Plasmodium falciparum Dd2: PFDG_00715 Help Entry PFDG_00715        CDS       T01051                                  Name (Broad) ATP-dependent helicase NAM7   KO K14326   regulator of nonsense transcripts 1 [EC:5.6.2.5 5.6.2.3] Organism pfd  Plasmodium falciparum Dd2 Pathway pfd03013   Nucleocytoplasmic transport pfd03015   mRNA surveillance pathway Brite KEGG Orthology (KO) [BR:pfd00001]  09120 Genetic Information Processing   09122 Translation    03013 Nucleocytoplasmic transport     PFDG_00715    03015 mRNA surveillance pathway     PFDG_00715  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pfd03019]     PFDG_00715 Enzymes [BR:pfd01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.3  DNA 5'-3' helicase      PFDG_00715     5.6.2.5  RNA 5'-3' helicase      PFDG_00715 Messenger RNA biogenesis [BR:pfd03019]  Eukaryotic type   mRNA surveillance and transport factors    Surveillance factors     Surveillance complex      PFDG_00715    mRNA cycle factors     Common to processing body (P body) and stress granule      PFDG_00715 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  AAA_12 UPF1_Zn_bind AAA_11 UPF1_1B_dom AAA_30 AAA_19 ResIII Helicase_RecD AAA_22 SRP54 DEAD AAA_16 AAA ATPase AAA_5 PhoH Motif LinkDB All DBs AA seq 1579 aa AA seqDB search MDKTFDYNNIHVDNFDELYDFCISKDTNKKKIKEENYFSEDTQQKFNDDKDTCNKEVLKK NTNIKPTKKHGKNKKSEYSPCKIIEEKRLDMLNESLEDTESYYDRKKKNSHKYKEMNNSN NNNNNNNNNNNDDNNSKKHIDPHGNDCIHQGKHKNEHEQQYYSNKHMKNNSECLSDISSY TDIRSCNNVEDGIYDEYDLTNKMKYEKTNKYKNKNKNKNGYNNKYENKNNYYKNDYSKYY SNHKDDTHNELYEEGNNYRYKNKKSKDDLKYYRCRYCEIDSIDSVVQCNNCKRWFCNGSY GTCGSHIVTHLVRSKHKEIRLHKNSLLGETILECYNCACRNVFLLGFLPTSEEGVVVIIC RDPCLSSYISLYEKHVGPFDEHKSKSLQDDMEKEILLEDHDVDNEEINDEPNKNNKKKCE NINSSNEDEKEHEEPINFCSLNHPSDSSDYYPYYYYNHHSNYSRREKNKKHNKGSEKKHM NVCCDDNKMKDCQNNNNPNKYVDDENMIDGKDNKKYEKKGKQNDVYKEDEKGSYINNSHI NDELKKIKDWDLKKWQPVIEDRFFLEWLVNIPSNEEAERKGKLSTSYNVNKLEELWKNKK DVYIDELNFEILNDEPNKVELKYEDAHHYQSIFSPLVQLEADYDKSIKEGQKQGNVSVRW DIGLNKKRYAHFIYIKEESELRLVAGDELKISYTYPDGSVWCCEGHISRLHNTEEISLEL RTSCTSNGPWVDNITTGFTVEFIWKSTAYDRMQLALNEFALNSYSLSGFLYHKLLGHDIS EDSLEYNKNTFHKLMHKKVMSIRNYSAPNLAPLNHSQIDAIKRSLLSPLSLIQGPPGTGK TLTCATLVYHLVKMNMGKVLVTAPSNVAVDQLSVRIHRSGLKVVRLCSKSRESVPSIAEY LYLHNQMKLLKTDIAEELNKLLELKEEVGELSQKDERRLKKLILFAEHEILIEADVICCT CVGAMDKRLKKFRFRQVLVDEATQSTEPECLVPLVTGAKQIVLVGDHCQLGPIIVCKKAA NAGLGKSLFERLVMLGITPFRLEVQYRMHPALSEFPSYVFYDGSLQNGITLKEREYPLKS FPWPNAKCPMFFYNSTGLEEMSASGTSYLNRSEASNMEKLVRTLLQCGLKPSQIGVITPY EGQRAYITSLFQKNISFQNSSDIEVASVDAFQGREKDFILLSCVRSNKKLGIGFLNDPRR LNVALTRAKYGLIICGNAKVLSRHHFISREKINANETITNVNSVWINLLSQFKKKDLIVE GCLANLKPVNINIPTPTKLPSRYTNFNYFHSYDNFQKNKTYSYQDKFKSNTYKDNNTNTT