDGDASVSTTFSLTVTNVNDAP
VVGTPIPPQSVAQDGGFNFTVPAGTFTDPDGDTLTLSATLADGSPLPSWLHFDPTIGTFS
GTPGNGDVGMLVIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTNINDAPVVGTPIPPQSVAQDGGFNFT
VPAGTFTDPDGDTLTLSATLANGSPLPSWLHFDPTIGTFSGTPGNGDVGMLVIRVTATDG
SNTSISTSFGLTVTNVNEAPVVSTPIPPQSVAQDGGFNFTVPAGTFTDPDGDTLTLSATL
ANGSPLPSWLHFDPTIGTFSGTPGNGDIGTLVIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTNVNDAP
VVSTPIPPQSVAQDGGFNFTVPAGTFTDPDGDTLTLSATLANGSPLPSWLRFDPTIGTFS
GTPGNGDIGTLVIRVTATDGSNTSISTSFGLTVTRSIIGGDPQFKANDGIGRTPSSSDAR
QLSTQDATTAPPTLNGLITNPSLGSFTVGNDGAPMSVMSAIFATGRQNTEGGTIPVSQVA
GTFGRGVASGIGINFDSTLGSFPSFSKDPALGGTSSLASAFSGIYLPSLMPMEVFSGGSW
KNIPIDSAGSTTNSTDDGTGRSVAFMPSLHQQLQQIGDSELQRLAAIEQALQESGQQQG
NT seq
8460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatggcgccatttcttatcttcatgcagtaaacgcgatcgtaccagtagcgacacg
gtgacagatttatcgacaccgctagggtacgcccttgaagcacgcatgatgtttgatggc
gccgtcgccgccaccgtgaatcaagccgatgccgggcaaaccgccagcgatgcggcacac
aacaccgcctcagcaacaaccaatgacacccaaaaagatcaatccagtgctcaaaccgac
caccgcacagggcaggacgcaacggatacccaggatgcaaccagcgacatcgcggttgct
ggggatactgcccgcaaagaagtggtgtttatcgatacctcattaaccgattaccaaacg
ctggtcgacaacgtacctaccggtatcgaggtggtattgctggatggcagcaaagatggc
ttaagccaactggcagagtgggcaaaaacccacagcggttatgatgcaattcatgtactt
agccacggtggtgagggcgaactgcaattgggttcgttaacgctggacagcaagaccgcc
gacgcacgtgccgctgatttagccacgctgggcgcagcgctgacggaatcaggagattta
ctgttgtacggctgtgaagtcgcgcaaagctccgggcagagcttcgtttctctgctggca
caaatcacgggggccgatatcgcggcctctaacgataccacgggtctgggtggagattgg
gatcttgaaatacagactggggtgattgaagccgcagcgctacaaatagacagttaccag
catgccttgcacgtcagcaacactgaggtgacactgtggatcgatggtctagattatagc
accaacccagtggggccaggcagcgaagtattcctggatttaagggatgcggccagttcc
gaatggtacattgatatcgacccagtcgcctcgaccatcaccatgaccatacgtaacggt
caagggccgtatgtggggcttgagtcgttcgacttggtgttcaataacatcactaacggc
acattactcgccatcacttcgatcaccaaggataacagcgtaaccaccagtgaggcgaag
ctttcagccagcgttatcggcaccgacaaaaccatcaccttccatgtcgacaacgacggt
acaaaaggcgatggggttttagtgtggcacttcacgtcgaccaatcttggcggtagcagt
gataccctaccaagcgtcagcggtagcggcaccaatccgacctacaccgaaaacggcacc
gacgtcggcttatttaccaacgtaatcgctaataccaacgacaatggacaaacctttacc
ggtgccacctttaccgtaaccaacgtaacagacagcaccgaatacctgaacatcaatggc
gttaaggtatcgctgatcaatggcaatagcgtctcactcggcagcggctacggttcggcc
agtgtctccctcagcgctggcacggcaagcatcagcctaagcggagcgatattaagcaat
gccgatatgggcaccttgctatctggcatgacctacggcaacagcagcgagaatccccat
