Panacibacter ginsenosidivorans: FRZ67_20810
Help
Entry
FRZ67_20810 CDS
T06131
Name
(GenBank) T9SS type B sorting domain-containing protein
Organism
pgin
Panacibacter ginsenosidivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
PKD_4
CHU_C
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEC69623
UniProt:
A0A5B8VEW9
LinkDB
All DBs
Position
complement(4892150..4897531)
Genome browser
AA seq
1793 aa
AA seq
DB search
MTNCFKTFKIISCIVFQYLLNNVVLFAQAPAIISFSPTTVCQGDAVTITGTNFTGIKSVK
LGTDTASKFTVNSATSITAYVSVKATTGTVIVTTGNGADTTTEKLTINPLPVPGLADINN
PDAPFTYCNGLTTTYTLVVGNSTTQAGSGASYDIDWGDGSAHFTQTDWAANAQTTHTYTN
QGYFKIKFTVTTSNGCSKTATYNFYNGTNPLASITTTASTVNLCAPADVTFVIGNWANNS
PGTTYQLDFGDGTSPVTLQHPLNNADTAQQVTHTYKTSSCPKTDYTAILQPTNACYTTTY
TVNQIIIRDKPIADFAIDTPVCVTDAVCFTNKTTDGSSGNNCNTISNYTWDFGDGSTSTA
TTPPCHNYTDAGTYTVTLTSSNATCGGDIKTKTVVVKETSQSPVVSATPVSYCQDETAVQ
LTATGTGLLWYTSVTGGTGTSVAPTPSTAIPGTTTYYVSQTLAGKCESPRVPVTVVVHAI
PAEPGVSTPVNLCKGQAATPLTATGTGLLWYTTAIGGTGSSTAPTPSTAATGTFNFYVSQ
TVSDCESKRAVITVNVESLPGAPVVVSPIIYCQNQPAVPLTASGTGLRWYTTATGGTGST
VAPTPSTTTVGNSDYYVSQSTNCGEGPRALITVTTKAAPSATISYPVTNLCNVNNTAQTP
NPPVNVNLTGSTGGTYTISPSPGLPVNASTGTIDPSGATAGTYTIYYRITGTGGCSDFVT
STTVTVNSTPNASITYPSICTSNGDVKVQLTGSSGGSYTSTAGLTINAATGTITASTSIP
GNYVVTYTIAPSSPCPGFTTTTNVTVTKAPSATITYNVSNLCNVTNTASTPNPPIDVVLT
GNTGGTYSIQPATGLPINTINGRIDPSGAAAGTYTISYTIPGSGGCTDFVTTATVTVNGT
PEATISYPPICTSTNAISVQLNGTQGGSFSSTTGLTIDAATGVITASTSTAGDYIVTYSI
AASAPCPGFTTTTKVTITKAPFATISYAATNLCNVINSANTPNPKVDVMLTGNKGGTYTV
SPSTGLPINTVTGTIDPSGAVAGTYTISYTIAAAGGCAEFVTTTQITINSTPTAAIQYPA
SSYCRGVTIPQAVTFSGTTGGTYSSAQGLSVNSTTGAINPSLSLPGTYTVTYTIQPSAPC
PGFVTTTTVTINDSPVITFSSLVQSICSGGTAVFKPLSTVANTLYTWSVTSALPAGVTGV
TSGTTSDPNASISLLFTNTSSVSQSIIIHVVPTNPTQNPCDGAPTDLTLIINPIPAALVT
DTFKYCMHTPPETLTVNAVPGNTVNWYDGNLNPLNAAPLINTNTPATFTFYASQSNSYGC
ESGKSKVTAVVNATAKIISSSYTNPTACGIPSGSIVLNVLDLNNNAMPNISFIVHYTKFQ
TAYAIVATSDANGKITIPLVAGTYSNIYVESNNCLSQKIPDVFVLKDPDPPAQPIAGYNG
PLCSENMLSLSASSPTSSETYPIDYVWVGPAFGPLADTTRNTVISFPSAPVSYAGTYIVY
AIQNNCISPATNFIVTIKQSPTKPQVTTRSPLCVGDNLSLQATSSIPGNSILSFVWNGPG
TGFPVNNAYAAINNVQVQDGGVYSITVTSAQTGCSSTTDTLIKIGNYPIVKFAQDTLTVP
TGYLLNLATTITNANDPNVLPMKSYAWTPSQNINCNDAICSAPVAAVKNAGCYYLNATNV
YGCVGRDTICVKVFCQSSQVFMPNAFTPNGNASNAVFMVRASGIASVKSFRIFNRWGRLV
FERTNFSPNSAAYGWNGLINGRPADVGVYIYTVDVICENGVPYTYKGNVTLLR
NT seq
5382 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactaactgctttaaaacctttaaaataattagctgtattgttttccagtatttatta
aacaacgttgtcttgtttgcacaagcaccggcaataatatcattttctccaacgacggtt
tgccagggtgatgctgtgactataacaggtacgaactttacaggcataaagagtgtaaag
ctcggaactgatacggcatcaaaatttaccgttaacagcgctacatctattacagcttat
gtgtctgttaaagcaacaacaggaactgtaattgttacaacaggtaatggggctgatact