NQYNNNNNNNNNNNNKNDDQLFNSSHNNHYYSSYYYYSHFNKNHLPDENTNSQFNLNLSN YSYCSDHFMNNDLYNYINKNKKKNIVNSYVNNLSQMSQFNDYPTETNHNNDDHNYLHLHD KYNDTLDDDKKSSNKCNISSSLNNSEFSYPNNKMSSNHSIDSYNHDTNLISMSKNADNLL PYLFYYKNNQNSSSQPYMYYNQNSEQINSSKTQKGLKNTVLNKSSTSNTMVSQKDSIIVN DQKLNCDNLKKVSENTHIN NT seq 4740 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggataaaactttcgattataataatattcatgtagataattttgacgaactgtacgat ttttgtatttctaaggatacgaataaaaaaaaaataaaagaagaaaactatttttcagaa gatacacaacaaaaatttaatgacgataaggatacatgtaataaagaggtgttaaaaaaa aatacaaatataaaacctacaaaaaaacatgggaaaaataaaaaatcggaatattctcca tgtaaaataatagaggaaaagaggttagatatgttaaatgaaagtttggaagatacggaa tcatattatgatcgaaaaaaaaaaaattcacataaatacaaagaaatgaataacagcaat aataataataataataataataataataataatgatgataacaatagtaagaagcatatt gatcctcatggtaatgattgcattcatcaaggaaaacacaagaatgaacatgaacaacaa tattatagtaataagcatatgaaaaataattcagaatgtttaagtgatataagtagctat actgatattagaagttgtaataatgtagaggatggaatatatgatgaatatgatttaacg aataaaatgaaatatgagaaaacaaataaatataaaaataaaaataaaaataaaaatggt tataataacaaatatgagaataagaataattattataaaaatgattatagcaaatattat agtaatcataaggatgacacacataatgaactttatgaagaaggtaataattatagatat aaaaataaaaaaagtaaagatgatttaaaatattatagatgcagatattgtgaaattgat tctattgatagtgttgttcaatgtaataattgtaagcgttggttttgtaatggttcttat ggtacttgtggtagtcacattgttacacatttagttcgatcaaaacataaagaaattaga ttacataaaaatagtttattaggtgaaacaattttagaatgttataactgtgcatgcaga aatgtatttttgttaggtttccttccgacatccgaagaaggtgttgttgttattatttgt agagatccttgtttatctagttatatatccttatatgaaaaacatgtcggtccttttgat gaacacaaaagtaagagtttacaagatgatatggaaaaggagattttgttagaagatcac gacgtggataatgaagaaataaatgacgaacctaataaaaataataaaaaaaaatgtgaa aatattaatagtagtaatgaagatgaaaaagaacatgaggagcctattaatttttgttcc cttaatcatccaagtgatagttctgattactatccttattattattataatcatcattct aattattcgagacgtgaaaagaataaaaaacataataaaggatcagagaagaaacacatg aatgtttgttgtgatgataacaaaatgaaggattgtcagaataataataatcccaataaa tatgttgatgatgaaaatatgatagatggaaaagataataaaaaatatgagaaaaaagga aaacaaaatgatgtgtataaagaagatgaaaaggggagttatattaataatagtcatatt aatgatgaattaaagaaaataaaagattgggatttaaaaaaatggcaacctgtaattgaa gatcgtttttttttagaatggttagtaaatataccgtctaatgaagaagcagaacgaaaa ggtaaattatcaacatcttataatgtaaataaattagaagaattatggaaaaataaaaag gatgtgtatatagatgaattaaattttgaaatattaaatgatgaacctaataaagtggaa ctaaaatatgaagatgctcatcattatcaatccatattttctcctttagttcaattagaa gctgattatgataaatcgattaaagaaggccagaaacaagggaatgtgagtgttcgatgg gatattggtttaaataagaaacgatatgctcattttatttatattaaagaagagagtgaa ttaagattggttgctggtgatgaactaaaaatatcttatacatatccagatggatccgtg tggtgttgtgaaggacatatatctagattacataatacagaagaaatttcattagaatta agaacatcttgtacatctaatggaccatgggtagataatataacaaccggatttactgta