accaccgcacgggtcgtgaccctgactcaggtcaccgattctggtgccagcaacaacagc
tacagccccggcaatatcgccagcaccgtcaccgtggttgccgtcaacgatgcaccaacg
gatttggcgctttccaacacgacattcggccagtctctgggcagcaacggtattatcggg
acgttatcggcaaccgacgtagactccaccacatttacctacagcctggtgagtggtgtc
ggcagtactgataatgcactctttaccctcagcggcagcacgctgagagcggttaatgcc
gccaccatggcagccggaacctattccgtgcgtatccaggtctccgacgggcaagcgacc
tatgagaaggtcgtcaccctaacggtggccgacgatatcgcgcctacatttgacgcgaca
ccgacgatcaccgcaccgacagtgagcggttttacccttaatactgacctcaacgagcgg
ggcaccatctattatgttgtgctctccgatggcgccagtgcaccgagcgtcactcaggtc
attaacgggcagaacgcctcaggtagcctggcactcgctttcggcagtcagttagccggc
agcgcgccctacagtcaatccctgaccctgacgggtttagccgccgccaccgcctatgat
gtgtatgtggtcgccagagacagcgccggtaatgccaccgtcagcgtcgtcaagcttgat
gtcacgaccgccgcaagcagcaccgcaccaaccctgtccgccacgggcagcaatccggta
tttattggcggtatggcgggtgctgtcgatctgttcagcggcgtcagcgccgacacgcgg
gacagcgggcagacctttaacgcactgactctgaccgtatccaacgtcagcgacagcggt
gaatttatcagcgtggcgggcaacaccatcagcctggcgagcaatggcagcggcacactg
accggcatcggcagttatacggtaacgcgcgtcggcaatactgtgacgctacagttgagc
gggatgaccgccagcaacacgcaatttgccggtctggtggatggcttacgctacggcaat
aacaacagcagcgttacggcggccacacgggatgtgtccttaactgccgtcagcgatagc
gggaccagtaacaacaccacgtcgctgagccttacgtcgtcagtgaatgtattagccagc
aacagcgcgctgtatgttacctctggagacgataccggcgctgatgcgtctttcggcaat
agcttacaagacgatctcaatgatggcggcgggctcagcctgcgcgaagcgttgcattgg
gccaaccagacccccggcatcgatcgtatcgtatttcagaccgacgtgacgctgagcagc
tccattttgtcacccaccgagaccctgcttatcgacggtcagagtttcaccctgaacggt
ggcggttattctggctttcagatcaccagttcgtcgctgacgttcgccatccagaaccta
accctgacccatttcaccaccaccaccaacgaattctcaggtggtgtgctggggatcaat
actggcgcattagatatcaacttcaggttgtacaacgttgatattacggggaacaccgac
gatggctggggcaatggcatgattgacctgagcaatattcaacagggcacctacatcttc
gatctcgatcaggtcaatatccatggtaatacccagttgggcggcacggatgaagaaggc
gtgatcaagttgtccgtgtcagcccaacaaacactctcgctgtcgatcaccaattcagcc
atctacaacaatattggcgccaatgcggccaatgggtcgattggcgtggcgggtctctat
ctggcggcaagcggcagcaccaacgcgcccaacacccatgtcaccttgatgaacaccacc
atcaccggtcaggatgctggtattcagtttcacttcaccaacgaagcgtcaagctgggtt
gccagtgtgcgcaactcgattatatcgggcaataccgtcgatatggtcatccataacgac
accaccactaacggttcctataccctaaatggcggtaataacctgatcggcagtagtgtg
gatctgatgtcatcgtcagatcctcgtctggctactacagccagcaatgccattaatcag
ggtgaccgtttctctgttaccggcaatggtgatgcgcgcggtctggatcgtgtgcgacaa
ggggctgtcgacatcggtgcttacgaatcacagtttacttcgggtgtgagtccacaagtg
gacctgaacggtgcaggctctggcagtgactatagcgctaccgtctctaccggtctgagt