acaactgaaaaacttaccattaatcccttacctgttcccggcttggctgatatcaataat
ccagacgccccttttacttattgcaatggtttaacaacaacctatactttagtagtaggc
aatagtacaacacaggcaggttcaggtgcaagctatgacatagattggggtgatggttca
gcacattttacacaaacggactgggctgcaaatgcacaaaccacgcatacctataccaac
cagggctattttaaaataaaattcacagttactacatcgaatggttgcagcaaaactgca
acatataatttttataatggtaccaaccccctggcaagcattaccactacagcttcaaca
gtaaatttatgtgcaccggcagatgttacttttgtgataggtaactgggccaataattct
ccgggtacaacttaccagctggattttggagatggtacttctcctgttactttacaacat
ccgctaaataatgcggatacagcgcagcaggtaacacatacttataaaacatcatcttgt
ccgaaaacagattatacagctatattacaacccacgaacgcctgttatactactacctat
acagtaaaccagatcataataagggataaaccaattgctgattttgctatagatacgcct
gtatgcgttactgacgcagtttgttttaccaataaaacaacggatggaagcagtggtaat
aattgtaacaccataagtaattatacatgggattttggagatggttccacttctactgca
acaacaccgccatgtcataattatacagatgctggtacttacactgttacattaacaagt
tccaacgcaacctgtggcggggatatcaaaaccaaaacagtagtggtaaaagaaacctcg
caaagcccggttgtttcagcaacaccagttagctattgccaggatgaaacggctgtgcaa
ttaacagcaacaggtacgggattgttatggtacacatctgttacaggaggtacaggtact
tcagtagcaccgacaccttcaactgcaataccgggcactactacctactatgttagccag
accctggcaggtaaatgtgagagtccgagagtacctgttaccgttgttgttcatgccata
ccagcagagcccggagtaagcacacctgtgaatctttgtaagggccaggcagcaactcca
cttacagcaacaggtacaggattgttgtggtacactactgctatcgggggtacaggttca
tcaactgcccctactccatcaactgctgcaacaggcacttttaatttttatgtaagtcaa
acagtaagtgattgcgaaagtaaaagagcagtgataactgtaaatgttgaatcattaccg
ggagcaccggttgttgtatcacctataatttattgtcagaaccaacctgctgtaccatta
actgcaagtggtacaggattacgttggtacacaacagctacaggaggaacaggaagtaca
gtagctccaacaccttctacaactactgttggcaattcagattattatgtaagccagtca
actaattgtggtgaaggaccaagagcattaataactgtaacaacaaaagcagcaccatct
gcaacgataagttatcctgttacgaatctttgtaatgtaaacaatactgcacaaacacca
aacccgcccgttaatgtaaaccttactggatctacaggtggaacttatactatttctcca
tcaccaggtttacctgttaatgcatcaacaggcaccatcgacccttcgggagctactgca
ggaacatacactatttattataggataacaggaacaggaggttgttccgattttgttact
tccactacagttacagtaaacagtacaccaaatgcttccataacttatccttctatctgt
acttcaaacggggatgtaaaagttcagcttaccggttcatcaggtggctcttatacatct
acagcaggattaacgatcaatgctgcaacaggcaccattacagcttcaacaagcataccc
ggaaattatgttgttacatatacaattgctccttcatctccctgcccaggatttacaaca
acaacaaatgttactgttacaaaagcgccgagtgcaactataacttataatgtttccaat
ctttgtaatgttaccaacactgcatcaacaccaaatccgccaattgatgtagtacttaca
ggcaataccggaggcacttattctatacagcctgcaacaggcttaccaattaatacaatt
aatggaagaatagatccatcgggtgctgcggcaggaacatatactatctcttatacaatt
ccaggttcaggtggttgtactgattttgtaacaactgcaactgttacagtgaacggaaca
cctgaagcaacgataagctatccaccaatatgtacttcaaccaatgcaataagtgtacag
cttaacggaacacaaggtggtagtttttcatcaacaacaggtcttactatagatgctgct
acaggtgttataacagcttcaacaagtactgcaggagactatattgtaacttacagcata
