Pedobacter aquae: FYC62_11350
Help
Entry
FYC62_11350 CDS
T06312
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
pej
Pedobacter aquae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
DUF5907
AMIN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEK53313
UniProt:
A0A5C0VNQ2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2585112..2589884)
Genome browser
AA seq
1590 aa
AA seq
DB search
MQGLVGAKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGAQGEAGAQGIAGVKGDKGDKGDQGDVGPQG
PIGLTGATGPAGPQGPIGLTGATGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIG
LTGATGAQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAGPIGLTGATG
PQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAGPQGPIGLTGATGAQG
IAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAGPIGLTGATGPQGPIGLTGATGPQGIAGVKG
DKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAGPIGLTGATGPQGPIGLTGATGPQGPIGLTGAIGPQG
PIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQG
PIGLTGATGPAGPIGLTGATGPQGPIGLTGAIGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQG
DVGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAGPIGLTGATGPQG
PIGLTGATGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGAQGPIGLTG
ATGAQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGAQGPIGLTGATGPAGPVGLTGATGPQG
IAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGAQGPIGLTGATGPQGIAGVKGDKGDQGDVGPQG
PIGLTGATGAQGPIGLTGATGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTG
ATGPAGPIGLTGATGAQGPIGLTGATGPQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAG
PIGLTGATGPQGPIGLTGATGAQGIAGVKGDKGDQGDVGPQGPIGLTGATGPAGPIGLTG
ATGPQGIQGLAGVKGDKGDKGDTGATGPQGLAGAKGDKGDKGDTGPIGLTGATGPQGLAG
AKGDKGDTGAQGPIGLTGATGPQGIQGLAGAKGDKGDTGAQGPVGLTGATGPAGPIGLTG
ATGPAGATGPQGPAGTYTAGSLISISGSTLGVNLFGTIGAGGGDIEGSLNQMLLRSGAVE
GFQIADGTIQAAKLANASVTGAKIQDGVITAAKLASASVTDAAIGFASINPNKLSASGAT
LNQVLSWNGGSWVPTSPSVAGDANATTRGIVQLAGDLSGTATAPIVAANAITSAKIADGT
IATIDVADNAITSAKIADGTIVTTDIADNAITSAKILNGTILREDIADGAVTGLKIFDGS
IISQDLADNAVTSAKITDGTIATADLADGSITGAKLNAMSATDGQVLKFNGTAWAPATEA
AVNNWLIGGNNNATASSFLGTTNDIAMRIRSNNIPMLEFGRRQTLGLTQSQVDYTNNDQP
LVHVNGNGTTSALQFAASAAEFYKPMFFTTTEGNFRLKGSAAGTDFFEIGSAGTGNAGRL
DFIIGDDGDEPIVFSKFNYTTSTPVEMMRMQGTGLDNTVRVGVNTNGNVANSTMQVNGSV
SNSILRTNNNITLNDTHYTVIITNNGGLTITLPAANSCIGRIYVIKNTGTGGTKTVTPNY
RNASNTSTSNVPSSSVIIIQSDGIDWQQIN
NT seq
4773 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attcaaggtttagtaggagcgaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaa
ggtccaataggtttaacaggagcaacaggtgcacaaggagaagctggtgcacaaggtata
gccggagtaaaaggtgacaaaggcgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaaggt
ccgataggcttaactggagcaacaggtccagcaggtccacaagggccaatcggtttaacc
ggagcaacaggtccacaagggccaattggtttaactggagcaacaggagcacaaggtata
gctggagtaaagggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaaggtccaataggc
ttaacaggagcaactggtgcacaaggtccaattggtttaactggagcaacaggagcacaa
ggtatagctggagtaaagggtgataagggagatcaaggagatgttggtccgcaaggtccg
ataggattaactggagcaacaggtccagcaggtccaatcggtttaaccggagcaacaggt
ccacaagggccaattggtttaactggagcaacaggagcacaaggtatagctggagtaaag
ggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaaggtccaataggcttaactggagca
acaggtccagcaggtccacaagggccaattggtttaactggagcgacaggagcacaaggt
atagctggagtaaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccgcaaggtccgata
ggattaactggagcaacaggtccagcaggtccaatcggtttaaccggagcaacaggtcca
caaggtccaattggtttaactggagcgacaggtccacaaggtatagctggagtaaaaggt
gataagggagatcaaggagatgtaggtccgcaaggtccgataggattaactggagcaaca
ggtccagcaggtccaatcggtttaaccggagcaacaggtccacaaggtccaatcggttta
accggagcaacaggtccacaaggtccaatcggtttaaccggagcaataggtccacaaggt
ccaattggtttaactggagcaacaggagcacaaggtatagctggagtaaagggtgataag
ggagatcaaggagatgtaggtccacaaggtccaataggtttaacaggagcaactggtgca
caaggtatagctggagtaaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccgcaaggt
ccgataggattaactggagcaacaggtccagcaggtccaatcggtttaaccggagcaaca
ggtccacaaggtccaatcggtttaaccggagcaataggtccacaaggtccaattggttta
actggagcaacaggagcacaaggtatagctggagtaaagggtgataagggagatcaagga
gatgtaggtccacaaggtccaataggtttaacaggagcaactggtgcacaaggtatagct
ggagtaaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccgcaaggtccgataggatta
actggagcaacaggtccagcaggtccaatcggtttaaccggagcaacaggtccacaaggt
ccaatcggtttaaccggagcaacaggtccacaaggtccaattggtttaactggagcaaca
ggagcacaaggtatagctggagtaaagggtgataagggagatcaaggagatgtaggtcca
caaggtccaataggtttaacaggagcaactggtgcacaaggtccaattggtttaactgga
gcaactggtgcacaaggtccaattggtttaactggagcaacaggagcacaaggtatagct
ggagtaaaaggtgataagggagatcaaggtgatgtaggagcacaaggtccaatcggttta
accggagcaacaggtccagcaggtccagtaggtttaactggagcaacaggtccacaaggt
atagctggagtaaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaaggtccgata
ggtttaaccggggcaacaggtgcacaaggtccaataggtttaacaggagcaacaggtcca
caaggtatagctggagtaaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaaggt
ccgataggtttaaccggagcaacaggtgcacaaggtccaataggcttgacaggagcaaca
ggtccacaaggtccaattggtttaactggggcgaccggagcacaaggtatagctggagta
aaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtccacaaggtccgataggtttaaccgga
gcaacaggtccagcaggtccaataggcttgacaggagcaacaggtgcacaaggcccaatt
ggtttaactggagcgacaggtccacaaggtatagctggagtaaaaggtgataagggagat
caaggagatgtaggtccgcaaggtccgataggattaactggagcaacaggtccagcaggt
ccaatcggtttaactggagcaacaggtccacaaggtccaattggtttaactggagcgaca
ggagcacaaggtatagctggagtaaaaggtgataagggagatcaaggagatgtaggtcca
caaggtccgataggtttaactggagcaacaggtccagcaggtccaatcggattaactgga
gcaacaggcccacaaggtatccaaggtttagcaggagtgaaaggtgataaaggcgacaag
ggagatacaggtgcaacaggtccacaaggattagcaggagcgaaaggtgataaaggtgac
aagggagatacaggtccaataggtttaaccggagccacaggtccacaaggattagcagga
gcgaaaggcgacaagggagatacaggagctcaaggtccaataggtttaactggagcgaca
ggtccacaaggaattcaaggattagcaggagcgaaaggcgacaagggagatacaggagct
caaggtccagtaggtttaaccggagcaacaggtccagcaggtccgataggtttaactgga
gcaacaggtccagctggtgcaaccggtccacaaggtccagcaggaacatacacagcggga
tctttaatttctatatcaggaagtactctaggtgttaatcttttcggtactattggcgct
ggaggtggagatattgaaggttctttaaatcaaatgctattaagaagtggtgcagttgaa
ggttttcaaattgctgatggcacaattcaagctgctaaattagctaatgcttctgttact
ggggccaaaattcaggatggggtaataaccgcagctaaattagctagtgcgtctgttaca
gatgctgcaattggttttgcaagtattaatcctaataaattatctgcttctggagcaaca
ttgaatcaagtattaagttggaatggcggaagttgggtgcctactagcccaagcgttgca
ggtgatgcaaacgcaacaactagaggtattgttcaattagctggagatttatctggaact
gctactgcgccaatagttgctgctaatgccattacatcagcaaaaattgcagatggtact
attgcaactatagatgtagcagataacgcaattacatcagcaaaaattgcagatggaaca
attgttacaacagatatagctgataatgcaattacatcagccaaaattcttaatggaacg
atattacgagaagatatagcagatggggctgtgacaggattaaagatttttgatggaagt
attatttctcaagatcttgcagacaatgcggtaacatcagcaaaaattactgatggaacg
atagctacagcagatttagcagatggttctattacaggtgctaaactaaatgctatgtct
gctactgatggtcaagtacttaaatttaacggtacggcttgggctcctgcaacagaagcc
gctgttaataattggttaataggtggtaataataatgctacagcgtcaagtttcttagga
acaacaaatgatatagccatgagaattaggtctaataatataccgatgttagaatttggt
agaagacaaacgctaggtttaacacagtctcaagttgattataccaataacgatcagccg
ttggtacatgttaatggtaatggtacaacttcggccttacaatttgcggcatctgcagcg
gaattctataaacctatgttttttactacaacagaaggtaatttcagattaaaaggtagt
gcagcagggacagatttctttgagataggaagtgccggaacaggtaatgcgggtaggtta
gactttattatcggagatgatggggatgagccaattgtattttctaaatttaattacact
acttctaccccagtagaaatgatgagaatgcaaggtacaggtttagataatacagtaaga
gttggtgtaaataccaatggtaatgttgctaattcaaccatgcaagtgaatggctctgtt
tctaattctattttaaggactaataataatataactttaaatgatacgcattatactgta
attataacaaataatggtggtttaactataactttaccagctgcaaattcttgcataggt
aggatttatgtaataaagaatacaggtacagggggtactaaaactgttacaccaaattat
agaaatgctagtaatacctctacttcaaatgtgccatcttcaagtgttatcattatacag
tctgatggtattgattggcaacaaataaattaa
DBGET
integrated database retrieval system