acaggcgtgcctataaccgatatgctggcaacgctgtcacaaactgatggcgatactcgt
ctgtggacactgacgctcgcgctgtctggcaacacagatggcagtaacgaatatatgacg
ctatcgcagcaggcgctgttggcagctcatgcagcaggcatcaacgtctccggggatggc
agccaaaccctgactctcactggcggtgctacgtcagaagccttccagaccgcactacgc
gctatcgtgtatgtcaatgtggccacgacccctagcggcggcacacgtaccattaacgtc
accgcaaacgacgatgccagccgcagcgcgacctcaacgctgacactggtcgtaggcaat
ccgcctgtggttggcacgccaatcccgtcacaaagtgtggtacaggatggcagcctgaac
ttcaccattcccgctggcacttttaccgatcccgatgtcggcgatatcctgactctgggc
gcgacgttagcggatggaacaccgttgccaagctggctaacctttaatccagccacgaac
accttctccggcacgccgggcaatgcggatgtcggcaatctgtctatccgcgtcactgcc
accgatggcggtaacgcctcggtatatacggatttcagtctgaccgtcaccaacatcaac
gacgctccggtggtcgcgacgccgatacccgcacaaagcgtggcacaagatgacagcctg
aacttcaccgtaccggcaggtaccttcaccgatccggatgtcggcgataccctgaccctc
agcgccacgctggccgatggttcaccgctgccgaactggattacctttaatccggccacg
ggcaccttctccggcacgccaggcaatgcagatgtcggtaccctgagtattaaggtcacc
gccaacgatggcgatgcgtccgtcagcaccacgtttagtttgacggtcaccaacgtcaac
gacgctccggtggtcgcgacgccgataccggcgcaaagtgtggcacaggatggcagtctg
agcttcaccgtacccgcaggcaccttcacggatccggatggcgatactctctctctgagc
gccacgctggccaacggttcaccgctgccaagctggctcacctttaattcggccaccggc
accttctccggcacaccgggcaatgcagatgtcggcaccctaagcattaaggtcatcgcc
aacgatagtggggcatcgatcagcaccacctttagcctaaccgtcaccaacgccaacgac
gctccggtggtcgcgacgccgataccggcgcaaagtgtggcacaagatggcagtctgaat
ttcatcattcccgcgggtactttcaccgatccggatggcgataccctgaccctgagcgcc
acgctagctaacggctccccgttgccaagctggctcacctttaacacagccactggcacc
ttctccggcacaccggttaatgcggatgttggtagcctgtctatccgcatcaccgccacc
gatggcagcaacgcctcggtatatacggatttcagcctgaccgtcaccaacgtcaacgat
gtgccagtggttggcacaccgataccggcacagagtatcgcgcaggatggtagcctgaat
ttcaccgttcccgctggcacgtttatcgatcccgatggcgacactctgaccctgagcgcc
acgctggctaacggctcaccgctaccgggctggattacctttaatccgactactggcacc
ttctccggcacgccaggcaatggcgatatcggcaatctgagcattaaggtcaccgccaac
gatggtgatgcctcgatcagtaccaccttcagtctgacagttacgccagcgaaccaggct
cccgtagtatccacaccaatcccgccgcaaagtgtagtgcaggatggcggcttcaacttt
accgtgcctgcgggcaccttcagcgatcccgatggcgacactctgaccctgagtgccacg
ctggcagacggttcaccgctgccaagctggatcacctttaatccggccactggcaccttc
tccggtacaccgggcaacgccgatgtcggtaatctgagcatccgcgtcaccgccaccgac
ggcagtaatacctcaattagcaccagttttggcctgacggtgaccaacgttaatgatgcg
ccagtggttggcacaccgataccggcacagagtatcgcgcaggatggtagcctgaatttc
accgttcccgctggcacgtttatcgatcccgatggcgataccctgacactgagcgccacg