gaatttatatggaagagtacagcttatgatcgcatgcaattagcattaaacgaatttgct ttgaattcctattcgttaagtggatttttatatcacaaattattaggacatgatatatct gaggattctttggaatataataaaaatacatttcataaattaatgcacaagaaagtaatg agtatacgaaattattctgctcctaatttagcacctttgaatcattcccagatagatgct ataaaaagaagtttattatctcctttatctttaatacaaggacctcctggtacaggaaaa acgttaacatgtgcaactttggtatatcatttggtaaagatgaatatgggtaaggtatta gttactgcacctagtaatgtggctgtagatcaattatctgttagaatacatagaagtggt ttaaaggtagttcgtttgtgttctaagagtagagaatcggttccaagtatagctgagtat ttatatttacataatcagatgaaattattaaaaacagatattgctgaagaattaaataaa ttattagaattaaaagaggaagtaggagaattatctcaaaaagatgaacgtcgattaaaa aagttaatcttatttgcagaacatgaaatattaatagaagcagatgtaatttgttgtaca tgtgttggggctatggataaacgattaaaaaaatttcgttttcgtcaagtattagttgat gaagcaacacaatcaaccgaaccagaatgtttagtacctttagtaacaggagcaaaacaa attgtattagttggtgatcattgtcaattaggacccatcattgtttgtaaaaaagctgca aatgctggtttaggaaaaagtttatttgaaagattagttatgttaggtataacaccattt agattagaagtacaatatcgcatgcatccagctttaagtgaatttccatcttatgttttt tatgatggtagtttacaaaatggtattactttaaaagaaagagaatatcctttaaaatca tttccatggcctaatgctaaatgccctatgtttttttataattcaactggattagaagaa atgtctgcatcaggtacaagttatcttaatagaagtgaagcttctaatatggaaaaatta gttcgtaccttattacaatgtggtttgaaaccatcacaaataggtgttataacaccctat gaaggacaaagagcatatattacttcattatttcaaaaaaatatttcttttcaaaattcg tcggatatagaagtagcttcagtagatgcattccaaggaagagaaaaagattttatatta ttatcatgtgttcgatctaataaaaaattaggtatagggtttttaaatgatcctagaaga ttaaatgttgccttaaccagagcaaaatatggattaattatatgtggaaatgcaaaagtt ttatcaagacatcattttatatccagagaaaaaattaatgcaaatgaaaccataactaat gtaaattcagtatggatcaatttattaagtcaatttaaaaaaaaagatttaattgtagaa ggttgtttagctaacttgaaaccagtaaatataaatatacctacacctacaaaattacca tctagatatacaaactttaattatttccatagttatgataatttccaaaaaaataaaaca tattcatatcaagataaattcaaatctaatacttataaagataataacacaaatacaact aatcaatataataataataataataataataataataataataacaaaaatgatgatcaa ttatttaattcttctcataataatcattattattcttcgtattattattattcacatttt aataaaaatcatctaccagacgaaaatactaattcacaatttaatcttaacctttccaat tatagttattgtagtgaccattttatgaacaacgatttgtataattatattaataaaaat aagaagaaaaatattgtcaactcatatgttaataatctcagtcaaatgtctcaatttaat gattatccaaccgaaacaaatcataataatgacgatcataattatttacatcttcatgac aaatataatgatactcttgatgatgataagaaaagtagtaataaatgtaatatttcgtca tcattgaataattcagaattttcatatcctaataataaaatgtcatctaatcattctata gattcatataatcatgatacaaatttaatttccatgtcgaaaaatgcggacaacttatta ccgtatcttttctattataaaaataatcaaaacagtagttcacagccatatatgtattat aatcaaaatagtgaacaaataaattcatccaagacacaaaaaggtttaaaaaatacggta ctaaataaatcttctacctctaatacgatggtatcacaaaaggattctattatagttaat gatcaaaaattaaattgtgataacttgaaaaaggtatctgaaaatacgcatataaattag

DBGET integrated database retrieval system