gctgcatctgcaccatgccccgggtttacaacaacaacaaaagttactatcacaaaagcg
ccttttgcaactatttcatatgctgctacaaacctctgtaatgttattaattcagccaat
acacctaaccctaaagttgatgtaatgcttaccggtaacaaaggcggtacttatactgtt
tcaccatcaacgggattaccgatcaatactgtaacaggtactattgatccgtcaggtgca
gttgcgggaacatatactatatcttatactattgctgctgcaggaggttgtgctgaattt
gtaaccacaacacaaataaccatcaatagcacaccaactgctgctatacaatatcctgct
tcttcttattgtcgtggtgtaacaattccacaagctgttacattttccggaacaactggt
ggaacatatagttcagcacaaggattatctgttaattcaacaacaggtgcaataaatcca
tcattaagtttaccgggtacttataccgtaacctataccatacaaccatctgcaccgtgt
cccggttttgtaacaactacaactgttacaattaatgatagtcctgttataacattttca
tctttggtacaatcaatttgttccggcggaacggctgtctttaaacctttatcaacagtt
gccaatactctttatacatggtctgttacaagtgcactacctgcaggtgtaacaggtgta
acttcaggaacaacctctgatccaaatgcaagcatatcattgttgtttacaaatacaagt
tcagtaagtcagtctatcatcatacatgttgtaccaacaaatcctacacaaaatccctgc
gatggtgcgcctacagatcttacgctaataattaatccaatacctgctgcattggtaaca
gatacttttaaatattgcatgcatacaccaccggaaacattaacggtaaatgccgtaccg
ggaaatactgttaactggtatgatggaaatttaaatcctttgaatgcagcacctctcatt
aatacaaatacacctgcaacattcacattttatgcaagccagtcgaactcgtatggatgc
gaaagcgggaaatcaaaagttacagcagttgtaaatgcaacagcgaagatcattagttca
agctatacgaatcctacagcatgtggtattccttcaggctctattgtgttgaatgtactt
gatcttaataataacgcaatgccgaacatttcatttattgttcactacacaaaatttcaa
acagcttatgcaatcgttgcaacaagtgatgcaaacggaaaaataactataccgcttgtt
gcaggaacttactcaaacatatatgtcgaaagcaataattgcctttctcaaaaaatacct
gatgtatttgtgttgaaagatcctgacccgcctgcacaaccaattgccggttataacggc
cctttatgcagtgaaaatatgttgagtttatccgcatcatcaccaacaagttcagaaaca
tacccgatagattatgtatgggtaggacctgcatttggcccgcttgcagatactacaaga
aatactgttataagctttccatctgcgcctgtatcttatgcaggaacatatattgtctat
gctatacagaataattgtatttcacctgcaaccaattttattgttactataaaacaatcc
ccaaccaagccccaggtaactacaagaagtcctttatgtgtgggagataatctgagtttg
caggcaacaagttctattcccggcaatagcatattaagttttgtttggaatgggccgggc
acaggctttcccgtaaacaatgcttatgctgctatcaataatgtacaggtgcaggatggc
ggtgtgtattcaataactgtaacgtcggcgcaaacagggtgcagttccacaacagataca
cttataaagatcgggaactatcctattgtaaaatttgcacaggatacacttactgtacca
accggatacctgctgaatttagcaacaactattaccaatgcaaatgatccgaatgtgttg
cccatgaaatcatatgcatggacaccgtcgcagaatatcaattgcaatgatgctatttgt
tctgctcctgttgctgctgtaaaaaatgcaggttgttattatttaaatgcgacaaatgtt
tacggatgtgttggccgtgatactatttgcgtaaaagttttctgccagagttcgcaggtg
tttatgcccaatgcatttacaccaaatggcaatgcatccaatgcggtatttatggtaaga
gcttcgggtattgcatctgtaaaatctttcaggatttttaaccgctggggaagattagtt
tttgagcgtaccaacttttcgccaaacagcgctgcttacggatggaatggattaataaac
ggaagacccgcagatgttggtgtgtatatttatactgttgatgttatttgtgagaatggt
gttccatacacgtacaaaggaaatgtaacgttgcttagataa
DBGET
integrated database retrieval system