ctggcagacggttcaccgctgccaagctggatcacctttaatccggccactggcaccttc
tccggcacaccgggcaacgccgatgtcggtaatctgagcatccgcgtcaccgccaccgac
ggcagcagcgcggcggcacatacggatttcggcctgaccgtcaccaacgtcaacgatgtg
ccagtggttggcacaccgataccggcacagagtatcgcgcaggatggtagcctgaatttc
actgttcccgctggcacgtttatcgatcccgatggcgacactctgaccctgagcgccacg
ctggcagacggttcaccgctgccaagctggatcacctttaatccggccactggtaccttc
tccggcacgccgggcaatggtgatgtaggcaacctgacgatcaaagtcaccgccaacgac
ggtgatgcctcggtcagcaccacctttagcctgacggtcactaacgttaacgatgctcca
gtggttggcaccccaatcccaccacaaagcgtggcgcaggatggtggctttaacttcacc
gtaccggcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccaccctc
gctgacgggtcaccgttgccgagctggctgcacttcgatcccaccatcggcaccttctcc
ggcacgccgggcaatggtgatgtcggtatgctggtgatccgagtaacggccaccgacggc
agcaatacgtccatcagcaccagctttggtctgacagtcactaacatcaacgatgcccca
gtggttggcaccccaatcccaccacaaagcgtggcgcaggatggtggctttaactttacc
gtacccgcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccaccctc
gccaacgggtcaccgctgccgagctggctgcacttcgatcccaccatcggcaccttctcc
ggcacgccgggcaatggtgatgtcggtatgctggtgatcagggtaacggccaccgacggc
agcaatacgtccatcagcaccagctttggtctgacagtcactaacgttaatgaagctcct
gtggtatccacccctattccaccgcaaagcgtggcgcaggatggtggctttaactttacc
gtacccgcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccaccctc
gccaacgggtcaccgctgccgagctggctgcacttcgatcccaccatcggcaccttctcc
ggtacgccgggcaatggcgatatcggtacgttggtgatcagggtaacggccaccgacggc
agcaatacgtccatcagcaccagctttggtctgacggtgaccaacgttaacgatgcgcca
gtggtgtccaccccgatcccgccgcaaagcgtggcgcaggatggtggctttaactttacc
gtacccgcaggcacctttaccgatccggatggcgataccctgacgctcagtgccaccctc
gccaacgggtcaccgctgccgagctggctgcgcttcgatcccaccatcggaaccttctcc
ggtacgccgggcaatggcgatatcggtacgttggtgatcagggtaacggccactgacggc
agcaatacgtccattagcaccagctttggtctgacggtgacgcgcagcattataggcggc
gatccgcagttcaaagccaacgacggtattggccggacgccgtcatcaagcgatgcgcgc
cagttgtctacgcaggatgccacaacggcaccgccgacgttgaatggcctgattaccaac
ccgtcgctcggcagtttcaccgtgggtaacgacggtgcaccaatgtcagtgatgtctgcc
attttcgctaccggacgccagaacacagagggaggcaccataccggtcagccaggttgcg
ggcactttcggacgcggagtcgccagcggcattggcattaacttcgacagcaccctaggc
tccttccccagctttagtaaagatcccgcactaggcggcacctcatcgctggctagcgca
ttctcggggatctatctgccttcactgatgccaatggaggtcttctccggcggtagttgg
aagaacattccgatcgatagcgcgggcagcacaacgaatagcaccgatgacggcactggg
cgttccgtggcatttatgccctcgctgcatcagcaattacaacagataggtgactcggaa
ctgcaacgtctggcagccattgagcaagcattgcaggaaagtggtcagcagcaaggataa
DBGET
integrated database retrieval system